Despite the growing number of immune repertoire sequencing studies, the field still lacks software for analysis and comprehension of this high-dimensional data. Here we report VDJtools, a complementary software suite that solves a wide range of T cell receptor (TCR) repertoires post-analysis tasks, provides a detailed tabular output and publication-ready graphics, and is built on top of a flexible API. Using TCR datasets for a large cohort of unrelated healthy donors, twins, and multiple sclerosis patients we demonstrate that VDJtools greatly facilitates the analysis and leads to sound biological conclusions. VDJtools software and documentation are available at https://github.com/mikessh/vdjtools.
- MeSH
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- dvojčata genetika MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mladý dospělý MeSH
- receptory antigenů T-buněk chemie genetika metabolismus MeSH
- roztroušená skleróza genetika MeSH
- sekvenční analýza DNA metody MeSH
- shluková analýza MeSH
- software * MeSH
- transplantace hematopoetických kmenových buněk MeSH
- výpočetní biologie metody MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mladý dospělý MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
PhDr. Hana Drábková oslavila v květnu roku 2014 své devadesáté narozeniny. Článek se zabývá nejen její profesní dráhou a ojedinělým dílem na poli psychologie, ale připomíná i jejího otce, prof. Alberta Pražáka, významného českého literárního vědce.
PhDr. Hana Drábková celebrated her ninetieth birthday in May 2014. The paper is focused not only on her professional career and unique work in the field of psychology but it also reminds her father, prof. Albert Pražák, an important Czech literary scholar.
- MeSH
- biografie jako téma MeSH
- dějiny 20. století MeSH
- dějiny 21. století MeSH
- dvojčata genetika MeSH
- filozofie dějiny MeSH
- inteligence genetika MeSH
- klinická psychologie * dějiny MeSH
- lidé MeSH
- literatura dějiny MeSH
- longitudinální studie * MeSH
- psychologie * dějiny MeSH
- společnosti lékařské MeSH
- významné osobnosti MeSH
- Check Tag
- dějiny 20. století MeSH
- dějiny 21. století MeSH
- lidé MeSH
- Publikační typ
- biografie MeSH
- zprávy MeSH
- MeSH
- AGRP protein analýza MeSH
- celogenomová asociační studie MeSH
- draslíkové kanály aktivované vápníkem analýza MeSH
- dvojčata genetika MeSH
- fenotyp MeSH
- genetická predispozice k nemoci * MeSH
- genetické asociační studie * MeSH
- lidé MeSH
- mozkový neurotrofický faktor analýza MeSH
- polymorfismus genetický MeSH
- poruchy příjmu potravy * genetika MeSH
- proteiny přenášející noradrenalin přes plazmatickou membránu analýza MeSH
- receptory opiátové delta analýza MeSH
- receptory pro estrogeny analýza MeSH
- rodina MeSH
- selektivní inhibitory zpětného vychytávání serotoninu farmakokinetika terapeutické užití MeSH
- serotonin biosyntéza fyziologie genetika MeSH
- tryptofan fyziologie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
Cíl studie: Analýza rozdílného vývoje vrozených vývojových vad (VVV) u dvojčat a u novorozenců z jednočetných těhotenství v ČR v období 1996-2007 v mezinárodním srovnání. Typ studie: Retrospektivní epidemiologická studie. Materiál a metodika: Použity byly jednak celostátní údaje z Národního registru vrozených vad v ČR, který je veden v Ústavu zdravotnických informací a statistiky České republiky (ÚZIS ČR) za období let 1996-2007, jednak vybrané údaje ze Zprávy o rodičce, rovněž vedené v ÚZIS ČR z roku 2006. Výsledky analýzy byly srovnány s výsledky obdobných studií ve vyspělých zemích. Výsledky: Zjištěný zvýšený celostátní nárůst VVV u dvojčat, jak v absolutních počtech v souvislosti s nárůstem dvojčat, tak v počtu na 10 000 živě narozených, který v průběhu analyzovaného období byl vždy vyšší než u novorozenců z jednočetných těhotenství (jedináčků), byl shodný s výsledky studií z vybraných evropských zemí. Vyšší výskyt VVV byl i u novorozenců matek, které otěhotněly po IVF + ET, což se opět shodovalo s výsledky ojedinělých zahraničních studií toho druhu. Závěr: Výskyt VVV u dvojčat v analyzovaném období v ČR narůstal a byl vyšší než u jedináčků. Byl vyšší u novorozenců matek, které otěhotněly po IVF + ET než po přirozeném otěhotnění. Tyto výsledky se shodovaly se zahraničními studiemi.
Aim of study: Analysis of different development of congenital anomalies among twins and among singletons in the Czech Republic during 1996-2007 in international context. Type of study: Retrospective epidemiological study. Material and methods: Nation-wide data from National Registry of congenital anomalies in the Czech Republic by the Institute for Health Information and Statistics (IHIS) for 1996-2007 and selected data from Report on Mothers at Childbirth database by the IHIS for 1996. The results were compared to similar international data in developed countries. Results: The increase of congenital anomalies found in twins in absolute figures due to increase of twin pregnancies as well as per 10 000 live-born babies was always higher during the observed period than among singletons. This pattern was identical with results of similar studies in selected European countries. There were also more anomalies among newborns of mothers after IVF + ET which was in agreement with scarce foreign studies of this type. Conclusion: Incidence of congenital anomalies among twins in the Czech Republic increased during the study period and was higher than among singletons. It was also higher among newborns of mothers after IVF + ET than among spontaneously conceived women. These results were in agreement with other international studies.
- Konspekt
- Obecná genetika. Obecná cytogenetika. Evoluce
- NLK Obory
- genetika, lékařská genetika
- genetika, lékařská genetika
- NLK Publikační typ
- elektronické časopisy
- MeSH
- dítě MeSH
- dvojčata dizygotní MeSH
- dvojčata monozygotní MeSH
- dvojčata genetika MeSH
- lidé MeSH
- průzkumy a dotazníky MeSH
- výchova dítěte MeSH
- vztahy mezi rodiči a dětmi MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
- přehledy MeSH
- srovnávací studie MeSH
- studie na dvojčatech MeSH
elektronický časopis
- Konspekt
- Obecná genetika. Obecná cytogenetika. Evoluce
- NLK Obory
- genetika, lékařská genetika
- genetika, lékařská genetika
- NLK Publikační typ
- elektronické časopisy
- MeSH
- dospělí MeSH
- dvojčata genetika výchova MeSH
- extraverze (psychologie) MeSH
- introverze (psychologie) MeSH
- lidé MeSH
- neurotické poruchy genetika MeSH
- osobnostní testy MeSH
- výchova dítěte MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- srovnávací studie MeSH
