To trace evolution of Panton-Valentine leucocidin-positive clonal complex 398 methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) in the Czech Republic, we tested 103 MRSA isolates from humans. Five (4.9%) were Panton-Valentine leucocidin-positive clonal complex 398, sequence types 1232 and 9181. Spread to the Czech Republic may result from travel to or from other countries.

• MeSH
• bakteriální toxiny * biosyntéza   genetika   MeSH
• dějiny 21. století MeSH
• dospělí MeSH
• exotoxiny * genetika   biosyntéza   MeSH
• leukocidiny * genetika   MeSH
• lidé MeSH
• methicilin rezistentní Staphylococcus aureus * genetika   izolace a purifikace   MeSH
• stafylokokové infekce * mikrobiologie   epidemiologie   MeSH
• Check Tag
• dějiny 21. století MeSH
• dospělí MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• historické články MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

We retrospectively analyzed of 211 frozen cerebrospinal fluid samples from immunocompetent persons in the Czech Republic and detected 6 Encephalitozoon cuniculi-positive samples. Microsporidiosis is generally underestimated and patients are not usually tested for microsporidia, but latent infection in immunodeficient and immunocompetent patients can cause serious complications if not detected and treated.

• MeSH
• dospělí MeSH
• Encephalitozoon cuniculi * izolace a purifikace   genetika   MeSH
• encephalitozoonóza * mozkomíšní mok   mikrobiologie   epidemiologie   MeSH
• imunokompetence MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• retrospektivní studie MeSH
• senioři MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

Total joint arthroplasty is a commonly used surgical procedure in orthopedics. Revision surgeries are required in >10% of patients mainly because of prosthetic joint infection caused by bacteria or aseptic implant loosening caused by chronic inflammation. Encephalitozoon cuniculi is a microsporidium, an obligate intracellular parasite, capable of exploiting migrating proinflammatory immune cells for dissemination within the host. We used molecular detection methods to evaluate the incidence of E. cuniculi among patients who had total hip or knee arthroplasty revision. Out of 49 patients, E. cuniculi genotypes I, II, or III were confirmed in joint samples from 3 men and 2 women who had implant loosening. Understanding the risks associated with the presence of microsporidia in periprosthetic joint infections is essential for proper management of arthroplasty. Furthermore, E. cuniculi should be considered a potential contributing cause of joint inflammation and arthrosis.

• MeSH
• Encephalitozoon cuniculi * genetika   MeSH
• encephalitozoonóza * epidemiologie   MeSH
• lidé MeSH
• Microsporidia * genetika   MeSH
• zánět MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

Despite high vaccination coverage, pertussis is increasing in many industrialized countries, including the Czech Republic. To better understand Bordetella pertussis resurgence, we analyzed historic strains and recent clinical isolates by using a comparative omics approach. Whole-genome sequencing showed that historic and recent isolates of B. pertussis have substantial variation in genome organization and form separate phylogenetic clusters. Subsequent RNA sequence analysis and liquid chromatography with mass tandem spectrometry analyses showed that these variations translated into discretely separated transcriptomic and proteomic profiles. When compared with historic strains, recent isolates showed increased expression of flagellar genes and genes involved in lipopolysaccharide biosynthesis and decreased expression of polysaccharide capsule genes. Compared with reference strain Tohama I, all strains had increased expression and production of the type III secretion system apparatus. We detected the potential link between observed effects and insertion sequence element-induced changes in gene context only for a few genes.

• MeSH
• Bordetella pertussis * genetika   MeSH
• fylogeneze MeSH
• lidé MeSH
• pertuse * epidemiologie   MeSH
• pertusová vakcína MeSH
• proteomika MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

During 2008-2018, we collected samples from rodents and patients throughout the Czech Republic and characterized hantavirus isolates. We detected Dobrava-Belgrade and Puumala orthohantaviruses in patients and Dobrava-Belgrade, Tula, and Seewis orthohantaviruses in rodents. Increased knowledge of eco-epidemiology of hantaviruses will improve awareness among physicians and better outcomes of patients.

• MeSH
• fylogeneze MeSH
• hantavirové infekce epidemiologie   imunologie   virologie   MeSH
• Hantavirus genetika   imunologie   MeSH
• imunoglobulin G imunologie   MeSH
• imunoglobulin M imunologie   MeSH
• lidé MeSH
• molekulární epidemiologie * MeSH
• protilátky virové MeSH
• virové geny MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• zvířata MeSH
• Publikační typ
• dopisy MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

We retrospectively assessed the utility of a flow cytometry-based test quantifying the percentage of CD3+ T cells with the CD4-/CD8- phenotype for predicting tularemia diagnoses in 64 probable and confirmed tularemia patients treated during 2003-2015 and 342 controls with tularemia-like illnesses treated during 2012-2015 in the Czech Republic. The median percentage of CD3+/CD4-/CD8- T cells in peripheral blood was higher in tularemia patients (19%, 95% CI 17%-22%) than in controls (3%, 95% CI 2%-3%). When we used 8% as the cutoff, this test's sensitivity was 0.953 and specificity 0.895 for distinguishing cases from controls. The CD3+/CD4-/CD8- T cells increased a median of 7 days before tularemia serologic test results became positive. This test supports early presumptive diagnosis of tularemia for clinically suspected cases 7-14 days before diagnosis can be confirmed by serologic testing in regions with low prevalences of tularemia-like illnesses.

• MeSH
• antigeny CD3 MeSH
• časná diagnóza MeSH
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• mladý dospělý MeSH
• poměr CD4 a CD8 lymfocytů MeSH
• průtoková cytometrie metody   MeSH
• retrospektivní studie MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• senzitivita a specificita MeSH
• sérologické testy metody   MeSH
• studie případů a kontrol MeSH
• T-lymfocyty MeSH
• tularemie krev   diagnóza   MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• mladý dospělý MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

Using long-term data on incidences of Lyme disease and tickborne encephalitis, we showed that the dynamics of both diseases in central Europe are predictable from rodent host densities and climate indices. Our approach offers a simple and effective tool to predict a tickborne disease risk 1 year in advance.

• MeSH
• incidence MeSH
• klíště MeSH
• klíšťová encefalitida epidemiologie   etiologie   MeSH
• krysa rodu rattus * fyziologie   MeSH
• lymeská nemoc epidemiologie   etiologie   MeSH
• nemoci přenášené klíšťaty * epidemiologie   etiologie   MeSH
• podnebí * MeSH
• rizikové faktory MeSH
• zdroje nemoci MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• krysa rodu rattus * fyziologie   MeSH
• zvířata MeSH
• Geografické názvy
• východní Evropa MeSH

• MeSH
• dospělí MeSH
• Echinococcus multilocularis * MeSH
• echinokokóza plic epidemiologie   farmakoterapie   patologie   MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• zoonózy epidemiologie   přenos   MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• zvířata MeSH

• MeSH
• dospělí MeSH
• Echinococcus multilocularis patogenita   MeSH
• echinokokóza plic farmakoterapie   epidemiologie   patologie   MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• zoonózy epidemiologie   přenos   MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• zvířata MeSH
• Publikační typ
• dopisy MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

We report molecular evidence of Tula hantavirus as an etiologic agent of pulmonary-renal syndrome in an immunocompromised patient. Acute hantavirus infection was confirmed by using serologic and molecular methods. Sequencing revealed Tula virus genome RNA in the patient's blood. This case shows that Tula virus can cause serious disease in humans.

• MeSH
• fylogeneze MeSH
• genom virový MeSH
• glomerulonefritida diagnóza   MeSH
• hantavirové infekce diagnóza   MeSH
• Hantavirus klasifikace   genetika   imunologie   MeSH
• hostitel s imunodeficiencí * MeSH
• krvácení diagnóza   MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• molekulární sekvence - údaje MeSH
• plicní nemoci diagnóza   MeSH
• protilátky virové imunologie   MeSH
• RNA virová MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• kazuistiky MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH