Cíl práce: Cílem studie bylo získat aktuální informace o prevalenci a druhovém zastoupení bakterií rodu Campylobacter u psů na Moravě a zhodnotit rizikové faktory ovlivňující jejich výskyt s ohledem na možný přenos do humánní populace. Materiál a metody: Od května 2013 do prosince 2014 byly vyšetřovány rektální výtěry psů získané v rámci rutinní praxe veterinárních lékařů z Jihomoravského a Olomouckého kraje. Základní vyšetření bylo provedeno v laboratoři Státního veterinárního Ústavu Olomouc a Veterinární a farmaceutické univerzity Brno. K průkazu bakterií rodu Campylobacter byla využita kultivace na půdě mCCDA (modifikovaný dezoxycholátový agar s aktivním uhlím a cefoperazonem). Suspektní kolonie byly konfirmovány metodou MALDI-TOF MS (Biotyper Microflex, Bruker) nebo pomocí specifické PCR umožňující odlišení druhů C. jejuni, C. coli, C. lari a C. upsaliensis. Podrobnější anamnestické údaje o vyšetřených zvířatech byly čerpány z dotazníků vyplněných chovatelem. Výsledky: Z celkem 258 vyšetřených rektálních výtěrů bylo potvrzeno 41 pozitivních vzorků (16 %). Z hlediska druhového zastoupení byl nejčastěji detekován C. jejuni, následně C. upsaliensis a C. coli. Druh C. lari byl zjištěn pouze jedenkrát. Po vyhodnocení informací Z dotazníků bylo zjištěno, že četnost výskytu bakterií rodu Campylobacter i jejich druhové zastoupení se liší v závislosti na věku zvířat, složení krmné dávky a klinických příznacích onemocnění zvířete. Závěr: Za rizikovou skupinu z hlediska možného přenosu kampylobakterových infekcí z domácích zvířat na člověka je možno považovat psy mladších věkových kategorií s průjmem, krmené doma připraveným krmivem. V domácnostech s malými dětmi, které v ČR i v zemích EU představují nejvíce postiženou věkovou skupinu, by proto měl být v případě chovu psů a zejména štěňat kladen vysoký důraz na dodržování základních hygienických pravidel.
Objectives: The aims of this study were to obtain current information on the prevalence and species representation of bacteria of the genus Campylobacter in dogs in Moravia and to evaluate the risk factors affecting their occurrence with respect to possible transmission to the human population. Material and Methods: Rectal swabs of dogs obtained in the routine practice of veterinarians in the South Moravian and Olomouc regions were examined from May 2013 to December 2014. The basic tests were performed in laboratories of the State Veterinary Institute in Olomouc and the University of Veterinary and Pharmaceutical Sciences Brno. To detect Campylobacter spp., the samples were cultured on mCCDA (modified charcoal-cefoperazone-deoxycholate agar). Suspected colonies were confirmed by MALDI-TOF MS (Biotyper Microflex, Bruker) or using specific PCR which allows to distinguish between the species C. jejuni, C. coli, C. lari and C. upsaJiensis. A detailed history was obtained from questionnaires completed by the dog owners. Results: From a total of 258 rectal swabs examined, 41 samples were positive (16%). The most frequently detected species was C. jejuni, followed by C. upsaliensis a C. coif. There was only one sample of C. iari. The evaluation of the questionnaire data showed that the frequency of Campyiobacter spp. and their species representation depended on the age of the animals, the composition of feed and the clinical signs of the disease. Conclusion: Young dogs on a homemade diet and with diarrhea may be considered a risk group in terms of possible transmission of Campylobacter infections from pets to humans. Households with young children are the most affected group in the Czech Republic md EU countries. As such, they should be given a high priority with respect to the basic hygiene rules if they breed dogs, especially puppies.
