Úkolem této studie je porozumění změn v genové expresi na buněčné úrovni v souvislosti se zablokováním exprese COX1 resp. COX2 pomocí RNA interference (RNAi). Pomocí RNAi, syntetických siRNA nebo shRNA exprimujících plasmidů či retrovirů, budou vytvořenybuněčné linie se zablokovanou expresí COX1 resp. COX2. Profil genové exprese bude určen pomocí DNA mikročipů srovnáním s mateřskou linií a ověřením pomocí real-time PCR. Na základě prvních výsledků bude sestaven experimentální jednoúčelový DNA mikročipobsahující vybrané geny. Na základě výsledků bude posouzena fyziologická funkce COX1 a COX2 v souvislosti s absencí jedné z izoforem.; The aim of this study is to better understand the cellular gene expression changes upon the RNA interference (RNAi) mediated down-regulation of COX1 resp. COX2 gene expression. The corresponding cell-lines with COX1 resp. COX2 gene expression down regulated will be constructed via RNAi, the synthetic siRNA or plasmid or retrovirus mediated shRNA expression, respectively. The gene expression profile will be determined by DNA microarrays comparing the gene expression with parental cell-line. Based on theresults, experimental, single-purpose DNA microarray containing selected genes will be constructed. Altered physiological function of COX1 resp. COX2 in the absence of one of the isoforms will be discussed.

• MeSH
• cyklooxygenasa 1 fyziologie   MeSH
• cyklooxygenasa 2 fyziologie   MeSH
• exprese genu MeSH
• inhibitory cyklooxygenasy škodlivé účinky   MeSH
• malá interferující RNA MeSH
• mikročipové analytické postupy MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• RNA interference MeSH
• zánět MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• biologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

• MeSH
• diagnostické testy rutinní ekonomika   MeSH
• lidé MeSH
• obchod MeSH
• paternita MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• úvodníky MeSH

• MeSH
• antigeny krevních skupin MeSH
• DNA fingerprinting MeSH
• etika MeSH
• motivace MeSH
• otcové MeSH
• paternita MeSH

Projekt je zaměřen na vývoj obecného systému pro multiplexní detekci bodových mutací v lidské proveditelnosti celé metody omezeným multiplexním způsobem; Project is focused on creating a system for multiplex detection of defined point mutations in human DNA,on feasibility study of every single step of the system and on feasibility study of the entire system as a whole.

• MeSH
• diagnostické techniky molekulární MeSH
• genetické testování MeSH
• mutace MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• biologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Detekce mutací v exonech 14,16,20,23 genu pro těžký řetězec beta-myosinu (MYH7) pomocí DGGE, SSCP na kapilární elektroforéze a přímé sekvenace. Mutace na DNA v genu MYH7 jsou častou příčinou familiárních hypertrofických kardiomyopatií.; Detetion of mutations in exons 14,16,20.23 of gene coding for heavy chain of B-myosin(MYH7)by means of DGGE,SSCP on capillary electrophoresis and direct sequencing. Mutations on DNA of MYH7 are frequent cause of familiar hypertrophic cardiomyopathies.

• MeSH
• familiární hypertrofická kardiomyopatie genetika   MeSH
• genetické testování metody   MeSH
• mutace MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• polymorfismus konformace jednovláknové DNA MeSH
• těžké řetězce myosinu genetika   MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• kardiologie
• biologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

• MeSH
• amplifikace genu MeSH
• dospělí MeSH
• exony MeSH
• hypertrofická kardiomyopatie genetika   patologie   MeSH
• lidé MeSH
• mutace MeSH
• srdeční myosiny genetika   MeSH
• těžké řetězce myosinu genetika   MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• kazuistiky MeSH

Detekce mutací v exonu 13 genů pro těžký řetěz beta-myosinu s cílem vypracovat metodu detekce na principu DGGE.

• MeSH
• hypertrofická kardiomyopatie genetika   MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• embryologie a teratologie
• kardiologie
• angiologie
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

• MeSH
• exony MeSH
• hypertrofická kardiomyopatie genetika   MeSH
• lidé MeSH
• mutace MeSH
• plošný screening MeSH
• těžké řetězce myosinu analýza   genetika   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

Detekce mutací v ras-řadě onkogenů u vzorků tkáně nádoru a jejich metastáz pomocí DGGE a jejich charakteristika.

• MeSH
• mutace MeSH
• mutageneze MeSH
• onkogeny MeSH
• protoonkogenní proteiny p21(ras) MeSH

• Konspekt
• Obecná genetika. Obecná cytogenetika. Evoluce
• NLK Obory
• onkologie
• embryologie a teratologie
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Detekce mutací v ras-řadě onkogenů u vzorků tkáně nádoru a jejich metastáz pomocí reversního dot blotingu a jejich charakteristika jako doplněk DGGE metod.

• MeSH
• imunoblotting metody   MeSH
• onkogeny analýza   MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• embryologie a teratologie
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR