Wilt (Fusarium oxysporum f. sp. lentis; Fol) is one of the major diseases of lentil worldwide. Two hundred and thirty-five isolates of the pathogen collected from 8 states of India showed substantial variations in morphological characters such as colony texture and pattern, pigmentation and growth rate. The isolates were grouped as slow (47 isolates), medium (118 isolates) and fast (70 isolates) growing. The macroconidia and microconidia (3.0-77.5 × 1.3-8.8 μm for macroconidia and 1.8-22.5 × 0.8-8.0 μm for microconidia for length × width) were variable in size and considering the morphological features, the populations were grouped into 12 categories. Seventy representative isolates based on their morphological variability and place of origin were selected for further study. A set of 10 differential genotypes was identified for virulence analysis and based on virulence patterns on these 10 genotypes, 70 Fol isolates were grouped into 7 races. Random amplified polymorphic DNA (RAPD), universal rice primers (URPs), inter simple sequence repeats (ISSR) and sequence-related amplified polymorphism (SRAP) were used for genetic diversity analysis. URPs, ISSR and SRAP markers gave 100% polymorphism while RAPD gave 98.9% polymorphism. The isolates were grouped into seven clusters at genetic similarities ranging from 21 to 80% using unweighted paired group method with arithmetic average analysis. The major clusters include the populations from northern and central regions of India in distinct groups. All these three markers proved suitable for diversity analysis, but their combined use was better to resolve the area specific grouping of the isolates. The sequences of rDNA ITS and TEF-1α genes of the representative isolates were analysed. Phylogenetic analysis of ITS region grouped the isolates into two major clades representing various races. In TEF-1α analysis, the isolates were grouped into two major clades with 28 isolates into one clade and 4 remaining isolates in another clade. The molecular groups partially correspond to the lentil growing regions of the isolates and races of the pathogen.
Luštěniny jsou významnými potravinovými alergeny. K jejich hlavním alergenním složkám patří seed storage proteiny a PR-10 proteiny. Rozhodli jsme se prozkoumat senzibilizační profily specifických IgE protilátek na jednotlivé luštěniny u velkého souboru pacientů vyšetřených pomocí multiplexu ALEX®. Současně jsme sledovali anamnestický výskyt a charakter klinických reakcí na luštěniny a také senzibilizaci a klinické reakce na zkříženě reagující alergeny, konkrétně ořechy, semena a PR-10 proteiny. Vyšetřeno bylo celkem 685 pacientů. Téměř čtvrtina z nich (24 %) byla senzibilizována na některou z luštěnin. Mezi nimi převažovala senzibilizace na arašídy (n = 122) a sóju (n = 98), s velkým odstupem za nimi následovala čočka a příbuzné luštěniny (n = 11). V anamnéze udávali pacienti nejčastěji klinické reakce na arašídy (n = 17), nicméně sóju (4 pacienti) v tomto případě předstihly právě čočka a jí příbuzné luštěniny (celkem 11 pacientů). V klinických reakcích převažovaly reakce systémové, jejichž podkladem byla nejčastěji senzibilizace na seed storage proteiny. Čočka a příbuzné luštěniny sice nepatří mezi přední původce alergických reakcí na potraviny, avšak v našich podmínkách podle všeho významem předstihují sóju a měla by jim proto být věnována větší pozornost.
Legumes are important food allergens. Their major allergenic components are seed storage proteins and PR-10 proteins. We decided to investigate the sensitization profiles of specific IgE antibodies to distinct legumes in a large group of patients examined by multiplex system ALEX ®. We also studied the history of clinical reactions to legumes in sensitized patients and possible cross-reactivity to other allergens, i.e., tree nuts, seeds, or PR-10 proteins. Our study group included 689 patients; almost a quarter of them (24%) was sensitized to some legume. Sensitization to peanuts (n = 122) and soybean (n = 98) prevailed, being followed by sensitization to lentil and the relative legumes. A positive history of clinical reactions was most frequently to peanuts (17 patients); however, clinical reactions to lentil and the relative legumes prevailed (11 patients) over that induced by soybean (4 patients). The clinical reactions were predominantly systemic, mainly due to sensitization to seed storage proteins. Though lentil and the relative legumes are not considered to be prominent food allergens, their importance is significantly higher in our country compared to soybean, and thus we should pay increased attention to them.
- MeSH
- alergeny imunologie MeSH
- alergie na arašídy diagnóza imunologie MeSH
- čočka imunologie MeSH
- Fabaceae imunologie klasifikace MeSH
- Glycine max imunologie MeSH
- imunoglobulin E analýza MeSH
- lidé MeSH
- potravinová alergie * diagnóza etiologie imunologie MeSH
- zásobní proteiny semen imunologie MeSH
- zkřížené reakce imunologie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- MeSH
- čočka MeSH
- Fabaceae * MeSH
- Glycine max MeSH
- hrách setý MeSH
- lidé MeSH
- zdravá strava MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- populární práce MeSH
- Klíčová slova
- viciliny,
- MeSH
- alergeny škodlivé účinky MeSH
- čočka škodlivé účinky MeSH
- dítě MeSH
- Fabaceae * škodlivé účinky MeSH
- imunologické testy metody MeSH
- kožní testy metody MeSH
- lidé MeSH
- potravinová alergie * diagnóza dietoterapie MeSH
- výsledek terapie MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
- Klíčová slova
- viciliny,
- MeSH
- alergeny škodlivé účinky MeSH
- čočka škodlivé účinky MeSH
- Fabaceae škodlivé účinky MeSH
- imunologické testy metody MeSH
- kožní testy metody MeSH
- lidé MeSH
- potravinová alergie * diagnóza dietoterapie MeSH
- předškolní dítě MeSH
- výsledek terapie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- předškolní dítě MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
Although the proteome of each organism is unambiguously coded in its genome, the proteome shows the real biology in action in each particular organism. New powerful tools are being developed for biochemists and biologists to analyze complex biological samples for studying the complete protein supplement of the genome, i. e., the proteome. There are several methods available for proteome analysis including 2-DE and several forms of MS. In recent years, technologies such as microfluidics and array-based systems have appeared in the field of analysis, identification, and quantification of proteins. These novel approaches might help in solving current technical challenges in proteomics. This paper presents a practical application of the first commercially available microfluidic nano-ESI device coupled with nano-LC (i. e., HPLC-chip) for the analysis of samples of some biological protein mixtures.
- MeSH
- chromatografie kapalinová metody přístrojové vybavení MeSH
- čočka chemie MeSH
- financování organizované MeSH
- hmotnostní spektrometrie metody přístrojové vybavení MeSH
- lidé MeSH
- mikrofluidní analytické techniky MeSH
- molekulární sekvence - údaje MeSH
- proteiny analýza genetika MeSH
- rýže (rod) chemie MeSH
- semena rostlinná chemie MeSH
- testování materiálů MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- hodnotící studie MeSH
