OBJECTIVES: To characterize by restriction fragment length polymorphism (RFLP) patterns, the distribution of different Mycobacterium tuberculosis strains isolated consecutively from 75 tuberculosis patients who resided in Prague and had culture-confirmed cases during a 4-month period in 1995. METHODS: The insertion sequence IS6110-based RFLP analysis of M. tuberculosis isolates was carried out. RESULTS: There were a total of 75 patients with various forms of tuberculosis (54 males; 21 females). The sources of M. tuberculosis isolates were sputum (n = 64), pleura or lymph node drainage (n = 8), and urine (n = 3). Fifty-three of the patients (70.7%) had isolates with unique RFLP patterns, while 22 (29.3%) had isolates that belonged to seven clusters of related RFLP patterns. The seven clusters consisted of four groups of two patients, two groups of four patients, and one group of six patients. Most of the patients whose isolates fell within a clustered RFLP pattern lived in different quarters of the city and had no identifiable contacts with other patients whose isolates had the same pattern. CONCLUSIONS: The finding that isolates from most patients (70.7%) had unique rather than clustered RFLP patterns suggests that endogenous reactivation rather than exogenous transmission is the major determinant of most of the tuberculosis cases in Prague. The occurrence of seven distinct clusters comprising 29.3% of the isolates suggests that approximately one third of cases developed active tuberculosis from recent exogenous transmission.
- MeSH
- DNA bakterií * analýza MeSH
- DNA fingerprinting MeSH
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- lymfatické uzliny mikrobiologie MeSH
- moč mikrobiologie MeSH
- molekulární epidemiologie MeSH
- Mycobacterium tuberculosis * genetika izolace a purifikace MeSH
- polymorfismus délky restrikčních fragmentů * MeSH
- senioři MeSH
- sputum mikrobiologie MeSH
- tuberkulóza * epidemiologie mikrobiologie MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
- MeSH
- amplifikace genu MeSH
- kultivované buňky MeSH
- lidé MeSH
- mikroskopie MeSH
- Mycobacterium tuberculosis MeSH
- tuberkulóza diagnóza MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- srovnávací studie MeSH
Autoři prezentují molekulárně epidemiologickou studii hlavního města Prahy s nejvyššími hodnotami prevalence bacilární tuberkulózy (14,3 na 100 000 obyvatel) z měst v České republice v roce 1995. Vyšetřený vzorek 75 kmenů (z toho 64 vzorků sputa) shromážděných v období od 1. 1. do 30. 4. 1995 představoval 43,6 % vylučovatelů M. tuberculosis hlášených v roce 1995. Věk nemocných se pohyboval mezi 21 až 92 lety (průměr 49,2 u mužů a 65,7 u žen) a jejich bydliště byla disperzně rozložena ve všech městských částech, mezi nemocnými nebyly zaznamenány žádné vzájemné epidemiologické souvislosti. Metoda fingerprintingu byla založena na průkazu počtu a molekulární hmotnosti kopií inzertivního segmentu IS6110 v elektroforeticky rozdělené DNA natrávené restrikčním enzymem Pvull. Počítačovým programem byly kmeny M. tuberculosis rozděleny na podskupinu tvořenou 22 kmeny a složenou ze 7 clusterů tvořených vždy dvěma až šesti příbuznými fingerprinty a na podskupinu nonclusterovaných 53 kmenů, které jevily individuálně odlišný obraz fingerprintu tvořený různým počtem i lokalizací IS6110. Vysoký podíl (70,7 %) vylučovatelů M. tuberculosis reprezentovaný individuálně odlišnými profily fingerprintu přisuzují autoři hypoteticky endogenní reaktivaci perzistentní tuberkulózní infekce a zbývající podíl 29,3 % clusterovaných kmenů vysvětlují recentní exogenní superinfekcí.
Authors present a molecular epidemiological study of the capital Prague with the highest prevalence of tuberculosis of 14.3 cases/100.000 inhabitants among Czech cities in 1995. The evaluated sample of 75 strains (from 64 sputum samples) gathered in the period from 1.1. 1995 to 30. 4. 1995 presented 43.6 % of Mycobacterium tuberculosis spreaders in this year. The mean age of patients was 49.2 years in men and 65.7 years in females (range 21 - 92 years). Their lodgings were dispersed throughout all districts of the town. Among the patients no epidemiological relations were detected. The fingerprinting method was based on the demonstration of the amount and molecular weight of the copies of insertion sequences of 1S6110 in the electrophoretically divided DNA by means of the restrictive enzymatic digestion of Pvull. The strains of Mycobacterium tuberculosis were, by means of a Computer programme, further divided into two subgroups. The first one contained 22 strains and 7 clusters, consisting from two to six akin fingerprints, the second one contained from 53 non-cluster strains, having individually various fingerprint pictures and various amount and locations of 1S6110. Authors hypothetically attribute the high share (70.7 %) of Mycobacterium tuberculosis spreaders represented by individually various profiles of fingerprints to endogenous reactivation of a persistent tuberculous iiifection. The remaining 29.3 % of cluster strains they explain as a recent exogenous superinfection.
- MeSH
- molekulární epidemiologie MeSH
- prevalence MeSH
- tuberkulóza epidemiologie klasifikace mikrobiologie MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Zavedení amplifikačních metod průkazu Mycobacterium tuberculosis zrychluje a zpřesňuje klinickou diagnostiku tuberkulózy. Cílem naší práce bylo stanovit optimální počet odběrů sputa na pacienta, posoudit vliv pozitivního a negativního výsledku vyšetření na tvorbu diagnózy a na léčbu pacienta. Do retirospektivní studie bylo zahrnuto 220 pacientů, kten byli vyšetřováni pro podezření na tuberkulózu. Od nich bylo zpracováno metodikou Gen-Probe Mycobacterium Tuberculosis Direct Test, využívající amplifikace ribozomální 16S RNA, 472 sput. Diagnóza stanovená amplifikační metodou byla porovnána s diagnózou stanovenou bakteriologicky. Za optimální považujeme odběr 3 sput na pacienta, u kterého senzitivita diagnózy stanovené amplifikační metodou je 92,9 % a specificita 85,1 %. Falešně pozitivní výsledky jsou nejčastější u nespecifických bronchopneumonu a nádorů. Pozitivm výsledek testu, který vede pri odpovídajícím klinickém obraze a rentgenovém nálezu k zahájení antituberkulotické terapie, vyžaduje ještě definitivní potvrzení kultivací a reakcí na léčbu. Negativní výsledek ve 3 odběrech sputa vylučuje s pravděpodobností 98 % bacilámí tuberkulózu.
The introduction of amplification methods in the diagnostics of Mycobacterium tuberculosis accelerates the clinical diagnosis and makes it more precise. Authors evaluated the optimal number of sputum withdrawal from the patient and judged the influence of positive and negative results of examination in the diagnostics and on the treatment of the patient. In a retrospective study authors evaluated 220 patients, examined for suspicion having tuberculosis. They examined 473 sputums, using the Gen-Probe Mycobacterium Tuberculosis Direct Test method, working on the basis of amplification of the ribosomal 16S RNA. Authors compared the diagnosis made by this method with the bacteriologically made diagnosis. Authors consider as optimal taking 3 samples of sputum firom a patient. The sensitivity of the diagnosis made by the amplification method is 92.9 %, the specificity is 85.1 %. False positive results are caused mostiy by non-specific bronchopneumonias and tumours. Positive results of the test with a corresponding clinical and X-ray leading to an antituberculous treatment must be verified by cultivation and favourable reaction to treatment. Negative result in all of the 3 sputums exclude with 98 % probability a bacilar tuberculosis.
- MeSH
- klinické laboratorní techniky metody MeSH
- lidé MeSH
- sputum mikrobiologie MeSH
- tuberkulóza diagnóza MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR
98 l. : il. ; 32 cm
Monitorování nízkých koncentrací hydrazinu v ovzduší na pracovištích s využitím sorpce a difuse. XXX XXX XXX
- Konspekt
- Lékařské vědy. Lékařství
- NLK Obory
- environmentální vědy
- pracovní lékařství
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR