Statistica (software) Dotaz Zobrazit nápovědu
Rostoucí množství sbíraných dat a vývoj nových technologií s sebou přináší změny v přístupu k datům. Mění se i pohled na samotné softwary, jež s daty pracují. Obstojí tradiční přístupy k vyhodnocení dat? Jaké jsou současné trendy v oblasti nástrojů pro zpracování dat? A co bude dál? Trendy v oblasti nástrojů pro analýzu dat Vám ukáže přímo v softwaru konzultant analytické platformy Statistica – Ing. Miloš Uldrich. To vše se zaměřením na analýzu dat v oblasti medicíny.
Increased amount of data collected, development of new technologies as well as need of quick decisions brings changes in the field of data processing. This implies development of analytical platforms, including new features or even different approaches for working in the software. What are the current trends in tools for data processing? What about traditional approaches? And what will be next? Trends in data analysis tools will be shown by software consultant of analytic platform Statistica - Ing. Milos Uldrich. Contribution will be focused on data and problems from medical sector.
Praktické zkušenosti s využitím softwarových produktů společnosti Zajíc v rámci služeb sociální péče a sociální prevence v naší organizaci: Obsah software (možnosti systému, filtry, adaptabilita) Evidence a záznamy sociální práce (karta klienta, intervence, individuální plánování) Dokumentace (administrativa, statistiky, hlášení, stížnosti, personalistika) Možnosti vykazování – převodu dat ze software do systému MPSV Použitelnost sledovaných dat v rámci benchmarkingu Prezentace systému metodické podpory služeb sociální péče a sociální prevence v zařízeních Oblastní charity Uherské Hradiště vedoucí k zvyšování kvality poskytovaných služeb: Příprava metodika – poradce kvality Status metodika v rámci organizace Systém metodické podpory služeb
The practical experience to using software products ,, Zajíc“ in services of social care and social prevention in our organization. Content of software Evidence and records Documentation Methods of reporting Usability dates in „ benchmarking“ Presentation methodological support services of social care and social prevention in institutions of Regional charity Uherské Hradiště. Preparation of methodology Status methodology in organization The system of methodological support services
- MeSH
- lidé MeSH
- řízení kvality * MeSH
- sociální práce * MeSH
- software * MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
Účel studie: Mw\Pharm software (MEDI\WARE, Prague, Czech Republic / Groningen, Netherlands) je dlouhodobě používán pro PK/PD modelování pro terapeutické monitorování hladin léčiv (TDM). Cílem práce bylo najít nejvhodnější model pro kontinuální aplikaci vankomycinu v novější Windows verzi Mw\Pharm++ 1.3.5.558 (WIN). Pacienti: 20 dospělých pacientů (průměrný věk 66 ± 12 let, hmotnost 85 ± 16kg), bylo opakovaně vyšetřeno na hladinu vankomycinu. Medián dávky byl 1625g/24h. Koncentrace vankomycinu predikované pomocí WIN modelů "#vancomycin_adult_k_C2", "#vancomycin_adult_C2", "vancomycin_adult_C2", "vancomycin_C1" a DOS modelů "vancomycin (cont.inf.) %ahz" (DOS1) a "vancomycin adult" byly porovnány s naměřenou hodnotou a DOS1 modelem. Statistika: Průměrná procentuální chyba predikce (% PE) vypočtená jako (predikovaná - změřená)/změřená, příp. (predikovaná-DOS1)/DOS1, RMSE, Bland-Altmanova bias, Pearsonův korelační koeficient (R), Studentův t-test. Statistická analýza byla provedena pomocí GraphPad Prism version 5.00 pro Windows. Výsledky: % PE se pohybovala mezi -3,2 ± 33,0 % a -7,4 ± 36,7%, s výjimkou jednokompartmentového modelu "vancomycin_C1", kde byla -20,8 ± 39,4%. Nejlepší výsledky byly dosaženy modelem "vancomycin adult". Model "#vancomycin_adult_k_C2" produkoval nejnižší % PE, RMSE and Bland-Altman bias mezi WIN modely, ale korelace byla slabší. Korelace byla mírně lepší u modelu "vancomycin_adult_C2" RMSE byl stejný, % PE a Bland-Altmanova bias byly obdobné jako u modelu "#vancomycin_adult_k_C2". % PE mezi oběma DOS modely byla 4,1 ± 13,9% (NS); "vancomycin adult" měl mírně lepší výsledky než DOS1. Závěr: Z WIN modelů byly nejlepší výsledky dosaženy modely "vancomycin_adult_C2" a "#vancomycin_adult_k_C2". Oba DOS modely produkovaly nízkou bias a jejich predikce byly srovnatelné.
Objective: For a long time, the Mw\Pharm software suite (MEDI\WARE, Prague, Czech Republic/Groningen, Netherlands) has been used for PK/PD modelling in therapeutic drug monitoring (TDM). The aim of this study was to find the best model in the newer Windows version of Mw\Pharm++ 1.3.5.558 (WIN) for continuous administration of vancomycin. Patients: Twenty adult patients with a mean age of 66 ± 12 years, body weight 85 ± 16kg, and median dose 1,625g/24h were repeatedly examined for vancomycin. Methods: Concentrations predicted by "#vancomycin_adult_k_C2", "#vancomycin_adult_C2", "vancomycin_adult_C2", "vancomycin_C1" WIN models and "vancomycin (cont.inf.) %ahz" (DOS1) and "vancomycin adult" DOS models were compared with the measured values and with the DOS1 model. Statistics: Percentage prediction error (%PE) calculated as (predicted-measured)/measured or (predicted-DOS1)/DOS1, RMSE, Bland-Altman bias, Pearson's coefficient of rank correlation (R), Student's t-test. Statistical analysis was performed using the GraphPad Prism version 5.00 for Windows. Results: %PE values varied between -3.2 ± 33.0% and -7.4 ± 36.7%, with the exception of "vancomycin_C1", the only one-compartment model, where it was -20.8 ± 39.4%. The best outcomes were achieved with "vancomycin adult". The "#vancomycin_adult_k_C2" model produced the lowest %PE, RMSE, and Bland-Altman bias among the WIN models, but its correlation (Pearson's R) was less tight. RMSE was the same in "vancomycin_adult_C2" while %PE and Bland-Altman bias were similar, with slightly better correlation when compared to "#vancomycin_adult_k_C2". The %PE value between the two DOS models was 4.1 ± 13.9% (NS); "vancomycin adult" produced slightly better outcomes than DOS1. Conclusion: "vancomycin_adult_C2" and "#vancomycin_adult_k_C2" produced the best outcomes between WIN models. Both DOS models produced lower bias and their prediction was comparable.
- MeSH
- antibakteriální látky terapeutické užití MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- monitorování léčiv * MeSH
- racionální návrh léčiv MeSH
- senioři MeSH
- software MeSH
- vankomycin * aplikace a dávkování farmakokinetika krev MeSH
- Check Tag
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
Episteme. Natura
Druhé, revidované vydání 438 stran : ilustrace ; 21 cm
Učebnice, která se zaměřuje na biostatistiku.
- Klíčová slova
- Statistica (software), R (software),
- MeSH
- analýza dat MeSH
- biostatistika MeSH
- software MeSH
- statistika jako téma MeSH
- Publikační typ
- učebnice MeSH
Určeni vhodné nury frekvence výsUyůi jistého onemocnení je v epidemiologu nezbytným prostředkem při porovnávání sledovaných populací, a tedy určení příčin onemocněnu Dvě porovnávané frekvence jistého onemocněni mohou být zkombinovány do jediného souhrnného parametru, který odhaduje souvislosti meú nemocí a rizikovými faktory. Tento parantetr může být reprezentován bud' pomJěrem frekvenci onemocnění u dvou populací, který naznačuje, kolikrát je pravděpodobnost výskytu onemocněni v jedné populaci vyšší nd ve druhé, nebo razdňem těchto frekvencí, který ukazjuje, o kolik je vyšší výskyt nemoci v jedné z populací. K výpočtu výše zmíněných měr výskytu onemocnění můžeme použň statistici^ software. Ten však vždy nebývá nejvhodnější pro analýzu dat z epidemiologických studií V EuroMlSE Centru Univerzity Karlovy a Ákadenúe věd České republiky byl s podporou projektu Copernicus JRP-10053 vyvinut program E.T. (Epidemiology Tools) . Tento program je vhodný pro praktickou analýzu dat z retrospektivních či prospektivních studií Slouží také pro porovnávám'úmrtnosti a nemocnosti populací (metoda standardizace). Úplatném'nachází i při výuce epidemiologie.
