V programu surveillance byl v roce 2023 zjištěn v České republice pokles počtu invazivních meningokokových onemocnění oproti předchozímu roku: celkem 16 (nemocnost 0,15/100 000 obyv.) proti 25 v roce 2022 (nemocnost 0,24/100000 obyv.). Z 16 onemocnění v roce 2023 jedno skončilo úmrtím – celková smrtnost 6,25 %. Toto úmrtí způsobila séroskupina Y ve věkové skupině nad 65 let věku. Podobně jako v předchozím roce převažovala i v roce 2023 onemocnění způsobená Neisseria meningitidis B (8 ze 16), čtyři onemocnění byla způsobená séroskupinou C a po jednom onemocnění způsobily séroskupiny A aY. U dvou případů nebyla séroskupina určena: N. meningitidis ND. V roce 2023 došlo ve srovnání s předchozím rokem k výraznému poklesu nemocnosti v nejmladší věkové skupině 0–11měsíčních (na 1,96/100 000 z 5,37/100000 obyv.). Nemocnost v nejmladší věkové skupině klesla u onemocnění způsobeného séroskupinou B (na 0,98/100 000 z 3,58/100000 obyv.) i u séroskupin preventabilních konjugovanou tetravakcínou A, C, W, Y (na 0,98/100 000 z 1,79/100000 obyv.). Ve věkové skupině 1–4letých nemocnost v roce 2023 mírně klesla oproti předchozímu roku (na 0,43/100 000 z 0,67/100000 obyv.) a byla způsobena pouze séroskupinou B. Ve věkové skupině 15–19 letých v roce 2023 nemocnost poklesla oproti předchozímu roku (na 0,18/100 000 z 0,79/100 000 obyv.) a byla rovněž způsobena pouze séroskupinou B. Z 16 invazivních meningokokových onemocnění v roce 2023 bylo 9 prokázáno pouze kultivačně, 2 kultivačně a metodou PCR, 5 pouze metodou PCR. V roce 2023 byla v Národní referenční laboratoři provedena multilokusová sekvenční typizace (MLST) u všech 9 kmenů z invazivního meningokokového onemocnění, které byly do NRL pro meningokokové nákazy poslány. MLST prokázala heterogenitu izolátů způsobujících IMO: celkem bylo zjištěno 5 hypervirulentních klonálních komplexů, z nich nejčastější byl cc103 (3 izoláty), následovaný cc11, cc213, cc23 a cc41/44 (vždy po jednom izolátu). MLST analýze byl podroben také jeden izolát od kontaktu s IMO s výsledkem cc103.
In the surveillance programme, a decrease in the number of invasive meningococcal diseases (IMD) was detected in the Czech Republic in 2023 compared to the previous year: a total of 16 (incidence 0.15/100000) compared to 25 in 2022 (incidence 0.24/100000). Of the 16 cases in 2023, one resulted in death – an overall case fatality rate was 6.25%. This death was caused by serogroup Y in the age group over 65 years. As in the previous year, Neisseria meningitidis B accounted for the majority of cases in 2023 (8 out of 16), four cases were caused by serogroup C and one case each by serogroups A and Y. In two cases, the serogroup was not determined: N. meningitidis ND. In 2023, there was a significant decrease in the morbidity in the youngest age group 0–11 months (to 1.96/100,000 from 5.37/100,000) compared to the previous year. Morbidity in the youngest age group decreased for serogroup B (to 0.98/100,000 from 3.58/100,000) and for serogroups preventable with conjugate tetravaccine A, C, W, Y (to 0.98/100,000 from 1.79/100,000). In the age group 1–4 years old, the morbidity in 2023 decreased slightly compared to the previous year (to 0.43/100,000 from 0.67/100,000) and was caused only by serogroup B. In the age group 15–19 years old, the morbidity in 2023 decreased compared to the previous year (to 0.18/100 000 from 0.79/100000) and was also due to serogroup B only. Of the 16 invasive meningococcal disease cases in 2023, 9 were proven by culture only, 2 by culture and PCR, and 5 by PCR only. In 2023, multilocus sequence typing (MLST) was performed for all the 9 strains from the invasive meningococcal disease cases sent to the National Reference Laboratory for Meningococcal Infections. MLST demonstrated heterogeneity of the isolates causing IMD: a total of 5 hypervirulent clonal complexes were identified, the most common being cc103 (3 isolates), followed by cc11, cc213, cc23 and cc41/44 (one isolate each). One isolate from the IMD contact was also subjected to MLST analysis with the result of cc103.
- MeSH
- lidé MeSH
- meningokokové infekce * epidemiologie mortalita prevence a kontrola MeSH
- meningokokové vakcíny MeSH
- Neisseria meningitidis izolace a purifikace klasifikace MeSH
- polymerázová řetězová reakce MeSH
- séroskupina MeSH
- surveillance populace MeSH
- věkové rozložení MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- grafy a diagramy MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
- Publikační typ
- abstrakt z konference MeSH
V programu surveillance byl v roce 2022 zjištěn v České republice vzestup počtu invazivních meningokokových onemocnění oproti předchozímu roku: celkem 25 (nemocnost 0,24/100000 obyv.) proti 11 v roce 2021 (nemocnost 0,10/100 000 obyv.). Z 25 onemocnění v roce 2022 tři skončila úmrtím – celková smrtnost 12 %. Jedno úmrtí způsobila séroskupina B, dvě úmrtí séroskupinaY. Tato úmrtí byla preventabilní očkováním. Podobně jako v předchozím roce převažovala i v roce 2022 onemocnění způsobená N. meningitidis B (16 z 25), tři onemocnění byla způsobená séroskupinou Y a po dvou onemocněních způsobily séroskupiny C a W. V roce 2022 došlo ve srovnání s předchozím rokem k výraznému vzestupu nemocnosti v nejmladší věkové skupině 0–11měsíčních (na 5,37/100000 z 1,82/100 000), který byl způsoben zejména séroskupinou B, u níž nemocnost stoupla oproti předchozímu roku na 3,58/100000 z 1,82/100 000. U séroskupin preventabilních konjugovanou tetravakcínou A, C, W, Y stoupla v roce 2022 nemocnost v nejmladší věkové skupině na 1,79/100000 oproti nulové hodnotě v předchozím roce. Ve věkové skupině 1–4letých nemocnost stoupla oproti předchozímu roku (na 0,67/100000 z 0,22/100000) a byla způsobena pouze séroskupinou B.Ve věkové skupině 15–19letých nemocnoststoupla oproti předchozímu roku na 0,79/100000 oproti nulové hodnotě v předchozím roce a byla způsobena pouze séroskupinou B. Z 25 invazivních meningokokových onemocnění bylo 14 prokázáno pouze kultivačně, 6 kultivačně a metodou PCR, 5 pouze metodou PCR. V roce 2022 byla v NRL provedena multilokusová sekvenční typizace (MLST) u 15 kmenů z invazivního meningokokového onemocnění, které byly do NRL pro meningokokové nákazy poslány. MLST prokázala heterogenitu izolátů způsobujících invazivní meningokokové onemocnění: celkem bylo zjištěno 10 klonálních komplexů, z nich nejčastější byl cc213 (4 izoláty), následovaný cc41/44 (2 izoláty).
The surveillance programme data showed an increase in the number of invasive meningococcal disease cases in the Czech Republic in 2022 compared to the previous year: a total of 25 (0.24/100000) compared to 11 in 2021 (0.10/100000). Three of the 25 cases in 2022 were fatal, and the overall case fatality rate was 12%. One death was caused by serogroup B, two by serogroup Y. These deaths were vaccine preventable. As in the previous year, N. meningitidis B accounted for the majority of the cases in 2022 (16 out of 25), three cases were caused by serogroup Y, and two cases each were caused by serogroups C and W. In 2022, there was a significant increase in morbidity in the youngest age group of 0–11 months (to 5.37/100,000 from 1.82/100,000), mainly due to serogroup B, which increased to 3.58/100,000 from 1.82/100,000 compared to the previous year. In serogroups preventable withA, C, W,Y conjugated tetravaccine, the morbidity in the youngest age group increased to 1.79/100,000 in 2022 compared to zero in the previous year. In the 1–4-year age group, morbidity increased from the previous year (to 0.67/100,000 from 0.22/100,000) and was due to serogroup B only. In the 15–19 age group, the morbidity increased from the previous year to 0.79/100 000 compared to zero in the previous year and was due to serogroup B only. Of the 25 cases of invasive meningococcal disease, 14 were proven by culture only, 6 by culture and PCR, and 5 by PCR only. In 2022, multilocus sequence typing (MLST) was performed on 15 strains from invasive meningococcal disease that were sent to the National Reference Laboratory for Meningococcal Infections. MLST demonstrated heterogeneity of the isolates causing invasive meningococcal disease: a total of 10 clonal complexes were identified, with cc213 (4 isolates) being the most common, followed by cc41/44 (2 isolates).
- MeSH
- lidé MeSH
- meningokokové infekce * epidemiologie mortalita MeSH
- séroskupina MeSH
- vakcinace MeSH
- věkové rozložení MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- zprávy MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
BACKGROUND: The Invasive Respiratory Infection Surveillance (IRIS) Consortium was established to assess the impact of the COVID-19 pandemic on invasive diseases caused by Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Neisseria meningitidis, and Streptococcus agalactiae. We aimed to analyse the incidence and distribution of these diseases during the first 2 years of the COVID-19 pandemic compared to the 2 years preceding the pandemic. METHODS: For this prospective analysis, laboratories in 30 countries and territories representing five continents submitted surveillance data from Jan 1, 2018, to Jan 2, 2022, to private projects within databases in PubMLST. The impact of COVID-19 containment measures on the overall number of cases was analysed, and changes in disease distributions by patient age and serotype or group were examined. Interrupted time-series analyses were done to quantify the impact of pandemic response measures and their relaxation on disease rates, and autoregressive integrated moving average models were used to estimate effect sizes and forecast counterfactual trends by hemisphere. FINDINGS: Overall, 116 841 cases were analysed: 76 481 in 2018-19, before the pandemic, and 40 360 in 2020-21, during the pandemic. During the pandemic there was a significant reduction in the risk of disease caused by S pneumoniae (risk ratio 0·47; 95% CI 0·40-0·55), H influenzae (0·51; 0·40-0·66) and N meningitidis (0·26; 0·21-0·31), while no significant changes were observed for S agalactiae (1·02; 0·75-1·40), which is not transmitted via the respiratory route. No major changes in the distribution of cases were observed when stratified by patient age or serotype or group. An estimated 36 289 (95% prediction interval 17 145-55 434) cases of invasive bacterial disease were averted during the first 2 years of the pandemic among IRIS-participating countries and territories. INTERPRETATION: COVID-19 containment measures were associated with a sustained decrease in the incidence of invasive disease caused by S pneumoniae, H influenzae, and N meningitidis during the first 2 years of the pandemic, but cases began to increase in some countries towards the end of 2021 as pandemic restrictions were lifted. These IRIS data provide a better understanding of microbial transmission, will inform vaccine development and implementation, and can contribute to health-care service planning and provision of policies. FUNDING: Wellcome Trust, NIHR Oxford Biomedical Research Centre, Spanish Ministry of Science and Innovation, Korea Disease Control and Prevention Agency, Torsten Söderberg Foundation, Stockholm County Council, Swedish Research Council, German Federal Ministry of Health, Robert Koch Institute, Pfizer, Merck, and the Greek National Public Health Organization.
Cíl: Analýza potenciálních genů virulence metodou sekvenace celého genomu (WGS) u invazivních a neinvazivních izolátů Neisseria meningitidis příbuzných epidemiologicky a/nebo klinicky z období 2005–2021. Materiál a metody: Pro analýzu bylo vybráno 79 izolátů ze tří různých kategorií: z případů invazivního meningokokového onemocnění (IMO) a od jejich zdravých kontaktů; z různého klinického materiálu téhož případu IMO; z různého klinického materiálu téhož případu IMO a od jejich zdravých kontaktů. Metodou WGS byly analyzovány sekvenční změny v genech potenciálních faktorů virulence N. meningitidis, jednalo se o více než 250 lokusů. Výsledky: Četnost sekvenčních změn v potenciálních genech virulence N. meningitidis byla u studovaných invazivních a neinvazivních izolátů značně variabilní. Nejvyšší míra genetické variability byla pozorována u genů pilu, především pilE a pglA. V naší studii byly detekovány změny v genu opacitního proteinu opaA u více než poloviny studovaných izolátů, u MenC izolátů dosahovala četnost změn genu opaA téměř 70 %. Zvýšená četnost změn byla pozorována i v genech, které jsou zodpovědné za produkci kapsule, především genech kapsulárního regionu D+D’. Závěry: Získané výsledky podporují hypotézu, že v patogenitě N. meningitidis se uplatňují i genetické mechanismy, které jsou séroskupinově specifické. Tyto výsledky přispívají k rozšíření vědeckého poznání, které je nezbytné pro vývoj nových účinných vakcín proti IMO.
Aim: Whole genome sequencing (WGS) analysis of candidate virulence genes of epidemiologically and/or clinically related invasive and non-invasive isolates of Neisseria meningitidis from 2005–2021. Material and Methods: Seventy-nine isolates were selected for analysis from three different categories: cases of invasive meningococcal disease (IMD) and their healthy contacts, different clinical specimens from the same IMD case, and different clinical specimens from the same IMD case and their healthy contacts. WGS was used to analyse sequence variability in candidate N. meningitidis virulence factor genes, with more than 250 loci studied. Results: The frequency of sequence changes in the candidate N. meningitidis virulence factor genes of invasive and non-invasive isolates varied widely. The highest level of variability was observed in the pilus genes, especially pilE and pglA. Our study detected variability in the opacity protein A (opaA) gene in more than half of the isolates analysed, with the frequency of opaA gene changes reaching almost 70% in MenC isolates. Higher frequency of changes were also observed in the genes for capsule production, especially in those of the D+D’ capsular region. Conclusions: The results obtained support the hypothesis that serogroup-specific genetic mechanisms are also involved in the pathogenicity of N. meningitidis. These data add to the body of knowledge necessary for the development of new effective IMD vaccines.
- MeSH
- faktory virulence MeSH
- lidé MeSH
- meningokokové infekce epidemiologie MeSH
- Neisseria meningitidis * genetika izolace a purifikace MeSH
- sekvenování celého genomu * MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
- Publikační typ
- abstrakt z konference MeSH
Invasive meningococcal disease belongs among the most dangerous infectious diseases in the world. Several polysaccharide conjugate vaccines against serogroups A, C, W and Y are available and two recombinant peptide vaccines against serogroup B (MenB vaccines) have been developed: MenB-4C (Bexsero) and MenB-fHbp (Trumenba). The aim of this study was to define the clonal composition of the Neisseria meningitidis population in the Czech Republic, to determine changes in this population over time and to estimate the theoretical coverage of isolates by MenB vaccines. This study presents the analysis of whole genome sequencing data of 369 Czech N. meningitidis isolates from invasive meningococcal disease covering 28 years. Serogroup B isolates (MenB) showed high heterogeneity and the most common clonal complexes were cc18, cc32, cc35, cc41/44, and cc269. Isolates of clonal complex cc11 were predominately serogroup C (MenC). The highest number of serogroup W isolates (MenW) belonged to clonal complex cc865, which we described as exclusive to the Czech Republic. Our study supports the theory that this cc865 subpopulation originated in the Czech Republic from MenB isolates by a capsule switching mechanism. A dominant clonal complex of serogroup Y isolates (MenY) was cc23, which formed two genetically quite distant subpopulations and which showed constant representation throughout the observed period. The theoretical coverage of isolates by two MenB vaccines was determined using the Meningococcal Deduced Vaccine Antigen Reactivity Index (MenDeVAR). Estimated Bexsero vaccine coverage was 70.6% (for MenB) and 62.2% (for MenC, W, Y). For Trumenba vaccine, estimated coverage was 74.6% (for MenB) and 65.7% (for MenC, W, Y). Our results demonstrated sufficient coverage of Czech heterogeneous population of N. meningitidis with MenB vaccines and, together with surveillance data on invasive meningococcal disease in the Czech Republic, were the basis for updating recommendations for vaccination against invasive meningococcal disease.
- MeSH
- antigeny bakteriální MeSH
- lidé MeSH
- meningokokové infekce * epidemiologie MeSH
- meningokokové vakcíny * MeSH
- Neisseria meningitidis séroskupiny B * genetika MeSH
- Neisseria meningitidis * MeSH
- sekvenování celého genomu MeSH
- séroskupina MeSH
- syntetické vakcíny genetika MeSH
- vakcinace MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Od prosince 2022 došlo dle dat Národní referenční laboratoře pro streptokokové nákazy (NRL/STR) k nárůstu počtu případů invazivního onemocnění vyvolaného Streptococcus pyogenes (iGAS). Trend pokračoval i v roce 2023, kdy bylo zaznamenáváno zvýšené množství případů především během jarních měsíců s poklesem výskytu v letních měsících. Zvýšený výskyt iGAS v tomto období byl hlášen i z jiných států Evropy a z USA. Invazivní onemocnění vyvolaná S. pyogenes jsou povinně hlášena do Informačního systému infekčních nemocí (ISIN), není však zaveden surveillance program iGAS a posílání izolátů S. pyogenes do NRL/STR je založeno na dobrovolnosti a spolupráci NRL/STR a terénních laboratoří. V NRL/STR byla u všech doručených izolátů S. pyogenes prováděna emm typizace, u vybraných izolátů byla testována citlivost k antibiotikům, dále byla provedena multilokusová sekvenační typizace a celogenomová sekvenace.
Since December 2022, there had been an increase in the number of cases of invasive disease caused by Streptococcus pyogenes (iGAS), according to data from the National Reference Laboratory for Streptococcal Infections (NRL/STR). The trend continued in 2023, with an increased number of cases primarily during the spring months with a decrease in incidence during the summer months. Increased incidence of iGAS during this period was also reported from other European countries and the USA. Invasive diseases caused by S. pyogenes must be reported to the Infectious Disease Information System (ISIN), but there is no surveillance programme for iGAS and S. pyogenes isolates are thus sent to NRL/STR based on voluntary and collaborative efforts between NRL/STR and field laboratories. At the NRL/STR, all S. pyogenes isolates received were emm typed, selected isolates were tested for antibiotic susceptibility, and multilocus sequence typing and whole genome sequencing were performed.
V programu surveillance byl v roce 2021 zjištěn v České republice další výrazný pokles počtu invazivních meningokokových onemocnění oproti předchozímu roku: celkem 11 (nemocnost 0,10/100 000 obyv.) proti 25 v roce 2020 (nemocnost 0,23/100 000 obyv.). Vzhledem k nastaveným opatřením proti šíření onemocnění covid-19 pokračovalo i v roce 2021 snížení řady infekčních onemocnění přenášených vzdušnou cestou, mezi něž patří i invazivní meningokokové onemocnění. Z 11 onemocnění v roce 2021 žádné neskončilo úmrtím. Podobně jako v předchozím roce převažovala i v roce 2021 onemocnění způsobená Neisseria meningitidis B (6 z 11), dvě onemocnění byla způsobena séroskupinou C. U tří z 11 onemocnění nebyla v roce 2021 prokázána séroskupina: N. meningitidis ND. Metodou PCR bylo v roce 2021 z 11 onemocnění prokázáno 6, z toho u jednoho onemocnění byla PCR jedinou metodou poskytující pozitivní výsledek. V roce 2021 byla v NRL provedena multilokusová sekvenční typizace (MLST) u všech šesti kmenů z invazivního meningokokového onemocnění, které byly do NRL poslány. Všechny náležely do séroskupiny B a jejich MLST charakterizace potvrdila vysokou klonální heterogenitu této séroskupiny (cc213, cc32, cc35 a cc41/44).
The surveillance program data showed that the incidence of invasive meningococcal disease (IMD) in the Czech Republic further considerably decreased from 25 cases (0.23/100000) in 2020 to 11 cases (0.10/100000) in 2021. Due to the measures taken to prevent the spread of covid-19, a number of airborne infectious diseases, including IMD, continued to drop in 2021. None of the 11 cases was fatal. Similar to the previous year, the dominant causa- tive agent was N. meningitidis B (five of 11 cases), followed by serogroup C (two cases). The causative serogroup was not determined (N. meningitidis ND) in three of the 11 cases. Six of the 11 cases were diagnosed by PCR, in one of which, PCR was the only method to detect positivity. In 2021, the National Reference Laboratory for Me- ningococcal Infections performed multilocus sequence typing (MLST) of all six referral strains from IMD. They were all assigned to serogroup B, and their MLST characterisation confirmed the high clonal heterogeneity of this serogroup (cc213, cc32, cc35 a cc41/44).
- MeSH
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- kojenec MeSH
- lidé MeSH
- meningokokové infekce * epidemiologie mikrobiologie mortalita MeSH
- meningokokové vakcíny terapeutické užití MeSH
- Neisseria meningitidis izolace a purifikace klasifikace MeSH
- novorozenec MeSH
- věkové rozložení MeSH
- věkové skupiny MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- kojenec MeSH
- lidé MeSH
- novorozenec MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Cíl: V této studii prezentujeme analýzy epidemiologických a molekulárních dat surveillance invazivního meningokokového onemocnění (IMO) v České republice (ČR) za období 1993–2020, které je pro možnost porovnání trendů rozděleno do čtyř sedmiletých období: 1993–1999, 2000–2006, 2007–2013 a 2014–2020. Materiál a metody: Data surveillance IMO vznikají propojením dat Národní referenční laboratoře pro meningokokové nákazy s epidemiologickými daty rutinně hlášenými do informačních systémů infekčních nemocí s vyloučením duplicit. Metodou sekvenace celého genomu (WGS) byly analyzovány vybrané izoláty z IMO. V této studii jsou analyzována WGS data 323 izolátů, které způsobily IMO v ČR mezi roky 1993–2020. Výsledky: Za celé sledované období 1993–2020 bylo v programu surveillance IMO zjištěno 2 674 onemocnění, z nichž 272 skončilo úmrtím na IMO. V prvním sedmiletém období byla zjištěna nejvyšší nemocnost 2,2/100 000 obyvatel v roce 1995, ve třetím období byl zaznamenán pozvolný pokles nemocnosti z 0,8 na 0,6/100 000 obyvatel a v posledním období tento pokles pokračoval až do roku 2020 na nejnižší hodnotu 0,2/100 000. Ve všech čtyřech sledovaných obdobích byla nejvyšší nemocnost ve věkové skupině 0–11 měsíců, na druhém místě byla věková skupina 1–4 roky a na třetím místě věková skupina 15–19 roků. Nejvíce onemocnění způsobily meningokoky séroskupiny B (43,6 %), následované séroskupinou C (34,9 %), séroskupinou Y (1,8 %) a séroskupinou W (1,5 %). Séroskupina X byla zjištěna pouze u tří onemocnění. Celková smrtnost IMO za celé sledované období byla 10,2 % a ve srovnávaných obdobích neklesala. Z hlediska séroskupin za celé sledované období způsobily nejvyšší smrtnost meningokoky séroskupiny Y (14,6 %), následované séroskupinou W (12,5 %), séroskupinou C (12,0 %) a séroskupinou B (8,1 %). Z hlediska věkových skupin za celé sledované období byla nejvyšší smrtnost zjištěna ve věkové skupině 65 a více roků (24,7 %). Data WGS 323 izolátů z IMO z let 1993–2020 ukázala nejpočetnější zastoupení osmi klonálních komplexů: cc11, cc44/41, cc32, cc267, cc23, cc18, cc35 a cc865. Izoláty séroskupiny C, cc11 z posledního sledovaného období, tvoří dvě vzájemně geneticky odlišné populace s odlišnými fenotypy, které jsou geneticky vzdálené od linie izolátů cc11 z prvních dvou období. Ve studovaném souboru byla zastoupena unikátní česká subpopulace izolátů séroskupiny W (ST-3342, cc865), zachycená pouze v posledních dvou sledovaných obdobích (2007–2020), jejíž pozice na fylogenetické síti podporuje teorii, že tato subpopulace séroskupiny W vznikla na území ČR z izolátů séroskupiny B mechanismem změny séroskupiny („capsule switching“). Klonální komplexy cc41/44, cc32, cc267, cc18 a cc35 jsou v převážné většině tvořeny izoláty séroskupiny B, zatímco cc23 je tvořen výhradně izoláty séroskupiny Y. Závěry: Analýza dat surveillance za 28leté období potvrzuje, že současné nastavení vakcinační strategie v ČR, tj. očkování malých dětí a adolescentů kombinací vakcíny MenB a konjugované tetravakcíny A, C, W, Y, nejlépe odpovídá dlouhodobé epidemiologické situaci IMO v ČR.
Aim: An analysis is presented of epidemiological and molecular data from invasive meningococcal disease (IMD) surveillance in the Czech Republic (CR) for 1993–2020, comparing trends in four seven-year periods: 1993–1999, 2000–2006, 2007–2013, and 2014–2020. Material and Methods: IMD surveillance data are generated by linking National Reference Laboratory for Meningococcal Diseases data and epidemiological data routinely reported to the infectious diseases information systems, with duplicate data removal. Whole genome sequencing (WGS) was used for analysis of selected isolates from IMD cases. In this study, WGS data are analysed on 323 isolates recovered from IMD cases in the Czech Republic between 1993–2020. Results: Over the entire study period 1993–2020, 2,674 cases were recorded in the IMD surveillance programme, of which 272 were fatal. In the first seven-year period, the highest incidence rate of 2.2/100,000 population was reported in 1995, a gradual decline from 0.8 to 0.6/100,000 was observed in the third period, and in the last period, this decline continued until 2020, achieving a low of 0.2/100,000. In all four study periods, the age group 0-11 months was the most affected, followed by 1–4-year-olds and 15-19-year-olds. Serogroup B caused the highest number of cases (43.6%), followed by serogroups C (34.9%), Y (1.8%), and W (1.5%). Serogroup X was only found in three cases. The overall case fatality rate in the entire study period was 10.2%, with no decline seen in the four periods. The highest case fatality rate was associated with serogroup Y (14.6%), followed by serogroups W (12.5%), C (12.0%), and B (8.1%). In terms of age, the highest case fatality rate was observed in people aged 65+ (24.7%). The WGS data for 323 IMD isolates from 1993-2020 showed the highest representation of eight clonal complexes: cc11, cc44/41, cc32, cc267, cc23, cc18, cc35, and cc865. Isolates of serogroup C, cc11, from the last study period form two genetically distinct populations with distinct phenotypes that are genetically distant from the lineage of cc11 isolates from the first two periods. The study population included a unique Czech subpopulation of serogroup W isolates (ST-3342, cc865), recorded only in the last two periods (2007–2020), whose position in the phylogenetic network supports the theory that the serogroup W population in the Czech Republic originated from serogroup B isolates as a result of serogroup switch (capsule switch). Clonal complexes cc41/44, cc32, cc267, cc18, and cc35 are predominantly composed of serogroup B isolates, while cc23 includes exclusively serogroup Y isolates. Conclusions: The analysis of surveillance data over a 28-year period confirms that the vaccination strategy currently used in the Czech Republic, i.e., vaccination of young children and adolescents with a combination of MenB vaccine and quadrivalent conjugate ACWY vaccine, appears to be the most appropriate in the context of the long-term epidemiological situation of IMD in the CR.
