• MeSH
• antibiotická rezistence MeSH
• antigeny analýza   MeSH
• diagnostické techniky dýchacího ústrojí klasifikace   MeSH
• diagnostické techniky molekulární MeSH
• infekce dýchací soustavy * diagnóza   etiologie   mikrobiologie   MeSH
• kultivační techniky metody   MeSH
• lidé MeSH
• mikrobiologické techniky * klasifikace   metody   MeSH
• mikroskopie metody   MeSH
• odběr biologického vzorku metody   MeSH
• odběr vzorku krve MeSH
• protilátky analýza   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH

Identifikace buněčných cílů aktivních látek má zásadní význam pro optimalizaci léčiv a minimalizaci jejich nežádoucích vedlejších účinků. Komplexní povaha biologických systémů ztěžuje tuto identifikaci, ale mikroskopické metody, zejména fenotypové testování, reprezentované metodou „Cell Painting“, představují cenný nástroj pro pochopení vlivu látek na úrovni buněk a organel. Tyto metody umožňují rychlé testování rozsáhlých knihoven látek a nabízejí unikátní pohled na mechanismus jejich účinku pozorováním chování buněk, pomocí hodnocení jejich morfologie, pohyblivosti, dělení a migrace. Mikroskopie živých buněk čelí výzvám, jako je fototoxicita, což vyžaduje pečlivý výběr fluorescenčních značek a optimalizaci podmínek. Mezi syntetickými fluorescenčními sondami pro mikroskopii živých buněk vynikají BODIPY barviva se svou syntetickou univerzálností a fotofyzikálními vlastnostmi, které zajišťují minimální poškození vzorku během biozobrazování.

Target identification of active substances is critical in optimizing drugs and minimizing side effects. The complex nature of biological systems presents challenges; to meet them, however, microscopic methods, particularly phenotypic screening, represented by "Cell Painting" method and fluorescent probes, can be used as valuable tools for understanding the impact of various substances at the cellular and organelle levels. These methods enable rapid testing of large libraries of compounds and offer unique insights into their mechanism of action by observing cell behavior, assessing cell morphology, motility, division, and migration. However, live cell microscopy faces challenges like phototoxicity, requiring a careful selection of fluorescent labels and optimized conditions. Among synthetic probes for live cell microscopy, BODIPY dyes stand out for their synthetic versatility and photophysical properties, providing minimal sample damage during bioimaging.

• MeSH
• farmakologické účinky - molekulární mechanismy * MeSH
• fluorescenční barviva chemie   MeSH
• lidé MeSH
• mikroskopie metody   MeSH
• rychlé screeningové testy metody   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

Ciel: Zistiť efekt opakovaných intravitreálnych aplikácii afliberceptu na endotel rohovky u pacientov s diabetickým makulárnym edémom (DME) a edémom makuly pri oklúzii retinálnej vény (RVO). Metodika: Do prospektívneho sledovania v období od januára 2021 do novembra 2023 bolo zaradených 87 naivných očí s diagnózou DME a RVO. Exklúzne kritérium pre zaradenie bol operačný alebo laserový zákrok počas sledovacieho obdobia, nosenie kontaktných šošoviek, ope rácia katarakty pred menej ako 6 mesiacmi, dystrofie alebo iné ochorenia rohovky, ktoré môžu spôsobiť zmeny endotelu. Okrem rutinných vyšetrení sme v deň 1., 4. a 8. injekcie vyšetrovali aj endotel rohovky pomocou bezkontaktnej endotelovej mikroskopie. Vyhodnocovali sme 4 parametre: hustotu endotelových buniek (CD), hexagonalitu (HEX), koeficient variability (CV) a centrálnu hrúbku rohovky (CCT). Najskôr sme vyhodnocovali celý súbor očí a následne sme ho rozdelili podľa 2 kritérií; podľa diagnózy na DME/RVO a podľa šošovky na fakické/pseu dofakické oči. Výsledky: Vyhodnotených bolo 87 očí (68 pacientov). Priemerný vek pacientov v čase diagnózy bol 66,8 ±9,3 rokov. Z celkového počtu 87 bolo 51 (59 %) fakických a 36 (41 %) pseudofakických očí. S diagnózou DME bolo liečených 61 (70 %) očí a s diagnózou RVO 26 (30 %). V prie behu sledovania nedošlo vplyvom liečby k štatisticky signifikantnej zmene priemerných hodnôt CD, HEX, CV, CCT či už v súbore všetkých očí alebo v rozdelení do podskupín podľa diagnózy či stavu šošovky. Záver: Zistili sme, že intravitreálne aplikácie afliberceptu u pacientov s DME a RVO neovplyvňujú parametre rohovkového endotelu ako CCT, HEX, CD, CV hodnotené pomocou endotelovej mikroskopie pri sledovaní po 8 injekciu.

Aim: To determine the effect of repeated intravitreal injections of aflibercept on the corneal endothelium in patients with diabetic macular edema (DME) and macular edema due to retinal vein occlusion (RVO). Methods: In a prospective study conducted between January 2021 and November 2023, a total of 87 treatment-naive eyes with DME and RVO were evaluated. The exclusion criteria were surgery or laser intervention during the follow-up period, contact lens wear, cataract surgery in the last 6 months, dystrophy, or other corneal condition that may cause endothelial damage. In addition to routine examinations on the day of application, we also measured the corneal endothelium using specular microscopy on the 1st, 4th and 8th day of injection. We evaluated 4 parameters: endothelial cell density (CD), hexagonality (HEX), coefficient of variability (CV) and central corneal thickness (CCT). First of all, we evaluated the entire cohort of eyes, and then divided it according to 2 criteria; the diagnosis into DME/RVO and according to the lens status into phakic/pseudophakic eyes. Results: A total of 87 eyes of 68 patients were evaluated. The average age of the patients at the time of diagnosis was 66.8 ±9.3 years. Within the cohort 51 (59%) eyes were phakic and 36 (41%) pseudophakic. A total of 61 (70%) eyes with a diagnosis of DME were treated, and 26 (30%) with RVO. During the follow-up, there were no significant changes in the average values of CD, HEX, CV, CCT due to aflibercept treatment, either in the whole group or in subgroups according to diagnosis or lens condition. Conclusions: The results of this study suggest that intravitreal administration of aflibercept in patients with DME and RVO did not have an impact on corneal endothelial parameters, including CCT, HEX, CD and CV. These parameters were measured using endothelial microscopy during an 8-injection observation period.

• Klíčová slova
• aflibercept,
• MeSH
• bevacizumab aplikace a dávkování   farmakologie   terapeutické užití   MeSH
• endoteliální buňky účinky léků   MeSH
• humanizované monoklonální protilátky farmakologie   klasifikace   terapeutické užití   MeSH
• inhibitory angiogeneze * aplikace a dávkování   farmakologie   klasifikace   terapeutické užití   MeSH
• injekce intravitreální * klasifikace   metody   MeSH
• lidé MeSH
• makulární edém chemicky indukované   etiologie   MeSH
• mikroskopie klasifikace   metody   MeSH
• počet buněk MeSH
• prospektivní studie MeSH
• rohovkový endotel diagnostické zobrazování   účinky léků   MeSH
• vaskulární endoteliální růstový faktor A antagonisté a inhibitory   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

Úvod: Iridokorneální endotelový (ICE) syndrom je vzácné onemocnění charakterizované abnormální proliferací a strukturálními změnami endotelu, obliterací iridokorneálního úhlu a anomáliemi duhovky. Důsledkem těchto změn je sekundární glaukom a dekompenzace rohovky. Etiologie je nejasná a častěji postihuje ženy středního věku. Kazuistiky: Formou článku prezentujeme dvě odlišné kazuistiky mladých pacientů s diagnózou ICE syndromu s rozvinutými komplikacemi. V 1. kazuistice se jedná o mladou pacientku, u které se pomocí antiglaukomové a rohovkové chirurgie daří stabilizovat glaukomové onemocnění a rohovkový edém. Naproti tomu kazuistika 2. poukazuje na složitý a komplikovaný případ 29letého pacienta, u kterého ani přes opakované zákroky není léčba úspěšná. Závěr: Tento text poukazuje na komplikovanost ICE syndromu, obtížnost jeho terapie a důležitost včasné diagnostiky.

Aim: Iridocorneal endothelial (ICE) syndrome is a rare disease characterized by abnormal proliferation and structural changes of the endothelium, obliteration of the iridocorneal angle, and anomalies of the iris. The consequence of these changes is secondary glaucoma and corneal decompensation. The etiology is unclear, and the syndrome more commonly affects middle-aged women. Case reports: In this article we present two different case studies of young patients diagnosed with ICE syndrome with complications. The first case report is about a young woman in whom surgical treatment of glaucoma and corneal edema was successful. On the other hand, the second report presents a complicated case of a 29-year-old patient whose treatment was not successful despite repeated interventions. Conclusion: This text highlights the complexity of ICE syndrome, the difficulty of its therapy and the importance of early diagnosis.

• MeSH
• diferenciální diagnóza MeSH
• dospělí MeSH
• glaukom etiologie   MeSH
• iridokorneální endoteliální syndrom * diagnostické zobrazování   diagnóza   komplikace   patologie   MeSH
• lidé MeSH
• mikroskopie klasifikace   metody   MeSH
• nemoci rohovky diagnostické zobrazování   diagnóza   klasifikace   MeSH
• nitrooční tlak MeSH
• rohovkový endotel diagnostické zobrazování   patologie   MeSH
• slepota etiologie   MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• kazuistiky MeSH

Aktuální WHO klasifikace nádorů gastrointestinálního traktu (2019) představuje koncept diagnostiky intraduktálních a cystických nádorů pankreatu dominantně založený na integraci molekulárních dat a vyhodnocení maligního potenciálu předmětných lézí. Intraduktální neoplazie pankreatu s duktálním fenotypem zahrnují mikroskopické prekurzorové léze pankreatického duktálního adenokarcinomu – pankreatické intraepitelové neoplazie a makroskopické prekurzorové léze pankreatického karcinomu, kde intraduktální papilární mucinózní neoplazie představuje nejčastější pankreatickou neoplazii cystického vzhledu. Intraduktální onkocytární papilární neoplazie a intraduktální tubulopapilární neoplazie jsou nyní klasifikovány jako samostatné jednotky asociované s méně agresivními subtypy pankreatického karcinomu, vyznačující se lepší prognózou. Klinický význam mikroskopických pankreatických intraepitelových neoplazií je omezený, na rozdíl od jiných intraduktálních neoplazií, prezentujících se zobrazovacími metodami jako solidní a/nebo cystické neoplazie s významnými konsekvencemi pro další léčbu a indikaci chirurgické terapie (resekce versus strategie „watch and wait“). Nádory neduktálního původu, jako je karcinom z acinárních buněk a neuroendokrinní neoplazie, mohou vzácně vykazovat intraduktální růst a jejich správná klasifikace je klinicky velmi významná. Cystické pankreatické léze v diferenciální diagnóze zahrnují nejen cystické a pseudocysticky transformované nádory, ale i rozsáhlé spektrum reaktivních, inflamatorních a dysontogenetických cystických lézí.

The current WHO classification of digestive system tumours (2019) has presented the concept of diagnostics of intraductal and cystic neoplasms of the pancreas mostly based on integrated molecular data and evaluations of their malignant potential. Intraductal pancreatic neoplasms with ductal phenotype include microscopic precursor lesions of pancreatic ductal adenocarcinoma – the pancreatic intraepithelial neoplasia and macroscopic precursor lesions of pancreatic cancer, where intraductal papillary mucinous neoplasm represents the most common neoplasm of the pancreas with cystic appearance. Both intraductal oncocytic papillary neoplasm and intraductal tubulopapillary neoplasm are now classified as separate entities associated with less aggressive subtypes of pancreatic carcinoma and better prognosis. Clinical significance of microscopic pancreatic intraepithelial neoplasias is limited, in contrast to other intraductal neoplasms, which are presented as cystic and/or solid tumours by imaging methods with important consequences for further treatment and indication of surgical therapy (resection versus „watch and wait“ strategies). Neoplasms of nonductal origin, such as acinar cell carcinomas and neuroendocrine neoplasms, can uncommonly display an intraductal growth and their correct classification has a great clinical importance. Moreover, differential diagnostics of cystic pancreatic lesions include not only cystic and pseudocystically transformed neoplasms, but also a large spectrum of reactive, inflammatory and dysontogenetic cystic lesions.

• MeSH
• biopsie metody   MeSH
• diferenciální diagnóza MeSH
• intraduktální nádory pankreatu * diagnóza   klasifikace   patologie   MeSH
• lidé MeSH
• mikroskopie metody   MeSH
• nádory cystické, mucinózní a serózní * diagnóza   klasifikace   patologie   MeSH
• nádory slinivky břišní * diagnóza   patologie   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

We present two cases from the neonatal department with cerebrospinal fluid examination. We revealed a striking discrepancy in polymorphonuclear (PMN) and mononuclear (MN) cell counts using conventional light microscopy in comparison with automated analyzer Sysmex XN-1000 (PMNs - 13 vs. 173x106/L, MNs - 200 vs. 67x106/L in case 1 and PMNs - 13 vs. 372x106/L, MNs - 411 vs. 179x106/L in case 2). We revealed the dominant presence of hemosiderophages in both cases in cytospin slide. Even though Sysmex XN-1000 offers fast examination with a low sample volume, there is possibility of misdiagnosis, with negative impact on the patient.

• MeSH
• leukocyty mononukleární patologie   cytologie   MeSH
• lidé MeSH
• mikroskopie * metody   MeSH
• mozkomíšní mok cytologie   MeSH
• neutrofily cytologie   patologie   MeSH
• novorozenec MeSH
• počet leukocytů MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• novorozenec MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• kazuistiky MeSH
• srovnávací studie MeSH

• MeSH
• biopsie MeSH
• diagnostické techniky molekulární metody   MeSH
• lidé MeSH
• mikroskopie metody   MeSH
• rejekce štěpu * diagnóza   prevence a kontrola   MeSH
• transplantáty * MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

Live cells act as biological lenses and can be employed as real-world optical components in bio-hybrid systems. Imaging at nanoscale, optical tweezers, lithography and also photonic waveguiding are some of the already proven functionalities, boosted by the advantage that cells are fully biocompatible for intra-body applications. So far, various cell types have been studied for this purpose, such as red blood cells, bacterial cells, stem cells and yeast cells. White Blood Cells (WBCs) play a very important role in the regulation of the human body activities and are usually monitored for assessing its health. WBCs can be considered bio-lenses but, to the best of our knowledge, characterization of their optical properties have not been investigated yet. Here, we report for the first time an accurate study of two model classes of WBCs (i.e., monocytes and lymphocytes) by means of a digital holographic microscope coupled with a microfluidic system, assuming WBCs bio-lens characteristics. Thus, quantitative phase maps for many WBCs have been retrieved in flow-cytometry (FC) by achieving a significant statistical analysis to prove the enhancement in differentiation among sphere-like bio-lenses according to their sizes (i.e., diameter d) exploiting intensity parameters of the modulated light in proximity of the cell optical axis. We show that the measure of the low intensity area (S: Iz

• MeSH
• holografie * metody   MeSH
• lidé MeSH
• lymfocyty MeSH
• mikroskopie * metody   MeSH
• monocyty MeSH
• optika a fotonika MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

• MeSH
• feces parazitologie   MeSH
• hlodavci parazitologie   MeSH
• mikroskopie metody   MeSH
• parazitární nemoci u zvířat * diagnóza   MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• zvířata MeSH

Automatic detection and segmentation of biological objects in 2D and 3D image data is central for countless biomedical research questions to be answered. While many existing computational methods are used to reduce manual labeling time, there is still a huge demand for further quality improvements of automated solutions. In the natural image domain, spatial embedding-based instance segmentation methods are known to yield high-quality results, but their utility to biomedical data is largely unexplored. Here we introduce EmbedSeg, an embedding-based instance segmentation method designed to segment instances of desired objects visible in 2D or 3D biomedical image data. We apply our method to four 2D and seven 3D benchmark datasets, showing that we either match or outperform existing state-of-the-art methods. While the 2D datasets and three of the 3D datasets are well known, we have created the required training data for four new 3D datasets, which we make publicly available online. Next to performance, also usability is important for a method to be useful. Hence, EmbedSeg is fully open source (https://github.com/juglab/EmbedSeg), offering (i) tutorial notebooks to train EmbedSeg models and use them to segment object instances in new data, and (ii) a napari plugin that can also be used for training and segmentation without requiring any programming experience. We believe that this renders EmbedSeg accessible to virtually everyone who requires high-quality instance segmentations in 2D or 3D biomedical image data.

• MeSH
• algoritmy * MeSH
• lidé MeSH
• mikroskopie * metody   MeSH
• počítačové zpracování obrazu metody   MeSH
• zobrazování trojrozměrné metody   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH