Penile squamous cell carcinoma (pSCC) represents an uncommon malignancy characterized by stagnant mortality, psychosexual distress, and a highly variable prognosis. Currently, the World Health Organization distinguishes between human papillomavirus (HPV)-related and HPV-independent pSCC. Recently, there has been an evolving line of research documenting the enrichment of HPV-independent pSCC with a high tumor mutational burden (TMB) and programmed death ligand-1 expression, as well as clusters of genes associated with HPV status. In this study, we conducted comprehensive next-generation sequencing DNA profiling of 146 pSCC samples using a panel consisting of 355 genes associated with tumors. This profiling was correlated with immunohistochemical markers and prognostic clinical data. A survival analysis of recurrent genomic events (found in ≥10 cases) was performed. TP53, CDKN2A, ATM, EPHA7, POT1, CHEK1, GRIN2A, and EGFR alterations were associated with significantly shortened overall survival in univariate and multivariate analysis. HPV positivity, diagnosed through both p16 immunohistochemistry and HPV DNA analysis, displayed no impact on survival but was associated with high-grade, lymphatic invasion, programmed death ligand-1 negativity/weak expression, and low TMB. FAT1, TP53, CDKN2A, CASP8, and HRAS were more often mutated in HPV-independent pSCC. In contrast, HPV-associated pSCCs were enriched by EPHA7, ATM, GRIN2A, and CHEK1 mutations. PIK3CA, FAT1, FBXW7, and KMT2D mutations were associated with high TMB. NOTCH1, TP53, CDKN2A, POT1, KMT2D, ATM, CHEK1, EPHA3, and EGFR alterations were related to adverse clinicopathologic signs, such as advanced stage, high tumor budding, and lymphovascular invasion. We detected 160 alterations with potential treatment implications, with 21.2% of samples showing alterations in the homologous recombination repair pathway. To the best of our knowledge, this study describes the largest cohort of pSCC with complex molecular pathologic, clinical, and prognostic analysis correlating with prognosis.
- MeSH
- ATM protein genetika MeSH
- dospělí MeSH
- erbB receptory genetika MeSH
- infekce papilomavirem MeSH
- inhibitor p16 cyklin-dependentní kinasy genetika MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mutace MeSH
- nádorové biomarkery * genetika analýza MeSH
- nádorový supresorový protein p53 genetika MeSH
- nádory penisu * genetika mortalita patologie virologie MeSH
- prognóza MeSH
- proteiny vázající telomery MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- shelterinový komplex MeSH
- spinocelulární karcinom * genetika mortalita patologie virologie MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
Extrapulmonary small cell neuroendocrine carcinoma (EP-SCNC) is a rare malignancy with a poor prognosis. Most patients with EP-SCNC have metastatic disease upon presentation, and their average overall survival (OS) is less than 12 months. Our study aimed to conduct a complex analysis of EP-SCNC. One hundred eighty-one EP-SCNC tissue samples were subjected to a complex analysis. One hundred fifty-five tumors were pure EP-SCNC, whereas 26 were combined tumors. Immunohistochemistry for ASCL1, NEUROD1, YAP1, POU2F3, Rb1, p53, cyclin D1, p16, PTEN, DLL3, PD-L1, CD56, synaptophysin, chromogranin A, and INSM1 was performed, and 128 samples were analyzed molecularly using next-generation sequencing, comprising DNA and RNA analyses. Detailed results on immunohistochemical and molecular analyses were provided for each primary origin of EP-SCNC separately. Median survival for the whole cohort of patients was 8.94 months. Patient age (≥70 years), tumor mutational burden <15, and TP53 and BRCA2 mutations were negative prognostic factors. High expression of ASCL-1 was associated with shorter OS, whereas high expression of YAP1 was associated with longer OS. Patients with genitourinary tumors had significantly better OS than those with gastrointestinal tract EP-SCNC tumors. Rb1 expression loss was detected more often in genitourinary tract SCNCs. In contrast, p16 overexpression was found more often in genitourinary tract SCNCs. POU2F3 expression was detected more often in combined tumors, whereas NEUROD1 was detected more often in pure EP-SCNC. Regarding "druggable markers," DLL3 was expressed in 66% of tumors and PD-L1 in 17.4%. Detailed analyses of different prognostic and predictive markers are needed to better understand EP-SCNC biology and create more personalized therapy to improve patient prognosis.
- MeSH
- dospělí MeSH
- imunohistochemie MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- malobuněčný karcinom * genetika patologie klasifikace metabolismus mortalita MeSH
- nádorové biomarkery * genetika metabolismus analýza MeSH
- neuroendokrinní karcinom * genetika patologie klasifikace mortalita metabolismus MeSH
- prognóza MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
Penile squamous cell carcinoma (pSCC) is a rare tumour with a variable prognosis. More prognostic markers linked to mutational signatures and the tumour immune microenvironment are needed. A cohort made up of 165 invasive pSCC was retrospectively analysed using formalin-fixed, paraffin-embedded tumour tissue, focusing on tumour mutational burden (TMB), programmed death ligand 1 (PD-L1) expression, microsatellite instability (MSI), the number of tumour infiltrating lymphocytes (TILs) expressing cytotoxic T-lymphocyte-associated protein 4 (CTLA4), HPV status determined by p16 immunohistochemistry, and several traditional histopathological variables. High TMB (>10 mut/Mb) was associated with high PD-L1 expression (TPS 50-100%), and HPV-negative status. High PD-L1 expression was linked to HPV negativity, a high number of intratumoural CTLA4+ cells, and brisk lymphocytic infiltrate. High TMB was a significant predictor of shorter overall survival (OS) in both univariate and multivariate analysis when using a median cut-off value of 4.3 mut/Mb, but not when using an arbitrary cut-off of 10 mut/Mb. Low CTLA4+ cell infiltration at the tumour invasion front was a marker of shorter OS and cancer-specific survival in both univariate and multivariate analysis. PD-L1 expression had no significant impact on prognosis. Only two cases were MSI high. The results support the hypothesis of two aetiological pathways in pSCC cancerogenesis: (1) SCC linked to HPV infection characterised by low TMB, less common PD-L1 expression, and a lower number of TILs; and (2) SCC linked to chronic inflammation leading to a high number of acquired mutations (high TMB), HPV negativity, increased neoantigen production (i.e., PD-L1), and high immune cell infiltration.
- MeSH
- antigen CTLA-4 MeSH
- antigeny CD274 metabolismus MeSH
- infekce papilomavirem * komplikace MeSH
- lidé MeSH
- nádorové mikroprostředí MeSH
- nádory penisu * genetika MeSH
- retrospektivní studie MeSH
- spinocelulární karcinom * MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
Colorectal cancer (CRC) is a leading global cause of illness and death. There is a need for identification of better prognostic markers beyond traditional clinical variables like grade and stage. Previous research revealed that abnormal expression of cytokeratin 7 (CK7) and loss of the intestinal-specific Special AT-rich sequence-binding protein 2 (SATB2) are linked to poor CRC prognosis. This study aimed to explore these markers' prognostic significance alongside two extraintestinal mucins (MUC5AC, MUC6), claudin 18, and MUC4 in 285 CRC cases using immunohistochemistry on tissue microarrays (TMAs). CK7 expression and SATB2-loss were associated with MUC5AC, MUC6, and claudin 18 positivity. These findings suggest a distinct "non-intestinal" immunohistochemical profile in CRC, often right-sided, SATB2-low, with atypical expression of CK7 and non-colorectal mucins (MUC5AC, MUC6). Strong MUC4 expression negatively impacted cancer-specific survival (hazard ratio = 2.7, p = 0.044). Genetic analysis via next-generation sequencing (NGS) in CK7 + CRCs and those with high MUC4 expression revealed prevalent mutations in TP53, APC, BRAF, KRAS, PIK3CA, FBXW7, and SMAD4, consistent with known CRC mutation patterns. NGS also identified druggable variants in BRAF, PIK3CA, and KRAS. CK7 + tumors showed intriguingly common (31.6%) BRAF V600E mutations corelating with poor prognosis, compared to the frequency described in the literature and databases. Further research on larger cohorts with a non-colorectal immunophenotype and high MUC4 expression is needed.
- MeSH
- dospělí MeSH
- fenotyp MeSH
- fosfatidylinositol-3-kinasy třídy I genetika metabolismus MeSH
- imunohistochemie * MeSH
- keratin-7 metabolismus genetika MeSH
- kolorektální nádory * genetika patologie metabolismus mortalita MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mucin 4 genetika metabolismus MeSH
- mucin 5AC genetika metabolismus MeSH
- mucin 6 genetika metabolismus MeSH
- mutace MeSH
- nádorové biomarkery * genetika metabolismus MeSH
- prognóza MeSH
- protoonkogenní proteiny B-Raf genetika MeSH
- protoonkogenní proteiny p21(ras) genetika MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- transkripční faktory MeSH
- vazebné proteiny DNA v oblastech připojení k matrix * genetika metabolismus MeSH
- vysoce účinné nukleotidové sekvenování MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
Karcinom pankreatu patří mezi poměrně časté maligní nádory se stoupající incidencí i mortalitou, protože nádor je obvykle diagnostikován v pokročilém stadiu a má obecně špatnou prognózu, pouze 5 % nemocných žije 5 let od stanovení diagnózy. Zásadním faktorem ovlivňujícím prognózu je stadium onemocnění v době diagnózy, přičemž u lokalizovaných nádorů žije 3 roky od diagnózy 25 % nemocných, u generalizovaných pouze 1 %. Radikální chirurgické odstranění nádoru (parciální či totální pankreatektomie) je klíčovým parametrem prodlužujícím přežití, téma je tedy pro chirurgickou obec vysoce relevantní. Statistiky o karcinomu pankreatu zpracovávají ve své většině duktální adenokarcinom, který je v pankreatu nejčastějším a prognosticky nejméně příznivým maligním nádorem pankreatu. Toto přehledové sdělení se zaměřuje právě na duktální adenokarcinom, jeho varianty a prekancerózy. Článek shrnuje informace z poslední WHO klasifikace z roku 2019, která vyšla 11 let od předchozího vydání. V této nové WHO klasifikaci došlo v oblasti duktálního adenokarcinomu oproti staršímu spíše k minoritním změnám, přičemž vymezení vzácných variant duktálního adenokarcinomu má své opodstatnění na základě genetické i morfologické příbuznosti a na základě klinické relevance, kdy se jednotlivé subtypy zásadně liší prognózou. Článek obsahuje i popis a definiční vymezení makroskopických i mikroskopických prekurzorů duktálního adenokarcinomu. Genetické a imunohistochemické diferenciálně diagnostické aspekty jsou pojednány stručně, neboť jsou relevantní spíš pro patologa než pro chirurga.
Pancreatic carcinoma is a relatively common malignant tumor with increasing incidence and mortality. The tumor is usually diagnosed at an advanced stage and generally has a poor prognosis, with only 5% of patients surviving 5 years from the time of diagnosis. The stage of the disease at the time of diagnosis is a crucial factor for the prognosis; 25% of patients with localized tumors survive 3 years from diagnosis, compared to only 1% of those with generalized tumors. Radical surgical removal of the tumor (partial or total pancreatectomy) is a key factor in improving survival. Therefore, the topic is highly relevant to surgeons. Statistics on pancreatic carcinoma mainly focus on ductal adenocarcinoma, which is the most common and least favorable malignant tumor of the pancreas. This review focuses on ductal adenocarcinoma, its variants, and precancerous lesions. The article summarizes information from the latest WHO classification of 2019, which was released 11 years after the previous edition. Compared to the previous version, this new WHO classification introduced rather minor changes in the field of ductal adenocarcinoma. The delineation of rare variants of ductal adenocarcinoma is justified based on genetic and morphological similarities and clinical relevance, as individual subtypes significantly differ in prognosis. The article also includes a description of macroscopic and microscopic precursors of ductal adenocarcinoma and their definitions. Genetic and immunohistochemical differential diagnostic aspects are briefly discussed, as these are more relevant to pathologists than to surgeons.
- MeSH
- barvicí látky terapeutické užití MeSH
- diferenciální diagnóza MeSH
- duktální karcinom slinivky břišní * chirurgie diagnóza klasifikace patologie MeSH
- histologické techniky metody MeSH
- lidé MeSH
- nádory slinivky břišní * chirurgie diagnóza klasifikace patologie MeSH
- prekancerózy chirurgie diagnóza klasifikace patologie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
Nádory penisu patří mezi poměrně vzácná onkologická onemocnění se značně variabilní prognózou. Nejdůležitějším ukazatelem nádorově specifického přežití (cancer specific survival, CSS) je postižení regionálních lymfatických uzlin, které nemusí být při klinickém vyšetření či konvenčními zobrazovacími metodami identifikováno. Z toho důvodu jsou v současnosti zkoumány nové prognostické a terapeuticko-indikační markery dlaždicobuněčného karcinomu penisu (penile squamous cell carcinoma, SCC) na histologické, imunohistochemické a molekulární úrovni. Ačkoliv WHO klasifikuje pSCC na HPV-asociovaný a HPV-independentní, vliv HPV statutu na prognózu je podle řady studií a našich dat sporný. V naší studii byl zjištěn negativní prognostický vliv nádorového grade buddingu na celkové přežití (overall survival, OS) i CSS. Nádorový budding byl u SCC aso- ciován s metastatickým postižením regionálních lymfatických uzlin. Prognostický význam infiltrace imunitními buňkami u pSCC zkoumá jen málo relevantních studií. V naší studii byl řídký/chybějící lymfocytární lem signifikantně asociovaný s kratším OS i CSS. Mutovaný profil p53 koreluje s agresivním fenotypem a nepříznivou prognózou u mnoha typů nádorů včetně pSCC. V naší práci jsme potvrdili jeho negativní prognostický dopad na OS i CSS. Vysoká nádorová mutační nálož (tumor mutational burden, TMB) byla asociovaná s kratším OS, s vysokou expresí programmed death ligandu 1 (PD-L1) a HPV/p16 negativitou. Nález časté PD-L1 pozitivity u HPV-negativních nádorů s vysokým TMB ilustruje onkogenezi pSCC v souvislosti s chronickým zánětem, vysokým množstvím získaných mutací a produkcí neoantigenů (PD-L1) a činí z nemocných s HPV-independentními SCC kandidáty anti-PD-1/PD-L1 léčby. Popsané znaky, jako je nádorový budding, lymfocytární infiltrát a p53, korelují s přežitím významněji než pT stadium, histopatologický grade nebo morfologický subtyp karcinomu penisu.
Penile cancer is a relatively rare malignancy with a highly variable prognosis. The most important indicator of cancer specific survival (CSS) is the involvement of regional lymph nodes, which may not be identified during clinical examination or by conventional imaging methods. For that reason, new prognostic and therapeutic markers of penile squamous cell carcinoma (SCC) are currently being investigated at the histological, immunohistochemical and molecular level. Although the WHO classifies penile SCC into HPV-associated and HPV-independent, the prognostic impact of HPV status remains questionable according to several studies and our data. In our study, a negative prognostic effect of tumour grade budding on overall survival (OS) and CSS was found. Tumour budding has been associated with the metastatic involvement of regional lymph nodes in penile SCC. A few relevant studies have investigated the prognostic significance of immune cell infiltration in pSCC. In our study, a non-brisk/absent lymphocyte infiltrate was significantly associated with shorter OS and CSS. Mutated p53 profile correlates with aggressive phenotype and poor prognosis in many tumour types including penile SCC. Our data confirmed its negative prognostic impact on both OS and CSS. High tumour mutational burden (TMB) was associated with shorter OS, with high programmed death ligand 1 (PD-L1) expression and HPV/p16 negativity. The PD-L1 positivity enrichment in HPV-negative tumours harboring high TMB illustrates pSCC oncogenesis in association with chronic inflammation, high amount of acquired mutations, and neoantigen (PD-L1) production. This discovery suggests that patients with HPV-independent SCC could be suitable candidates for anti-PD-1/PD-L1 treatment. In summary, tumour budding, tumour lymphocytic infiltration and p53 show a stronger correlation with survival outcomes compared to factors such as pT stage, histopathological grade or morphological subtype in penile carcinoma.
- MeSH
- biologické markery * analýza MeSH
- infekce papilomavirem komplikace MeSH
- lidé MeSH
- metastázy nádorů patofyziologie MeSH
- mutace MeSH
- nádorový supresorový protein p53 škodlivé účinky MeSH
- nádory penisu * chirurgie diagnóza terapie MeSH
- prognóza * MeSH
- tumor infiltrující lymfocyty patologie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
