Following the COVID-19 infection, the sternum dislocation and wound dehiscence resulted in an infection complicating the recovery of an immunosuppressed patient after bilateral lung transplantation. Anaerobic culture (96 h) of milky cloudy wound secretion resulted in the growth of pinpoint haemolytic colonies identified as Metamycoplasma hominis (formerly Mycoplasma hominis). The search for the endogenous source of the infection found the bacterium exclusively in the patient's sputum, making a possible link to donor lung M. hominis colonization. Unfortunately, the donor samples were no longer available. The wound infection was successfully treated with 17 days of clindamycin despite the continuous PCR detection of M. hominis in the sputum after the end of the treatment.

• MeSH
• antibakteriální látky terapeutické užití   MeSH
• COVID-19 diagnóza   MeSH
• imunokompromitovaný pacient MeSH
• infekce chirurgické rány * mikrobiologie   farmakoterapie   diagnóza   MeSH
• klindamycin terapeutické užití   MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• Mycoplasma hominis * genetika   izolace a purifikace   MeSH
• mykoplazmové infekce * mikrobiologie   diagnóza   farmakoterapie   MeSH
• SARS-CoV-2 genetika   izolace a purifikace   MeSH
• sputum mikrobiologie   MeSH
• transplantace plic * škodlivé účinky   MeSH
• Check Tag
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• kazuistiky MeSH

• MeSH
• antifungální látky terapeutické užití   MeSH
• Candida * MeSH
• kandidemie * farmakoterapie   MeSH
• lidé MeSH
• rizikové faktory MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• dopisy MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

A case report of post-traumatic exogenous endophthalmitis caused by Nocardia farcinica, including treatment procedures, microbiology examination, and systemic medications. A 23-year-old male suffered a penetrating corneal injury that was treated with sutures. On the thirteenth day after the final suture was removed, an anterior uveitis developed and progressed to whitish, plump, nodular, and tufted exudates within the anterior chamber over the next 10 days; this led to an indication for intraocular surgery. Anterior chamber lavage and resection of solid fibrinous exudates (using a vitrectomy knife) for a complete microbiological examination were performed. Nocardia farcinica was identified. Systemic medications were chosen according to sensitivity, and a fixed combination of sulfamethoxazole 400 mg/trimethoprim 80 mg was administered long-term (months). In this case, accurate, early detection of an atypical infectious agent and determination of its sensitivity to antibiotic treatment enabled effective treatment that achieved the best functional and anatomical results under the circumstances.

• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

Úvod: Invazivní mykotické infekce představují život ohrožující infekční komplikace u hematologických pacientů a jejich časná diagnostika může přispět ke zlepšení přežívání těchto nemocných. Jejich zastoupení se v posledních letech mění zejména vlivem selekčního tlaku antimykotik. Materiál a metodika: Cílem naší práce bylo retrospektivní zhodnocení změn v epidemiologii invazivních aspergilóz, invazivních kandidóz a vzácných mykóz u hematologických nemocných v českých a slovenských hematoonkologických centrech v letech 2005–2017. Sledované období bylo rozděleno na 1. období (2005–2012) a 2. období (2013–2017). K analýze byla použita data zadaná do databáze FIND (Fungal INfection Database) na základě diagnostických EORTC/ MSG kritérií z roku 2008. Spotřeba vybraných antimykotik byla vyjádřena v relativní roční spotřebě na 1 000 lůžkodní. Výsledky: Celkem bylo zdokumentováno 349 invazivních aspergilóz, 168 invazivních kandidóz a 102 vzácných mykóz (z toho 65,7 % invazivních zygomykóz). Výskyt invazivní aspergilózy vzrůstal v 1. období, přičemž od roku 2013 nastal naopak klesající trend (průměrný počet případů na centrum v letech 2005–2012–2017: 1,1–3,6–0,7). Snížilo se zastoupení invazivních aspergilóz u vysoce rizikových pacientů (2005 – 72,7 %; 2010 – 40,7 %; 2017 – 18,2 %). Celková spotřeba posakonazolu rostla od roku 2005 (rDDD v roce 2005–2010–2015: 0–831–1043). Celkový počet invazivních kandidóz a vzácných mykóz zůstal v letech neměnný. Zastoupení druhů Candida albicans vs. non-albicans se také v 1. a 2. období nelišilo (26,1 % vs. 29,1 %; p = 0,732). U průlomových infekcí na profylaxi posakonazolem nebo vorikonazolem se signifikantně častěji vyskytovaly vzácné patogeny ve srovnání s infekcemi vzniklými u pacientů bez této profylaxe (35,3 % vs. 14,4 %; p = 0,000). Závěr: Na základě analýzy byl potvrzen klesající výskyt invazivních aspergilóz dominantně v souvislosti se zavedením rutinní antimykotické profylaxe posakonazolem u vysoce rizikových pacientů. Zastoupení zygomykózy u těchto nemocných také kleslo. U pacientů na profylaxi posakonazolem nebo vorikonazolem došlo ke změně spektra infekcí ve prospěch vzácných patogenů.

Background: Invasive fungal diseases are life-threatening infectious complications affecting haematological patients and their early diagnosis can contribute to improved survival of affected patients. In the last years, the patterns of invasive fungal infections have changed mainly due to the selection pressure of antifungals. Material and Methods: The aim of our analysis to evaluate retrospectively changes in the epidemiology of invasive aspergillosis, invasive candidiasis and rare mycoses in haematological patients at Czech and Slovak haematological centres from 2005–2017. The observed period was divided into: 2005–2012 (1st period) and 2013–2017 (2nd period). Data entered into FIND – Fungal INfection Database (according to the EORTC/MSG criteria from 2008) was used for the analysis. The total consumption of posaconazole and micafungin was expressed in relative annual consumption per 1000 bed-days. Results: A total of 349 invasive aspergillosis, 168 invasive candidiasis and 102 rare mycoses (65.7% invasive zygomycosis) were documented. The incidence of aspergillosis increased from 2005 to 2012, with a declining trend since 2013 (the average number of cases per centre in 2005–2012–2017 was: 1.1–3.6–0.7). The incidence of aspergillosis in high risk patients decreased (2005 – 72.7%, 2013 – 42.4%, 2017 – 18.2%). Total consumption of posaconazole has been on the increase since 2005 (rDDD in 2005-2010-2015: 0-831-1043). The total number of invasive candidiasis and rare mycoses remained unchanged over the years. The Candida albicans vs. non-albicans ratio remained unchanged in the 1st and 2nd periods (26.1% vs. 29.1%, p=0.732). There was a significant increase in rare mycoses in breakthrough infections on posaconazole or voriconazole prophylaxis compared to non-breakthrough infections (35.3% vs. 14.4%). Conclusion: Based on our analysis, we have confirmed a decrease in the incidence of invasive aspergillosis from 2013 after the introduction of routine antifungal prophylaxis with posaconazole in high-risk patients. The ratio of high-risk patients with invasive zygomycosis has also decreased. Patients on posaconazole or voriconazole prophylaxis have changed the spectrum of infections in favour of rare pathogens.

• Klíčová slova
• hematologický pacient,
• MeSH
• akutní lymfatická leukemie komplikace   MeSH
• dospělí MeSH
• hematologické nádory * komplikace   MeSH
• invazivní mykotické infekce * epidemiologie   MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• retrospektivní studie MeSH
• senioři MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• senioři MeSH

• Publikační typ
• abstrakt z konference MeSH

Invasive fungal disease represents one of the severe complications in haematopoietic stem cell transplant recipients. We describe a case of a patient treated for relapse of chronic lymphoblastic leukaemia 6 years after HSCT. The patient was treated for invasive pulmonary aspergillosis but died 3 months later from multiple organ failures consisting of haemorrhagic necrotizing fungal pneumonia, refractory chronic hepatic graft versus host disease and cytomegalovirus hepatitis. Autopsy samples revealed histopathological evidence of fungal hyphae and an unusual Aspergillus nidulans-like species was isolated in pure culture. More precise identification was achieved by using scanning electron microscopy of ascospores and sequencing of calmodulin gene, and the isolate was subsequently re-identified as A. sublatus (section Nidulantes) and showed good in vitro susceptibility against all classes of antifungals. Commonly used ITS rDNA region and β-tubulin gene fail to discriminate A. sublatus from related pathogenic species, especially A. quadrilineatus and A. nidulans. Although this is the first case of proven IPA attributed to A. sublatus, we demonstrated that at least some previously reported infections due to A. quadrilineatus were probably caused by this cryptic species.

• MeSH
• antifungální látky aplikace a dávkování   MeSH
• Aspergillus klasifikace   cytologie   genetika   izolace a purifikace   MeSH
• chronická lymfatická leukemie komplikace   MeSH
• cytomegalovirové infekce komplikace   diagnóza   MeSH
• DNA fungální chemie   genetika   MeSH
• fatální výsledek MeSH
• fylogeneze MeSH
• invazivní plicní aspergilóza diagnóza   farmakoterapie   mikrobiologie   patologie   MeSH
• kalmodulin genetika   MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mezerníky ribozomální DNA chemie   genetika   MeSH
• mikrobiální testy citlivosti MeSH
• mikroskopie elektronová rastrovací MeSH
• nemoc štěpu proti hostiteli komplikace   diagnóza   MeSH
• příjemce transplantátu MeSH
• sekvenční analýza DNA MeSH
• shluková analýza MeSH
• transplantace hematopoetických kmenových buněk škodlivé účinky   MeSH
• tubulin genetika   MeSH
• virová hepatitida u lidí komplikace   diagnóza   MeSH
• Check Tag
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• kazuistiky MeSH

The achievement of a better life for cystic fibrosis (CF) patients is mainly caused by a better management and infection control over the last three decades. Herein, we want to summarize the cornerstones for an effective management of CF patients and to give an overview of the knowledge about the fungal epidemiology in this clinical context in Europe. Data from a retrospective analysis encompassing 66,616 samples from 3235 CF patients followed-up in 9 CF centers from different European countries are shown.

• MeSH
• cystická fibróza komplikace   MeSH
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• kojenec MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• management nemoci * MeSH
• mladiství MeSH
• mladý dospělý MeSH
• novorozenec MeSH
• plicní mykózy diagnóza   farmakoterapie   epidemiologie   MeSH
• předškolní dítě MeSH
• retrospektivní studie MeSH
• senioři MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• kojenec MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• mladý dospělý MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• novorozenec MeSH
• předškolní dítě MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• Geografické názvy
• Evropa epidemiologie   MeSH

Cíl práce: Kandidémie patří mezi poměrně časté infekční komplikace u kriticky nemocných pacientů. V posledním desetiletí se díky novým terapeutickým přístupům (zejména u některých skupin pacientů) mění spektrum kvasinek, které infekci způsobují. Předkládaná multicentrická studie si dala za úkol získat aktuální informace o epidemiologické situaci týkající se invazivních kandidóz (IC) v České republice. Materiál a metody: Do souboru byla zařazena data pacientů s kultivačně pozitivním nálezem kvasinky v krvi z 11 mikrobiologických pracovišť v České republice v rozmezí let 2012–2015. Byla hodnocena incidence, zastoupení jednotlivých kvasinkových druhů podle sledovaných let, podle věku a podle odborností. Dále byl posouzen vliv kolonizace a nakonec zda IC předcházela přítomnost toxigenního kmene Clostridium difficile ve stolici. U části izolovaných kmenů byly standardní metodikou stanoveny minimální inhibiční koncentrace (MIC) systémových antimykotik. Výsledky: V průběhu sledovaného období bylo v zúčastněných laboratořích zachyceno 921 kvasinkových kmenů od 886 pacientů. Celková incidence IC na 1 000 přijatých pacientů byla 0,40 (rozmezí 0,21–1,22 podle pracovišť). Takřka polovina izolátů spadala do druhu Candida albicans (49,7 %), následovaná Candida glabrata (15,3 %) a Candida parapsilosis (11,2 %). Na onkologických odděleních výrazně převažovaly non-albicans druhy (71,6 %), na rozdíl od chirurgických (40,4 %) nebo interních (52,0 %) oborů. Více než 70,0 % pacientů bylo v době pozitivní kultivace hospitalizováno na jednotkách intenzivní péče (JIP) a 65,0 % nemocných bylo kolonizováno stejným druhem kvasinky, který byl později nalezen v hemokultuře. Pouze u 5,1 % pacientů z celkového počtu byla potvrzena předchozí přítomnost toxigenního kmene C. difficile ve stolici. Celkem bylo otestováno 56 kmenů kvasinek (z 921) a byla zaznamenána zvýšená MIC u azolů pro C. glabrata. Závěr: Incidence kandidémií v České republice se ve sledovaném období výrazně neměnila a po C. albicans je druhou nejčastěji izolovanou kvasinkou v krvi C. glabrata.

Background: Candidemia is a severe and often life-threatening infection frequently occurring in critically ill patients. During the last decade, new therapeutic and prophylactic strategies influenced (at least in some patient subgroups) the epidemiological situation and the spectrum of causative Candida strains. The present multicentre study aimed to assess the current epidemiological situation of Candida strains causing invasive candidiasis (IC) in patients of tertiary care hospitals in the Czech Republic. Material and methods: Clinical and microbiological data on patients with bloodstream yeast isolates collected in 11 tertiary care hospitals in the Czech Republic between 2012 and 2015 were analysed. The incidence of cases and species distribution were assessed by study year, age, and specialty. Moreover, an association with the Candida colonization and presence of toxigenic strains of Clostridium difficile in stool prior to blood culture positivity was analysed. For some of the strains, minimum inhibitory concentrations (MICs) of systemic antifungals were determined using standard methods. Results: A total of 886 episodes of candidemia (921 yeast strains) were identified during the study period. The overall incidence per 1000 admissions was 0.40 (range 0.21–1.22 depending on the hospital). Almost half of the isolates belonged to the species Candida albicans (49.7 %), followed by Candida glabrata (15.3 %) and Candida parapsilosis (11.2 %). Non-albicans species of Candida significantly predominated in oncology wards (71.6 %) as compared to surgery (40.4 %) or internal medicine (52.0 %) departments. More than 70.0 % of patients stayed in intensive care units at the time of positive culture; in 65.0 % of patients, colonization with the same yeast species preceded blood culture positivity. In only 5.1 % of all patients, the previous presence of toxigenic strains of Clostridium difficile in stool was found. Fifty-six of the 921 yeast strains were tested for antifungal susceptibility, with an increase in MICs to azoles being observed for C. glabrata. Conclusion: The incidence of candidemia in the Czech Republic did not vary significantly between 2012 and 2015, and C. glabrata was the second most common yeast species after C. albicans isolated from blood.

• MeSH
• antifungální látky MeSH
• Candida klasifikace   patogenita   MeSH
• incidence MeSH
• infekce spojené se zdravotní péčí * MeSH
• kandidemie * diagnóza   epidemiologie   krev   MeSH
• lidé MeSH
• mikrobiální testy citlivosti metody   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• multicentrická studie MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

• MeSH
• cystická fibróza MeSH
• DNA fungální MeSH
• dýchací soustava mikrobiologie   MeSH
• feces mikrobiologie   MeSH
• gastrointestinální trakt mikrobiologie   MeSH
• houby izolace a purifikace   MeSH
• idiopatické střevní záněty MeSH
• lidé MeSH
• mykobiom * MeSH
• transplantace plic MeSH
• ústa mikrobiologie   MeSH
• vagina mikrobiologie   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

Clinical yeast isolates belonging to Candida pelliculosa, Candida utilis and Candida fabianii are difficult to distinguish in a routine mycology laboratory using common biochemical tests. The aims of this study were to determine the prevalence of C. pelliculosa, C. utilis and C. fabianii in clinical samples and to compare their minimum inhibitory concentrations (MICs) to systemic antifungals. Two hundred and forty-eight clinical yeast isolates obtained from eight large hospitals in the Czech Republic were included in this study. Identification was performed biochemically using ID 32C kit and by MALDI-TOF MS. MICs were determined using colorimetric broth dilution Sensititre YeastOne panels. From a total number of 248 isolates, 175 were identified as C. pelliculosa and 73 as C. utilis using the biochemical kit. In contrast, MALDI-TOF MS identified 222 isolates as C. fabianii, 20 as C. pelliculosa and 6 as C. utilis. The highest mean MICs were found in C. fabianii and, regardless of the studied species, in isolates from blood cultures and central venous catheters. MALDI-TOF MS revealed C. fabianii to be most prevalent in clinical samples as compared with the other studied species. Higher MIC values in C. fabianii support the importance of correct identification of this species.

• MeSH
• antifungální látky farmakologie   MeSH
• Candida klasifikace   izolace a purifikace   MeSH
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• kandidóza epidemiologie   mikrobiologie   MeSH
• kojenec MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mikrobiální testy citlivosti MeSH
• mladiství MeSH
• mladý dospělý MeSH
• mykologické určovací techniky MeSH
• nemocnice MeSH
• novorozenec MeSH
• předškolní dítě MeSH
• prevalence MeSH
• prospektivní studie MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• kojenec MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• mladý dospělý MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• novorozenec MeSH
• předškolní dítě MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika epidemiologie   MeSH