external proficiency testing
Dotaz
Zobrazit nápovědu
Coeliac disease (CD) is an autoimmune disorder caused by the ingestion of gluten-containing grains. One of the prerequisites for the development of the disease is the presence of specific combinations of HLA alleles at the DQA1 and DQB1 loci. The HLA test is a supportive diagnostic test. In the Czech Republic, approximately 3,500 HLA tests for CD diagnosis are performed annually in almost three dozen laboratories. The HLA Department of the Institute of Haematology and Blood Transfusion in Prague has been offering the EPT "Detection of HLA Alleles Associated with Diseases" for more than 10 years. The results are evaluated in terms of the correct determination of predisposing alleles/allelic groups and clinical interpretation. Every year, we notice some problems with the detection of CD-associated alleles and the interpretation of results. Annual workshops are part of this EPT, and they also include recommendations for the interpretation of results. This interpretation is evolving based on the current knowledge in the field. The current recommendation for interpretation was adopted in 2023, dividing HLA-DQA1/DQB1 genotypes into three categories: 1) detected HLA genotype is associated with predisposition to coeliac disease; 2) coeliac disease could not be excluded based on the detected HLA genotype; 3) coeliac disease could be excluded with high probability based on the detected HLA genotype. The quality of examination is increasing but still needs improvement. Correct results and accurate interpretation can inform clinicians' decisions about the diagnosis of coeliac disease in appropriate patients.
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- přehledy MeSH
Numerous associations of HLA variants with susceptibility to diseases, namely, those with an immunopathological component, have been described to date. The strongest HLA associations were incorporated into the standard algorithms for the diagnostics. Disease-associated HLA variants are routinely detected by various techniques including DNA-based assays. For the identification of HLA markers or their combinations with the highest diagnostic value and those with frequent clinical indications (e.g., HLA-B*27, -B*57:01, -DQ2/-DQ8, -DQB1*06:02), diagnostic tests that focus on a single or limited number of specific HLA antigens/alleles, have already been developed; the use of complete typing for particular HLA loci is a relevant alternative. Importantly, external proficiency testing (EPT) became an integral part of good laboratory practice for HLA disease associations in accredited laboratories and not only supports correct "technical" identification of the associated HLA variants, but also adequate interpretation of the results to the clinicians. In the present article selected aspects of EPT for HLA disease associations related to population genetics are reviewed and discussed with the emphasis on the optimal level of HLA typing resolution, population-based differences in disease associated HLA alleles within the allelic group, distribution and linkage disequilibrium of HLA alleles in particular populations and interpretation of the presence of less common HLA variants/haplotypes. In conclusion, the laboratories that perform and interpret the tests to the clinicians, producers of the certified diagnostics and EPT providers should consider, among others, the genetic characteristics of the populations in order to optimise the diagnostic value of the tests for disease-associated HLA variants.
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- přehledy MeSH
Předmětem sdělení jsou předpokládané změny v charakteru a metodice programů externího hodnocení kvality, korespondující s jeho dvěma hlavními trendy pro blízkou budoucnost: s harmonizací měřících postupů a s inovovanými normami a požadavky na in vitro diagnostika, jak jsou shrnuty v materiálu IVDR (in vitro device diagnostics requirements). Konkrétně jde o důslednou standardizaci a harmonizaci výsledků měření opírající se o metrologickou návaznost kalibrace a hrající roli nástroje dozoru nad kvalitou nejen pro klinické laboratoře, ale i pro výrobce souprav a zařízení IVD. Komutabilita kontrolních materiálů, omezenost postupů při použití kontrolních materiálů nekomutabilních, způsoby stanovení a pravidla aplikace specifikací kvality analytických metod (hodnot APS) k tomu patří. Výhody, možnosti a meze použití biologických variabilit jsou dalším důležitým faktorem harmonizačního potenciálů EHK. V době digitalizace klinických laboratoří nemůže být v programech EHK opomíjena preanalytická a postanalytická fáze měření. Nutnost kontinuálních změn EHK je jasná a odpovídá soudobému trendu vývoje. Je třeba provádět potřebné změny kontinuálně, evolučně a vhodným tempem tak, aby bylo dosahováno pokroku maximálně možného v odpovídajícím čase.
In vitro device diagnostics requirements (IVDR 746), harmonization of results, realized by metrological traceability of calibration are the main fields of next development in laboratory medicine. Corresponding face of external quality assurance programs (EQA) are here briefly described. We deal with problems of commutability of control materials and also with analytical performance specification values (APS). The role of biological variation introduced in EuBIVAS database is also briefly mentioned Problems of using the non-commutable control materials should be solved intensively too. The necessity of stepwise development EQA is clear and leads via commutability control materials and well determined analytical performance values.
External quality assurance (EQA) is crucial to monitor and improve the quality of biochemical genetic testing. ERNDIM (www.erndim.org), established in 1994, aims at reliable and standardized procedures for diagnosis, treatment and monitoring of inherited metabolic disease (IMD) by providing EQA schemes and educational activities. Currently, ERNDIM provides 16 different EQA schemes including quantitative schemes for various metabolite groups, and interpretive schemes such as diagnostic proficiency testing (DPT). DPT schemes focus on the ability of laboratories to correctly identify and interpret abnormalities in authentic urine samples across a wide range of IMDs. In the DPT schemes, six samples each year are distributed together with clinical information. Laboratories choose and perform the tests needed to reach a diagnosis. Data were collected on 345 samples, distributed to up to 105 laboratories worldwide. Diagnostic proficiency (the % of total points possible for all participating laboratories within a scheme for analysis and interpretation) ranged widely: amino acid disorders (n = 20), range 33%-100%, mean 84%; organic acid disorders (n = 35), range 14%-100%, mean 84%; lysosomal storage disorders (n = 13), range 20%-97%, mean 73%; purine/pyrimidine disorders (n = 9), range 37%-100%, mean 70%; miscellaneous disorders (n = 8), range 17%-100%, mean 65%; no IMD, range 65%-95%, mean 85%. When a sample with the same disorder was distributed in a subsequent survey, performance improved in 75 cases with no improvement seen in 32, suggesting overall improvement of performance. ERNDIM diagnostic proficiency testing is a valuable activity which can help to assess laboratory performance, identify methodological/technical challenges, be informative during quality audits and contribute to a better clinical appreciation of diagnostic uncertainty.
- MeSH
- diagnostické techniky a postupy MeSH
- laboratoře MeSH
- lidé MeSH
- lyzozomální nemoci z ukládání * MeSH
- metabolické nemoci * diagnóza genetika moč MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- přehledy MeSH
Nedostatečná úroveň analytické kvality měření chloridů v séru, plasmě a krvi rutinními laboratorními metodami ISE je prokázána výsledky externího hodnocení kvality – EHK (čtyř programů), vyhodnocením interferencí bikarbonátů a dlouhodobým sledováním výsledků pacientů v asi 130 laboratořích v různých zemích. Základním problémem jsou vysoké rozdíly mezi testovacími soupravami nebo mezi přístroji různých výrobců. Příčinou je nedostatečná selektivita a stabilita signálu řady rutinně používaných chloridových elektrod, důsledkem je nízká diagnostická efektivita výsledků měření, kterou lze demonstrovat pomocí extrémně vysokých hodnot kritických referenčních změn (RCV). Přitom již řadu let existuje funkční referenční systém měření chloridů i metrologická návaznost kalibrace rutinních metod na něj.
Insufficient level of analytical quality of chloride determination in blood serum and plasma using routine ISE methods has been demonstrated by the external quality assessment (EQA), by assessment of bicarbonate interference, and longterm follow-up of patient results in approx. One hundred thirty laboratories in several countries. The principal issues are considerable differences between test kits and instruments of various producers. The cause is insufficient selectivity and signal stability of many commonly used chloride electrodes, leading to low diagnostic effectivity of measurement results. This can be demonstrated by extremely high reference change values (RCV). Paradoxically, for many years there was a functional reference system of chloride measurement and metrological traceability of routine methods calibration.
Programmed death ligand 1 (PD-L1) immunohistochemistry (IHC) is accepted as a predictive biomarker for the selection of immune checkpoint inhibitors. We evaluated the staining quality and estimation of the tumor proportion score (TPS) in non-small-cell lung cancer during two external quality assessment (EQA) schemes by the European Society of Pathology. Participants received two tissue micro-arrays with three (2017) and four (2018) cases for PD-L1 IHC and a positive tonsil control, for staining by their routine protocol. After the participants returned stained slides to the EQA coordination center, three pathologists assessed each slide and awarded an expert staining score from 1 to 5 points based on the staining concordance. Expert scores significantly (p < 0.01) improved between EQA schemes from 3.8 (n = 67) to 4.3 (n = 74) on 5 points. Participants used 32 different protocols: the majority applied the 22C3 (56.7%) (Dako), SP263 (19.1%) (Ventana), and E1L3N (Cell Signaling) (7.1%) clones. Staining artifacts consisted mainly of very weak or weak antigen demonstration (63.0%) or excessive background staining (19.8%). Participants using CE-IVD kits reached a higher score compared with those using laboratory-developed tests (LDTs) (p < 0.05), mainly attributed to a better concordance of SP263. The TPS was under- and over-estimated in 20/423 (4.7%) and 24/423 (5.7%) cases, respectively, correlating to a lower expert score. Additional research is needed on the concordance of less common protocols, and on reasons for lower LDT concordance. Laboratories should carefully validate all test methods and regularly verify their performance. EQA participation should focus on both staining concordance and interpretation of PD-L1 IHC.
- MeSH
- antigeny CD274 analýza antagonisté a inhibitory MeSH
- artefakty MeSH
- čipová analýza tkání MeSH
- imunohistochemie * MeSH
- inhibitory kontrolních bodů terapeutické užití MeSH
- klinické rozhodování MeSH
- lidé MeSH
- nádorové biomarkery analýza antagonisté a inhibitory MeSH
- nádory plic farmakoterapie imunologie patologie MeSH
- nemalobuněčný karcinom plic farmakoterapie imunologie patologie MeSH
- odchylka pozorovatele MeSH
- prediktivní hodnota testů MeSH
- reprodukovatelnost výsledků MeSH
- testování odbornosti laboratoří MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- multicentrická studie MeSH
- Geografické názvy
- Evropa MeSH
Stanovení počtu CD34+ buněk průtokovou cytometrií je základní metodou pro hodnocení kvality transplantátů hemopoetických kmenových buněk a pro plánování leukaferéz k jejich odběru. Metoda je založena na víceparametrové průtokové cytometrii a je mezinárodně dobře standardizovaná. Program EHK pro CD34+ kvantifikaci je v rámci ČR a SR k dispozici od roku 2010 a účastní se jej více než 20 laboratoří. Vyhodnocení 8leté zkušenosti ukázalo výbornou dlouhodobou úspěšnost účastníků pohybující se mezi 80–100 % s ojedinělými výkyvy. Část účastníků, kteří jsou do programu zapojeni od začátku, dosahuje dokonce 90% úspěšnosti. Reprodukovatelnost výsledků měření je velmi závislá na množství CD34+ buněk ve vzorku. Při počtu CD34+ buněk nad 10/μl se pohybuje CV okolo 10 %, pod touto hladinou roste o desítky procent. Program hraje důležitou roli v harmonizaci měření CD34+ buněk mezi transplantačními centry a zvyšuje pravděpodobnost získání přesných a porovnatelných výsledků.
Determination of CD34+ cells by flow cytometry is a basic method for assessing the quality of hematopoietic stem cell grafts and for planning their collection by leukapheresis. This method is based on multiparameter flow cytometry and is well-standardized internationally. The EQA program for CD34 + quantification has been available in the Czech and the Slovak Republic since 2010 with more than 20 laboratories involved. Evaluation of the 8-year experience has shown an excellent long-term success of participating laboratories ranging between 80–100 %, with sporadic fluctuations. Some of the participants who have been involved in the program from the beginning, achieve even 90% success rates. Reproducibility of measurement results is highly dependent on the amount of CD34+ cells in the sample. CV oscillates around 10 % if the CD34+ count is 10/μL or higher and increases by dozens of percent below this level. The program plays an important role in harmonizing CD34+ determination between transplant centres and increases the likelihood of obtaining accurate and comparable results.
- Klíčová slova
- CD34+ buňky, variabilita,
- MeSH
- kmenové buňky cytologie MeSH
- lidé MeSH
- průtoková cytometrie MeSH
- reprodukovatelnost výsledků MeSH
- řízení kvality MeSH
- testování odbornosti laboratoří * MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
- Slovenská republika MeSH
EuroFlow Quality Assessment was designed to provide a feedback on the quality of the standardization effort in executing the EuroFlow protocols for sample preparation and instrument setup. It was first beta-tested by the members of the EuroFlow consortium internally (2010-2013) and opened to the external participants from 2015 onwards. The goal of participation in the EuroFlow QA is to evaluate whether the technical quality of the data generated by the laboratory is comparable to the data of the EuroFlow members and thus if a non-EuroFlow member participant can use the EuroFlow reference sample database for his own patient evaluation. Also it assesses whether data are sufficiently standardized for automated population gating and alarm notification. By spring 2018, a total 87 laboratories from 32 countries on five continents have registered for the EuroFlow QA program. We evaluated 163 results of 2015-2016 QA rounds, where we noted clear improvement in the score of first-time participants (median score of 91% correct) when they participated second time or later (median score of 94% correct, p = 0,017), which was comparable to EuroFlow member scores (median score of 97% correct). Among frequent mistakes, we found non-adherence to the EuroFlow protocols (improper reagent used), improper gating and some compensation issues. In summary, we show that EuroFlow QA has a positive impact on improvement of standardized data quality of non-member laboratories adhering to the EuroFlow standard operating procedures and reagent panels.
- MeSH
- laboratoře normy MeSH
- lidé MeSH
- průtoková cytometrie normy MeSH
- referenční standardy MeSH
- testování odbornosti laboratoří metody MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
Cíl: Doporučení Kidney Disease Improving Global Outcomes (KDIGO) doporučuje vydávat výsledek koncentrace cystatinu C společně s odhadovanou glomerulární filtrací (eGFRcys). Míra implementace tohoto doporučení v praxi není známa. Cílem této studie je stanovit míru této implementace a laboratořím, které tak ještě neučinily, poskytnout návod k jejímu zavedení. Typ studie: průřezová. Název a sídlo pracoviště: SEKK, spol. s.r.o., Za Pasáží 1609, 530 02 Pardubice. Materiál a metody: Hodnocení implementace doporučení bylo provedeno pomocí internetového elektronického dotazníku, který byl přidán k cyklu externího hodnocení kvality (EQA). 70 účastníkům (59 z České republiky a 11 ze Slovenska). Účastníci odpovídali, jestli má jejich metoda návaznost kalibrace na mezinárodní referenční materiál ERM DA471/IFCC a jestli počítají eGFRcys. Odpovědi byly analyzovány. Výsledky: Na dotazník odpovědělo 63 účastníků. Návaznost kalibrace měření k mezinárodnímu referenčnímu materiálu ERM DA471/IFCC uvedlo 53 odpovědí. Celkem 53 laboratoří uvedlo vydávání eGFR u všech dospělých pacientů a čtyři vydávají eGFR jen na vyžádání. Šest laboratoří nepočítá eGFR. The Chronic Kidney Disease Epidemiology Collaboration (CKD - EPI) rovnice byla užívána 57 laboratořemi. Z nich 22 počítá také kombinovanou rovnici s kreatininem a tři laboratoře počítají také Caucasian, Asian, Pediatric and Adult (CAPA) rovnici. Závěr: Většina laboratoří dodržuje KDIGO doporučení. Nicméně další edukace ohledně návaznosti měření a výpočtu eGFR s každým výsledkem je stále potřebná.
Objectives: Kidney Disease Improving Global Outcomes (KDIGO) guidelines recommend reporting the cystatin C concentration result together with estimated glomerular filtration rate (eGFRcys). The extent to which the recommendation is implemented to practice is not known. The aim of this study is to determine the implementation extent and to show how laboratories that have not yet implemented the measure can be guided to adopting it to their routines. Design: Cross – sectional study. Settings: SEKK, spol. s.r.o., Za Pasáží 1609, 530 02 Pardubice. Material and methods: Evaluation of cystatin C post-analytical phase was performed by an online electronic questionnaire which was added to routine cystatin C External Quality Assessment (EQA) scheme. A total of 70 participants (59 from the Czech Republic and 11 from Slovakia) were given the questionnaire. They reported traceability of their method calibration to international standard ERM DA471/IFCC, and equations for eGFRcys. Answers were analysed. Results: In the end, 63 participants responded to the questionnaire. Traceability of calibration to ERM DA471/IFCC was declared by 53 responders. A total of 53 laboratories stated reporting eGFR in all adult patients and 4 participants stated reporting eGFR only on direct request. Six laboratories did not report eGFR. The Chronic Kidney Disease Epidemiology Collaboration (CKD - EPI) equation was used by 57 laboratories. Of them, 22 laboratories also used combined equation with creatinine and three laboratories also calculated Caucasian, Asian, Pediatric and Adult (CAPA) equation. Conclusion: Majority of laboratories follow the KDIGO guidelines. Further education on calibration traceability and eGFR accompanying all cystatin C concentration results is still needed.
- Klíčová slova
- odhadovaná glomerulární filtrace,
- MeSH
- cystatin C * analýza MeSH
- hodnoty glomerulární filtrace MeSH
- lidé MeSH
- průzkumy a dotazníky MeSH
- testování odbornosti laboratoří MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
Pojednává se o aktuálním stavu názorů na výpočet chyb a použití nejistot měření. Diskutuje se rozdíl mezi celkovou chybou a nejistotou měření ve světle současných názorů, souvislost nejistot s akceptovatelnými limity programů EHK a s hodnotami referenčních změn následných měření (RCV), s hodnotami referenčních intervalů a s hodnotami biologických variabilit. Dále jsou obsahem sdělení souvislosti nejistot měření s hodnotami bias, se stavem metrologické návaznosti a kalibrační hierarchie. Některé názory na problémy stanovení nejistot měření zaznamenaly v poslední době změny. Máme na mysli zejména v jakém vztahu jsou nejistoty k akreditacím laboratoří, jak použít nejistoty k posuzování shody, a zda a nakolik jsou rozdíly mezi celkovou chybou a nejistotami, časté předměty kontroverzí, vůbec významné. Velmi zajímavou otázkou je problém nejistot i celkových chyb u metod bez metrologické návaznosti a harmonizace. Konečně je zmiňován způsob, jak snadno a bez závažných problémů vypočítat nejistoty v rutinních laboratořích z dat analytické kontroly a hodnocení výsledků vnitřní kontroly a externího hodnocení kvality.
In our presentation we deal with some recent points of view on the problems of uncertainty measurement in clinical laboratories. Our presentation discusses questions about the differences between uncertainties and total error of measurements. We introduce crucial links among uncertainty and, analytical performance specification of EQAS, biological variation, reference change values and reference intervals. We also introduce relations of uncertainty to metrological traceability and harmonization processes and problems uncertainty calculation in methods with the lack of standardization and harmonization. Also, performance of calculation measurement uncertainty from internal quality and external assessment data are presented.