epigenetic memory
Dotaz
Zobrazit nápovědu
T cell memory relies on the generation of antigen-specific progenitors with stem-like properties. However, the identity of these progenitors has remained unclear, precluding a full understanding of the differentiation trajectories that underpin the heterogeneity of antigen-experienced T cells. We used a systematic approach guided by single-cell RNA-sequencing data to map the organizational structure of the human CD8+ memory T cell pool under physiological conditions. We identified two previously unrecognized subsets of clonally, epigenetically, functionally, phenotypically and transcriptionally distinct stem-like CD8+ memory T cells. Progenitors lacking the inhibitory receptors programmed death-1 (PD-1) and T cell immunoreceptor with Ig and ITIM domains (TIGIT) were committed to a functional lineage, whereas progenitors expressing PD-1 and TIGIT were committed to a dysfunctional, exhausted-like lineage. Collectively, these data reveal the existence of parallel differentiation programs in the human CD8+ memory T cell pool, with potentially broad implications for the development of immunotherapies and vaccines.
- MeSH
- biologické markery MeSH
- buněčná diferenciace imunologie MeSH
- CD8-pozitivní T-lymfocyty imunologie metabolismus MeSH
- homeostáza telomer MeSH
- imunofenotypizace MeSH
- imunologická paměť * MeSH
- lidé MeSH
- lymfoidní progenitorové buňky cytologie imunologie metabolismus MeSH
- myši MeSH
- stanovení celkové genové exprese MeSH
- T-lymfocyty - podskupiny imunologie metabolismus MeSH
- výpočetní biologie metody MeSH
- vysoce účinné nukleotidové sekvenování MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- myši MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- MeSH
- DNA genetika metabolismus MeSH
- duševní procesy MeSH
- emoce fyziologie MeSH
- endokrinní systém fyziologie MeSH
- epigenetická paměť MeSH
- epigeneze genetická MeSH
- genetické jevy MeSH
- genom MeSH
- geny MeSH
- imunitní systém fyziologie MeSH
- lidé MeSH
- mikrobiota MeSH
- nervový systém MeSH
- vědomí * fyziologie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
Psychiatric and mood disorders may play an important role in the development and persistence of irritable bowel syndrome (IBS). Previously, we hypothesized that stress-induced implicit memories may persist throughout life via epigenetic processes in the enteric nervous system (ENS), independent of the central nervous system (CNS). These epigenetic memories in the ENS may contribute to developing and perpetuating IBS. Here, we further elaborate on our earlier hypothesis. That is, during pregnancy, maternal prenatal stresses perturb the HPA axis and increase circulating cortisol levels, which can affect the maternal gut microbiota. Maternal cortisol can cross the placental barrier and increase cortisol-circulating levels in the fetus. This leads to dysregulation of the HPA axis, affecting the gut microbiota, microbial metabolites, and intestinal permeability in the fetus. Microbial metabolites, such as short-chain fatty acids (which also regulate the development of fetal ENS), can modulate a range of diseases by inducing epigenetic changes. These mentioned processes suggest that stress-related, implicit, long-term epigenetic memories may be programmed into the fetal ENS during pregnancy. Subsequently, this implicit epigenetic stress information from the fetal ENS could be conveyed to the CNS through the bidirectional microbiota-gut-brain axis (MGBA), leading to perturbed functional connectivity among various brain networks and the dysregulation of affective and pain processes.
- MeSH
- epigeneze genetická * MeSH
- lidé MeSH
- osa mozek-střevo fyziologie MeSH
- psychický stres * metabolismus MeSH
- střevní mikroflóra fyziologie MeSH
- střevní nervový systém * MeSH
- syndrom dráždivého tračníku * metabolismus MeSH
- těhotenství MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- těhotenství MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- přehledy MeSH
Nepříznivé podmínky pro vývoj v perinatálním období (zátěž v podobě malnutrice, hypoxie) mají četné klinické důsledky, které jsou velmi dobře popsány i na základě experimentálních modelů. V mozku mezi ně patří ztráty neuronů v integračních okruzích mozkové kůry, redukce jejich dendritických větví, změny počtu synapsí i stupně myelinizace axonů. Tyto strukturální změny mají funkční důsledky, hlavně v oblasti kognitivních funkcí. Vývoj jedince v kriticky nepříznivých podmínkách však nemusí vždy znamenat jednoznačné poškození, zhoršení či ochuzení výsledného fenotypu. Může také znamenat vytvoření "alternativního fenotypu", který reprezentuje pro dané podmínky optimální přizpůsobení a který může být spojen i s lepšími vyhlídkami na přežití.
Perinatal distress (malnutrition, hypoxia etc.) has many clinical effects and it is well characterized in experimental animal models. Among the principal effects in the brain belongs the selective loss of neurons in integrative circuits of the cerebral cortex, reduction of dendritic branches and synapses or myelin impairment. Such structural changes have serious functional consequences, including impairment of cognitive functions. Development of an individual in such conditions does not always mean an impairment, harm or impoverishment of the resulting phenotype. It can represent formation of an "alternative phenotype" which enables optimal adjustment to given conditions and it can have better prospects for the survival.
- Klíčová slova
- vývoj fenotypu, postnatální zátěž,
- MeSH
- asfyxie novorozenců * komplikace MeSH
- epigeneze genetická MeSH
- fenotyp MeSH
- fyziologická adaptace * MeSH
- kognice fyziologie MeSH
- lidé MeSH
- maternální deprivace MeSH
- mozek * fyziologie patofyziologie růst a vývoj MeSH
- novorozenec MeSH
- podvýživa komplikace MeSH
- poruchy paměti etiologie MeSH
- psychický stres MeSH
- psychosociální deprivace MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- novorozenec MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- přehledy MeSH
Despite essential progress towards understanding the evolution of cooperative behaviour, we still lack detailed knowledge about its underlying molecular mechanisms, genetic basis, evolutionary dynamics and ontogeny. An international workshop "Genetics and Development of Cooperation," organized by the University of Bern (Switzerland), aimed at discussing the current progress in this research field and suggesting avenues for future research. This review uses the major themes of the meeting as a springboard to synthesize the concepts of genetic and nongenetic inheritance of cooperation, and to review a quantitative genetic framework that allows for the inclusion of indirect genetic effects. Furthermore, we argue that including nongenetic inheritance, such as transgenerational epigenetic effects, parental effects, ecological and cultural inheritance, provides a more nuanced view of the evolution of cooperation. We summarize those genes and molecular pathways in a range of species that seem promising candidates for mechanisms underlying cooperative behaviours. Concerning the neurobiological substrate of cooperation, we suggest three cognitive skills necessary for the ability to cooperate: (i) event memory, (ii) synchrony with others and (iii) responsiveness to others. Taking a closer look at the developmental trajectories that lead to the expression of cooperative behaviours, we discuss the dichotomy between early morphological specialization in social insects and more flexible behavioural specialization in cooperatively breeding vertebrates. Finally, we provide recommendations for which biological systems and species may be particularly suitable, which specific traits and parameters should be measured, what type of approaches should be followed, and which methods should be employed in studies of cooperation to better understand how cooperation evolves and manifests in nature.
- MeSH
- altruismus MeSH
- biologická evoluce * MeSH
- chování zvířat MeSH
- epigeneze genetická MeSH
- fenotyp MeSH
- genetická zdatnost MeSH
- kongresy jako téma MeSH
- kooperační chování * MeSH
- neurosekreční systémy fyziologie MeSH
- paměť MeSH
- vývojová biologie MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- přehledy MeSH
- Geografické názvy
- Švýcarsko MeSH
Adaptive immunity changes over an individual's lifetime, maturing by adulthood and diminishing with old age. Epigenetic mechanisms involving DNA and histone methylation form the molecular basis of immunological memory during lymphocyte development. Monocytes alter their function to convey immune tolerance, yet the epigenetic influences at play remain to be fully understood in the context of lifespan. This study of a healthy genetically homogenous cohort of children, adults and seniors sought to decipher the epigenetic dynamics in B-lymphocytes and monocytes. Variable global cytosine methylation within retro-transposable LINE-1 repeats was noted in monocytes compared to B-lymphocytes across age groups. The expression of the human leukocyte antigen (HLA)-DQ alpha chain gene HLA-DQA1*01 revealed significantly reduced levels in monocytes in all ages relative to B-lymphocytes, as well as between lifespan groups. High melting point analysis and bisulfite sequencing of the HLA-DQA1*01 promoter in monocytes highlighted variable cytosine methylation in children and seniors but greater stability at this locus in adults. Further epigenetic evaluation revealed higher histone lysine 27 trimethylation in monocytes from this adult group. Chromatin immunoprecipitation and RNA pulldown demonstrated association with a novel lncRNA TINA with structurally conserved similarities to the previously recognized epigenetic modifier PARTICLE. Seeking to interpret the epigenetic immunological landscape across three representative age groups, this study focused on HLA-DQA1*01 to expose cytosine and histone methylation alterations and their association with the non-coding transcriptome. Such insights unveil previously unknown complex epigenetic layers, orchestrating the strength and weakening of adaptive immunity with the progression of life.
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
K běžnému bio-psycho-sociálnímu modelu zdraví a nem oci, přidává autor ve své úvaze filosofický aspekt. Klade si otázku, proč vlastně k ritizujeme Descarta za neřešitelnou karteziánskou podvojnost těla a duše, když jde skut ečně o dvě odlišné úrovně lidského žití? K plnému porozumění člověka, jenž je charakte rizován autopoezou a svobodnou volbou, patří i pochopení a smysl, čemuž odpovídají konotativní teorie. Zde se hodí k poznání vnitřního světa a chování druhého empatie, příběhy, obrazy, přirovnání a metafory, tak je třeba chápat i psychoanalytické te orie a interpretace.
