BACKGROUND: Monoallelic germline pathogenic variants (GPVs) in five Fanconi anemia (FA) genes (BRCA1/FANCS, BRCA2/FANCD1, PALB2/FANCN, BRIP1/FANCJ, and RAD51C/FANCO) confer an increased risk of breast (BC) and/or ovarian (OC) cancer, but the role of GPVs in 17 other FA genes remains unclear. METHODS: Here, we investigated the association of germline variants in FANCG/XRCC9 with BC and OC risk. RESULTS: The frequency of truncating GPVs in FANCG did not differ between BC (20/10,204; 0.20%) and OC (8/2966; 0.27%) patients compared to controls (6/3250; 0.18%). In addition, only one out of five tumor samples showed loss-of-heterozygosity of the wild-type FANCG allele. Finally, none of the nine functionally tested rare recurrent missense FANCG variants impaired DNA repair activities (FANCD2 monoubiquitination and FANCD2 foci formation) upon DNA damage, in contrast to all tested FANCG truncations. CONCLUSION: Our study suggests that heterozygous germline FANCG variants are unlikely to contribute to the development of BC or OC.
- MeSH
- dospělí MeSH
- genetická predispozice k nemoci * MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- nádory prsu * genetika MeSH
- nádory vaječníků * genetika MeSH
- oprava DNA genetika MeSH
- protein FANCG * genetika MeSH
- senioři MeSH
- studie případů a kontrol MeSH
- zárodečné mutace * MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
Germline CHEK2 pathogenic variants confer an increased risk of female breast cancer (FBC). Here we describe a recurrent germline intronic variant c.1009-118_1009-87delinsC, which showed a splice acceptor shift in RNA analysis, introducing a premature stop codon (p.Tyr337PhefsTer37). The variant was found in 21/10,204 (0.21%) Czech FBC patients compared to 1/3250 (0.03%) controls (p = 0.04) and in 4/3639 (0.11%) FBC patients from an independent German dataset. In addition, we found this variant in 5/2966 (0.17%) Czech (but none of the 443 German) ovarian cancer patients, three of whom developed early-onset tumors. Based on these observations, we classified this variant as likely pathogenic.
- MeSH
- checkpoint kinasa 2 * genetika MeSH
- dospělí MeSH
- genetická predispozice k nemoci * genetika MeSH
- introny * genetika MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- nádory prsu * genetika MeSH
- nádory vaječníků genetika MeSH
- prekurzory RNA genetika MeSH
- sestřih RNA * genetika MeSH
- zárodečné mutace * MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
- Německo MeSH
We report the case of a hydrocephalic fetus in which clinical exome sequencing revealed a recurrent synonymous variant of unknown significance, c.453G>T, in the L1CAM gene. This report presents the second case of X-linked hydrocephalus in a fetus with this variant. Since we reproduced the RNA analysis, we were able to reclassify this variant as likely pathogenic. Our results stress the importance of not excluding synonymous variants during prioritization.
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
BACKGROUND: X-linked nephrogenic diabetes insipidus (NDI) is a rare genetic renal disease caused by pathogenic variants in the AVPR2 gene. Single nucleotide variants and small insertions/deletions in AVPR2 are reliably detected by routine clinical sequencing. Nevertheless, structural variants involving AVPR2 are challenging to identify accurately by conventional genetic testing. Here, we report a novel deletion of AVPR2 in a Czech family identified for the first time by targeted long-read sequencing (T-LRS). METHODS: A male proband with X-linked NDI underwent clinical sequencing of the AVPR2 gene that failed and thus indicated possible whole-gene deletion. Therefore, PCR mapping and subsequent targeted long-read sequencing (T-LRS) using a Pacific Biosciences sequencer were applied to search for the suspected deletion. To validate the deletion breakpoints and prove variant segregation in the family with X-linked NDI, Sanger sequencing of the deletion junction was performed. Quantitative real-time PCR was further carried out to confirm the carrier status of heterozygous females. RESULTS: By T-LRS, a novel 7.5 kb deletion of AVPR2 causing X-linked NDI in the proband was precisely identified. Sanger sequencing of the deletion junction confirmed the variant breakpoints and detected the deletion in the probands ́ mother, maternal aunt, and maternal cousin with X-linked NDI. The carrier status in heterozygous females was further validated by quantitative real-time PCR. CONCLUSIONS: Identifying the 7.5 kb deletion gave a precise molecular diagnosis for the proband, enabled genetic counselling and genetic testing for the family, and further expanded the spectrum of structural variants causing X-linked NDI. Our results also show that T-LRS has significant potential for accurately identifying putative structural variants.
- Publikační typ
- abstrakt z konference MeSH
Vydání první 157 stran : ilustrace ; 21 cm
Příručka, která se zaměřuje na dyslexii u dětí, na problémy při učení angličtiny a na techniky jejich překonání. Určeno odborné veřejnosti, zejména pedagogům.
- Klíčová slova
- angličtina,
- MeSH
- dyslexie MeSH
- jazykové techniky MeSH
- postižené děti výchova MeSH
- speciální vzdělávání MeSH
- Publikační typ
- příručky MeSH
- Konspekt
- Angličtina
- NLK Obory
- psychiatrie
- pedagogika
- pediatrie
Krvácení z varikózních pletení je jednou z nejčastějších manifestací portální hypertenze u pacientů s jaterní cirhózou. Kromě gastroezofageální oblasti se mohou varixy vyskytovat i v dalších částech trávicí trubice - jako nejčastější lokalizace těchto tzv. ektopických varixů jsou v mnoha zdrojích uváděny chirurgicky vytvořená umělá vyústění střeva, tedy stomie. V kazuistice představujeme pacienta s recidivujícím krvácením do stomie v důsledku portální hypertenze při nepoznané jaterní cirhóze. Terapeutický přístup k pacientovi se stomickými varixy je obvykle založen na kombinaci lokálních metod, které jsou využívány k zástavě akutního krvácení, a dekompresních metod, v praxi nejčastěji transjugulárního intrahepatálního portosystémového shuntu (TIPS), který zabrání recidivě krvácení.
Variceal bleeding is of the most usual complications of portal hypertension in patients with liver cirhosis. Besides gastroesophaeal region, varices can also be seen in other parts of gastrointestinal tract - most frequently in stomas. In our case report, we present a patient with reccurent stomal bleeding due to unrecognised liver cirhosis with portal hypertension. Therapeutic approach to such patients usually combines local methods to stop acute bleeding and decompression methods, such as transjugular intrahepatic portosystemic shunt (TIPS).
- MeSH
- chirurgické stomie * patologie MeSH
- gastrointestinální krvácení * diagnostické zobrazování etiologie terapie MeSH
- ileostomie MeSH
- jaterní cirhóza MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- pooperační komplikace MeSH
- varixy * chirurgie patologie MeSH
- Check Tag
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
- MeSH
- diagnostické techniky molekulární metody MeSH
- dítě MeSH
- genetické testování metody MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- poruchy růstu * genetika MeSH
- protein SHOX genetika MeSH
- výsledek terapie MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
