Hematologické malignity obvykle vznikají následkem nejméně dvou získaných genetických aberací, kde sekundární aberace způsobují transformaci pre-leukemických buněk na buňky plně leukemické. Dysregulovaná imunitní odpověď na běžnou infekci je považována za spouštěcí mechanismus druhého zásahu, nicméně jaká je role vnitřních imunologických mechanismů při dohledu/progresi z pre-leukémie do plně rozvinutého onemocnění není zcela jasné. Naše nedávná studie leukemií s pomalým nástupem naznačila některé zúčastněné imunitní mechanismy, které poskytují (dočasnou) kontrolu (pre-)maligního klonu. Nalezli jsme fyziologické gama/delta T-lymfocyty charakterizované specifickou přestavbou T-buněčného receptoru gama, s dynamikou opačnou, než jakou má (pre-)leukemický klon. V tomto projektu chceme popsat pozadí imunologických mechanismů spojených se závěrečnými fázemi vývoje hematologických malignit a pokusit se identifikovat fyziologické buňky/klony, které se podílejí na dočasné imunitní kontrole (pre-)maligního klonu.; Haematological malignancies usually result from cooperation of at least two acquired genetic aberrations, with secondary aberrations driving the transformation of pre-leukaemic to fully leukaemic cells. Dysregulated immune response to a common infection is considered to be the trigger leading to the second hit; however, what is the role of intrinsic immunological mechanisms in the surveillance/progression from pre-leukaemia to full blown disease is not clearly understood. Our recent study on “slow onset” leukaemias suggested some immunological mechanisms involved, providing (temporarily) surveillance over the (pre-)malignant clone. We found physiological gamma/delta T-cells characterised by specific T-cell receptor gamma rearrangement, with dynamics mirroring the one of the (pre-)leukaemic clone. In this project, we aim to dissect a background of immunological mechanisms related to the final stages of development of haematological malignancies and possibly to define physiological cells/clones participating on temporary immunosurveillance.

• Klíčová slova
• repertoire, repertoár, leukémie, leukaemia, imunoreceptorové geny, immunoreceptor genes,

• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

• MeSH
• akutní lymfatická leukemie * farmakoterapie   genetika   MeSH
• bcr-abl fúzní proteiny genetika   MeSH
• lidé MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• dopisy MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

Recently, we defined "CML-like" subtype of BCR::ABL1-positive acute lymphoblastic leukemia (ALL), resembling lymphoid blast crisis of chronic myeloid leukemia (CML). Here we retrospectively analyzed prognostic relevance of minimal residual disease (MRD) and other features in 147 children with BCR::ABL1-positive ALL (diagnosed I/2000-IV/2021, treated according to EsPhALL (n = 133) or other (n = 14) protocols), using DNA-based monitoring of BCR::ABL1 genomic breakpoint and clonal immunoglobulin/T-cell receptor gene rearrangements. Although overall prognosis of CML-like (n = 48) and typical ALL (n = 99) was similar (5-year-EFS 60% and 49%, respectively; 5-year-OS 75% and 73%, respectively), typical ALL presented more relapses while CML-like patients more often died in the first remission. Prognostic role of MRD was significant in the typical ALL (p = 0.0005 in multivariate analysis for EFS). In contrast, in CML-like patients MRD was not significant (p values > 0.2) and inapplicable for therapy adjustment. Moreover, in the typical ALL, risk-prediction could be further improved by considering initial hyperleukocytosis. Early distinguishing typical BCR::ABL1-positive ALL and CML-like patients is essential to enable optimal treatment approach in upcoming protocols. For the typical ALL, tyrosine-kinase inhibitors and concurrent chemotherapy with risk-directed intensity should be recommended; in the CML-like disease, no relevant prognostic feature applicable for therapy tailoring was found so far.

• MeSH
• akutní lymfatická leukemie * genetika   farmakoterapie   MeSH
• akutní nemoc MeSH
• bcr-abl fúzní proteiny genetika   MeSH
• chronická myeloidní leukemie * farmakoterapie   genetika   MeSH
• dítě MeSH
• lidé MeSH
• retrospektivní studie MeSH
• reziduální nádor genetika   MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