The author, in his essay, adds a philosophical asp ect to the current bio-psycho-social model of health and illness. The question “Why is D escartes criticized for intractable Cartesian duality of body and soul when it is reall y two different levels of human life?” is being raised. Both understanding and sense are i nvolved in full understanding of a human being, who is characterized by autopoiesis an d free choice, with which connotative theories correspond. Empathy, stories, images, similes and metaphors suit to the knowledge of the inner world and the behavio ur of the others. It is to be even understood psychoanalytic theories and interpretati ons.
- MeSH
- duševní procesy MeSH
- epigeneze genetická MeSH
- filozofie MeSH
- lidé MeSH
- neurologické manifestace MeSH
- paměť MeSH
- posttraumatická stresová porucha MeSH
- psychofyziologie * MeSH
- psychosomatické lékařství * MeSH
- psychosomatické poruchy MeSH
- reflex MeSH
- retence (psychologie) * MeSH
- sociální prostředí MeSH
- spiritualita * MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
BACKGROUND: In order to gain insight into the contribution of DNA methylation to disease progression of chronic lymphocytic leukemia (CLL), using 450K Illumina arrays, we determined the DNA methylation profiles in paired pre-treatment/relapse samples from 34 CLL patients treated with chemoimmunotherapy, mostly (n = 31) with the fludarabine-cyclophosphamide-rituximab (FCR) regimen. RESULTS: The extent of identified changes in CLL cells versus memory B cells from healthy donors was termed "epigenetic burden" (EB) whereas the number of changes between the pre-treatment versus the relapse sample was termed "relapse changes" (RC). Significant (p < 0.05) associations were identified between (i) high EB and short time-to-first-treatment (TTFT); and, (ii) few RCs and short time-to-relapse. Both the EB and the RC clustered in specific genomic regions and chromatin states, including regulatory regions containing binding sites of transcription factors implicated in B cell and CLL biology. CONCLUSIONS: Overall, we show that DNA methylation in CLL follows different dynamics in response to chemoimmunotherapy. These epigenetic alterations were linked with specific clinical and biological features.
- MeSH
- chronická lymfatická leukemie farmakoterapie genetika MeSH
- cyklofosfamid farmakologie terapeutické užití MeSH
- dospělí MeSH
- epigeneze genetická účinky léků MeSH
- genové regulační sítě účinky léků MeSH
- imunoterapie MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- longitudinální studie MeSH
- metylace DNA účinky léků MeSH
- progrese nemoci MeSH
- rituximab farmakologie terapeutické užití MeSH
- sekvenční analýza hybridizací s uspořádaným souborem oligonukleotidů MeSH
- senioři MeSH
- vidarabin analogy a deriváty farmakologie terapeutické užití MeSH
- výsledek terapie MeSH
- vysoce účinné nukleotidové sekvenování metody MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
Výživa matky během těhotenství a laktace je nejjednodušším preventivním opatřením pro zdárný rozvoj dítěte. Přísun cholinu ve stravě snižuje riziko rozvoje vrozených vývojových vad, zmírňuje dopad nežádoucí expozice plodu alkoholu a zlepšuje vývoj hipokampu a paměťových funkcí. Cholin patří mezi donátory metylových skupin a je významným účastníkem epigenetických mechanizmů. Cholin se nejvíce vyskytuje v mase, mléce a vejcích, a proto je důležité sledovat jejich příjem ve stravě matky. U vegetariánek je vhodné dostatek cholinu suplementovat doplňky stravy.
Maternal diet during pregnancy and lactation is the simplest prevention for fetal development. Adequate intake of choline decreases the risk of birth defects, protects from undesirable exposure of the fetus to alcohol and has potential effects on hippocampal neurogenesis and memory function. Choline is one of the major source of methyl groups and very important component of epigenetic mechanism. Meat, milk and eggs contain enough choline. For women who do not eat vegetarian diet, a supplement should be considered.
- Klíčová slova
- mateřská strava,
- MeSH
- cholin * aplikace a dávkování fyziologie metabolismus MeSH
- dieta vegetariánská škodlivé účinky MeSH
- epigenomika MeSH
- fosfatidylcholiny aplikace a dávkování terapeutické užití MeSH
- fosfatidylethanolamin-N-methyltransferasa genetika MeSH
- fyziologie výživy v mateřství * MeSH
- lecitiny aplikace a dávkování MeSH
- lidé MeSH
- metylace DNA MeSH
- nedostatek cholinu farmakoterapie patofyziologie MeSH
- nutriční nároky * MeSH
- potraviny MeSH
- potravní doplňky MeSH
- těhotenství MeSH
- vrozené vady prevence a kontrola MeSH
- vývoj plodu účinky léků MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- těhotenství MeSH
- ženské pohlaví MeSH
