In this prospective longitudinal study, we quantified regional brain volume and susceptibility changes during the first two years after the diagnosis of multiple sclerosis (MS) and identified their association with cerebrospinal fluid (CSF) markers at baseline. Seventy patients underwent MRI (T1 and susceptibility weighted images processed to quantitative susceptibility maps, QSM) with neurological examination at the diagnosis and after two years. In CSF obtained at baseline, the levels of oxidative stress, products of lipid peroxidation, and neurofilaments light chain (NfL) were determined. Brain volumetry and QSM were compared with a group of 58 healthy controls. In MS patients, regional atrophy was identified in the striatum, thalamus, and substantia nigra. Magnetic susceptibility increased in the striatum, globus pallidus, and dentate and decreased in the thalamus. Compared to controls, MS patients developed greater atrophy of the thalamus, and a greater increase in susceptibility in the caudate, putamen, globus pallidus and a decrease in the thalamus. Of the multiple calculated correlations, only the decrease in brain parenchymal fraction, total white matter, and thalamic volume in MS patients negatively correlated with increased NfL in CSF. Additionally, negative correlation was found between QSM value in the substantia nigra and peroxiredoxin-2, and QSM value in the dentate and lipid peroxidation levels.
- MeSH
- atrofie patologie MeSH
- lidé MeSH
- longitudinální studie MeSH
- magnetická rezonanční tomografie metody MeSH
- mozek diagnostické zobrazování patologie MeSH
- nemoci centrálního nervového systému * patologie MeSH
- oxidační stres MeSH
- prospektivní studie MeSH
- roztroušená skleróza * diagnostické zobrazování patologie MeSH
- šedá hmota patologie MeSH
- železo MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
Oxidative stress has been implied in cellular injury even in the early phases of multiple sclerosis (MS). In this study, we quantified levels of biomarkers of oxidative stress and antioxidant capacity in cerebrospinal fluid (CSF) in newly diagnosed MS patients and their associations with brain atrophy and iron deposits in the brain tissue. Consecutive treatment-naive adult MS patients (n = 103) underwent brain MRI and CSF sampling. Healthy controls (HC, n = 99) had brain MRI. CSF controls (n = 45) consisted of patients with non-neuroinflammatory conditions. 3T MR included isotropic T1 weighted (MPRAGE) and gradient echo (GRE) images that were processed to quantitative susceptibility maps. The volume and magnetic susceptibility of deep gray matter (DGM) structures were calculated. The levels of 8-hydroxy-2'-deoxyguanosine (8-OHdG), 8-iso prostaglandin F2α (8-isoPG), neutrophil gelatinase-associated lipocalin (NGAL), peroxiredoxin-2 (PRDX2), and malondialdehyde and hydroxyalkenals (MDA + HAE) were measured in CSF. Compared to controls, MS patients had lower volumes of thalamus, pulvinar, and putamen, higher susceptibility in caudate nucleus and globus pallidus, and higher levels of 8-OHdG, PRDX2, and MDA + HAE. In MS patients, the level of NGAL correlated negatively with volume and susceptibility in the dentate nucleus. The level of 8-OHdG correlated negatively with susceptibility in the caudate, putamen, and the red nucleus. The level of PRDX2 correlated negatively with the volume of the thalamus and both with volume and susceptibility of the dentate nucleus. From MRI parameters with significant differences between MS and HC groups, only caudate susceptibility and thalamic volume were significantly associated with CSF parameters. Our study shows that increased oxidative stress in CSF detected in newly diagnosed MS patients suggests its role in the pathogenesis of MS.
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- MeSH
- acidobazická rovnováha MeSH
- fyziologie výživy * MeSH
- lidé MeSH
- mikrobiota MeSH
- poruchy výživy MeSH
- střevní mikroflóra MeSH
- živiny MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
Každý badatel čas od času čelí problému správného výběru statistické metody, která by měla být aplikována, aby vhodně analyzovala jeho data. Naší snahou je zjednodušit tento proces ve smyslu vytvoření webové aplikace, která nabízí pomocnou ruku výzkumníkovi, který řeší statistickou analýzu ve své práci. Aplikace je vytvořena pomocí jazyka R a jednoho z jeho balíčků, Shiny, a je volně dostupná online. R je otevřený programovací jazyk a prostředí věnované zejména statistickým výpočtům a následným grafickým náhledům. Aplikace je dostupná na R-serveru 1. lékařské fakulty Univerzity Karlovy na http://shiny.statest.cz:3838/statisticke_nastroje/ a je založena na vývojovém diagramu navigujícím k aplikovatelné statistické metodě. Integrovaný vývojový diagram umožňuje výzkumníkovi vybrat nejvhodnější statistickou metodu ve smyslu průchodu diagramem krok po kroku tak, jak výzkumník dělá rozhodnutí odpovídáním na kladené otázky. Po určení nejvhodnější metody je přímým odkazem přesměrován na záložku aplikace, která nabízí provedení dané metody nad daty, která badatel do aplikace nahrál. Poskytnutí uživatelsky přátelské aplikace a vývojového diagramu mapujícího rozhodovací proces potenciálních statistických metod a vybírající tu nejvhodnější považujeme za cestu, jak tento proces zjednodušit. Přímé spojení – pomocí odkazu – mezi návrhem metody a záložkou s její realizací může zlepšit uživatelský komfort.
- MeSH
- diabetes mellitus 2. typu * komplikace MeSH
- inzulin metabolismus MeSH
- kardiometabolické riziko MeSH
- kardiovaskulární látky metabolismus MeSH
- komplikace diabetu metabolismus MeSH
- kožní cévní nemoci metabolismus MeSH
- lidé MeSH
- mikrocévy * metabolismus patofyziologie MeSH
- mikrocirkulace fyziologie MeSH
- postprandiální období MeSH
- vazodilatace fyziologie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
Otevřenou platformu pro kooperativní tvorbu webových stránek wiki používají desítky výukových medicínských projektů. Čtvrtým největším z nich jsou WikiSkripta - výukový portál pro české a slovenské studenty medicíny.Stejnou metodikou a podporou vybavený paralelní projekt pro zahraniční studenty medicíny na českých lékařských fakultách v angličtině - WikiLectures, je naproti tomu neúspěšný. V článku popisujeme oba projekty a diskutujeme faktory, které způsobují rozdíly v úspěšnosti obou projektů.
Wiki, an opened platform for cooperative creating of web pages, is used by dozens of medical educational projects. The fourth biggest of them is WikiSkripta – an educational portal for Czech and Slovak medical students. A parallel project intended for foreign medical students taught in English at Czech medical faculties, WikiLectures, uses the same methods and obtains the same support. WikiLectures are however, in contrast to WikiSkripta, not successful. Both WikiSkripta and WikiLetures are described in the paper and factors determining the differences in success are discussed.