In epidemiological research the calculation of appropriate measures of disease frequency is the basis for a comparison of populations and, herefore, the identification of disease determinants. Two frequencies being compared can be combined into a single summary parameter that estimates the associctiion between an exposure and a disease. This ľort fee accomplished by calculation either the ratio of the measures of disease frequency for two populations which incäcates how much likely one population is to develop a disease than another, or the difference between the frequencies which indicates how much greater the frequency of a cäsease is in one population compared with the other. In epidemiology we often need to compute measures of disease f requency mentioned above. We can do that by means of complex statistical software, but sometimes it is not easy or possible to use these software for an analysis of epidemiological data. At the EuroMISE Zenter of Charies University and Academy of Sciences in frame of the research supported from grant COPERNICUS JRP-10053 the E.T. program (Epidenúology took) was developed This program can be uedfor practical analysis of data from retrospective (case-control) studies or prospective (cohort) stiidies and for the standardization. However, the program can be also useful teaching tod in the epidemiology courses.
Příspěvek pojednává některé aspekty využívání programů pro statistickou analýzu. Ukazuje se, že vedle tradičních programových systému jako SPSS nebo STATISTICA se stále více prosazuje systém R se svým programovacím jazykem. Tento systém má dvě hlavní výhody. Je volně šiřitelný stejně jako programové balíčky, které jsou v něm vytvářeny. Existuje již několik tisíc programových balíčku v jazyce R pro nejrůznější úkoly statistické analýzy. Pojednáváme základy systému R a některé rozšiřující programové balíčky.
The paper discusses some aspects of using statistical analysis programs. Besides traditional program systems such as SPSS or STATISTICA, rising popularity of R system with its own programming language has been seen. This system entails two principal advantages. It can be freely distributed, similarly as its program packages created in its environment. Currently, several thousand program packages in the R language exist for varied tasks of statistical analysis. This paper discusses the basics of the R system, as well as some extension program packages.
Využití metod průzkumové analýzy dat (exploratory data analysis, EDA) je při hodnocení klinických dat v medicíně klíčovou fází. Vizualizační principy, modely poukazující na trendy vývoje či např. znázornění potenciálních závislostí, pomáhají k lepší interpretaci měření a v diagnostickém rozhodování. Počet dostupných moderních EDA balíků pro vývojáře v posledních letech roste v souvislosti s rozvojem oboru Data Science. NeuroEDA je interaktivní webová aplikace pro hodnocení biomedicínských dat. Aplikace byla naprogramována ve statistickém jazyce R, v rámci reaktivního paradigmatu frameworku Shiny. Je dále rozvíjena a využívána Katedrou biomedicínské informatiky FBMI ČVUT ve spolupráci s Neurologickou klinikou 1. LF UK a VFN v Praze, především pro hodnocení pacientů s dystoniemi a Parkinsonovou nemocí. Zpracování uživatelských dat v tabulkové formě (.csv, excel) probíhá v serverové části. Kromě základních popisných statistik, průzkumových grafů a shlukové analýzy, které jsou vhodné i pro hodnocení velkých dat, nabízí aplikace metody pro robustní a neparametrickou analýzu. Ty jsou v neurologii obzvlášť vhodné. Typicky z důvodu malých počtů a vlivných pozorování. Dále kvůli častému nesplnění dalších statistických předpokladů. Mezi její výhody patří snadná rozšiřitelnost o nové R balíky a rychlá odezva ve webových prohlížečích. Uživatelské interaktivní prostředí umožňuje práci s funkcemi jazyka R bez znalosti skriptování.
Usage of methods for exploratory data analysis (EDA) plays an important role in assessment of clinical medical data. Visualizations, models and illustration of dependency can help for better understanding of measurements in the diagnostics and making decision. The number of available modern EDA packages for developers is increasing as well as the development of the Data Science field. NeuroEDA is an interactive web application for biomedical data assessment. The application was programmed in the R statistical language, based on reactive paradigm framework called Shiny. It is further developed and used by the Department of Biomedical Informatics FBME CTU in cooperation with the Neurological Clinic of the 1st Medical Faculty, Charles University in Prague. Especially for the patients with dystonia and Parkinson's disease. Computations and processing of user data are executed on the server side. Basic descriptive statistics, interactive graphs, clustering, robust and LOESS regression were implemented and are suitable for analytics of big data. Robust regression is especially suitable in neurology. Typically, due to the small numbers of measured observations and failure to prove other statistical assumptions. Among its advantages we can consider easy expandability of new R packages and quick response in web browsers. User interface allows to work with the R language features without any scripting knowledge.
