Using expression profiling arrays we will identify intracellular (from endomyocardial biopsies) as well as circulating (from plasma, urine and peripheral blood mononuclear cells) miRNAs that will distinguish heart transplant patients with graft rejection from those without rejection; different miRNA profile during cellular and antibody-mediated rejection will be identified. We will further validate panel of miRNAs that will enable more comfort and non-invasive detection of both types of rejection without the need of economically and technically demanding invasive diagnostics.

S využitím expresního profilováni identifikujeme intracelulární (z endomyokardiálních biopsií) a cirkulující (z plasmy, moči a periferních mononukleárních buněk) miRNA, které rozliší pacienty po srdeční transplantaci prodělávající rejekci od jedinců bez rejekce; dále identifikujeme profil miRNA, který od sebe odliší buněčnou rejekci od rejekce zprostředkované protilátkami. Následně validujeme panel miRNA, který umožní komfortnější neinvazivní detekci obou typů rejekce srdečního štěpu, bez nutnosti ekonomicky i technicky náročné invazivní diagnostiky.

• MeSH
• analýza moči metody   MeSH
• biochemická analýza krve metody   MeSH
• biologické markery analýza   MeSH
• biopsie metody   MeSH
• cirkulující mikroRNA analýza   MeSH
• lidé MeSH
• mikro RNA analýza   MeSH
• rejekce štěpu diagnóza   MeSH
• reprodukovatelnost výsledků MeSH
• senzitivita a specificita MeSH
• transplantace srdce MeSH
• vysoce účinné nukleotidové sekvenování metody   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• transplantologie
• kardiologie
• biochemie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Pancreatic ductal adenocarcinoma is one of the most malignant types of cancer. The main reasons of high mortality are late diagnosis and low effectiveness of conventional radiotherapy and chemotherapy. Therefore, the radical surgical resection together with adjuvant chemotherapy is the only chance for long-term survival. Unfortunately, most of the patients are diagnosed with local advanced or metastatic disease without the possibility of radical surgery. Finally, there is no clear clinical indication for radical resection in case of borderline resectable pancreatic cancer when surgery is associated with significant morbidity. The aim of this project is to determine the classifier enabling the precise classification of pancreatic lesions based on the expression profiles of microRNAs in blood plasma. Moreover, microRNAs with prognostic potential will be identified with the goal to select patients who will not benefit from the surgical resection that will lead to lower morbidity and therefore better quality of life of these patients.

Karcinomy slinivky břišní patří mezi nejzhoubnější nádorová onemocnění. Hlavními důvody vysoké mortality jsou stanovení diagnózy v pokročilých stádiích a nízká účinnost konvenční radioterapie a chemoterapie. Za jedinou potenciálně kurativní léčebnou metodu je proto stále považována radikální chirurgická resekce kombinovaná s adjuvantní chemoterapií. Velká část pacientů je však diagnostikována ve stádiu lokálně pokročilého či metastatického onemocnění, a nemohou tak podstoupit radikální resekční výkon. Otázkou dále zůstává indikace radikální resekce u hraničně resekabilního onemocnění, kdy je potřeba vzít v úvahu vysokou morbiditu spojenou s tímto výkonem. Cílem navrhovaného projektu je sestavit klasifikátor, který umožní přesnou klasifikaci pankreatických lézí pomocí expresních profilů mikroRNA v krevní plazmě. Nedílnou součástí projektu bude nalezení miRNA s prognostickým potenciálem, na základě jejichž exprese bude možné identifikovat pacienty neprofitující z chirurgické léčby, což povede k významnému snížení celkové morbidity, a tedy lepší kvalitě života pacientů.

• MeSH
• adenokarcinom chirurgie   diagnóza   MeSH
• chirurgie trávicího traktu metody   MeSH
• cirkulující mikroRNA analýza   MeSH
• duktální karcinom pankreatu chirurgie   diagnóza   MeSH
• krevní plazma MeSH
• lidé MeSH
• nádorové biomarkery analýza   MeSH
• prognóza MeSH
• výběr pacientů MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkochirurgie
• gastroenterologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Alteration of the microRNA regulatory network is one of the key events in pathogenesis of wide range of malignancies including rectal cancer. MicroRNAs are abundant and could be determined not only in tumor tissue, but also in blood plasma, where they were proved to be highly stable. In our study, by use of genome-wide expression analysis of microRNAs we plan to identify microRNAs (i) enabling sensitive prediction of therapeutic response to neoadjuvant chemoradiotherapy, and consequently, in combination with results of MRI/TRUS, (ii) to improve diagnostic accuracy of restaging (mainly in regards to T and N stage, positivity of resection margins and CRM) after this treatment. Prediction of therapeutic response would enable more individualized indication of this therapy only to patients expected to have clinical benefit. Improvement of the restaging accuracy will enable more precise planning of the surgery treatment and as a consequence better therapeutic results.

Porucha regulační mikroRNA je jednou z klíčových událostí v patogenezi celé řady nádorových onemocnění včetně karcinomu rekta. MikroRNA jsou abundantní a identifikovatelné nejen v nádorové tkáni, ale také v krevní plazmě a vykazují zde vysokou míru stability. V rámci naší studie chceme pomocí vysokokapacitní analýzy mikroRNA v tkáni/krevní plazmě pacientů s karcinomem rekta identifikovat mikroRNA, které (i) umožní predikovat léčebnou odpověď na neodajuvantní chemoradioterapii a následně v kombinaci s nálezy zobrazovacích metod (TRUS, MRI), (ii) zpřesní hodnocení léčebné odpovědi = restaging (především změny na úrovni T a N stádia a postižení resekčních okrajů, CRM) po ukončení této léčby. Predikce léčebné odpovědi na neoadjuvantní chemoradioterapii by umožnila její individualizované podání pouze pacientům, u kterých je předpokládán klinický benefit. Zdokonalení restagingu umožní přesnější plánování chirurgické léčby a následně také lepší léčebné výsledky.

• MeSH
• cirkulující mikroRNA analýza   MeSH
• krevní plazma MeSH
• kvantitativní polymerázová řetězová reakce MeSH
• lidé MeSH
• nádorové biomarkery analýza   MeSH
• nádory rekta farmakoterapie   MeSH
• neoadjuvantní terapie MeSH
• staging nádorů MeSH
• výsledek terapie MeSH
• vysoce účinné nukleotidové sekvenování MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• koloproktologie
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Successful treatment of cancer depends on early diagnosis and effective monitoring of patients' response to therapy. Traditional tools based on tumor biopsies lack the sensitivity and specificity to capture cancer development in its early phases and are not applicable for continuous monitoring. To overcome these barriers, liquid biopsies have been introduced as a minimally invasive and cost-efficient means of diagnosis with high level of specificity and sensitivity. Traditionally, liquid biopsy markers include circulating tumor cells and circulating tumor DNA. During the last decade, a new promising group of biomarkers has appeared and its utilization for cancer diagnosis and monitoring is intensively studied - the microRNAs (miRNAs). In this review, we provide a comprehensive overview of circulating miRNA analysis. We highlight the importance of sampling and quality control, discuss the technical aspects of miRNA extraction and quantification, summarize recommendations for downstream analysis and conclude with future perspectives. Taken together, we present the current state of knowledge in the field of miRNA analysis in liquid biopsies and the expected development and standardization.

• MeSH
• cirkulující mikroRNA analýza   izolace a purifikace   MeSH
• lidé MeSH
• nádorové biomarkery genetika   MeSH
• nádory diagnóza   genetika   terapie   MeSH
• odběr biologického vzorku metody   MeSH
• řízení kvality MeSH
• tekutá biopsie MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• přehledy MeSH