- MeSH
- bakteriologické techniky metody využití MeSH
- Campylobacter coli izolace a purifikace MeSH
- Campylobacter jejuni izolace a purifikace MeSH
- Campylobacter lari izolace a purifikace MeSH
- Campylobacter upsaliensis izolace a purifikace MeSH
- domácí zvířata MeSH
- feces * mikrobiologie MeSH
- hygiena MeSH
- kampylobakterové infekce * přenos MeSH
- lidé MeSH
- průzkumy a dotazníky MeSH
- psi * MeSH
- trasování kontaktů MeSH
- zoonózy epidemiologie přenos MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- psi * MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
Cíl práce: Molekulární epidemiologie je oborem, který využívá výsledky typizačních technik k získání informací o detailní charakteristice bakteriálních kmenů umožňujících stanovit identitu, příbuznost nebo odlišnost bakterií stejného rodu, druhu, případně i sérotypu. V současnosti jsou nejvíce používány metody založené na sledování rozdílu v genotypu bakterií. Většina těchto technik je ovšem časově i finančně náročná. Do rutinní praxe mikrobiologických laboratoří se ale rozšiřuje i metoda založená na analýze bakteriálního proteomu - hmotnostní spektrometrie s laserovou desorpcí/ionizací za účasti matrice s použitím průletového analyzátoru (MatrixAssisted Laser Desorption/Ionization Time-of-Flight Mass Spectrometry, MALDI-TOF MS). Je využívána zejména k rychlému a přesnému zařazení bakterií do rodu i druhu. Cílem naší práce proto bylo posoudit možnost využití této metody k typizaci kampylobakterů pod úroveň druhu a aplikaci výsledků při epidemiologických šetřeních. Materiál a metody: Do studie bylo zahrnuto 39 kmenů Campylobacter jejuni izolovaných z potravin (16) nebo humánního původu (23). U kmenů bylo provedeno stanovení makrorestrikčních profilů metodou pulzní gelové elektroforézy (PFGE) a současně také analýza proteinových profilů s využitím metody MALDI-TOF MS. Výsledky: Vyhodnocení míry podobnosti pulzních profilů prokázalo shody mezi izoláty pocházejícími ze stejné epidemie nebo z opakovaných odběrů jednoho pacienta. Dále byly detekovány stejné pulzní profily u kmenů bez známé spojitosti, ale se shodným místem původu a rokem izolace. Z porovnání shlukových analýz obou metod vyplývá, že kmeny označené metodou PFGE jako shodné se V dendrogramu MALDI-TOF MS objevují v jedné podskupině s výjimkou kmenů z opakovaného odběru stejného pacienta. Závěr. Naše výsledky ukazují, že potvrzení identity nebo příbuznosti kmenů v souladu se zjištěnými epidemiologickými skutečnostmi se zatím metodou MALDI-TOF nepodařilo jednoznačně prokázat.
Objectives: Molecular epidemiology is a field that uses results of typing techniques to obtain information on detailed characterization of bacterial strains for determining the identity, similarity or difference in bacteria of the same genus, species or serotype. Nowadays, the most commonly used methods are based on monitoring differences in bacterial genotypes. However, most of these techniques are time-consuming and costly. A method increasingly used in routine microbiological testing is matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS), which is based on analysis of the bacterial proteome. It is mainly used for rapid and accurate classification of bacteria into genera and species. The aims were to assess the potential use of this method for typing of Campylobacter below the species level and to apply these results in epidemiological investigations. Material and Methods: The study comprised 39 strains of Campylobacter jejuni isolated from food (16) and humans (23). Macrorestriction fragment profiling by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) and simultaneous protein profile analysis using MALDI-TOF MS were performed for all tested strains. Results: Similar pulse profiles were found among isolates originating from the same outbreak or repeatedly collected from a single patient. The same pulse profiles were also detected in strains of unknown relationship but sharing the same place of origin and year of isolation. The comparison of dendrograms from both analyses showed that strains identified as identical by PFGE appeared in the same subgroups in dendrograms obtained by MALDI-TOF MS, the only exception being isolates repeatedly collected from a single patient. Conclusion: The results suggest that confirmation of the identity or similarity of strains in accordance with the established epidemiological facts has not been clearly demonstrated using MALDI-TOF MS.
- Klíčová slova
- MALDI-TOF MS,
- MeSH
- Campylobacter jejuni * izolace a purifikace MeSH
- lidé MeSH
- pilotní projekty MeSH
- pulzní gelová elektroforéza statistika a číselné údaje MeSH
- shluková analýza MeSH
- spektrometrie hmotnostní - ionizace laserem za účasti matrice * statistika a číselné údaje MeSH
- techniky typizace bakterií metody statistika a číselné údaje využití MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- hodnotící studie MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- srovnávací studie MeSH
Tato studie byla zaměřena na sledování kontaminace syrového vepřového masa bakteriemi Staphylococcus aureus v tržní síti a jejich schopnosti podílet se na vzniku alimentárních intoxikací. Kmeny byly charakterizovány genotypovými metodami. Ze 197 vyšetřených vzorků byly ve 43 (21,8 %) detekovány bakterie S. aureus. Schopnost produkovat enterotoxiny byla potvrzena u 21 (48,8 %) izolátů, gen zodpovědný za tvorbu enterotoxinu H byl potvrzen nejčastěji (81 %). U všech izolátů byla sledována rezistence k antimikrobiálním látkám diskovou difuzní metodou a přítomnost genu mecA zodpovědného za rezistenci k meticilinu (MRSA). Dva kmeny izolované v této studii nesly gen mecA (MRSA). U obou izolátů byla potvrzena příslušnost k sekvenačnímu typu 398 (ST398).
This study was conducted to evaluate the contamination of raw pork meat with Staphylococcus aureus in retail market and their ability to participate in the creation of foodborne intoxication. Strains were characterized by genotypic traits. Of the 197 samples examined 43 (21.8%) were found to be positive for the presence of S. aureus. Toxigennic properties were found in 21 (48.8%) isolates, the major enterotoxigennic gene found was seh (81%). All the S. aureus isolates were screened for resistance to antimicrobial agents by disk diffusion method and for mecA gene encoding resistance to meticillin. Two of the strains isolated in this study harboured the mecA gene (MRSA). The determination of sequence type 398 (ST398) has been confirmed in both MRSA isolates.
