To trace evolution of Panton-Valentine leucocidin-positive clonal complex 398 methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) in the Czech Republic, we tested 103 MRSA isolates from humans. Five (4.9%) were Panton-Valentine leucocidin-positive clonal complex 398, sequence types 1232 and 9181. Spread to the Czech Republic may result from travel to or from other countries.

• MeSH
• bakteriální toxiny * biosyntéza   genetika   MeSH
• dějiny 21. století MeSH
• dospělí MeSH
• exotoxiny * genetika   biosyntéza   MeSH
• leukocidiny * genetika   MeSH
• lidé MeSH
• methicilin rezistentní Staphylococcus aureus * genetika   izolace a purifikace   MeSH
• stafylokokové infekce * mikrobiologie   epidemiologie   MeSH
• Check Tag
• dějiny 21. století MeSH
• dospělí MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• historické články MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

x

x

• MeSH
• exfoliatiny izolace a purifikace   škodlivé účinky   MeSH
• leukocidiny izolace a purifikace   škodlivé účinky   MeSH
• lidé MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• septický šok etiologie   MeSH
• stafylokokové infekce * mortalita   MeSH
• Staphylococcus aureus * izolace a purifikace   klasifikace   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

BACKGROUND: A novel Panton-Valentine leukocidin (PVL)-positive meticillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) clonal complex (CC)5-MRSA-IVc ('Sri Lankan' clone) was recently described from Sri Lanka. Similar isolates caused a recent Irish hospital outbreak. AIM: To investigate the international dissemination and diversity of PVL-positive CC5-MRSA-IVc isolates from hospital and community settings using whole-genome sequencing (WGS). METHODS: Core-genome single nucleotide polymorphism (cgSNP) analysis, core-genome multi-locus sequence typing (cgMLST) and microarray-based detection of antimicrobial-resistance and virulence genes were used to investigate PVL-positive CC5-MRSA-IVc (N = 214 including 46 'Sri Lankan' clone) from hospital and community settings in 12 countries over 17 years. Comparators included 29 PVL-positive and 23 PVL-negative CC5/ST5-MRSA-I/II/IVa/IVc/IVg/V. RESULTS: Maximum-likelihood cgSNP analysis grouped 209/214 (97.7%) CC5-MRSA-IVc into Clade I; average of 110 cgSNPs between isolates. Clade III contained the five remaining CC5-MRSA-IVc; average of 92 cgSNPs between isolates. Clade II contained seven PVL-positive CC5-MRSA-IVa comparators, whereas the remaining 45 comparators formed an outlier group. Minimum-spanning cgMLST analysis revealed a comparably low average of 57 allelic differences between all CC5/ST5-MRSA-IVc. All 214 CC5/ST5-MRSA-IVc were identified as 'Sri Lankan' clone, predominantly spa type t002 (186/214) with low population diversity and harboured a similar range of virulence genes and variable antimicrobial-resistance genes. All 214 Sri Lankan clone isolates and Clade II comparators harboured a 9616-bp chromosomal PVL-encoding phage remnant, suggesting both arose from a PVL-positive meticillin-susceptible ancestor. Over half of Sri Lankan clone isolates were from infections (142/214), and where detailed metadata were available (168/214), most were community associated (85/168). CONCLUSIONS: Stable chromosomal retention of pvl may facilitate Sri-Lankan clone dissemination.

• MeSH
• exotoxiny genetika   MeSH
• leukocidiny genetika   MeSH
• lidé MeSH
• methicilin rezistentní Staphylococcus aureus * MeSH
• methicilin MeSH
• mikrobiální testy citlivosti MeSH
• multilokusová sekvenční typizace MeSH
• nemocnice MeSH
• stafylokokové infekce * epidemiologie   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

Národní referenční laboratoř pro stafylokoky CEM SZÚ se i v roce 2022, v rámci zajištění surveillance stafylokokových infekcí, věnovala vyšetřování kmenů stafylokoků z humánního klinického materiálu. Celkem to bylo 661 kmenů, převážně druhu Staphylococcus aureus, které byly zaslány z 65 bakteriologických pracovišť z celé České republiky. Metodou PCR byla zjišťována přítomnost genů kódujících především Pantonův-Valentinův leukocidin (PVL), toxin syndromu toxického šoku TSST-1, exfoliatiny A, B, D a enterotoxiny A–D. Informace o produkci faktorů virulence jsou důležité pro ošetřující lékaře ke správnému stanovení klinické diagnózy a tedy i vhodné terapie. V roce 2022 jsme prokázali pozitivitu PVL leukocidinu z případu rozpadové pneumonie u novorozence. Zaregistrovali jsme 9 případů syndromu toxického šoku, kdy jsme mohli potvrdit původce – toxinogenní kmen S. aureus. U dvou pacientů se jednalo o komplikaci jiného stafylokokového onemocnění, v 7 případech to byla klasická menstruální forma. U jedné pacientky bylo v anamnéze použití menstruálního kalíšku, u zbývajících použití tamponu. V závěru roku nám byl zaslán kmen ze závažného onemocnění syndrom opařené kůže u půlroční dívky. Příčinou byl kmen S. aureus s produkcí exfoliatinu B, který sekundárně infikoval eflorescence při varicelle. V celém souboru bylo i 75 (11,3 %) kmenů koaguláza negativních stafylokoků. U těchto podmíněných patogenů jsme fenotypizací a metodou hmotnostní spektrometrie kmeny identifikovali, resp. konfirmovali identifikaci zjištěnou již v terénních laboratořích.

In 2022, the National Reference Laboratory for Staphylococci CEM of the National Institute of Public Health was dedicated to the detailed investigation of staphylococcal strains from human clinical material as part of the surveillance of staphylococcal infections. A total of 661 strains, mainly of Staphylococcus aureus species, were sent from 65 bacteriological departments from all over the Czech Republic. The PCR method was used to detect the presence of genes encoding mainly Panton-Valentine leukocidin (PVL), toxic shock syndrome toxin TSST-1, exfoliatins A, B, D and enterotoxins A-D. Information on the production of virulence factors is important for treating physicians to decide on a correct clinical diagnosis and therefore appropriate therapy. In 2022, we demonstrated PVL leukocidin positivity from a case of disseminated pneumonia in a newborn. We registered 9 cases of toxic shock syndrome where we could confirm the causative agent, a toxigenic strain of S. aureus. In two patients it was a complication of another staphylococcal disease, in 7 cases it was the classic menstrual form. One patient had a history of menstrual cup use, the remaining patients had a history of tampon use. At the end of the year, we were sent a strain from a severe case of scalded skin syndrome in a six-month-old girl. The cause was a strain of S. aureus producing exfoliatin B, which secondarily infected the efflorescence in varicella. There were also 75 (11.3%) strains of coagulase-negative staphylococci in the entire cohort. For these conditional pathogens, we identified the strains by phenotyping and mass spectrometry or confirmed the identification already established in the field laboratories.

• MeSH
• bakteriální toxiny analýza   MeSH
• enterotoxiny analýza   MeSH
• exfoliatiny analýza   MeSH
• leukocidiny MeSH
• lidé MeSH
• pneumonie stafylokoková MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• septický šok etiologie   MeSH
• stafylokoková toxická epidermální nekrolýza diagnóza   MeSH
• stafylokokové infekce * diagnóza   epidemiologie   MeSH
• Staphylococcus klasifikace   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

Národní referenční laboratoř pro stafylokoky CEM SZÚ se i v roce 2021, v rámci zajištění surveillance stafylokokových infekcí, věnovala podrobnému vyšetřování kmenů stafylokoků z humánního klinického materiálu. Celkem to bylo 659 kmenů, převážně druhu Staphylococcus aureus, které byly zaslány asi z 90 bakteriologických pracovišť z celé České republiky. Metodou PCR byla zjišťována přítomnost genů kódujících především Pantonův - Valentinův leukocidin, toxin Syndromu toxického šoku, exfoliatiny A, B, D a enterotoxiny A–D. Informace o produkci faktorů virulence jsou důležité pro ošetřující lékaře ke správnému stanovení klinické diagnózy a tedy i vhodné terapie. V roce 2021 jsme zaregistrovali 13 případů závažného onemocnění - syndrom toxického šoku, kdy jsme mohli potvrdit původce – toxinogenní kmen S. aureus. Pomohli jsme řešit i hromadný výskyt puchýřnatého onemocnění novorozenců v jedné porodnici, kdy byl příčinou kmen S. aureus s produkcí exfoliatinu A. V celém souboru bylo i 45 (5,9 %) kmenů koaguláza negativních stafylokoků. U těchto podmíněných patogenů jsme fenotypizací a metodou hmotnostní spektrometrie kmeny identifikovali, resp. konfirmovali identifikaci zjištěnou již v terénních laboratořích.

The main focus of the National Reference Laboratory for Staphylococci (NRL) in 2020 was again on the investigation of staphylococcal strains from human clinical specimens within the surveillance of staphylococcal infections. In total, 659 strains mostly of the species Staphylococcus aureus referred to the NRL by 90 bacteriological laboratories from all over the Czech Republic were analysed. The strains were screened by PCR for the genes encoding Panton-Valentine leukocidin, toxic shock syndrome toxin, exfoliative toxins A, B, and D, and enterotoxins A–D. Data on the production of virulence factors are helpful for attending physicians in determining the right diagnosis and effective treatment. In 2021, 13 cases of severe toxic shock syndrome were reported, with toxigenic strain of S. aureus being confirmed as the causative agent. The NRL also participated in the investigation of an outbreak of blistering skin condition in newborns in one maternity hospital where the cause of infection was an exfoliative toxin A producing strain of S. aureus. Fifty-eight strains (5.9%) referred to the NRL were coagulase-negative staphylococci. These opportunistic pathogens were identified or confirmed, after previous identification by field laboratories, by phenotyping and mass spectrometry.

• MeSH
• enterotoxiny izolace a purifikace   škodlivé účinky   MeSH
• exfoliatiny izolace a purifikace   škodlivé účinky   MeSH
• koagulasa izolace a purifikace   MeSH
• leukocidiny izolace a purifikace   škodlivé účinky   MeSH
• lidé MeSH
• mikrobiologické techniky MeSH
• septický šok epidemiologie   etiologie   klasifikace   MeSH
• stafylokokové infekce * epidemiologie   mortalita   patologie   prevence a kontrola   MeSH
• Staphylococcus aureus izolace a purifikace   klasifikace   patogenita   MeSH
• Staphylococcus izolace a purifikace   klasifikace   patogenita   MeSH
• statistika jako téma MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

• MeSH
• antibakteriální látky terapeutické užití   MeSH
• chřipka lidská * diagnóza   komplikace   terapie   MeSH
• leukocidiny škodlivé účinky   MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• péče o pacienty v kritickém stavu MeSH
• pneumonie stafylokoková * diagnóza   komplikace   terapie   MeSH
• respirační insuficience etiologie   komplikace   terapie   MeSH
• stafylokokové infekce etiologie   komplikace   terapie   MeSH
• vakcíny proti chřipce aplikace a dávkování   terapeutické užití   MeSH
• výsledek terapie MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• kazuistiky MeSH

Národní referenční laboratoř pro stafylokoky CEM–SZÚ se i v roce 2019 v rámci zajištění surveillance stafylokokových infekcí věnovala podrobnému vyšetřování kmenů stafylokoků z humánního klinického materiálu. Celkem to bylo 1405 kmenů, převážně druhu Staphylococcus aureus, které byly zaslány asi z 80 bakteriologických pracovišť z celé České republiky. Metodou PCR byla zjišťována přítomnost genů kódujících především Pantonův-Valentinův leukocidin, toxin Syndromu toxického šoku, exfoliatiny a enterotoxiny. Informace o produkci faktorů virulence jsou důležité pro ošetřujících lékaře ke správnému stanovení diagnózy a tedy i vhodné terapie. V celém souboru bylo i 79 (5,6 %) kmenů koaguláza negativních stafylokoků. U těchto podmíněných patogenů jsme fenotypizací a metodou hmotnostní spektrometrie kmeny identifikovali, resp. konfirmovali identifikaci zjištěnou již v terénních laboratořích.

The main focus of the National Reference Laboratory for Staphylococci (NRL) in 2019 was again on the investigation of staphylococcal strains from human clinical specimens within the surveillance of staphylococcal infections. In total, 1405 strains mostly of the species Staphylococcus aureus referred to the NRL by 80 bacteriological laboratories from all over the Czech Republic were analysed. The strains were screened by PCR for the genes encoding Panton- -Valentine leucocidin, toxic shock syndrome toxin, exfoliatins, and enterotoxins. Data on the production of virulence factors are helpful for attending physicians in determining the right diagnosis and effective treatment. Seventy-nine strains (5.6%) referred to the NRL were coagulase negative staphylococci. These opportunistic pathogens were identified or confirmed, after previous identification by field laboratories, by phenotyping and mass spectrometry.

• MeSH
• enterotoxiny izolace a purifikace   klasifikace   MeSH
• exotoxiny izolace a purifikace   MeSH
• koagulasa genetika   izolace a purifikace   MeSH
• leukocidiny izolace a purifikace   MeSH
• lidé MeSH
• polymerázová řetězová reakce metody   statistika a číselné údaje   MeSH
• septický šok epidemiologie   klasifikace   mikrobiologie   MeSH
• spektrometrie hmotnostní - ionizace laserem za účasti matrice metody   přístrojové vybavení   MeSH
• stafylokokové infekce * epidemiologie   genetika   klasifikace   MeSH
• Staphylococcus genetika   izolace a purifikace   klasifikace   patogenita   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

This study is aimed at detecting and characterizing methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) from bulk tank milk samples of cows, sheep, and goats collected from dairy farms in the Czech Republic. All MRSA isolates were identified using PCR detection of the Staphylococcus aureus-specific fragment SA442 and mecA gene. The staphylococcal chromosomal cassettes mec (SCCmec), spa, and multilocus sequence types (MLST) were determined. The presence of genes encoding enterotoxins (ses), Panton-Valentine leukocidin (pvl), exfoliative toxins A, B (eta, etb), and toxic shock syndrome toxin (tst) were assessed. To differentiate human and animal origin, the presence of staphylokinase (sak) gene, ϕSa3 prophage, and susceptibility to tetracycline was tested. Out of 49 bulk tank milk samples examined, 14 (28.6%) were MRSA-positive. Eleven positive samples came from cow's milk (38%) and the remaining three from goat's milk (33%). All samples of ewe's milk were negative. In MRSA isolates three sequence types containing seven spa types were identified. Twelve isolates (85.7%) belonged to ST398 spa types t011/SCCmec IVa, t011/SCCmec V, t034/SCCmec V, t1456/SCCmec IVa, t1255/SCCmec V, and t2346/SCCmec V. Another two isolates belonged to ST5/t3598/SCCmec IVa and ST8/t064/SCCmec IVNT. In six isolates, one or more ses genes (seb, sed, seg, sei, and sej) were confirmed. One isolate from cow's milk harbored the tst gene. Another two isolates (ST398/t1456/SCCmec IVa and ST5/t3598/SCCmec IVa) harbored the sak gene and ϕSa3 prophage, and the latter was the only tetracycline-susceptible isolate in this study. However, none of the isolates was positive for pvl or eta, etb. These results suggest that there is the wide geographical spread of ST398 across different regions of the Czech Republic with no host preference among dairy cattle and goats. Therefore, when evaluating the occupational and foodborne risks, MRSA carriage and infection should be taken into account.

• MeSH
• antibakteriální látky farmakologie   MeSH
• bakteriální proteiny genetika   MeSH
• bakteriální toxiny genetika   MeSH
• exotoxiny genetika   MeSH
• farmy MeSH
• kozy MeSH
• leukocidiny genetika   MeSH
• methicilin rezistentní Staphylococcus aureus genetika   izolace a purifikace   MeSH
• methicilin farmakologie   MeSH
• mlékárenství MeSH
• mléko mikrobiologie   MeSH
• multilokusová sekvenční typizace veterinární   MeSH
• ovce MeSH
• rezistence na methicilin * MeSH
• skot MeSH
• stafylokokové infekce epidemiologie   mikrobiologie   veterinární   MeSH
• techniky typizace bakterií veterinární   MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• skot MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• zvířata MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

OBJECTIVES: Staphylococcus aureus (SA) represents one of the most important microorganism that is part of the normal microflora of humans, but in certain conditions can cause very serious infections. Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) is responsible for a wide spectrum of nosocomial and community associated infections worldwide. The aim of this study was to determine community acquired MRSA (CA-MRSA), as well as the frequency of Panton-Valentine leukocidin (PVL) genes and staphylococcal cassette chromosome mec (SCCmec) types in isolates obtained from outpatients in the region of 700,000 people (Canton Sarajevo, Bosnia and Herzegovina) Methods: Our investigation included phenotypic and genotypic markers such as antimicrobial resistance, pulsed-field gel electrophoresis (PFGE), SCC typing, and PVL detection. RESULTS: Antimicrobial susceptibility: all MRSA isolates were resistant to the β-lactam antibiotics tested, and all isolates were susceptible to trimethoprim sulphamethoxazole, rifampicin, fusidic acid, linezolid, and vancomycin. After the PFGE analysis, the isolates were grouped into five similarity groups: A-E. The largest number of isolates belonged to one of two groups: C - 60% and D - 27%. In both groups C and D, SCCmec type IV was predominant (60% and 88.8%, respectively). A total of 24% of the isolates had positive expression of PVL genes, while 76% showed a statistically significantly greater negative expression of PVL genes. CONCLUSIONS: Using combination techniques, we were able to investigate the origin and genetic background of the strains. PFGE analysis revealed two large, genetically related groups of strains consisting of 87 isolates. Our results suggest failure to apply the screening policy, and a lack of knowledge about multiresistant MRSA strains. This study showed the local epidemiological situation which should be the basis of antimicrobial empiric therapy for non-hospitalized patients.

• MeSH
• antibakteriální látky terapeutické užití   MeSH
• bakteriální proteiny MeSH
• bakteriální toxiny genetika   MeSH
• chromozomy MeSH
• exotoxiny genetika   MeSH
• infekce získané v komunitě epidemiologie   mikrobiologie   MeSH
• leukocidiny genetika   MeSH
• lidé MeSH
• methicilin rezistentní Staphylococcus aureus účinky léků   genetika   izolace a purifikace   MeSH
• methicilin MeSH
• mikrobiální testy citlivosti MeSH
• proteiny vázající penicilin MeSH
• stafylokokové infekce epidemiologie   mikrobiologie   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• Geografické názvy
• Bosna a Hercegovina MeSH

Kmeny Staphylococcus aureus, pozitivní na Pantonův - Valentinův leukocidin, mohou být (kromě kožních infek-cí) příčinou závažných, život ohrožujících rozpadových pneumonií. V příspěvku prezentujeme již čtvrtý letošní případ tohoto onemocnění, který skončil úmrtím.

Panton-Valentine leukocidin-positive strains can cause, apart from skin infections, severe life-threatening disinte-grating pneumonia. A case report is presented of the fourth fatal case of PVL pneumonia this year.

• MeSH
• chřipka lidská komplikace   MeSH
• cytotoxiny škodlivé účinky   MeSH
• leukocidiny izolace a purifikace   škodlivé účinky   MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• pneumonie stafylokoková * diagnóza   farmakoterapie   mortalita   MeSH
• Check Tag
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• kazuistiky MeSH
• tabulky MeSH