• MeSH
• Web Browser MeSH
• Neurodegenerative Diseases MeSH
• Protein Aggregation, Pathological MeSH

Kancelářský balík programů Microsoft Office je nejpoužívanějším kancelářským programem. I nové verze aplikací Office 365/Microsoft 365 jsou důkazem jeho oblíbenosti. Další průvodce z pera zkušeného autora byl napsán formou krátkých tipů a triků, kde představí jednotlivé možnosti tak, abyste rychle našli to, co v dané aplikaci potřebujete udělat.; Průvodce je napsán formou krátkých tipů a triků, které představí jednotlivé možnosti tak, abyste rychle našli přesně to, co v dané aplikaci potřebujete udělat.Text knihy je rozdělen do pěti částí. První obecná část je věnována činnostem, které jsou pro všechny aplikace společné: instalace, nastavení aplikací, práce se soubory, dokumenty a daty, i využití webových úložišť. Další specializované části popisují funkce hlavních aplikací, Word, Excel, PowerPoint a Outlook, které jdou s dobou a stále více jsou propojení se světem internetu.

The binding of microRNAs (miRNAs) to their target sites is a complex process, mediated by the Argonaute (Ago) family of proteins. The prediction of miRNA:target site binding is an important first step for any miRNA target prediction algorithm. To date, the potential for miRNA:target site binding is evaluated using either co-folding free energy measures or heuristic approaches, based on the identification of binding 'seeds', i.e., continuous stretches of binding corresponding to specific parts of the miRNA. The limitations of both these families of methods have produced generations of miRNA target prediction algorithms that are primarily focused on 'canonical' seed targets, even though unbiased experimental methods have shown that only approximately half of in vivo miRNA targets are 'canonical'. Herein, we present miRBind, a deep learning method and web server that can be used to accurately predict the potential of miRNA:target site binding. We trained our method using seed-agnostic experimental data and show that our method outperforms both seed-based approaches and co-fold free energy approaches. The full code for the development of miRBind and a freely accessible web server are freely available.

• MeSH
• Algorithms MeSH
• Argonaute Proteins genetics   metabolism   MeSH
• Deep Learning * MeSH
• MicroRNAs * genetics   metabolism   MeSH
• Computational Biology methods   MeSH
• Publication type
• Journal Article MeSH
• Research Support, Non-U.S. Gov't MeSH

Vývoj v oblasti IT se neustále posouvá kupředu, staré technologie odcházejí a uvolňují místo novým a modernějším. Operační systém Windows je ale stále zde a nadále nám spolehlivě slouží. Jeho poslední verzí jsou Windows 11, které přinášejí celou řadu novinek, modernizací i zdokonalení toho, co se osvědčilo ve verzích předchozích.; Vývoj v oblasti IT se neustále posouvá kupředu, staré technologie odcházejí a uvolňují místo novým a modernějším. Operační systém Windows je ale stále zde a nadále nám spolehlivě slouží. Jeho poslední verzí jsou Windows 11, které přinášejí celou řadu novinek, modernizací i zdokonalení toho, co se osvědčilo ve verzích předchozích. Kniha je určena jak úplným začátečníkům, tak uživatelům, kteří tento operační systém používají už dlouhou dobu. Je koncipována tak, aby bylo možné rychle a efektivně najít přesně tu informaci, kterou ke své práci právě potřebují, ať už se týká nastavení systému, práce s aplikacemi, řešení různých problémů či vyhledání souvisejících informací. Práce s Windows 11 je rozdělena do deseti větších celků (instalace Windows 11, základní práce s operačním systémem, aplikace, multimédia, uživatelské účty, internet a sdílení, hardware, diskové jednotky, zálohování a obnovení, pokročilá práce se systémem). Každý celek se dělí na krátké kapitoly, které jsou vždy věnované konkrétnímu dílčímu tématu (od základních až po pokročilé). Nechybí ani rozsáhlý přehled známých i méně známých klávesových zkratek.

The transplantation of loops between structurally related proteins is a compelling method to improve the activity, specificity and stability of enzymes. However, despite the interest of loop regions in protein engineering, the available methods of loop-based rational protein design are scarce. One particular difficulty related to loop engineering is the unique dynamism that enables them to exert allosteric control over the catalytic function of enzymes. Thus, when engaging in a transplantation effort, such dynamics in the context of protein structure need consideration. A second practical challenge is identifying successful excision points for the transplantation or grafting. Here, we present LoopGrafter (https://loschmidt.chemi.muni.cz/loopgrafter/), a web server that specifically guides in the loop grafting process between structurally related proteins. The server provides a step-by-step interactive procedure in which the user can successively identify loops in the two input proteins, calculate their geometries, assess their similarities and dynamics, and select a number of loops to be transplanted. All possible different chimeric proteins derived from any existing recombination point are calculated, and 3D models for each of them are constructed and energetically evaluated. The obtained results can be interactively visualized in a user-friendly graphical interface and downloaded for detailed structural analyses.

• MeSH
• Internet MeSH
• Models, Molecular MeSH
• Protein Engineering MeSH
• Proteins * genetics   chemistry   MeSH
• Software * MeSH
• Publication type
• Journal Article MeSH
• Research Support, Non-U.S. Gov't MeSH

Employability is a major goal of higher education, according to the European University Association (EUA). As a result, a competency-based approach to education is critical. The representation of a standardized job profile in the field of medical informatics, based on the most common labour market criteria, is critical for identifying and communicating the learning goals associated with these capabilities. We took numerous job adverts from the job marketplace to find out what the most prevalent needs were. We used web crawling, web extraction, and text mining as part of a programme we wrote in R using the “rvest” library. Many job adverts remained after we removed duplicates and filtered for occupations that required a bachelor’s degree, from which we retrieved qualification terms. Professional competence, soft skills, teamwork, procedures, learning, and problem-solving abilities were divided into six categories. Employee soft skills studies have yielded comparable findings. Programming, experience, project, and server were the most often used terms. The value of experience is our second significant conclusion, emphasizing the importance of practical skills. Surveys and narrative accounts were employed in previous investigations. This is the first-time web crawling, web extraction, and text mining have been used in a study. Soft skills and specialist expertise are given equal weight in our studies. The findings of this study could be useful in the development of medical informatics curriculum.

Teicoplanin is a natural lipoglycopeptide antibiotic with a similar activity spectrum as vancomycin; however, it has with the added benefit to the patient of low cytotoxicity. Both teicoplanin and vancomycin antibiotics are actively used in medical practice in the prophylaxis and treatment of severe life-threatening infections caused by gram-positive bacteria, including methicillin-resistant Staphylococcus aureus, Enterococcus faecium and Clostridium difficile. The expression of vancomycin Z (vanZ), encoded either in the vancomycin A (vanA) glycopeptide antibiotic resistance gene cluster or in the genomes of E. faecium, as well as Streptococcus pneumoniae and C. difficile, was shown to specifically compromise the antibiotic efficiency through the inhibition of teicoplanin binding to the bacterial surface. However, the exact mechanisms of this action and protein structure remain unknown. In this study, the three-dimensional structure of VanZ from E. faecium EnGen0191 was predicted by using the I-TASSER web server. Based on the VanZ structure, a benzimidazole based ligand was predicted to bind to the VanZ by molecular docking. Importantly, this new ligand, named G3K, was further confirmed to specifically inhibit VanZ-mediated resistance to teicoplanin in vivo.

• MeSH
• Anti-Bacterial Agents pharmacology   MeSH
• Drug Resistance, Bacterial drug effects   MeSH
• Bacterial Proteins metabolism   MeSH
• Gram-Positive Bacterial Infections drug therapy   MeSH
• Gram-Positive Bacteria drug effects   MeSH
• Humans MeSH
• Lipoglycopeptides pharmacology   MeSH
• Microbial Sensitivity Tests methods   MeSH
• Molecular Docking Simulation methods   MeSH
• Teicoplanin pharmacology   MeSH
• Vancomycin pharmacology   MeSH
• Check Tag
• Humans MeSH
• Publication type
• Journal Article MeSH

R-loops are common non-B nucleic acid structures formed by a three-stranded nucleic acid composed of an RNA-DNA hybrid and a displaced single-stranded DNA (ssDNA) loop. Because the aberrant R-loop formation leads to increased mutagenesis, hyper-recombination, rearrangements, and transcription-replication collisions, it is regarded as important in human diseases. Therefore, its prevalence and distribution in genomes are studied intensively. However, in silico tools for R-loop prediction are limited, and therefore, we have developed the R-loop tracker tool, which was implemented as a part of the DNA Analyser web server. This new tool is focused upon (1) prediction of R-loops in genomic DNA without length and sequence limitations; (2) integration of R-loop tracker results with other tools for nucleic acids analyses, including Genome Browser; (3) internal cross-evaluation of in silico results with experimental data, where available; (4) easy export and correlation analyses with other genome features and markers; and (5) enhanced visualization outputs. Our new R-loop tracker tool is freely accessible on the web pages of DNA Analyser tools, and its implementation on the web-based server allows effective analyses not only for DNA segments but also for full chromosomes and genomes.

• MeSH
• Algorithms * MeSH
• DNA chemistry   genetics   MeSH
• Genomics methods   MeSH
• Internet statistics & numerical data   MeSH
• Humans MeSH
• Genomic Instability * MeSH
• R-Loop Structures * MeSH
• Software MeSH
• Check Tag
• Humans MeSH
• Publication type
• Journal Article MeSH

Publikace vás naučí pracovat s uživatelsky přívětivým redakčním systémem, který vám pomůže vytvořit krásné webové stránky, blogy nebo jiné aplikace a spravovat je při jejich provozu.; Příručka zabývající se jedním z nejpoužívanějších nástrojů pro tvorbu webových stránek - redakčním systémem WordPress.

Publikace si klade za cíl, jako první dílo na trhu, komplexně postihnout a popsat aspekty i principy webové kartografie.; Publikace si klade za cíl, jako první dílo na trhu, komplexně postihnout a popsat aspekty i principy webové kartografie. První čistě teoretická část přináší jednoznačné vymezení pojmů a uvedení čtenáře do kontextu. Druhá část publikace popisuje jednotlivé aspekty webové kartografie, včetně pilířů pro vlastní tvorbu mapových aplikací: data a knihovny. Publikace je koncipována jako soubor pravidel, zásad, doporučení a metod pro autory webových map. Čtenář této monografie by se po jejím prostudování měl jednoznačně orientovat v aspektech a principech webové kartografie, správně pojmenovat dané termíny, a v neposlední řadě by měl pochopit proces tvorby webové mapy s veškerými kartografickými náležitostmi.