Východiska: Přestože je bevacizumab prvním biologickým léčivem schváleným pro léčbu metastatického kolorektálního karcinomu (mCRC), neexistuje žádný zavedený DNA biomarker, který by zlepšil jeho účinnost a personalizoval léčbu. Materiál a metody: Sledováno bylo 30 pacientů s mCRC na terapii bevacizumabem (15 s dobrou odpovědí a 15 se špatnou odpovědí) z Fakultní nemocnice Olomouc. Pro analýzu variací v počtu kopií genů (copy number variation – CNV) byly použity vzorky FFPE a OncoScan FFPE Assay Kit, který zachycuje přibližně 900 nádorových genů. Výsledky: Ve skupině dobře reagujících pacientů bylo jako potenciálně významné pozitivní prediktivní nádorové biomarkery léčby bevacizumabem identifikováno 102 genů (klasifikovaných jako ATPázy, typ AAA, neuronální přenos signálu, regulace transkripce a domény typu PH superior). Ve špatně reagující skupině bylo identifikováno 74 potenciálně negativních prediktivních genů (klasifikovaných jako galektiny, signální dráha Jak-STAT, kaskáda MAPK, diferenciace a doména asociovaná s F-boxem). Závěr: V pilotní studii jsme našli slibné biomarkery variace počtu kopií odpovědi na bevacizumab v FFPE vzorcích nádorů pacientů s mCRC. Validační fáze by měla být zaměřena zejména na geny spojené s angiogenezí (AGRN, MAPK8, ARHGAP22, LGALS13, LGALS4, ZFP36 a MYC), tumorigenezí (DVL1) a proliferací tumoru (IFNL1, IFNL2, IFNL3, MAP3K10 a MAP4K1).

Background: Despite bevacizumab being the first biological agent approved for the treatment of metastatic colorectal cancer (mCRC), there is not any established DNA biomarker to improve its efficacy and personalize the treatment. Materials and methods: Thirty patients with mCRC on bevacizumab therapy (15 with a good response and 15 with a poor response) from the University Hospital Olomouc were followed. Formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) samples were used for copy number variation (CNV) analysis using the OncoScan FFPE Assay Kit in order to capture approx. 900 tumor genes. Results: In the group of good responding patients, 102 genes (classified as ATPases, type AAA, neuronal signal transmission, regulation of transcription, and superior domain PH type), potentially significant positive predictive tumor biomarkers of bevacizumab treatment, were found. In the poorly responding group, 74 potentially negative predictive genes (classified as galectines, Jak-STAT signalling pathway, MAPK cascade, differentiation, and F-box associated domain) were identified. Conclusion: In the pilot study, we found promising copy number variation biomarkers of bevacizumab response in FFPE samples of mCRC patients. The validation phase should be focused especially on the genes associated with angiogenesis (AGRN, MAPK8, ARHGAP22, LGALS13, LGALS4, ZFP36, and MYC), tumorigenesis (DVL1), and tumor proliferation (IFNL1, IFNL2, IFNL3, MAP3K10, and MAP4K1).

• MeSH
• bevacizumab aplikace a dávkování   terapeutické užití   MeSH
• kolorektální nádory * diagnóza   farmakoterapie   genetika   patologie   MeSH
• lidé MeSH
• metastázy nádorů farmakoterapie   MeSH
• mutační analýza DNA metody   MeSH
• nádorové biomarkery analýza   genetika   MeSH
• pilotní projekty MeSH
• protinádorové látky imunologicky aktivní aplikace a dávkování   terapeutické užití   MeSH
• variabilita počtu kopií segmentů DNA MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

Whole genome amplification replicates the entire DNA content of a sample and can thus help to circumvent material limitations when insufficient DNA is available for planned genetic analyses. However, there are conflicting data in the literature whether whole genome amplification introduces bias or reflects precisely the spectrum of starting DNA. We analyzed the origins of discrepancies in KRAS (Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog gene) mutation detection in six of ten samples amplified using the GenomePlex® Tissue Whole Genome Amplification kit 5 (WGA5; Sigma-Aldrich, St. Louis, MO, USA) and KRAS StripAssay® (KRAS SA; ViennaLab Diagnostics, Vienna, Austria). We undertook reextraction, reamplification, retyping, authentication, reanalysis, and reinterpretation to determine whether the discrepancies originated during the preanalytical, analytical, and/or interpretative phase of genotyping. We conclude that a combination of glass slide/sample heterogeneity and biased amplification due to stochastic effects in the early phases of whole genome amplification (WGA) may have adversely affected the results obtained. Our findings are relevant for both forensic genetics testing and massively parallel sequencing using preamplification.

• MeSH
• genom lidský genetika   MeSH
• genomika metody   MeSH
• genotypizační techniky metody   MeSH
• geny ras genetika   MeSH
• kolorektální nádory genetika   MeSH
• lidé MeSH
• sekvenční analýza DNA MeSH
• techniky amplifikace nukleových kyselin metody   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

• Publikační typ
• abstrakt z konference MeSH

• Klíčová slova
• kompletní Reiterův syndrom, postgonokoková artritida, klinický obraz, diagnostika,
• MeSH
• antibakteriální látky terapeutické užití   MeSH
• antiflogistika nesteroidní terapeutické užití   MeSH
• diferenciální diagnóza MeSH
• dospělí MeSH
• edém etiologie   komplikace   MeSH
• glukokortikoidy terapeutické užití   MeSH
• gonorea etiologie   farmakoterapie   komplikace   MeSH
• HLA-B27 antigen metabolismus   MeSH
• horečka MeSH
• kolenní kloub patologie   MeSH
• konjunktivitida etiologie   farmakoterapie   komplikace   MeSH
• lidé MeSH
• mezioborová komunikace MeSH
• poruchy zraku etiologie   MeSH
• reaktivní artritida diagnóza   farmakoterapie   patofyziologie   MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• kazuistiky MeSH

• MeSH
• lidé MeSH
• mutace genetika   MeSH
• nádory genetika   terapie   MeSH
• protoonkogenní proteiny B-raf genetika   MeSH
• senzitivita a specificita MeSH
• střevní nádory genetika   terapie   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• abstrakt z konference MeSH

Jednou z možností řešení chronických bolestí dolních končetin způsobených ischemickou chorobou je chemická bederní sympatektomie. Článek popisuje přípravu pacienta, provedení na CT pracovišti a možné komplikace.

One of the ways how to treat chronic pain associated with ischemic disease of lower extremities is chemical lumbar sympathectomy. The article describes preparation of the patient, procedure at CT department, and possible complications.

• Klíčová slova
• předoperační příprava, úloha sestry, neurolytická směs,
• MeSH
• bederní obratle MeSH
• bolest MeSH
• fenoly aplikace a dávkování   MeSH
• gangréna MeSH
• lidé MeSH
• management bolesti MeSH
• pooperační komplikace MeSH
• předoperační péče MeSH
• sympatektomie chemická dějiny   metody   využití   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Klíčová slova
• práce sestry,
• MeSH
• onemocnění periferních arterií MeSH
• sympatektomie MeSH

• MeSH
• antivirové látky aplikace a dávkování   terapeutické užití   MeSH
• dítě MeSH
• herpes genitalis epidemiologie   etiologie   přenos   terapie   MeSH
• herpes simplex * epidemiologie   etiologie   přenos   MeSH
• infekční komplikace v těhotenství prevence a kontrola   MeSH
• kojenec MeSH
• lidé MeSH
• lidský herpesvirus 1 patogenita   účinky léků   MeSH
• lidský herpesvirus 2 patogenita   účinky léků   MeSH
• novorozenec MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• kojenec MeSH
• lidé MeSH
• novorozenec MeSH
• ženské pohlaví MeSH

• Publikační typ
• abstrakt z konference MeSH

Ornithine-delta-aminotransferase (OAT, EC 2.6.1.13) catalyzes the transamination of L-ornithine to L-glutamate-gamma-semialdehyde. The physiological role of OAT in plants is not yet well understood. It is probably related to arginine catabolism resulting in glutamate but the enzyme has also been associated with stress-induced proline biosynthesis. We investigated the enzyme from pea (PsOAT) to assess whether diamines and polyamines may serve as substrates or they show inhibitory properties. First, a cDNA coding for PsOAT was cloned and expressed in Escherichia coli to obtain a recombinant protein with a C-terminal 6xHis tag. Recombinant PsOAT was purified under native conditions by immobilized metal affinity chromatography and its molecular and kinetic properties were characterized. Protein identity was confirmed by peptide mass fingerprinting after proteolytic digestion. The purified PsOAT existed as a monomer of 50 kDa and showed typical spectral properties of enzymes containing pyridoxal-5'-phosphate as a prosthetic group. The cofactor content of PsOAT was estimated to be 0.9 mol per mol of the monomer by a spectrophotometric analysis with phenylhydrazine. L-Ornithine was the best substrate (K(m)=15 mM) but PsOAT also slowly converted N(alpha)-acetyl-L-ornithine. In these reactions, 2-oxoglutarate was the exclusive amino group acceptor (K(m)=2mM). The enzyme had a basic optimal pH of 8.8 and displayed relatively high temperature optimum. Diamines and polyamines were not accepted as substrates. On the other hand, putrescine, spermidine and others represented weak non-competitive inhibitors. A model of the molecular structure of PsOAT was obtained using the crystal structure of human OAT as a template.

• MeSH
• biokatalýza MeSH
• chromatografie afinitní MeSH
• elektroforéza v polyakrylamidovém gelu MeSH
• hrách setý enzymologie   MeSH
• molekulární sekvence - údaje MeSH
• molekulová hmotnost MeSH
• polyaminy farmakologie   MeSH
• rekombinantní proteiny antagonisté a inhibitory   chemie   metabolismus   MeSH
• sekvence aminokyselin MeSH
• sekvenční homologie aminokyselin MeSH
• spektrometrie hmotnostní - ionizace laserem za účasti matrice MeSH
• substrátová specifita MeSH
• transaminasa ornithin-oxokyselin antagonisté a inhibitory   chemie   metabolismus   MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH