chromosome banding Dotaz Zobrazit nápovědu
We present the karyotype characteristics of five cytotypes of mole rats (Nannospalax) with 56 chromosomes revealed by the C-banding and AgNOR staining analyses. We attempt to investigate if the specific distinction between the populations from Thrace (N. leucodon) and Anatolia (N. xanthodon) is reflected also in their karyotypic differentiation. The specimens from each of the five populations studied revealed a distinct karyotype which was different from those found in other populations. The fundamental number of autosomal arms varied from 68 to 72. The amount of C-heterochromatin was larger in the Thrace sample of N. leucodon compared to the Anatolian population of N. xanthodon. The active NOR sites were recorded on five autosomal pairs in N. leucodon, whereas only three or four pairs bearing NOR were observed in N. xanthodon. Differences between the studied populations were quantified in the analysis of the distribution pattern of the C-positive bands and the AgNOR sites in individual chromosomes which indicated a basal position of the Thrace sample of N. leucodon and its divergence from other studied populations. The karyotypes of the 56-chromosome populations of N. leucodon and N. xanthodon are thus distinctly different.
- MeSH
- druhová specificita MeSH
- karyotyp * MeSH
- mikroftalmičtí podzemní hlodavci MeSH
- pruhování chromozomů * MeSH
- savčí chromozomy genetika MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- srovnávací studie MeSH
- Geografické názvy
- Turecko MeSH
104 s. : il., tab. ; 24 cm
- MeSH
- genetické techniky MeSH
- pruhování chromozomů trendy MeSH
- Publikační typ
- vysokoškolské kvalifikační práce MeSH
- Konspekt
- Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
- NLK Obory
- biologie
- histologie
Východiska:Chromozomové změny patří u chronické lymfocytární leukemie (CLL) mezi významné prognostické faktory. Hlavní metodou využívanou k detekci těchto chromozomových změn je fluorescenční in situ hybridizace (FISH), klasické cytogenetické vyšetření vyžadující buňky v metafázi je u CLL problematické kvůli nízké proliferační schopnosti maligních B-lymfocytů in vitro. V roce 2006 byla publikována metoda umožňující získat metafázní B-lymfocyty u CLL s využitím stimulace pomocí IL‐2 a CpG oligonukleotidem DSP30. Cílem naší studie bylo ověřit účinnost stimulace a zhodnotit využitelnost této metody v rutinní praxi. Soubor pacientů a metody: Celkem u 369 pacientů s diagnózou CLL byla vyšetřována periferní krev klasickou cytogenetickou metodou a současně metodou FISH pro oblasti 13q14, 11q22–23, CEP12 a 17p13. Výsledky: Pro klasické cytogenetické vyšetření se stimulací podařilo získat metafázní buňky u 307 (83 %) z 369 pacientů. Chromozomové změny byly nalezeny u 243 (79 %) ze 307 hodnocených pacientů. Kromě aberací vyšetřovaných metodou FISH byly nalezeny další specifické změny v karyotypu např. del(6q), del(14q), t(14;18)(q32;q21), t(11;14)(q13;q32) a t(18;22)(q21;q11). U 103 (42 %) pacientů byly cytogenetickým vyšetřením nalezeny komplexní změny karyotypu, které metodou FISH detekovány nebyly. Závěr: Stimulace pomocí IL‐2 a oligonukleotidu DSP30 účinně navozuje dělení maligních B‐lymfocytů a umožňuje zachytit velké množství chromozomových změn u CLL, které by při vyšetřování metodou FISH pro základní čtyři aberace zůstaly skryty. Používání této metody v rutinní praxi se osvědčilo hlavně při identifikaci pacientů s komplexními změnami karyotypu.
Background: Chromosomal aberrations play an important role as prognostic factors in chronic lymphocytic leukemia (CLL). These aberrations are mostly detected by fluorescent in situ hybridization (FISH), as chromosomal banding analysis has been scarce due to low proliferative activity of malignant B-lymphocytes in vitro. In 2006, a new method using stimulation with IL-2 and CpG oligonucleotide DSP30 for metaphase generation in CLL was published [1]. The objective of our study was to verify the efficacy of stimulation and to evaluate if the method is suitable for routine diagnostics. Patients and Methods: In total, peripheral blood samples of 369 CLL patients were analyzed in parallel by chromosomal banding analysis and by FISH probes for 13q14, 11q22–23, CEP12 and 17p13. Results: Out of 369 patients, 307 (83%) were successfully stimulated for metaphase generation. Chromosomal aberrations were detected in 243 (79%) out of 307 patients evaluated by chromosomal banding analysis. Other aberrations that are not included into standard FISH panel were detected in patients’ karyotypes, e.g. del(6q), del(14q), t(14;18)(q32;q21), t(11;14)(q13;q32) and t(18;22)(q21;q11). One hundred and three (42%) patients showed complex aberrant karyotype not detected by FISH analysis. Conclusion: Stimulation with IL-2 and oligonucleotide DSP30 is an efficient method how to induce proliferation of malignant B-lymphocytes and allows detection of a substantial number of chromosomal aberrations in addition to those detected by standard FISH panel. Using this method in routine diagnostics is helpful particularly in identification of patients with complex aberrant karyotype.
- Klíčová slova
- CpG‐ODN DSP30,
- MeSH
- chromozomální aberace * MeSH
- chromozomální delece MeSH
- chronická lymfatická leukemie * genetika MeSH
- cytogenetické vyšetření * statistika a číselné údaje využití MeSH
- dospělí MeSH
- hybridizace in situ fluorescenční * MeSH
- interleukin-2 MeSH
- karyotyp MeSH
- krev MeSH
- kultivované buňky MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- oligonukleotidy MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- translokace genetická MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
Molecular biology intelligence unit
[1st ed.] 185 s.
- Konspekt
- Obecná genetika. Obecná cytogenetika. Evoluce
- NLK Obory
- genetika, lékařská genetika
- biologie