Diffuse astrocytomas and oligodendrogliomas (WHO grade II) are the most common histological subtypes of low-grade gliomas (LGGs). Several molecular and epigenetic markers have been identified that predict tumor progression. Our aim was in detail to investigate the genetic and epigenetic background of LGGs and to identify new markers that might play a role in tumor behavior. Twenty-three patients with oligodendroglioma or oligoastrocytoma (LGO) and 22 patients with diffuse astrocytoma (LGA) were investigated using several molecular-cytogenetic and molecular methods to assess their copy number variations, mutational status and level of promoter methylation. The most frequent findings were a 1p/19q codeletion in 83% of LGO and copy-neutral loss of heterozygosity (CN-LOH) of 17p in 72% of LGA. Somatic mutations in the isocitrate dehydrogenase 1 or 2 (IDH1/IDH2) genes were detected in 96% of LGO and 91% of LGA. The O-6-methylguanine-DNA-methyltransferase (MGMT) promoter was methylated in 83% of LGO and 59% of LGA. MutL homolog 3 (MLH3) promoter methylation was observed in 61% of LGO and 27% of LGA. Methylation of the MGMT promoter, 1p/19q codeletion, mutated IDH1, and CN-LOH of 17p were the most frequent genetic aberrations in LGGs. The findings were more diverse in LGA than in LGO. To the best of our knowledge, this is the first time description of methylation of the MLH3 gene promoter in LGGs. Further studies are required to determine the role of the methylated MLH3 promoter and the other aberrations detected.

• MeSH
• astrocytom genetika   metabolismus   MeSH
• epigeneze genetická * MeSH
• kohortové studie MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• metylace DNA * MeSH
• nádorové biomarkery MeSH
• nádory mozku genetika   metabolismus   MeSH
• oligodendrogliom genetika   metabolismus   MeSH
• prognóza MeSH
• stupeň nádoru MeSH
• transportní proteiny genetika   metabolismus   MeSH
• Check Tag
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

MDS with complex chromosomal aberrations (CCA) are characterized by short survival and a high rate of transformation to AML. A comprehensive genome-wide analysis of bone-marrow cells of 157 adults with newly diagnosed MDS and CCA revealed a large spectrum of nonrandom genomic changes related to the advanced stages of MDS. Chromosome shattering, probably resulting from chromothripsis, was found in 47% of patients. Deleted chromosome 5 was unstable and often involved in different types of cryptic unbalanced rearrangements. No true monosomy 5 was observed. Patients with CCA involving deleted chromosome 5 had an extremely poor prognosis (median overall survival, 2 months).

• MeSH
• chromozomální delece * MeSH
• dospělí MeSH
• karyotyp MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• lidské chromozomy, pár 5 * MeSH
• myelodysplastické syndromy genetika   mortalita   MeSH
• prognóza MeSH
• retrospektivní studie MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• srovnávací genomová hybridizace MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

Východiska: Nízkostupňové gliomy představují heterogenní skupinu primárních mozkových nádorů. Jejich současná dia­gnostika je založena hlavně na histologické klasifikaci. S rozvojem molekulární cytogenetiky však bylo objeveno několik markerů umožňujících lépe definovat daný gliomový subtyp. Cílem studie bylo sledovat získané chromozomové aberace v buňkách nízkostupňových gliomů molekulárně cytogenetickými metodami a hledat nové genomové změny, které by mohly souviset s progresí nádoru. Soubor pacientů a metody: Technikami interfázní fluorescenční in situ hybridizace (I‑FISH) a single nucleotide polymorphism (SNP) array jsme vyšetřili vzorky od 41 pacientů s histologicky potvrzenými nízkostupňovými gliomy (19 žen a 22 mužů, medián věku 42 let). Výsledky: Kromě nejčastější známé aberace, tj. kombinované delece krátkých ramen chromozomu 1 a dlouhých ramen chromozomu 19 (u 81,25 % pacientů), jsme u pacientů s oligodendrogliomy detekovali další rekurentní aberace – delece krátkých a/nebo dlouhých ramen chromozomu 4 (25 % nemocných), delece krátkých ramen chromozomu 9 (18,75 % pacientů), delece dlouhých ramen chromozomu 13 a monozomii chromozomu 18 (18,75 % pacientů). U pacientů s astrocytomy jsme často pozorovali deleci krátkých ramen chromozomu 1 (24 % nemocných), amplifikaci dlouhých ramen chromozomu 7 (16 % nemocných), deleci dlouhých ramen chromozomu 13 (20 % nemocných), segmentální uniparentální disomii (UPD) na krátkých ramenech chromozomu 17 (60 % pacientů) a deleci dlouhých ramen chromozomu 19 (28 % nemocných). U jednoho pacienta jsme pozorovali tzv. chromothripsis chromozomu 10. Závěr: V pilotní studii jsme kombinací metod I‑FISH a SNP array detekovali nejen známé chromozomové změny, které jsou typické pro jednotlivé subtypy nádorů, ale také nové nebo méně časté rekurentní aberace. Jejich úlohu v progresi nádorových buněk, stejně jako jejich význam z hlediska klasifikace nízkostupňových gliomů však bude nezbytné ověřit v dalších studiích na větších souborech nemocných.

Background: Low-grade gliomas represent a heterogeneous group of primary brain malignancies. The current dia­gnostics of these tumors rely strongly on histological classification. With the development of molecular cytogenetic methods several genetic markers were described, conributing to a better distinction of glial subtypes. The aim of this study was to assess the frequency of acquired chromosomal aberrations in low‑grade gliomas and to search for new genomic changes associated with higher risk of tumor progression. Patients and Methods: We analysed bio­psy specimens from 41 patients with histological dia­gnosis of low-grade glioma using interphase fluorescence in situ hybridization (I‑FISH) and single nucleotide polymorphism (SNP) array techniques (19 females and 22 males, medium age 42 years). Results: Besides notorious and most frequent finding of combined deletion of 1p/19q (81.25% patients) several other recurrent aberrations were described in patients with oligodendrogliomas: deletions of p and q arms of chromosome 4 (25% patients), deletions of the short arms of chromosome 9 (18.75% patients), deletions of the long arms of chromosome 13 and monosomy of chromosome 18 (18.75% patients). In bio­psy specimens from patients with astrocytomas, we often observed deletion of 1p (24% patients), amplification of the long arms of chromosome 7 (16% patients), deletion of the long arm of chromosome 13 (20% patients), segmental uniparental disomy (UPD) of the short arms of chromosome 17 (60% patients) and deletion of the long arms of chromosome 19 (28% patients). In one patient we detected a shuttered chromosome 10 resulting from chromothripsis. Conclusion: Using a combination of I‑FISH and SNP array, we detected not only known chromosomal changes but also new or less frequent recur­rent aberrations. Their role in cancer‑cell progression and their impact on low‑grade gliomas classification remains to be elucidated in a larger cohort of patients. Key words: oligodendroglioma – astrocytoma – SNP array – interphase FISH – glioma This work was supported by grants of Internal Grant Agency of the Czech Ministry of Health No. NT/13212-4, PRVOUK-P27/LF1/1 a RVO-VFN64165. The authors declare they have no potential conflicts of interest concerning drugs, products, or services used in the study. The Editorial Board declares that the manuscript met the ICMJE “uniform requirements” for biomedical papers. Submitted: 5. 11. 2013 Accepted: 29. 1. 2014

• Klíčová slova
• SNP array, interfázní FISH,
• MeSH
• amplifikace genu MeSH
• astrocytom * genetika   patologie   MeSH
• chromozomální aberace MeSH
• chromozomální delece MeSH
• cytogenetické vyšetření MeSH
• delece genu MeSH
• DNA sondy MeSH
• dospělí MeSH
• gliom * genetika   patologie   MeSH
• hybridizace in situ fluorescenční MeSH
• jednonukleotidový polymorfismus MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• nádory mozku * genetika   patologie   MeSH
• oligodendrogliom * genetika   patologie   MeSH
• pilotní projekty MeSH
• statistika jako téma MeSH
• uniparentální disomie MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH

Příspěvek se zabývá problematikou trombofilních mutací v souvislosti s užíváním hormonální antikoncepce a hormonální substituce. Vysvětluje problematiku dědičných trombofilních mutací, jako jsou mutace leidenská (faktor V Leiden – FVL) a mutace protrombinu (faktor II protrombin), představuje kazuistiky již známých případů zdravotních komplikací s leckdy fatálními následky. Cílem příspěvku je informovat o problematice, varovat před příliš liberálním užíváním hormonální antikoncepce a hormonální substituce a vyzvat mladou generaci dívek a žen k převzetí zodpovědnosti za své zdraví a budoucí život.

This paper deals with issues of the thrombophilic mutations related to hormonal contraceptives and hormone replacement therapy. The issue of inherited thrombophilic mutations such as Factor V Leiden mutation (Factor V Leiden – FVL) and prothrombin mutation (Factor II prothrombin) is explained. Case studies of already known health complications are presented. Related complications may have fatal consequences. The aim of this paper is to inform about the problems, to warn about wide and uncontrolled use of hormonal contraceptives and hormone replacement therapy and also to challenge young girl’s generation and women in taking responsibility for their own health and future life.

• Klíčová slova
• Leidenská mutace, hluboká žilní trombóza,
• MeSH
• dospělí MeSH
• faktor V genetika   MeSH
• hormonální substituční terapie kontraindikace   škodlivé účinky   MeSH
• kontraceptiva orální hormonální aplikace a dávkování   krev   škodlivé účinky   MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• mutace fyziologie   genetika   účinky léků   MeSH
• plicní embolie prevence a kontrola   MeSH
• primární prevence MeSH
• tromboembolie prevence a kontrola   MeSH
• trombofilie * genetika   patologie   prevence a kontrola   vrozené   MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• kazuistiky MeSH

Chromosome 11 abnormalities are found in many hematological malignancies. In acute myeloid leukemia (AML), a proto-oncogene MLL (11q23.3) is frequently altered. However, rearrangements involving other regions of chromosome 11 have been reported. Therefore, we have characterized the chromosome 11 breakpoints and common deleted and amplified areas in the bone marrow or peripheral blood cells of newly diagnosed patients with AML. Using molecular-cytogenetic methods (multicolor fluorescence in situ hybridization (mFISH), multicolor banding (mBAND), microarrays, and FISH with bacterial artificial chromosome (BAC) probes, chromosome 11 abnormalities were delineated in 54 out of 300 (18%) newly diagnosed AML patients. At least 36 different chromosome 11 breakpoints were identified; two were recurrent (11p15.4 in the NUP98 gene and 11q23.3 in the MLL gene), and three were possibly nonrandom: 11p13 (ch11:29.31-31.80 Mb), 11p12 (ch11:36.75-37.49 Mb) and 11q13.2 (68.31-68.52 Mb). One new MLL gene rearrangement is also described. No commonly deleted region of chromosome 11 was identified. However, some regions were affected more often: 11pter-11p15.5 (n = 4; ch11:0-3.52 Mb), 11p14.1-11p13 (n = 4; ch11:28.00-31.00 Mb) and 11p13 (n = 4; ch11:31.00-31.50 Mb). One commonly duplicated (3 copies) region was identified in chromosomal band 11q23.3-11q24 (n = 9; ch11:118.35-125.00 Mb). In all eight cases of 11q amplification (>3 copies), only the 5' part of the MLL gene was affected. This study highlights several chromosome 11 loci that might be important for the leukemogeneic process in AML.

• MeSH
• akutní myeloidní leukemie genetika   patologie   MeSH
• amplifikace genu MeSH
• body zlomu chromozomu * MeSH
• chromozomální aberace MeSH
• chromozomální delece * MeSH
• dospělí MeSH
• hybridizace in situ fluorescenční MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• lidské chromozomy, pár 11 genetika   MeSH
• mladý dospělý MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladý dospělý MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

Myelodysplastic syndrome (MDS), a clonal disorder originating from hematopoietic stem cell, is characterized by a progressive character often leading to transformation to acute myeloid leukemia. We used single nucleotide polymorphism arrays (SNP-A) to identify previously cryptic chromosomal abnormalities such as copy number alterations and uniparental disomies (UPD) in cytogenetically normal MDS. In the aberrant regions, we attempted to localize candidate genes with potential relevance to the disease. Using SNP-A, we analyzed peripheral blood granulocytes from 37 MDS patients. The analysis identified 13 cryptic chromosomal defects in 10 patients (27%). Four UPD (affecting chromosomes 3q, 7q, 17q, and 20p), 5 deletions and 4 duplications were detected. Gene expression data measured on CD34+ cells were available for 4 patients with and 6 patients without SNP-A lesions. We performed an integrative analysis of genotyping and gene expression microarrays and found several genes with an altered expression located in the aberrant regions. The expression microarrays suggested BMP2 and TRIB3 located in 20p UPD as potential candidate genes contributing to MDS. We showed that the genome-wide integrative approach is beneficial to the comprehension of molecular backgrounds of diseases with incompletely understood etiopathology.

• MeSH
• analýza přežití MeSH
• chromozomální aberace MeSH
• dospělí MeSH
• jednonukleotidový polymorfismus MeSH
• karyotyp MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladý dospělý MeSH
• myelodysplastické syndromy genetika   mortalita   MeSH
• následné studie MeSH
• reprodukovatelnost výsledků MeSH
• sekvenční analýza hybridizací s uspořádaným souborem oligonukleotidů MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• stanovení celkové genové exprese MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladý dospělý MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

• Publikační typ
• abstrakty MeSH

• Publikační typ
• abstrakt z konference MeSH

• Publikační typ
• abstrakt z konference MeSH

• Publikační typ
• abstrakty MeSH