This review aims at comparing some historical data with the current situation in the study of biogenesis of natural compounds, antibiotics in the first place. Biogenesis of tetracyclines and cycloheximide and related compounds serves as example. Examples of molecular biological and bioinformatics methods used in the study of antibiotic biogenesis are described both in terms of its historical aspects and the current knowledge.
- MeSH
- antibakteriální látky biosyntéza metabolismus MeSH
- dějiny 20. století MeSH
- dějiny 21. století MeSH
- metabolické sítě a dráhy genetika MeSH
- objevování léků dějiny MeSH
- výpočetní biologie MeSH
- Check Tag
- dějiny 20. století MeSH
- dějiny 21. století MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- historické články MeSH
- přehledy MeSH
Electrospray ionization-tandem mass spectrometry (ESI-MS/MS) was used for characterizing intact plasmalogen phospholipid molecules in beer-spoilage bacteria. Identification of intact plasmalogens was carried out using collision-induced dissociation and the presence of suitable marker molecular species, both qualitative and quantitative, was determined in samples containing the anaerobic bacteria Megasphaera and Pectinatus. Using selected ion monitoring (SIM), this method had a limit of detection at 1 pg for the standard, i.e. 1-(1Z-octadecenyl)-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine and be linear in the range of four orders of magnitude from 2 pg to 20 ng. This technique was applied to intact plasmalogen extracts from the samples of contaminated and uncontaminated beer without derivatization and resulted in the identification of contamination of beer by Megasphaera and Pectinatus bacteria. The limit of detection was about 830 cells of anaerobic bacteria, i.e. bacteria containing natural cyclopropane plasmalogenes (c-p-19:0/15:0), which is the majority plasmalogen located in both Megasphaera and Pectinatus. The SIM ESI-MS method has been shown to be useful for the analysis of low concentration of plasmalogens in all biological samples, which were contaminated with anaerobic bacteria, e.g. juice, not only in beer. Significance and impact of the study: Electrospray ionization-tandem mass spectrometry (ESI-MS/MS) using collision-induced dissociation was used to characterize intact plasmalogen phospholipid molecules in beer-spoilage anaerobic bacteria Megasphaera and Pectinatus. Using selected ion monitoring (SIM), this method has a detection limit of 1 pg for the standard 1-(1Z-octadecenyl)-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine and is linear within four orders of magnitude (2 pg to 20 ng). The limit of detection was about 830 cells of bacteria containing natural cyclopropane plasmalogen (c-p-19:0/15:0). SIM ESI-MS method is useful for analyzing low concentrations of plasmalogens in biological samples contaminated with anaerobic bacteria, e.g. beer or juice.
- MeSH
- hmotnostní spektrometrie s elektrosprejovou ionizací MeSH
- limita detekce MeSH
- Megasphaera klasifikace izolace a purifikace metabolismus MeSH
- Pectinatus klasifikace izolace a purifikace metabolismus MeSH
- pivo mikrobiologie MeSH
- plasmalogeny analýza MeSH
- potravinářská mikrobiologie metody MeSH
- tandemová hmotnostní spektrometrie MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- MeSH
- antibakteriální látky izolace a purifikace terapeutické užití MeSH
- finanční podpora výzkumu jako téma MeSH
- interpretace statistických dat MeSH
- ivermektin chemie izolace a purifikace terapeutické užití MeSH
- naftoly chemie izolace a purifikace MeSH
- Streptomyces chemie izolace a purifikace růst a vývoj MeSH
- MeSH
- aminokyseliny metabolismus MeSH
- bakteriální polysacharidy metabolismus MeSH
- bakteriální toxiny metabolismus MeSH
- finanční podpora výzkumu jako téma MeSH
- hydroxykyseliny metabolismus MeSH
- lipidy MeSH
- metabolismus lipidů MeSH
- Nostoc chemie klasifikace metabolismus MeSH
- oligopeptidy metabolismus MeSH
- přehledová literatura jako téma MeSH
- sloučeniny dusíku MeSH
- MeSH
- antibakteriální látky farmakologie chemie metabolismus MeSH
- antiprotozoální látky farmakologie chemie metabolismus MeSH
- bakteriální proteiny genetika metabolismus MeSH
- léková rezistence MeSH
- lidé MeSH
- makrolidy farmakologie chemie metabolismus MeSH
- regulace genové exprese MeSH
- Streptomyces metabolismus MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- zvířata MeSH
- MeSH
- antiinfekční látky farmakologie terapeutické užití MeSH
- antiprotozoální látky farmakologie terapeutické užití MeSH
- Eukaryota účinky léků MeSH
- finanční podpora výzkumu jako téma MeSH
- gramnegativní bakterie účinky léků MeSH
- grampozitivní bakterie účinky léků MeSH
- klindamycin farmakologie MeSH
- lidé MeSH
- linkomycin farmakologie MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- zvířata MeSH
