Mutations and deletions of the tumor suppressor TP53 gene are the most frequent genetic alterations detected in human tumors, though they are rather less frequent in lymphomas. However, acquisition of the TP53 mutation was demonstrated to be one of the characteristic markers in mantle cell lymphoma (MCL) and diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) and prognostic value of the TP53 status has been recognized for these diseases. We present the complex analysis of the TP53 aberrations in 57 cases of MCL and 131 cases of DLBCL. The TP53 status was determined by functional analyses in yeast (FASAY) followed by cDNA and gDNA sequencing. The level of the p53 protein was assessed by immunoblotting and loss of the TP53-specific locus 17p13.3 was detected by FISH. Altogether, we detected 13 TP53 mutations among MCL cases (22.8%) and 29 TP53 mutations in 26 from 131 DLBCL cases (19.8%). The ratio of missense TP53 mutations was 76.9% in MCL and 82.8% in DLBCL. The frequency of TP53 locus deletion was rather low in both diseases, reaching 9.3% in MCL and 15.3% in DLBCL. The presence of TP53 mutation was associated with shorter overall survival (OS) and progression-free survival (PFS) in MCL. Among DLBCL cases, the TP53 mutations shortened both OS and PFS of patients treated with R-CHOP (rituximab, cyclophosphamide, doxorubicin, vincristine and prednisone) and decreased both OS and PFS of patients with secondary DLBCL disease.

• MeSH
• cyklofosfamid aplikace a dávkování   MeSH
• difúzní velkobuněčný B-lymfom farmakoterapie   genetika   patologie   MeSH
• dospělí MeSH
• doxorubicin aplikace a dávkování   MeSH
• Kaplanův-Meierův odhad MeSH
• kvasinky genetika   MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• lymfom z plášťových buněk farmakoterapie   genetika   patologie   MeSH
• mutace MeSH
• nádorový supresorový protein p53 genetika   MeSH
• prednison aplikace a dávkování   MeSH
• přežití bez známek nemoci MeSH
• prognóza * MeSH
• regulace genové exprese u nádorů účinky léků   MeSH
• rituximab aplikace a dávkování   MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• vinkristin aplikace a dávkování   MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

Lung cancer is the leading cause of cancer-related deaths worldwide. The p53 tumor suppressor is a transcription factor controlling expression of its target genes in response to various stress stimuli. Mutations of the TP53 gene occur very frequently in lung carcinomas and they play an important role in both oncogenic transformation of lung epithelial cells and lung carcinoma progression. We determined the TP53 status in 42 samples of squamous cell lung carcinoma (SQCC) and 56 samples of lung adenocarcinoma (AC) by the functional analysis FASAY and its variant called split assay. Altogether, we detected 64 TP53 mutations in 63 patients and analyzed them by cDNA and gDNA sequencing. The TP53 mutations were found in 76.2% (32/42) of SQCC cases, and 55.4% (31/56) of ACs. Immunoblotting revealed the p53 protein accumulation in 18 samples (42.9%) among SQCC cases and 19 samples (33.9%) among AC cases. Using fluorescence in situ hybridization we detected loss of the TP53-specific 17p13.3 locus in 23 from 41 analyzed SQCC samples (56.1%) and in 20 from 54 analyzed AC samples (37.0%). We did not find any statistically significant differences in overall and disease-free survival in relation to TP53 status.

• MeSH
• adenokarcinom genetika   patologie   MeSH
• dospělí MeSH
• hybridizace in situ fluorescenční MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mutace MeSH
• nádorová transformace buněk genetika   MeSH
• nádorový supresorový protein p53 genetika   MeSH
• nádory plic genetika   patologie   MeSH
• nemalobuněčný karcinom plic genetika   patologie   MeSH
• přežití bez známek nemoci MeSH
• prognóza MeSH
• regulace genové exprese u nádorů MeSH
• senioři MeSH
• spinocelulární karcinom genetika   patologie   MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

• Publikační typ
• abstrakt z konference MeSH

Glioblastoma is the most common and the most aggressive type of brain cancer. Aberrations of the RTK/RAS/PI3K-, p53-, and RB cell signaling pathways were recognized as a core requirement for pathogenesis of glioblastoma. The p53 tumor suppressor functions as a transcription factor transactivating expression of its target genes in response to various stress stimuli. We determined the p53 status in 36 samples of glioblastoma by functional analyses FASAY and split assay. Seventeen p53 mutations were detected and further analyzed by cDNA and gDNA sequencing in 17 patients (47.2 %). Fifteen (88.2 %) of the mutations were missense mutations causing amino acid substitutions, seven of them exhibited temperature-sensitivity. Two mutations were determined as short deletions, one of them causing formation of premature termination codon in position 247. Fluorescent in situ hybridization revealed the loss of the p53-specific 17p13.3 locus in four of 33 analyzed samples (12 %). In 12 out of 30 samples (40 %), the p53 protein accumulation was shown by immunoblotting. There was high (80 %) concordance between the presence of the clonal p53 mutation and the p53 protein accumulation.

• MeSH
• delece genu MeSH
• geny p53 * MeSH
• glioblastom genetika   metabolismus   MeSH
• hybridizace in situ fluorescenční MeSH
• kvasinky MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mutace * MeSH
• mutační analýza DNA MeSH
• nádorové buněčné linie MeSH
• nádorový supresorový protein p53 genetika   metabolismus   MeSH
• nádory mozku genetika   metabolismus   MeSH
• orgánová specificita MeSH
• sekvenční analýza DNA MeSH
• senioři MeSH
• teplota MeSH
• Check Tag
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

PURPOSE: There is a distinct connection between TP53 defects and poor prognosis in chronic lymphocytic leukemia (CLL). It remains unclear whether patients harboring TP53 mutations represent a homogenous prognostic group. PATIENTS AND METHODS: We evaluated the survival of patients with CLL and p53 defects identified at our institution by p53 yeast functional assay and complementary interphase fluorescence in situ hybridization analysis detecting del(17p) from 2003 to 2010. RESULTS: A defect of the TP53 gene was identified in 100 of 550 patients. p53 mutations were strongly associated with the deletion of 17p and the unmutated IgVH locus (both P < .001). Survival assessed from the time of abnormality detection was significantly reduced in patients with both missense (P < .001) and nonmissense p53 mutations (P = .004). In addition, patients harboring missense mutation located in p53 DNA-binding motifs (DBMs), structurally well-defined parts of the DNA-binding domain, manifested a clearly shorter median survival (12 months) compared with patients having missense mutations outside DBMs (41 months; P = .002) or nonmissense alterations (36 months; P = .005). The difference in survival was similar in the analysis limited to patients harboring mutation accompanied by del(17p) and was also confirmed in a subgroup harboring TP53 defect at diagnosis. The patients with p53 DBMs mutation (at diagnosis) also manifested a short median time to first therapy (TTFT; 1 month). CONCLUSION: The substantially worse survival and the short TTFT suggest a strong mutated p53 gain-of-function phenotype in patients with CLL with DBMs mutations. The impact of p53 DBMs mutations on prognosis and response to therapy should be analyzed in investigative clinical trials.

• MeSH
• časové faktory MeSH
• chronická lymfatická leukemie genetika   mortalita   MeSH
• delece genu MeSH
• DNA vazebné proteiny chemie   genetika   MeSH
• dospělí MeSH
• geny p53 MeSH
• kohortové studie MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• missense mutace MeSH
• mladiství MeSH
• mutace MeSH
• prognóza MeSH
• vazba proteinů MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

• Publikační typ
• abstrakty MeSH

Úvod: uroteliální karcinom (UK) je onemocnění s vysokým počtem recidiv po prvotní léčbě (70–80 %) a s tendencí k progresi při recidivě (30 %). Dlouhodobé sledování pacientů s tímto onemocněním je tedy nezbytné. Cystoskopie a cytologie jsou v současnosti hlavními metodami používanými k prokazování a sledování uroteliálních karcinomů. Cytologie však vykazuje nedostatečnou senzitivitu, především u dobře diferencovaných nádorů, cystoskopie pak je invazivní a relativně drahá metoda. Proto jsou hledány takové metody, které by umožnily lepší detekci uroteliálního karcinomu ze vzorku moči. V této práci jsou hodnoceny výsledky použití UroVysion (Vysis) fluorescenční in situ hybridizace (FISH) v detekci UK. Materiál a metodika: progrese karcinomu močového měchýře je provázena zvýšením chromozomální nestability a aneuploidií chromozomů 3, 7, 17 a ztrátou lokusu 9p21. Na Urologické klinice a Ústavu patologie FN Brno bylo vyšetřeno 124 pacientů. Vzorky moči byly vyšetřeny cytologicky a metodou FISH a současně byla provedena cystoskopie s odběrem bioptického materiálu pro histologické vyšetření. Výsledky: vyšetření FISH bylo pozitivní v 35 případech, včetně 5 případů s negativní biopsií a cytologií. Negativní výsledek FISH byl zjištěn u 24 pacientů, u kterých byla malignita jednoznačně prokázána histologicky. Senzitivita FISH v hodnoceném souboru byla 58,9 %, specificita 88,1 %. Závěr: FISH je relativně jednoduchá, rychlá a neinvazivní diagnostická metoda. Detekuje známky malignity na molekulární úrovni, což umožňuje časnější diagnostiku a terapii a tak může potenciálně dojít k prodloužení přežití. Metoda FISH s užitím kitu UroVysion se jeví jako perspektivní neinvazivní metoda schopná časné detekce UK, s vyšší senzitivitou než u standardní močové cytologie.

Urothelial carcinoma is a disease at high risk of recurrence after the initial therapy (70-80 %) and with the tendency to progression accomplishing the recurrence (30 %). Long lasting monitoring of patients with urothelial carcinoma is necessary. Cystoscopy and cytology are currently the primary modalities used to detect and monitor urothelial carcinoma. However, cytology has relatively poor sensitivity especially in well differentiated tumors. Cystoscopy is an invasive and relatively expensive method. Therefore, methods improving detection of urothelial carcinoma from urine specimens are employed. Uro Vysion (Vysis) fluorescence in situ hybridization (FISH) for improved detection of urothelial carcinoma was evaluated. Materials and methods. Bladder tumor progression is accompanied by increased chromosomal instability and aneuploidy of chromosomes 3, 7, 17 and loss of locus 9p21. A total of 124 patients were analyzed at Dpts. of Urology and Pathology, Faculty Hospital in Brno. Cytologically analyzed urine specimens were tested by FISH and simultaneously cystoscopy was employed including biopsy for histological examination. Results: FISH analysis was positive in 35 cases, including 5 cases with negative biopsy and cytology. Negative FISH result was detected in 24 cases where the malignant status was determined. The sensitivity of FISH in our series was 58.9 % and the specificity 88.1 %. Conclusions: FISH is a relatively simple, speedy and non invasive diagnostic method. It detects the symptoms of malignity on the molecular level, which leads to earlier diagnosis and therapy and, hence, to potential extended survival. FISH makes it possible to take decision in cases of atypical or unclear cytological finding. The FISH method using the Uro Vysion kit appears as a prospective non invasive method capable of early UK detection, with a higher sensitivity than the standard cytology of urine.

• MeSH
• biologie buňky MeSH
• biopsie metody   využití   MeSH
• chromozomální aberace MeSH
• cystoskopie metody   využití   MeSH
• diagnostické techniky urologické využití   MeSH
• histologie MeSH
• hodnocení biomedicínských technologií metody   využití   MeSH
• hybridizace in situ fluorescenční metody   využití   MeSH
• karcinom diagnóza   etiologie   MeSH
• lidé MeSH
• nádory močového měchýře diagnóza   MeSH
• senzitivita a specificita MeSH
• urologické nádory diagnóza   genetika   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

Deletion of TP53 gene, under routine assessment by fluorescence in situ hybridization analysis, connects with the worst prognosis in chronic lymphocytic leukemia (CLL). The presence of isolated TP53 mutation (without deletion) is associated with reduced survival in CLL patients. It is unclear how these abnormalities are selected and what their mutual proportion is. We used methodologies with similar sensitivity for the detection of deletions (interphase fluorescence in situ hybridization) and mutations (yeast functional analysis) and analyzed a large consecutive series of 400 CLL patients; a subset of p53-wild-type cases (n = 132) was screened repeatedly during disease course. The most common type of TP53 inactivation, ie, mutation accompanied by deletion of the remaining allele, occurred in 42 patients (10.5%). Among additional defects, the frequency of the isolated TP53 mutation (n = 20; 5%) and the combination of 2 or more mutations on separate alleles (n = 5; 1.3%) greatly exceeded the sole deletion (n = 3; 0.8%). Twelve patients manifested defects during repeated investigation; in all circumstances the defects involved mutation and occurred after therapy. Monoallelic defects had a negative impact on survival and impaired in vitro response to fludarabine. Mutation analysis of the TP53 should be performed before each treatment initiation because novel defects may be selected by previous therapies.

• MeSH
• chemorezistence genetika   MeSH
• chronická lymfatická leukemie farmakoterapie   genetika   mortalita   MeSH
• geny p53 genetika   MeSH
• hybridizace in situ fluorescenční MeSH
• Kaplanův-Meierův odhad MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mutační analýza DNA MeSH
• polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí MeSH
• poškození DNA genetika   MeSH
• prognóza MeSH
• protinádorové látky terapeutické užití   MeSH
• těžké řetězce imunoglobulinů genetika   MeSH
• umlčování genů MeSH
• variabilní oblast imunoglobulinu genetika   MeSH
• vidarabin analogy a deriváty   terapeutické užití   MeSH
• western blotting MeSH
• Check Tag
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH

• MeSH
• bodová mutace MeSH
• chronická lymfatická leukemie diagnóza   genetika   terapie   MeSH
• delece genu * MeSH
• DNA vazebné proteiny * genetika   MeSH
• geny nádorové MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• nádorové supresorové proteiny * genetika   MeSH
• nádorový supresorový protein p53 * genetika   MeSH
• protein-serin-threoninkinasy * genetika   MeSH
• proteiny buněčného cyklu * genetika   MeSH
• těžké řetězce imunoglobulinů * genetika   MeSH
• variabilní oblast imunoglobulinu * genetika   MeSH
• výsledek terapie MeSH
• Check Tag
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• dopisy MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

• MeSH
• aktivace transkripce genetika   MeSH
• biomedicínský výzkum MeSH
• bodová mutace genetika   účinky léků   MeSH
• buněčný cyklus genetika   účinky léků   MeSH
• genetické jevy * genetika   imunologie   účinky léků   MeSH
• geny p53 genetika   imunologie   účinky léků   MeSH
• konformace proteinů MeSH
• kvasinky MeSH
• lékařská onkologie trendy   MeSH
• lidé MeSH
• mutace genetika   imunologie   účinky léků   MeSH
• nádorový supresorový protein p53 * izolace a purifikace   metabolismus   účinky léků   MeSH
• Saccharomyces cerevisiae * imunologie   metabolismus   účinky léků   MeSH
• statistika jako téma MeSH
• techniky in vitro MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH