The biological fate of each mRNA and consequently, the protein to be synthesised, is highly dependent on the nature of the 3' untranslated region. Despite its non-coding character, the 3' UTR may affect the final mRNA stability, the localisation, the export from the nucleus and the translation efficiency. The conserved regulatory sequences within 3' UTRs and the specific elements binding to them enable gene expression control at the posttranscriptional level and all these processes reflect the actual state of the cell including proliferation, differentiation, cellular stress or tumourigenesis. Through this article, we briefly outline how the alterations in the establishment and final architecture of 3' UTRs may contribute to the development of various disorders in humans.

• MeSH
• 3' Untranslated Regions MeSH
• Chorea genetics   metabolism   pathology   MeSH
• Heredodegenerative Disorders, Nervous System genetics   metabolism   pathology   MeSH
• Dementia genetics   metabolism   pathology   MeSH
• Trinucleotide Repeat Expansion MeSH
• Cognition Disorders genetics   metabolism   pathology   MeSH
• Nucleic Acid Conformation MeSH
• Humans MeSH
• Myotonic Dystrophy genetics   metabolism   pathology   MeSH
• Neoplasms genetics   metabolism   pathology   MeSH
• RNA Precursors genetics   metabolism   MeSH
• Check Tag
• Humans MeSH
• Publication type
• Journal Article MeSH
• Research Support, Non-U.S. Gov't MeSH
• Review MeSH

• MeSH
• Carcinogenesis MeSH
• Carcinoma MeSH
• Neoplasm Metastasis MeSH
• Neoplasms metabolism   MeSH
• Carcinoma, Non-Small-Cell Lung MeSH
• Publication type
• Collected Work MeSH

• Conspectus
• Patologie. Klinická medicína
• NML Fields
• onkologie

• MeSH
• Cell Culture Techniques methods   utilization   MeSH
• Drug Resistance, Neoplasm genetics   immunology   drug effects   MeSH
• Financing, Organized utilization   MeSH
• Photometry methods   utilization   MeSH
• Clinical Trials as Topic MeSH
• Evidence-Based Medicine trends   MeSH
• Neoplasms classification   MeSH
• Antineoplastic Agents adverse effects   therapeutic use   toxicity   MeSH
• Succinates diagnostic use   MeSH
• Tetrazolium Salts diagnostic use   MeSH

Východiska: Akutní lymfoblastická leukémie je nejčastěji diagnostikovanou malignitou dětských pacientů v české republice. V posledních desetiletích byl učiněn nebývalý pokrok v její léčbě, k němuž bezesporu napomohla i řada poznatků týkající se molekulárních charakteristik onemocnění. Analýza expresních profilů pomocí „Arrays“ (čipů) se stala jednou z významných metod při identifikaci potenciálních markerů onemocnění, které by umožnily bližší charakterizaci nádorových buněk a přispěly k porozumění procesu vzniku leukémie i stratifikace léčby. Metody a výsledky:V rámci studie byl sledován vliv methotrexátu na expresi genů p53-signální dráhy u maligních blastů izolovaných z kostní dřeně dětských pacientů s akutní leukémií. Změny exprese genů byly detekovány pomocí „GEArray Q series Human p53 Signalling Pathway Gene Array“. Porovnáním získaných expresních profilů jednotlivých pacientů byly pozorovány odlišné hladiny exprese sledovaných genů u kontrolních buněk, taktéž změny transkripční aktivity vlivem methotrexátu byly různorodé. Kromě jiných došlo vlivem methotrexátu k výrazným změnám transkripce genů uplatňující se při apoptóze či regulaci buněčného cyklu. Změny exprese některých genů byly nalezeny u více pacientů, řada ostatních se však projevila individuálně, nezávisle na typu onemocnění. Závěry: Byly detekovány změny v expresi řady genů p53-signální dráhy u maligních blastů kultivovaných ex vivo s methotrexátem. Odlišné hladiny exprese genů potvrzují značnou heterogenitu dětských leukémií, projevující se v našem souboru v expresních profilech a ve způsobu buněčné odpovědi na přítomnost methotrexátu, jejichž důsledkem může být různá míra citlivosti k aplikované látce a také různá odpověď pacienta na terapii.

Backgrounds: Acute lymphoblastic leukemia is the most frequent malignancy diagnosed in children in the Czech Republic. During last few decades, considerable progress in the treatment had been made and it was similarly contributed by many findings on the molecular basis of the disease. Expression profiling analysis using Macro or Micro Arrays has become an important technique to identify potential markers of the disorder, which might characterise malignant cells and help in the understanding of development of leukaemia and treatment stratification. Methods and Results: In the present study, the effect of methotrexate on the expression of p53-signalling pathway genes was investigated in malignant blasts isolated from the bone marrow of patients with acute leukemia. Expression variations were detected using „GEArray Q series Human p53 Signalling Pathway Gene Array“. Having drawn a comparison between expression profiles, variable gene expression levels in the control cells; likewise various transcription activity alterations were observed. Significant changes in the transcription were found among genes involved in the of apoptosis or cell cycle regulation. Regarding some genes, changes in expression were observed in more that one patient. However, the expression levels of most other genes varied individually, independently on the subtype of the disease. Conclusions: Changes in the expression of p53-signalling pathway genes were detected in the malignant blasts cultivated ex vivo with methotrexate. Different levels of the transcription in our series confirm heterogeneity of childhood leukemias, where patients with the same diagnosis do not need to share identical gene expression profiles even the manner of cellular response on the presence of methotrexate, resulting in the various level of perceptiveness to the medication and in the final response to the therapy.

• MeSH
• DNA, C-Form MeSH
• Gene Expression genetics   drug effects   MeSH
• Financing, Organized MeSH
• Genes, p53 genetics   immunology   drug effects   MeSH
• Hematologic Neoplasms diagnosis   etiology   genetics   MeSH
• Drug Evaluation MeSH
• Bone Marrow MeSH
• Medical Oncology methods   trends   MeSH
• Drug Delivery Systems methods   utilization   MeSH
• Leukemia diagnosis   etiology   genetics   MeSH
• Humans MeSH
• Methotrexate administration & dosage   therapeutic use   MeSH
• Oligonucleotide Array Sequence Analysis methods   utilization   MeSH
• Check Tag
• Humans MeSH

• MeSH
• Gene Expression genetics   immunology   drug effects   MeSH
• Research Support as Topic MeSH
• Genes, p53 genetics   immunology   drug effects   MeSH
• Bone Marrow immunology   pathology   MeSH
• Leukemia MeSH
• Humans MeSH
• Methotrexate antagonists & inhibitors   immunology   therapeutic use   MeSH
• Check Tag
• Humans MeSH

• MeSH
• Research Support as Topic MeSH
• Genes, p53 drug effects   MeSH
• Methotrexate pharmacology   MeSH
• Gene Expression Regulation, Leukemic drug effects   MeSH

• Publication type
• Abstracts MeSH