• MeSH
• antibakteriální látky farmakologie   terapeutické užití   MeSH
• aplikace intravaginální MeSH
• bakteriální vaginóza * diagnóza   etiologie   farmakoterapie   MeSH
• lidé MeSH
• probiotika terapeutické užití   MeSH
• vaginální stěr MeSH
• vaginální výtok MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH

Identification of filamentous fungi based on morphological features is the most available approach used in clinical mycology laboratories. However, MALDI-TOF mass spectrometry is currently invaluable for identification of microorganisms because of its rapidity, simplicity, and accuracy. This study aimed to find the optimal way of identifying filamentous fungi using MALDI-TOF MS.The sample comprised 193 isolates of filamentous fungi. The identification started with morphological assessment. Then isolates were identified using MALDI-TOF MS, both directly from culture and following culture in liquid media with extraction. Subsequently, identification of 20 selected isolates was compared by sequencing of the benA gene, ITS1-5,8-ITS2, and D1-D2 LSU regions.Based on morphological criteria, 17 genera of fungi were identified. With MALDI-TOF MS performed directly from culture, nine isolates were identified to the genus level and 184 to the species level, with a total of 75 species being noted. With the MALDI-TOF MS extraction method, 190 isolates were identified to the species level, with 43 species being noted. The rates of agreement between identification using morphology and the MALDI-TOF MS direct method were 58.55% at the genus level and 22.24% at the species level. The rates of agreement between identification using morphology and the MALDI-TOF MS extraction method were 84.97% at the genus level and 46.11% at the species level. Using sequencing, 87.5% agreement was found for identification with the MALDI-TOF MS extraction method, as compared with only 43.75% for the direct method.The results suggest that the optimal approach to identification of filamentous fungi is a combination of morphological features and MALDI-TOF MS using the extraction method.

• MeSH
• Arthrodermataceae * genetika   MeSH
• diagnostické testy rutinní MeSH
• houby genetika   MeSH
• kultivační média MeSH
• spektrometrie hmotnostní - ionizace laserem za účasti matrice MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

• MeSH
• antifungální látky terapeutické užití   MeSH
• kandidóza vulvovaginální * terapie   MeSH
• lidé MeSH
• management nemoci MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH

Projekt má za cíl prostudovat současnou epidemiologii dermatofytických infekcí na území České republiky. Výsledky studie budou mít přímý dopad v oblasti prevence, diagnostiky a terapie nejběžnějších fungálních onemocnění člověka, kterými jsou právě dermatofytózy. Pilotní epidemiologická studie probíhající na našem území od roku 2011 přinesla řadu výsledků, na které navrhovaný projekt navazuje. Projekt umožní pokračování a rozšíření započaté práce, získání přesnějších dat a také uskutečnění dílčích cílů projektu, kterými jsou monitoring nových a nově se objevujících infekcí na našem území, testování citlivostí k antimykotikům u vybraných druhových komplexů, zpracování taxonomických studií s popisy nových lidských patogenů a tvorbu nových identifikačních manuálů. Populačně genetická a fylogeografická studie druhu Arthroderma benhamiae umožní poznat původ tohoto nově se šířícího patogenu. V rámci zlepšení identifikačních postupů bude vytvořena volně dostupná databáze MALDI-TOF profilů.; The project aims to study the current epidemiology of dermatophyte infections in the Czech Republic. Its results will have a direct impact on the prevention, diagnosis and treatment of the most common fungal infections in humans. A pilot epidemiological study that has been running in our country since 2011 revealed a number of interesting results on which this project is based. The grant support would allow the continuation and expansion of the ongoing work, obtaining more accurate data and meet the other objectives of the project. These are monitoring of new and re-emerging infections, antifungal susceptibility testing of selected species, preparation of updated manuals for identification of dermatophytes and taxonomic studies with descriptions of new human pathogenic fungi. Population genetics and phytogeography study of Arthroderma benhamiae will enable trace origin of this emerging pathogen. The free available MALDI-TOF database, providing choice of cheap and rapid identification, will be developed based on the local isolates.

• MeSH
• antifungální látky terapeutické užití   MeSH
• Arthrodermataceae patogenita   účinky léků   MeSH
• lidé MeSH
• molekulární epidemiologie MeSH
• pilotní projekty MeSH
• ribozomální DNA MeSH
• spektrometrie hmotnostní - ionizace laserem za účasti matrice MeSH
• tinea diagnóza   epidemiologie   mikrobiologie   MeSH
• výzkumný projekt MeSH
• zoonózy mikrobiologie   MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• zvířata MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• dermatovenerologie
• infekční lékařství
• epidemiologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

• MeSH
• antifungální látky aplikace a dávkování   terapeutické užití   MeSH
• Candida albicans patogenita   MeSH
• flukonazol aplikace a dávkování   terapeutické užití   MeSH
• kandidóza vulvovaginální diagnóza   farmakoterapie   MeSH
• klotrimazol aplikace a dávkování   terapeutické užití   MeSH
• mykózy * diagnóza   etiologie   farmakoterapie   MeSH

• MeSH
• alergie mikrobiologie   MeSH
• klinické laboratorní techniky metody   MeSH
• lidé MeSH
• mykologie * klasifikace   MeSH
• mykotoxikóza diagnóza   patologie   terapie   MeSH
• mykózy * diagnóza   mikrobiologie   terapie   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH

• Publikační typ
• úvodníky MeSH

• Publikační typ
• komentáře MeSH

A case report of ventriculoperitoneal shunt infection caused by Candida lusitaniae in a 6-year-old patient with cerebral astrocytoma and obstructive hydrocephalus is presented briefly with emphasis on the course of antifungal treatment. Seven isolates recovered subsequently from the cerebrospinal fluid were studied retrospectively. To confirm identity, isolates were typed using pulsed-field gel electrophoresis and melting curve of random amplified polymorphic DNA (McRAPD). Further, the ability to form biofilm and its susceptibility to systemic antifungals were evaluated. Using McRAPD, identity of C. lusitaniae isolates showing slight microevolutionary changes in karyotypes was undoubtedly confirmed; successful application of numerical interpretation of McRAPD for typing is demonstrated here for the first time. The strain was also recognized as a strong biofilm producer. Moreover, minimum biofilm inhibitory concentrations were very high, in contrast to low antifungal minimum inhibitory concentrations of isolates. It can be concluded that McRAPD seems to be a simple and reliable method not only for identification but also for typing of yeasts. A ventriculoperitoneal shunt colonized by C. lusitaniae was revealed as the source of this nosocomial infection, and the ability of the strain to form biofilm on its surface likely caused treatment failure.

• MeSH
• antifungální látky farmakologie   MeSH
• astrocytom komplikace   farmakoterapie   mikrobiologie   patologie   chirurgie   MeSH
• biofilmy účinky léků   růst a vývoj   MeSH
• Candida účinky léků   genetika   izolace a purifikace   MeSH
• denaturace nukleových kyselin MeSH
• dítě MeSH
• hydrocefalus komplikace   farmakoterapie   mikrobiologie   patologie   chirurgie   MeSH
• infekce spojené se zdravotní péčí komplikace   farmakoterapie   mikrobiologie   patologie   chirurgie   MeSH
• kandidóza komplikace   farmakoterapie   mikrobiologie   patologie   chirurgie   MeSH
• lidé MeSH
• mikrobiální testy citlivosti MeSH
• mykologické určovací techniky MeSH
• nádory mozku komplikace   farmakoterapie   mikrobiologie   patologie   chirurgie   MeSH
• neúspěšná terapie MeSH
• pulzní gelová elektroforéza MeSH
• technika náhodné amplifikace polymorfní DNA MeSH
• ventrikuloperitoneální zkrat škodlivé účinky   MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• kazuistiky MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

V článku je shrnuta základní charakteristika mykóz a specifikováni jejich původci se zaměřením na ty, s nimiž se lze v praxi běžně setkat. Ke stanovení nebo potvrzení klinicky suspektní mykotické infekce je nezbytným předpokladem správný odběr vzorků, jehož zásady jsou podrobně rozebrány. Dále je uveden přehled a stručná charakteristika metod, používaných v současné době v laboratořích lékařské mykologie, včetně jejich limitů z hlediska rychlosti a spolehlivosti vyšetření. Rovněž je podán aktuální přehled registrovaných antifungálních přípravků, jejich lékových forem pro celkovou i lokální aplikaci a stručně zhodnocen současný stav laboratorního testování citlivosti k antimykotikům.

In the article, basic characteristics of mycoses and etiological agents' specification are presented, with emphasis on infections frequently occurring in medical practice. Proper sampling is crucial for determination or verification of clinically suspected fungal infections. Guidelines for the collection of clinical specimen for mycological examination are described in detail. Further, an overview and brief characterization of diagnostic methods currently used in mycology laboratories are given and their limits in terms of speed and reliability are specified. Finally, a recent overview of registered antifungal drugs including their forms of administration is also presented and the current status of antifungal susceptibility testing is briefly evaluated.

• Klíčová slova
• diagnostika, odběr vzorků,
• MeSH
• allylamin MeSH
• antifungální látky farmakologie   klasifikace   terapeutické užití   MeSH
• azoly MeSH
• bakteriologické techniky metody   MeSH
• diferenciální diagnóza MeSH
• echinokandiny MeSH
• farmakoterapie metody   MeSH
• financování organizované MeSH
• katalogy léků jako téma MeSH
• klinické laboratorní techniky metody   MeSH
• lidé MeSH
• mikrobiologické techniky metody   normy   využití   MeSH
• mikroskopie metody   MeSH
• mykologické určovací techniky metody   MeSH
• mykózy diagnóza   etiologie   farmakoterapie   MeSH
• polyeny MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH