Porovnat genové databáze a navrhnout vhodné primerové páry pro detekci a kvantifikaci stafylokoků, enterokoků a jejich faktorů rezistence a virulence přímo v klinickém vzorku. Na reprezentativním souboru kmenů otestovat navržené primerové systémy sloužící k rychlému souběžnému záchytu stafylokoků a enterokoků z různých klinických materiálů, jejich kvantifikaci a případně druhové identifikaci. Po úspěšném zavedení a optimalizaci testovat klinický materiál. Pokud budou stafylokoky a enterokoky v materiálupřítomné, kvantifikovat je a provést průkaz genů, jejichž exprese odpovídá za rozšířenou rezistenci vůči antibiotikům a virulenci. Definovat případné spojitosti mezi výskytem virulentních faktorů a diagnózou.; To compare genetic databases and design suitable primer pairs for detection and quantification of staphylococci, enterococci and their resistance and virulence factors directly in clinical samples. To use a represenattive set of strains for testing the designed primer systems serving for prompt simultaneous capture of staphylococci and enteroccci from various clinical materials, their quantification and genus (or species) identification. Following the successful introduction and optimization, to test clinical material. To quantify enterococci and staphylococci present in the material and to demonstrate gene whose expression is responsible for broad antibiotic resistance and virulence. To define possible relations between the presence of virulence factors and diagnoses.

• MeSH
• Enterococcus MeSH
• faktory virulence MeSH
• infekce spojené se zdravotní péčí genetika   MeSH
• mnohočetná bakteriální léková rezistence MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• stafylokokové infekce MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• infekční lékařství
• biologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Charakteristika a výskyt multiretistentních gram-negativních bakterií z hlediska druhové identifikace, klinického materiálu, diagnózy, nemocničního oddělení a produkce ESBl. Dosažené výsledky mají praktický dopad v racionální antibiotické politice.

• MeSH
• aminoglykosidy terapeutické užití   MeSH
• antibiotická rezistence MeSH
• gramnegativní bakterie patogenita   MeSH
• infekce spojené se zdravotní péčí terapie   patologie   MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• pneumologie a ftizeologie
• parazitologie
• infekční lékařství
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

The minimum inhibitory concentrations (MICs) of 24 antibiotics were determined for 45 Stenotrophomonas maltophilia strains by the microdilution method at 37 and 30 degrees C (after 24 h and 48 h of incubation). The isolates were obtained from mouth swabs and pus of 116 captive snakes whereas the identical strains (based on PFGE) of the same origin were discarded. At 37 degrees C, the isolates showed a low frequency of resistance to levofloxacin (0 and 8.9 % of resistant strains after 24 and 48 h, MICs(50) 0.5 and 1 mg/L, MICs(90) 1 and 2 mg/L) and cotrimoxazole (2.2 % of resistant strains for 24 and 48 h, MICs(50) 4 mg/L for both time periods, MICs(90) 4 and 8). At 30 degrees C, the most effective drugs were also cotrimoxazole (2.2 and 6.7 %, MICs(50) 4 and 8, MICs(90) 8 and 32) and levofloxacin (8.9 and 46.7 %, MICs(50) 1 and 2, MICs(90) 2 and 4). The isolates were either identically or more susceptible to antibiotics than strains acquired from patients hospitalized at Olomouc University Hospital (the same region) with the exception of ciprofloxacin, cefoperazone, cefoperazone/sulbactam and ceftazidime.

• MeSH
• antibakteriální látky farmakologie   MeSH
• bakteriální léková rezistence MeSH
• financování organizované MeSH
• gramnegativní bakteriální infekce mikrobiologie   veterinární   MeSH
• hadi mikrobiologie   MeSH
• hnisání mikrobiologie   MeSH
• mikrobiální testy citlivosti MeSH
• přenašečství mikrobiologie   veterinární   MeSH
• Stenotrophomonas maltophilia izolace a purifikace   účinky léků   MeSH
• ústa mikrobiologie   MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• zvířata MeSH

Thermotolerant Campylobacter spp., in particular Campylobacter jejuni, are among the most frequently identified pathogens, found to be causing human gastrointestinal infections in Europe, with the Czech Republic being no exception. The presented work aimed at assessing results of the first nationwide monitoring of prevalence and antibiotic resistance of Campylobacter spp. in broiler flocks in the Czech Republic, including a comparison of antibiotic resistance of C. jejuni isolates collected from poultry and the human community. The monitoring was carried out in poultry slaughterhouses in 2006 and 2007. From broilers, cloacal swabs were collected and examined. The human isolates of C. jejuni were acquired from rectal swabs in community patients with diarrhoeal diseases. Suspected isolates of both animal and human origin were confirmed by the PCR methods. Antibiotic resistance to selected anti-microbial agents was tested by the microdilution method. In the monitored period, the prevalence of thermotolerant Campylobacter spp. in broilers in the Czech Republic reached almost 50%. In 2006, C. jejuni was detected in 46% and Campylobacter coli in 3% of the tested samples. In 2007, C. jejuni was found in 43% and C. coli in 2% of the samples. The results of anti-microbial susceptibility testing of C. jejuni showed higher resistance in animals when compared with humans. The only exception was tetracycline with higher resistance in isolates of human origin. The highest resistance detected was to quinolone antibiotics. Resistance to oxolinic acid was 77% in animal and 60% in human isolates, to ciprofloxacin 72% in isolates from poultry and 55% in those from humans. In ampicillin, 26% of poultry isolates and 16% of human isolates were resistant. Moreover, 9% of animal isolates demonstrated resistance to streptomycin, undetected in human isolates. In erythromycin, resistance was found in 6% of poultry and 1% of human isolates.

• MeSH
• antibakteriální látky terapeutické užití   MeSH
• bakteriální léková rezistence MeSH
• Campylobacter coli účinky léků   MeSH
• Campylobacter jejuni účinky léků   MeSH
• financování organizované MeSH
• kampylobakterové infekce epidemiologie   farmakoterapie   mikrobiologie   veterinární   MeSH
• kur domácí MeSH
• lidé MeSH
• mikrobiální testy citlivosti MeSH
• mnohočetná bakteriální léková rezistence MeSH
• nemoci drůbeže epidemiologie   farmakoterapie   mikrobiologie   MeSH
• počet mikrobiálních kolonií MeSH
• prevalence MeSH
• rizikové faktory MeSH
• veřejné zdravotnictví MeSH
• vztah mezi dávkou a účinkem léčiva MeSH
• zoonózy MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• zvířata MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

Pichia fabianii, a yeast rarely causing human infections, was isolated from the blood of a patient with aortic valve endocarditis. The isolates were initially identified biochemically as Candida pelliculosa, but based on direct sequencing of the ITS2 region of rRNA, they were subsequently reidentified as P. fabianii. Antifungal therapy with fluconazole and later with voriconazole led to the development of resistant variants which had high MIC values to both antifungals. Strong biofilm formation by this yeast could also have played a role in the development of its resistance and allowed for its persistence on the infected valve during antifungal therapy. To our knowledge, this is the first published case of endocarditis and the fourth human infection caused by this yeast species.

• MeSH
• antifungální látky farmakologie   MeSH
• azoly farmakologie   MeSH
• biofilmy MeSH
• dospělí MeSH
• endokarditida farmakoterapie   mikrobiologie   MeSH
• financování organizované MeSH
• fungální léková rezistence MeSH
• lidé MeSH
• mykózy farmakoterapie   mikrobiologie   MeSH
• Pichia fyziologie   izolace a purifikace   patogenita   účinky léků   MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• kazuistiky MeSH

A rather fast and complicated progression of an infection caused by some strains of Staphylococcus aureus could be associated with the expression and co-action of virulence factor complexes in these strains. This study screened the antibiotic susceptibility and prevalence of virulence markers in isolates of meticillin-resistant S. aureus (MRSA) obtained from patients hospitalized at the University Hospital in Olomouc, Czech Republic. A total of 100 isolates was screened for 13 genes encoding extracellular virulence determinants (tst, pvl, eta, etb, sea, seb, sec, sed, see, seg, seh, sei and sej) and for their distribution in sample types. Eighty-nine isolates were positive for at least one of the genes. Genes for etb, pvl, see and seh were not detected in any of the MRSA isolates. No statistically significant differences in the occurrence of the determinants studied among sample types were found.

• MeSH
• antibakteriální látky farmakologie   MeSH
• bakteriální proteiny genetika   MeSH
• DNA bakterií analýza   izolace a purifikace   MeSH
• faktory virulence genetika   MeSH
• lidé MeSH
• mikrobiální testy citlivosti MeSH
• nemocnice univerzitní MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• prevalence MeSH
• pulzní gelová elektroforéza MeSH
• rezistence na methicilin MeSH
• stafylokokové infekce epidemiologie   mikrobiologie   MeSH
• Staphylococcus aureus genetika   izolace a purifikace   patogenita   účinky léků   MeSH
• virulence genetika   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

Absces štítné žlázy je vzácné onemocnění s dramatickým průběhem. Vzniká nejčastěji v terénu polynodózní strumy. Infekce může být výjimečně způsobena iatrogenně. V předložené kazuistice je popsán vznik abscesu po biopsii tenkou jehlou. Infekčním agens byla Escherichia coli, která není typickým kožním patogenem. Stav vyžadoval intubaci, dočasnou tracheostomii a byl úspěšně vyřešen excizí abscesu a podáním širokospektrých antibiotik. Je zdůrazněna nutnost přísného dodržování aseptických zásad i při minimálně invazivním výkonu, jako je biopsie tenkou jehlou.

• MeSH
• absces etiologie   komplikace   mikrobiologie   MeSH
• asepse MeSH
• financování organizované MeSH
• lidé MeSH
• nemoci štítné žlázy diagnóza   klasifikace   komplikace   MeSH
• tenkojehlová biopsie škodlivé účinky   využití   MeSH
• uzlová struma komplikace   patologie   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• kazuistiky MeSH

Studie proběhla v devíti centrech České republiky a hodnotila charakteristiky pneumonie, která je léčena ambulantně a nevyžaduje hospitalizaci. Byly posuzovány klinické příznaky, radiologické projevy, základní laboratorní a mikrobiologické testy včetně sérologických vyšetření. Byl proveden rozbor antibiotické léčby, její úspěšnost, délka trvání příznaků a pracovní neschopnosti. Do počítačové databáze bylo uloženo 130 nemocných, 58 mužů a 72 žen. Průměrný věk byl 46,3 let, nejčastějším příznakem byla teplota (97,7 %), kašel (86,2 %), celková slabost (61,5 %). Vykašlávání sputa bylo přítomno jen u 50,8 % nemocných. Dle mikrobiologických testů byli nemocní rozděleni do 4 skupin. V 34,6 % se jednalo o pneumonii vyvolanou typickým agens, ve 30,8 % pneumonii vyvolanou atypickým agens, ve 13,1 % pneumonii smíšenou a u 21,5 % nebylo možné vyvolávající agens zjistit. Nejčastějšími typickými patogeny byly Haemophilus influenzae (20,8 %), Streptococcus pneumoniae (10,8 %) a Staphylococcus aureus (4,6 %). Mezi atypickými patogeny to byly Chlamydophila pneumoniae (39,2 %) a Mycoplasma pneumoniae (10,8 %). Nejčastěji podávanými antibiotiky byly makrolidy (53,7 %), (amino) peniciliny (27,4 %), cefalosporiny (9,1 %), tetracykliny (2,9 %), fluorochinolony (6,2 %), jiná antibiotika (0,7 %). Jen ve dvou případech ambulantní léčba selhala a nemocní museli být hospitalizováni.

The study, performed in eight centres in the Czech Republic, evaluated the characteristics of pneumonia treated in ambulatory care, without the need for hospitalization. Clinical signs, radiologic manifestations, basic laboratory and microbiological tests including serological examinations were assessed. Antibiotic therapy was analyzed - its success rate, duration of clinical signs and sick leave. A computer database was filled with 130 patients - 58 males and 72 females. The mean age was 46.3 years, the most frequent symptoms were fever (97.7 %), cough (86.2 %) and general malaise (61.5 %). Only 50.8 % of the patients coughed up sputum. According to microbiological test results, the patients were divided into 4 groups. Pneumonia was caused by typical pathogens in 34.6 %, atypical pathogens in 30.8 %, mixed pathogens in 13.1 %, and the causative agents were impossible to detect in 21.5 %. The most common typical pathogens were Haemophilus influenzae (20.8 %), Streptococcus pneumoniae (10.8 %) and Staphylococcus aureus (4.6 %V, the most common atypical pathogens were Chlamydophtla pneumoniae (39.2 %) and Mycoplasma pneumoniae (10.8 %). The most administered antibiotics were macrolides (53.7 %), (aminolpenicillins (27.4 %), cephalosporins (9.1 %), tetracyclines (2.9 %), fluoroquinolones (6.2 %), and other antibiotics (0.7 %). In only two cases, the ambulatory care failed and the patients had to be hospitalized.

• MeSH
• ambulantní péče metody   organizace a řízení   MeSH
• Chlamydophila pneumoniae patogenita   MeSH
• financování organizované MeSH
• lidé MeSH
• pneumonie etiologie   klasifikace   terapie   MeSH
• pracovní neschopnost MeSH
• Staphylococcus aureus patogenita   MeSH
• Streptococcus pneumoniae patogenita   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

• Publikační typ
• abstrakty MeSH