BACKGROUND: Vaccination against 5 prominent meningococcal serogroups (A/B/C/W/Y) is necessary for broad disease protection. We report immunopersistence through 4 years after a 2-dose (6-month interval) pentavalent MenABCWY primary vaccine series and safety and immunogenicity of a booster administered 4 years after primary vaccination. METHODS: This randomized, active-controlled, observer-blinded study was conducted in the United States and Europe. In stage 1, healthy MenACWY vaccine-naive or -experienced 10- to 25-year-olds were randomized 1:2 to receive MenABCWY and placebo or MenB-fHbp and MenACWY-CRM. Eligible participants were randomly selected to participate in stage 2, which was an open-label immunopersistence and booster extension. Immunogenicity was assessed through serum bactericidal antibody using human complement (hSBA) assays with serogroups A/C/W/Y (MenA/C/W/Y) and 4 primary serogroup B (MenB) test strains. Immunogenicity endpoints included hSBA seroprotection rates through 48 months after primary vaccination and 1 month after the booster. Safety endpoints included booster reactogenicity events and adverse events (AEs). RESULTS: Of 1379 eligible participants, 353 entered stage 2; 242 completed the 48-month blood draw after primary vaccination and 240 completed the booster vaccination phase. MenA/C/W/Y seroprotection rates remained high for 4 years following a 2-dose MenABCWY primary series (MenACWY-naive, 62.0 %-100.0 %; MenACWY-experienced, 98.7 %-100.0 %) and trended higher than those after a single MenACWY-CRM dose (MenACWY-naive, 38.1 %-95.2 %; MenACWY-experienced, 89.7 %-100.0 %). Corresponding seroprotection rates against MenB remained stable and generally higher than baseline (MenABCWY, 18.2 %-36.6 %; MenB-fHbp, 16.2 %-31.9 % across strains). Following a booster, seroprotection rates against all 5 serogroups were ≥ 93.8 % across groups. Most booster dose reactogenicity events were mild or moderate in severity, and AEs were infrequent. CONCLUSIONS: Immune responses remained high for MenA/C/W/Y and above baseline for MenB through 4 years after the MenABCWY primary series, with robust responses for all 5 serogroups observed following a booster. The MenABCWY booster had an acceptable safety and tolerability profile consistent with the primary series. NCT03135834.

• MeSH
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• imunogenicita vakcíny MeSH
• komplement imunologie   MeSH
• lidé MeSH
• meningokokové infekce * prevence a kontrola   imunologie   MeSH
• meningokokové vakcíny * imunologie   škodlivé účinky   aplikace a dávkování   MeSH
• mladiství MeSH
• mladý dospělý MeSH
• Neisseria meningitidis imunologie   MeSH
• protilátky bakteriální * krev   MeSH
• sekundární imunizace * metody   MeSH
• séroskupina MeSH
• vakcíny konjugované imunologie   aplikace a dávkování   škodlivé účinky   MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• mladý dospělý MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• randomizované kontrolované studie MeSH
• Geografické názvy
• Evropa MeSH
• Spojené státy americké MeSH

Several authors have attributed the explosive outbreak of gastroenteritis that occurred in Czechoslovakia in 1965 to a toxigenic strain of Vibrio cholerae serogroup O37 based on unverified metadata associated with three particular strains from the American Type Culture Collection. Here, by sequencing the original strain preserved at the Czech National Collection of Type Cultures since 1966, we show that the strain responsible for this outbreak was actually a V. cholerae O5 that lacks the genes encoding the cholera toxin, the toxin-coregulated pilus protein and Vibrio pathogenicity islands present in V. cholerae O37 strains.

• MeSH
• cholera * epidemiologie   mikrobiologie   dějiny   MeSH
• cholerový toxin genetika   MeSH
• epidemický výskyt choroby * MeSH
• gastroenteritida * mikrobiologie   epidemiologie   dějiny   MeSH
• genomové ostrovy MeSH
• lidé MeSH
• séroskupina MeSH
• Vibrio cholerae * genetika   klasifikace   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• historické články MeSH
• úvodníky MeSH
• Geografické názvy
• Československo MeSH

Invazivní meningokoková onemocnění patří mezi nejzávažnější infekční onemocnění s vysokou smrtností a četným zastoupením těžkých celoživotních následků u přeživších pacientů. Zákeřností tohoto onemocnění je fakt, že ke vzniku závažného klinického stavu mnohdy dochází často z plného zdraví během několika hodin, přičemž počáteční příznaky jsou většinou velmi nespecifické a nenasvědčují pro rozvoj život ohrožujícího stavu. I pro zkušeného lékaře může být úvodní diagnostika obtížná, o čemž pojednává níže předkládaná kazuistika a zdůrazňuje význam prevence, resp. očkování.

Invasive meningococcal disease is among the most serious infectious diseases with high mortality and a high percentage of severe lifelong consequences for patients who survive. The insidious nature of this disease is that a servus clinical condition often develops within hours from apparent good health, and initial symptoms are usually nonspecific and do not indicate the development of a life-threatening condition. Even experienced doctors may not recognize this disease in time; therefore prevention, vaccination respectively, is crucial. The presented article is based on case report.

• MeSH
• dítě MeSH
• lidé MeSH
• meningokokové infekce * diagnóza   farmakoterapie   prevence a kontrola   MeSH
• meningokokové vakcíny MeSH
• rizikové faktory MeSH
• séroskupina MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• kazuistiky MeSH

Cíl: Předkládáme analýzu celogenomových dat izolátů Streptococcus pneumoniae sérotypů 8 a 22F izolovaných v České republice z invazivního pneumokokového onemocnění (IPO) v období 2014–2020. Proti těmto sérotypům působí nové vícevalentní pneumokokové konjugované vakcíny (PCV). Sérotypy 8 a 22F jsou co do četnosti na předních pozicích v působení IPO v České republice v recentním období. České izoláty S. pneumoniae byly porovnány se zahraničními izoláty ze stejného období a stejných sérotypů, které byly dostupné v mezinárodní databázi PubMLST. Materiál a metody: Pro studii byly vybrány izoláty z IPO v České republice z období 2014–2020 sérotypu 8 (22 izolátů) a sérotypu 22F (21 izolátů). Byla zvolena metoda celogenomová sekvenace (WGS), analýzy a vzájemné porovnání genomů proběhlo s využitím mezinárodní databáze PubMLST. Výsledky: Většina studovaných českých izolátů sérotypu 8 patří do dvou hlavních subpopulací. První subpopulace, ve které dominují izoláty ST-53, je součástí vysoce početné skupiny geneticky blízkých evropských i neevropských izolátů, které jsou na fylogenetické síti zřetelně odděleny. Druhá subpopulace českých izolátů sérotypu 8 (s dominancí ST-404) je geneticky variabilnější a na celosvětové fylogenetické síti tvoří samostatnou linii, v níž se nevyskytují žádné jiné evropské izoláty. České izoláty sérotypu 22F představují homogenní populaci s naprostou převahou ST-433, která patří do geneticky blízké evropské populace. Závěr: Analýza WGS dat izolátů z IPO sérotypů 8 a 22F poskytla detailní pohled na vzájemné genetické vztahy českých populací těchto sérotypů. Zároveň také umožnila porovnání českých populací s odpovídajícími populacemi z ostatních evropských i neevropských zemí. Získané výsledky prohlubují znalosti o šíření genetických linií působících IPO v České republice v postvakcinačním období a jsou podkladem ke zhodnocení vhodnosti zavedení nových vícevalentních PCV v České republice.

Aim: An analysis is presented of whole genome data of Streptococcus pneumoniae serotypes 8 and 22F isolated in the Czech Republic from invasive pneumococcal disease (IPD) in 2014–2020. New multivalent pneumococcal conjugate vaccines (PCVs) are effective against these serotypes. Recently, serotypes 8 and 22F have been among the leading causes of IPD in the Czech Republic. S. pneumoniae isolates from the Czech Republic were compared with those of the same serotypes recovered in other countries in the same period and available in the international database PubMLST. Material and methods: Isolates from IPD of serotypes 8 (22 isolates) and 22F (21 isolates) recovered in the Czech Republic in 2014–2020 were subjected to whole genome sequencing (WGS). The genomes were analysed and compared using the international database PubMLST. Results: Most of the studied Czech serotype 8 isolates belong to two main subpopulations. The first subpopulation, dominated by ST-53 isolates, is part of a highly abundant group of genetically close European and non-European isolates that are clearly separated on the phylogenetic network. The second subpopulation of Czech serotype 8 isolates (dominated by ST-404) is more genetically variable and forms a separate lineage on the global phylogenetic network, with no other European isolates. Czech isolates of serotype 22F are a homogeneous population with a clear predominance of ST-433, which belongs to a genetically close European population. Conclusion: The analysis of WGS data of IPD isolates of serotypes 8 and 22F provided a detailed insight into the genetic relationships between the Czech populations of these serotypes. It also allowed comparison of the Czech populations with the matched populations from other European and non-European countries. The obtained results add to the body of knowledge about the spread of genetic lineages causing IPD in the Czech Republic in the post-vaccination period and provide a basis for considering whether the use of the new multivalent PCVs in the Czech Republic would be beneficial.

• MeSH
• genom bakteriální MeSH
• klinická studie jako téma MeSH
• lidé MeSH
• pneumokokové infekce epidemiologie   mikrobiologie   MeSH
• sekvenování celého genomu metody   MeSH
• séroskupina MeSH
• Streptococcus pneumoniae * genetika   izolace a purifikace   klasifikace   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

Adeno-associated viruses (AAVs) are promising gene therapy vectors, but challenges arise when treating patients with preexisting neutralizing antibodies. Worldwide seroprevalence studies provide snapshots of existing immunity in diverse populations. Owing to the uniqueness of the Basque socio-geographical landscape, we investigated the seroprevalence of eight AAV serotypes in residents of the Basque Country. We found the highest seroprevalence of AAV3, and the lowest seroprevalence of AAV9. Additionally, less than 50% of the Basque population has neutralizing antibodies against AAV4, AAV6, and AAV9. Our findings provide insight into AAV infections in the Basque region, public health, and the development of AAV-based therapeutics.

• MeSH
• Dependovirus * genetika   imunologie   MeSH
• dospělí MeSH
• infekce viry z čeledi Parvoviridae epidemiologie   imunologie   virologie   MeSH
• kohortové studie MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladý dospělý MeSH
• neutralizující protilátky * krev   imunologie   MeSH
• protilátky virové * krev   imunologie   MeSH
• séroepidemiologické studie MeSH
• séroskupina MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladý dospělý MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• Geografické názvy
• Španělsko MeSH

V programu surveillance byl v roce 2023 zjištěn v České republice pokles počtu invazivních meningokokových onemocnění oproti předchozímu roku: celkem 16 (nemocnost 0,15/100 000 obyv.) proti 25 v roce 2022 (nemocnost 0,24/100000 obyv.). Z 16 onemocnění v roce 2023 jedno skončilo úmrtím – celková smrtnost 6,25 %. Toto úmrtí způsobila séroskupina Y ve věkové skupině nad 65 let věku. Podobně jako v předchozím roce převažovala i v roce 2023 onemocnění způsobená Neisseria meningitidis B (8 ze 16), čtyři onemocnění byla způsobená séroskupinou C a po jednom onemocnění způsobily séroskupiny A aY. U dvou případů nebyla séroskupina určena: N. meningitidis ND. V roce 2023 došlo ve srovnání s předchozím rokem k výraznému poklesu nemocnosti v nejmladší věkové skupině 0–11měsíčních (na 1,96/100 000 z 5,37/100000 obyv.). Nemocnost v nejmladší věkové skupině klesla u onemocnění způsobeného séroskupinou B (na 0,98/100 000 z 3,58/100000 obyv.) i u séroskupin preventabilních konjugovanou tetravakcínou A, C, W, Y (na 0,98/100 000 z 1,79/100000 obyv.). Ve věkové skupině 1–4letých nemocnost v roce 2023 mírně klesla oproti předchozímu roku (na 0,43/100 000 z 0,67/100000 obyv.) a byla způsobena pouze séroskupinou B. Ve věkové skupině 15–19 letých v roce 2023 nemocnost poklesla oproti předchozímu roku (na 0,18/100 000 z 0,79/100 000 obyv.) a byla rovněž způsobena pouze séroskupinou B. Z 16 invazivních meningokokových onemocnění v roce 2023 bylo 9 prokázáno pouze kultivačně, 2 kultivačně a metodou PCR, 5 pouze metodou PCR. V roce 2023 byla v Národní referenční laboratoři provedena multilokusová sekvenční typizace (MLST) u všech 9 kmenů z invazivního meningokokového onemocnění, které byly do NRL pro meningokokové nákazy poslány. MLST prokázala heterogenitu izolátů způsobujících IMO: celkem bylo zjištěno 5 hypervirulentních klonálních komplexů, z nich nejčastější byl cc103 (3 izoláty), následovaný cc11, cc213, cc23 a cc41/44 (vždy po jednom izolátu). MLST analýze byl podroben také jeden izolát od kontaktu s IMO s výsledkem cc103.

In the surveillance programme, a decrease in the number of invasive meningococcal diseases (IMD) was detected in the Czech Republic in 2023 compared to the previous year: a total of 16 (incidence 0.15/100000) compared to 25 in 2022 (incidence 0.24/100000). Of the 16 cases in 2023, one resulted in death – an overall case fatality rate was 6.25%. This death was caused by serogroup Y in the age group over 65 years. As in the previous year, Neisseria meningitidis B accounted for the majority of cases in 2023 (8 out of 16), four cases were caused by serogroup C and one case each by serogroups A and Y. In two cases, the serogroup was not determined: N. meningitidis ND. In 2023, there was a significant decrease in the morbidity in the youngest age group 0–11 months (to 1.96/100,000 from 5.37/100,000) compared to the previous year. Morbidity in the youngest age group decreased for serogroup B (to 0.98/100,000 from 3.58/100,000) and for serogroups preventable with conjugate tetravaccine A, C, W, Y (to 0.98/100,000 from 1.79/100,000). In the age group 1–4 years old, the morbidity in 2023 decreased slightly compared to the previous year (to 0.43/100,000 from 0.67/100,000) and was caused only by serogroup B. In the age group 15–19 years old, the morbidity in 2023 decreased compared to the previous year (to 0.18/100 000 from 0.79/100000) and was also due to serogroup B only. Of the 16 invasive meningococcal disease cases in 2023, 9 were proven by culture only, 2 by culture and PCR, and 5 by PCR only. In 2023, multilocus sequence typing (MLST) was performed for all the 9 strains from the invasive meningococcal disease cases sent to the National Reference Laboratory for Meningococcal Infections. MLST demonstrated heterogeneity of the isolates causing IMD: a total of 5 hypervirulent clonal complexes were identified, the most common being cc103 (3 isolates), followed by cc11, cc213, cc23 and cc41/44 (one isolate each). One isolate from the IMD contact was also subjected to MLST analysis with the result of cc103.

• MeSH
• lidé MeSH
• meningokokové infekce * epidemiologie   mortalita   prevence a kontrola   MeSH
• meningokokové vakcíny MeSH
• Neisseria meningitidis izolace a purifikace   klasifikace   MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• séroskupina MeSH
• surveillance populace MeSH
• věkové rozložení MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• grafy a diagramy MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

Enteroaggregative Escherichia coli (EAEC) strains including those of serogroup O111 are important causes of diarrhea in children. In the Czech Republic, no information is available on the etiological role of EAEC in pediatric diarrhea due to the lack of their targeted surveillance. To fill this gap, we determined the proportion of EAEC among E. coli O111 isolates from children with gastrointestinal disorders ≤ 2 years of age submitted to the National Reference Laboratory for E. coli and Shigella during 2013-2022. EAEC accounted for 177 of 384 (46.1 %) E. coli O111 isolates, being the second most frequent E. coli O111 pathotype. Most of them (75.7 %) were typical EAEC that carried aggR, usually with aaiC and aatA marker genes; the remaining 24.3 % were atypical EAEC that lacked aggR but carried aaiC and/or aatA. Whole genome sequencing of 11 typical and two atypical EAEC O111 strains demonstrated differences in serotypes, sequence types (ST), virulence gene profiles, and the core genomes between these two groups. Typical EAEC O111:H21/ST40 strains resembled by their virulence profiles including the presence of the aggregative adherence fimbriae V (AAF/V)-encoding cluster to such strains from other countries and clustered with them in the core genome multilocus sequence typing (cgMLST). Atypical EAEC O111:H12/ST10 strains lacked virulence genes of typical EAEC and differed from them in cgMLST. All tested EAEC O111 strains displayed stacked-brick aggregative adherence to human intestinal epithelial cells. The AAF/V-encoding cluster was located on a plasmid of 95,749 bp or 93,286 bp (pAAO111) which also carried aggR, aap, aar, sepA, and aat cluster. EAEC O111 strains were resistant to antibiotics, in particular to aminopenicillins and cephalosporins; 88.3 % produced AmpC β-lactamase, and 4.1 % extended spectrum β-lactamase. We conclude that EAEC are frequent among E. coli O111 strains isolated from children with gastrointestinal disorders in the Czech Republic. To reliably assess the etiological role of EAEC in pediatric diarrhea, a serotype-independent, PCR-based pathotype surveillance system needs to be implemented in the future.

• MeSH
• antibakteriální látky farmakologie   MeSH
• Escherichia coli * genetika   izolace a purifikace   patogenita   klasifikace   MeSH
• faktory virulence genetika   MeSH
• gastrointestinální nemoci mikrobiologie   MeSH
• genom bakteriální MeSH
• infekce vyvolané Escherichia coli * mikrobiologie   epidemiologie   MeSH
• kojenec MeSH
• lidé MeSH
• multilokusová sekvenční typizace MeSH
• novorozenec MeSH
• předškolní dítě MeSH
• proteiny z Escherichia coli genetika   MeSH
• průjem * mikrobiologie   MeSH
• sekvenování celého genomu * MeSH
• séroskupina MeSH
• trans-aktivátory MeSH
• Check Tag
• kojenec MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• novorozenec MeSH
• předškolní dítě MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

The diverse environmental distribution of Salmonella makes it a global source of human gastrointestinal infections. This study aimed to detect Salmonella spp. and explore their diversity and antimicrobial susceptibility patterns in clinical and environmental samples. Pre-enrichment, selective enrichment, and selective plating techniques were adopted for the Salmonella detection whereas the API 20E test and Vitek Compact 2 system were used to confirm the identity of isolates. Salmonella serovars were subjected to molecular confirmation by 16S rDNA gene sequencing. Disc diffusion method and Vitek 2 Compact system determined the antibiotic susceptibility of Salmonella serovars. Multiple antibiotic resistance index (MARI) was calculated to explore whether Salmonella serovars originate from areas with heavy antibiotic usage. Results depicted low Salmonella prevalence in clinical and environmental samples (3.5%). The main detected serovars included Salmonella Typhimurium, S. enteritidis, S. Infantis, S. Newlands, S. Heidelberg, S. Indian, S. Reading, and S. paratyphi C. All the detected Salmonella serovars (27) exhibited multidrug resistance to three or more antimicrobial classes. The study concludes that the overall Salmonella serovars prevalence was found to be low in environmental and clinical samples of Western Saudi Arabia (Makkah and Jeddah). However, antimicrobial susceptibility patterns of human and environmental Salmonella serovars revealed that all isolates exhibited multidrug-resistance (MDR) patterns to frequently used antibiotics, which might reflect antibiotic overuse in clinical and veterinary medicine. It would be suitable to apply and enforce rules and regulations from the One Health approach, which aim to prevent antibiotic resistance infections, enhance food safety, and improve human and animal health, given that all Salmonella spp. detected in this investigation were exhibiting MDR patterns.

• MeSH
• antibakteriální látky * farmakologie   MeSH
• DNA bakterií genetika   MeSH
• fylogeneze MeSH
• lidé MeSH
• mikrobiální testy citlivosti * MeSH
• mikrobiologie životního prostředí MeSH
• mnohočetná bakteriální léková rezistence * MeSH
• prevalence MeSH
• RNA ribozomální 16S * genetika   MeSH
• Salmonella enterica * účinky léků   genetika   izolace a purifikace   klasifikace   MeSH
• salmonelóza * mikrobiologie   epidemiologie   MeSH
• séroskupina * MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• Geografické názvy
• Saudská Arábie MeSH

Streptococcus pneumoniae (pneumokok) je grampozitivní kok vyvolávající jak neinvazivní, tak invazivní infekční onemocnění. Onemocnění vyvolaná pneumokokem mohou být preventabilní očkováním. Invazivní pneumokoková onemocnění (IPO) musí splňovat mezinárodní definici případu, jsou hlášena na národní i mezinárodní úrovni a v řadě zemí, včetně České republiky, jsou sledována v programu surveillance. Důležitou součástí surveillance IPO je sledování vyskytujících se sérotypů, hodnocení četnosti jednotlivých sérotypů v čase a v relaci k probíhajícím vakcinačním programům. Ve světe i v České republice je u pneumokoků stále častěji prováděna metoda celogenomové sekvenace (whole genome sequencing, WGS), která umožňuje určování sérotypu pneumokoků ze sekvenačních dat, dále přesnou analýzu jejich genetických vztahů a studium genů obsažených v jejich genomu. Celogenomová sekvenace umožňuje získávat spolehlivá a mezinárodně srovnatelná sekvenační data, která lze snadno sdílet. Sekvenační data jsou analyzována pomocí bioinformatických nástrojů, které vyžadují znalosti z oblasti přírodních věd s důrazem na genetiku a znalosti z oblasti bioinformatiky. V publikaci jsou představeny některé možnosti analýzy pneumokoka, kterými jsou sérotypizace, multilokusová sekvenační typizace (MLST), ribozomální MLST (rMLST), core genome MLST (cgMLST), whole genome MLST (wgMLST), single nucleotide polymorphism (SNP) analýza, určení Global Pneumococcal Sequence Cluster (GPSC), stanovení genů virulence a genů antibiotické rezistence. U metody WGS je prezentována strategie její aplikace v Evropě a realizace v praxi. Analýza pneumokoků metodou WGS představuje zlepšení v provádění surveillance IPO, kdy je sérotyp určován molekulárně geneticky, jsou prováděny další podrobnější typizace, získaná data lze snadno mezinárodně porovnávat a lze lépe hodnotit účinnost vakcinačních programů.

Streptococcus pneumoniae (pneumococcus) is a Gram-positive coccus causing both non-invasive and invasive infectious diseases. Pneumococcal diseases are vaccine preventable. Invasive pneumococcal diseases (IPD) meeting the international case definition are reported nationally and internationally and are subject to surveillance programmes in many countries, including the Czech Republic. An important part of IPD surveillance is the monitoring of causative serotypes and their frequency over time and in relation to ongoing vaccination programmes. In the world and in the Czech Republic, whole genome sequencing (WGS) is increasingly used for pneumococci, which allows for serotyping from sequencing data, precise analysis of their genetic relationships, and the study of genes present in their genome. Whole-genome sequencing enables the generation of reliable and internationally comparable data that can be easily shared. Sequencing data are analysed using bioinformatics tools that require knowledge in the field of natural sciences with an emphasis on genetics and expertise in bioinformatics. This publication presents some options for pneumococcal analysis, i.e., serotyping, multilocus sequence typing (MLST), ribosomal MLST (rMLST), core genome MLST (cgMLST), whole genome MLST (wgMLST), single nucleotide polymorphism (SNP) analysis, assignment to Global Pneumococcal Sequence Cluster (GPSC), and identification of virulence genes and antibiotic resistance genes. The WGS strategies and applications for Europe and WGS implementation in practice are presented. WGS analysis of pneumococci allows for improved IPD surveillance, thanks to molecular serotyping, more detailed typing, generation of internationally comparable data, and improved evaluation of the effectiveness of vaccination programmes.

• MeSH
• molekulární biologie metody   MeSH
• multilokusová sekvenční typizace klasifikace   metody   MeSH
• pneumokokové infekce mikrobiologie   MeSH
• sekvenování celého genomu * metody   normy   MeSH
• séroskupina MeSH
• sérotypizace klasifikace   metody   MeSH
• Streptococcus pneumoniae * genetika   izolace a purifikace   MeSH
• techniky typizace bakterií klasifikace   MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH
• přehledy MeSH

• Klíčová slova
• PCV20,
• MeSH
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• kojenec MeSH
• lidé MeSH
• pneumokokové infekce * ekonomika   epidemiologie   prevence a kontrola   MeSH
• pneumokokové vakcíny * ekonomika   terapeutické užití   MeSH
• rizikové faktory MeSH
• séroskupina MeSH
• vakcinace ekonomika   statistika a číselné údaje   MeSH
• věkové faktory MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• kojenec MeSH
• lidé MeSH
• Publikační typ
• novinové články MeSH