- MeSH
- bakteriální léková rezistence MeSH
- enterotoxiny genetika MeSH
- kontaminace potravin MeSH
- maso * mikrobiologie MeSH
- methicilin rezistentní Staphylococcus aureus izolace a purifikace patogenita růst a vývoj MeSH
- potravinářská mikrobiologie MeSH
- prasata * MeSH
- prevalence MeSH
- Staphylococcus aureus * izolace a purifikace patogenita růst a vývoj MeSH
- statistika jako téma MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
Cíl práce: Tato studie byla zpracována ve spolupráci se Státní veterinární správou (SVS) s cílem monitorovat výskyt Shiga-toxin produkujících izolátů Escherichia coli ve sterech z jatečně upravených těl prasat a skotu. Materiál a metody: Od června do srpna roku 2013 odebraU pracovníci SVS 168 stěrů ze skotu a 318 z prasat na 157 různých porážkách v ČR Základní zpracování vzorků bylo provedeno ve Státních veterinárních ústavech Praha, Jihlava a Olomouc podle metodického postupu koordinovaného Národní referenční laboratoří (NRL) pro oblast Escherichia coh v rámci rezortu Ministerstva zemědělství. Laboratorní zpracování vzorků vycházelo z normy ISO TS 13136. Výsledky: Z celkem 486 odebraných stěrů bylo detekováno 22 pozitivních vzorků. Získáno bylo 22 izolátů shigatoxigenních E. coli (STEC) a 1 kmen s charakteristikou enterohemoragických E. coli (EHEC). U žádného izolátů nebyly zjištěny geny typické pro enteroagregativní E. coh (EAggEC). Většina získaných kmenů STEC pocházela z prasat (15 kmenů). Gen stx1, byl detekován 2krát (stx1a, stx1d), gen stx2 13krát (12krát stx2e, 1krát Stx2a). Ze vzorků stěrů skotu bylo získáno 8 izolátů STEC. jedenkrát se jednalo o gen stx, (subtyp a), 6krát byl zjištěn gen stx2 (4krát stx2e, 1krát stx2a a 1krát stx2c). Jeden izolát nesl současně geny pro oba typy toxinů stx1a a stx2a. Vždy po jednom izolátů byly detekovány séroskupiny 091,0113,0146 popisované ve spojitosti s onemocněním lidi. U žádného z těchto kmenu ale nebyly detekovány další faktory virulence, typické pro kmeny vyvolávající závažná onemocnění. Závěr: Z výsledků této studie vyplývá celková prevalence výskytu shigatoxigenních E. coli ve sterech z povrchu jatečně upravených těl prasat a skotu 4,5 % a v případě kmenů EHEC pouze 0,2 %. Syrové maso pocházející z tuzemských chovů zřejmě nepředstavuje v souČasnosti významný zdroj STEC pro člověka.
Objectives: This study was performed in cooperation with the State Veterinary Administration (SVA) in order to monitor the occurrence of Shiga toxin-producing Escherichia coli isolates in swabs from the carcasses of pigs and cattle at slaughterhouses. Material and Methods: From June to August 2013, SVA staff took 168 swabs from cattle and 318 from pigs at 157 different slaughters in the Czech Republic. Basic processing of the samples was carried out in the State Veterinary Institutes (SVIs) in Prague, Jihlava and Olomouc according to the methodical process coordinated by the National reference laboratory (NRL) for Escherichia coli (Czech Ministry of Agriculture). The procedure was based on the guideline ISO TS 13136. Results: Out of the 486 swabs, twenty-two positive samples were detected. There were a total of 22 isolates of Shiga toxigenic E. coli (STEC) and 1 strain with the characteristic of enterohemorrhagic E. coli (EHEC). Genes typical for enteroaggregative E. coli (EAggEC) were not found in any of the isolates. Most STEC strains originated from pigs. The stx, gene was detected twice (stxi1a, stx1d) and the stx2 gene 13 times (12 times stx2e, once Stx2a). Seven STEC isolates were detected from samples of cattle origin. One strain was stx1 (stx1a) -positive, the stx2 gene was found 6 times (4 stx2e, 1 stx2a aud 1 stx2c). One isolate carried simultaneously both stxja and stx2a. Each of the serogroups 091,0113 and 0146 described as etiological agents of severe disease in humans were detected only once. None of these strains harbored additional virulence factors typical for strains causing serious illness. Conclusion: Results of this study show the overall prevalence of Shiga toxigenic E. coli of 4.5% and 0.2% of enterohemorrhagic strains in the studied samples. Raw meat originating from local farms does not currently represent an important source of STEC for humans.
- Klíčová slova
- stěry, potravinová zvířata,
- MeSH
- enterohemoragická Escherichia coli * genetika izolace a purifikace MeSH
- epidemiologické monitorování veterinární MeSH
- Escherichia coli izolace a purifikace MeSH
- hospodářská zvířata MeSH
- jatka MeSH
- prasata mikrobiologie MeSH
- prevalence MeSH
- shiga toxin 1 genetika MeSH
- shiga toxin 2 genetika MeSH
- shiga-toxigenní Escherichia coli * genetika izolace a purifikace MeSH
- skot mikrobiologie MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- skot mikrobiologie MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