- Klíčová slova
- neuroinformatika, neuroEDA,
- MeSH
- internet MeSH
- interpretace statistických dat MeSH
- lékařská informatika * MeSH
- navrhování softwaru MeSH
- neurologie * MeSH
- software MeSH
- statistika jako téma MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
Během foniatrického vyšetření se provádí analýza hlasu, jejímž výsledkem je diagram hlasového pole, tzv. fonetogram. Aplikace RealVoiceLab vyvinutá centrem hudební akustiky HAMU v prostředí Matlab umožňuje vytvoření fonetogramu v reálném čase a další následné analýzy jakými jsou plocha hlasového pole, poloha nejčetnějších zastoupení, statistiky hlasových projevů po dokončení nahrávání. V příspěvku představíme vzdálené nasazení aplikace RealVoiceLab přes upravený protokol RDP. Tato aplikace je přístupná v síti CESNET 2 a obecně Internetu a umožňuje aplikaci používat pomocí standardního klientského programu „Vzdálená plocha“ nebo i „Remote Desktop“, která přesměrovává grafické rozhraní, vstupy z klávesnice a myši a nahrávaný zvuk k výkonnému serveru, kde aplikace ve skutečnosti běží. Aplikaci používají u specialistů na foniatrii, kteří ji používají k analýze hlasu v reálném čase za přítomnosti pacienta a také k analýze záznamu hlasu archivovaných.
Voice analysis is done as part of phoniatric examination, which provides a scheme of the voice field, the so called phonetogram. The application RealVoiceLab developed by the Musical Acoustics Research Centre at HAMU (Academy of Performing Arts in Prague) in Matlab environment makes it possible to create a phonetogram in real time, and to perform subsequent analyses such as the voice field area, position of most frequent representations, and voice manifestation statistics after the recording is completed. The contribution presents remote application of RealVoiceLab through an adapted RDP protocol. This application is accessible in the CESNET 2 network and generally on the Internet, and it supports using the application through standard client software “Remote Desktop“, which redirects the graphical interface, keyboard and mouse inputs and the recorded sound to a powerful server where the application is actually running. The application has been used by specialists in phoniatry for voice analysis in real time in the presence of the patient, and also for analyzing archived voice records.
V návaznosti na sběr dat prováděný společně Asociací nemocnic ČR, Ústavem pro zdravotnickou informatiku a statistiku a Ministerstvem zdravotnictví ČR vznikl z Iniciativy Fakultní nemocnice v Plzni projekt "OZISAL na WWW", který umožňuje přístup všem účastníkům projektu ke sbíraným datům prostřednictvím Internetu.
Autoři předkládají soubor materiálů pro praktickou výuku zdravotnické informatiky. Jsou zpracována následující témata: operační systém MS-DOS a MS Windows 95, zpracování textu, práce s kalkulačními tabulkami, základní pojmy relačních databází, tvorba prezentačních materiálů, Internet a elektronická pošta, základy statistiky, prostředky formalizace a rozhodování, základy zpracování biosignálů a obrazu, práce s bibliografickou databází, zdravotnický informační systém. Všechna uvedená témata jsou procvičována na příkladech z oblasti zdravotnictví. Pro kaidé téma jsou sestaveny návody ve formě textu, kíeryje na obrazovce dostupný jako samostatná aplikace v okně s jednoduchými ovládacími prvky. V jiném okně běží program zpracovávající probíranou tematiku. Aromě operačního systému MS Windows 95 a MS Office 97 Professional jsou všechny ostatní používané programy volně dostupné. Program je dvojjazyčný a lze volit mezi českou a anglickou verzi. Soubor obsahuje také tištěné materiály pro studenty a učitele a sadu testů.
A complex tool for medical informatics practical training is presented. Following topics are carried out: operating system MS-DOS and MS Windows 95, text processing, spreadsheet processing, relation databases basic terms, presentation ntaterials processing, Internet and e-mail, basic statistics, tools for formalisďion and decision making, basic biosignal and picture processing, the use of bibliographic database and medical information system. All topics are practised using medical field examples. There are text manuals available as a stand-alone application in a window equipped with simple control elementsfor every topic. The program for the described topic runs in a separate window. All other programs, except the operating system MS Windows 95 and MS Office Professional, are freely available. The program is bilingual and it is possible to select between the English and Czech version. The tool contains also printed materials for students and a teacher and a set of tests.