Fúzní gen BCR-ABL1 je charakteristickým znakem chronické myeloidní leukémie (CML) a je přítomen i u podskupiny akutních lymfoblastických leukémií (ALL). Naše předchozí studie a předběžné výsledky ukazují, že některé případy diagnostikované jako ALL mohou být ve skutečnosti CML v lymfoidní blastické krizi. V předkládaném projektu chceme objasnit pozadí BCR-ABL1-pozitivních dětských leukémií na buněčné a molekulární úrovni se zvláštím zaměřením na odlišnosti mezi případy “typické ALL” a “možné CML”. K tomu využijeme genomické (SNP array, MLPA, celoexomové sekvenování), transkriptomické (expresní profilování, celogenomové transkriptomové sekvenování) a cytometrické (“Mass Cytometry”) přístupy. Monitorování léčby různými metodami včetně kvantifikace genomické fúze mezi geny BCR a ABL1 navíc umožní stanovit úlohu sledování zbytkové nemoci u této podskupiny ALL a optimální techniku. Tyto výsledky mohou mít důležitý dopad na volbu optimálního terapeutického přístupu, monitorování a na léčebné výsledky těchto leukémií.; BCR-ABL1 fusion is a hallmark of chronic myeloid leukaemia (CML) and is present also in a subset of acute lymphoblastic leukaemia (ALL). Our previous studies and preliminary data suggest, that some cases diagnosed as ALL might be in fact CML in lymphoid blast crisis. In the proposed project we aim to disclose background of BCR-ABL1-positive childhood leukaemia at molecular and biological level, with a specific interest in differences between “typical ALL” and “possible CML” cases. For this purpose we will use genomic (SNP array, MLPA, whole exome sequencing), transcriptomic (expression profiling, RNAseq) and cytometric (Mass Cytometry) approaches. Moreover, employing monitoring of the treatment using various approaches including quantification of genomic fusion of BCR and ABL1 genes will help to establish the role of residual disease monitoring in this ALL subset and the optimal technique. The results could have an important implications for optimal treatment strategy, monitoring and for outcome of these leukaemias.

• MeSH
• akutní lymfatická leukemie diagnóza   genetika   MeSH
• bcr-abl fúzní proteiny analýza   genetika   škodlivé účinky   MeSH
• chronická myeloidní leukemie diagnóza   genetika   MeSH
• dítě MeSH
• lidé MeSH
• prognóza MeSH
• průtoková cytometrie metody   MeSH
• reziduální nádor MeSH
• sekvenování celého genomu metody   MeSH
• stanovení celkové genové exprese metody   MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• pediatrie
• onkologie
• hematologie a transfuzní lékařství
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Minimal residual disease (MRD) at the end of induction therapy is important for risk stratification of acute lymphoblastic leukaemia (ALL), but bone marrow (BM) aspiration is often postponed or must be repeated to fulfil qualitative and quantitative criteria for morphological assessment of haematological remission and/or MRD analysis. The impact of BM aspiration delay on measured MRD levels and resulting risk stratification is currently unknown. We analysed paired MRD data of 289 paediatric ALL patients requiring a repeat BM aspiration. MRD levels differed in 108 patients (37%) with a decrease in the majority (85/108). This would have resulted in different risk group allocation in 64 of 289 patients (23%) when applying the ALL-Berlin-Frankfurt-Münster 2000 criteria. MRD change was associated with the duration of delay; 40% of patients with delay ≥7 days had a shift to lower MRD levels compared to only 18% after a shorter delay. Patients MRD-positive at the original but MRD-negative at the repeat BM aspiration (n = 50) had a worse 5-year event-free survival than those already negative at first aspiration (n = 115) (86 ± 5% vs. 94 ± 2%; P = 0·024). We conclude that BM aspirations should be pursued as scheduled in the protocol because delayed MRD sampling at end of induction may result in false-low MRD load and distort MRD-based risk assessment.

• MeSH
• akutní lymfatická leukemie diagnóza   patologie   MeSH
• časové faktory MeSH
• chybná diagnóza prevence a kontrola   MeSH
• dítě MeSH
• hodnocení rizik MeSH
• indukce remise MeSH
• kojenec MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• opožděná diagnóza MeSH
• předškolní dítě MeSH
• reziduální nádor diagnóza   patologie   MeSH
• tenkojehlová biopsie MeSH
• vyšetřování kostní dřeně metody   MeSH
• výsledek terapie MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• kojenec MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• předškolní dítě MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

V rámci předkládaného projektu budeme analysovat buňky hyperdiploidních akutních lymfoblastických leukemií. Získáme data o charakteru genetických a funkčních změn typických pro tento nejčastější podtyp dětských leukemii a o jeho patogenesi. To může vést ke správnější stratifikaci a terapii těchto pacientů.; Within the proposed project we will analyse the cells of hyperdiplid acute lymphoblastic leukaemia. We will collect data on a type of genetic and functional changes typical for this most frequent subtype ofchildhood ALL and also data on its pathogenesis. This could lead to a better stratification and treatment of these patients.

• MeSH
• akutní lymfatická leukemie MeSH
• chromozomální aberace MeSH
• cytogenetika MeSH
• diploidie MeSH
• dítě MeSH
• exprese genu MeSH
• hybridizace in situ fluorescenční MeSH
• kvantitativní polymerázová řetězová reakce MeSH
• odběr fetální krve MeSH
• průtoková cytometrie MeSH
• transkriptom MeSH
• vyšetřování kostní dřeně MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH

• Konspekt
• Pediatrie
• NLK Obory
• pediatrie
• onkologie
• hematologie a transfuzní lékařství
• molekulární biologie, molekulární medicína
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

V rámci předkládaného projektu budeme analysovat preleukemické buňky získané ze čtyř různých zdrojů. Získáme data o fenotypu a o charakteru genetických a funkčních změn typických pro preleukemii a aberací, které vedou k následné progresi do leukemie. Pokusíme se pravděpodobnost této progrese negativně ovlivnit v in-vitro podmínkách.; During the course of the project we will analyse preleukaemic cells obtained from four different sources. We will obtain data on the phenotype and character of genetic and functional changes typical for preleukaemia as well as aberrations that lead to the progression towards leukaemia. We will try to negatively affect the probability of such progression under in-vitro conditions.

• MeSH
• akutní nemoc MeSH
• dítě MeSH
• genetická transkripce MeSH
• leukemie etiologie   MeSH
• odběr fetální krve MeSH
• preleukemie diagnóza   MeSH
• průtoková cytometrie MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH

• Konspekt
• Pediatrie
• NLK Obory
• pediatrie
• onkologie
• hematologie a transfuzní lékařství
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Dětské akutní leukémie jsou heterogenní skupinou onemocnění. Kromě základního rozdělení na akutní lymfoblastické leukémie (ALL) a akutní myeloidní leukémie (AML) je heterogenita dána především rozmanitostí primárních genetických aberací, které s sebou nesou rozdílný biologický základ, rozdílnou odpověď na léčbu i rozdílnou prognózu jednotlivých podtypů. Nejčastějšími primárními aberacemi s velmi dobrou prognózou jsou u ALL hyperdiploidie a fúzní gen TEL/AML1, naopak špatnou prognózu mají pacienti s fúzí BCR/ABL či s přestavbami genu MLL. U AML jsou za příznivé aberace považovány fúze AML1/ETO, CBFB/MYH11 a PML/RARA. Zřejmě nejspolehlivějším ukazatelem prognózy u ALL je časná odpověď na terapii, stanovená jako hladiny minimální reziduální nemoci (MRN) v předem stanovených časových bodech léčby. Role MRN u AML je méně jasná, v poslední době se však i zde stává její vyšetřování součástí léčebných protokolů.

Childhood acute leukaemias are heterogeneous group of diseases. Besides the basic classification into acute lymphoblastic leukaemias (ALL) and acute myeloid leukaemias (AML), the heterogeneity is mainly a consequence of variety of primary genetic aberrations. These aberrations result in various biological background, variable response to treatment and variable prognosis of different leukaemia subtypes. In ALL, the most common primary aberrations with a very good prognosis are hyperdiploidy and TEL/AML1 fusion gene. On the other hand, patients with BCR/ABL fusion or MLL gene rearrangements have poor prognosis. In AML, the AML1/ETO, CBFB/MYH11 and PML/RARA fusions are considered favourable. Probably the most reliable prognostic factor in ALL is an early response to treatment measured as levels of minimal residual disease (MRD) in specific time-points during therapy. The role of MRD in AML is less clear; however, its monitoring becomes a part of the standard treatment protocols recently.

• MeSH
• akutní lymfatická leukemie * etiologie   genetika   MeSH
• akutní myeloidní leukemie * etiologie   genetika   MeSH
• bcr-abl fúzní proteiny MeSH
• chromozomální aberace MeSH
• diploidie MeSH
• fúze genů MeSH
• fúzní onkogenní proteiny MeSH
• komplementární DNA MeSH
• lidé MeSH
• molekulární biologie MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• prognóza MeSH
• proteiny asociované s mikrotubuly MeSH
• protoonkogenní protein MLL MeSH
• průtoková cytometrie MeSH
• transkripční faktor Ikaros MeSH
• translokace genetická MeSH
• transplantace hematopoetických kmenových buněk MeSH
• vysoce účinné nukleotidové sekvenování MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH
• přehledy MeSH

Cílem je charakterizovat pomocí nejmodernějších molekulárně-genetických a imunologických metod pacienty s vysokým rizikem relapsu a vytipovat u nich možné příčiny selhání léčby. Tato data mohou vést k optimalizaci terapie vysoce rizikové dětské leukémie.; Aim of the study is to characterise patients with a very high risk of relapse using modern methods and to unravel possible causes of the treatment failure. The data could lead to treatment optimalisation in the very high risk childhood leukaemia.

• MeSH
• akutní lymfatická leukemie MeSH
• dítě MeSH
• nádorové buněčné linie MeSH
• nádorové kmenové buňky MeSH
• prognóza MeSH
• recidiva MeSH
• rizikové faktory MeSH
• sekundární prevence MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH

• Konspekt
• Pediatrie
• NLK Obory
• pediatrie
• onkologie
• hematologie a transfuzní lékařství
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

• Publikační typ
• abstrakt z konference MeSH