Pharmacophore modeling is a widely used strategy for finding new hit molecules. Since not all protein targets have available 3D structures, ligand-based approaches are still useful. Currently, there are just a few free ligand-based pharmacophore modeling tools, and these have a lot of restrictions, e.g., using a template molecule for alignment. We developed a new approach to 3D pharmacophore representation and matching which does not require pharmacophore alignment. This representation can be used to quickly find identical pharmacophores in a given set. Based on this representation, a 3D pharmacophore ligand-based modeling approach to search for pharmacophores which preferably match active compounds and do not match inactive ones was developed. The approach searches for 3D pharmacophore models starting from 2D structures of available active and inactive compounds. The implemented approach was successfully applied for several retrospective studies. The results were compared to a 2D similarity search, demonstrating some of the advantages of the developed 3D pharmacophore models. Also, the generated 3D pharmacophore models were able to match the 3D poses of known ligands from their protein-ligand complexes, confirming the validity of the models. The developed approach is available as an open-source software tool: http://www.qsar4u.com/pages/pmapper.php and https://github.com/meddwl/psearch.
V oblasti srdečního selhání, zejména akutní dekompenzace, dochází stále k hledání a vývoji nových lékových skupin. Uvádíme výsledky klinických studií, v nichž byly pacientům podávány natriuretické peptidy, blokátory receptoru pro adenosin, blokátory receptoru pro vazopresin, léčivo serelaxin a nová pozitivně inotropní látka ‒ omecamtiv mecarbil. Ačkoliv tyto nové lékové skupiny znamenají klinický posun, prognózu nemocných trpících srdečním selháním žádná z nich nezlepšuje
The search and development of new drug classes in heart failure, and acute decompensation in particular, is still ongoing. We present results of clinical studies where natriuretic peptides, adenosine receptor blockers, vasopressin receptor blockers, serelaxin and omecamtiv mecabril, a new positive inotropic substance, are administered to patients. Although these new drug classes translate into advance in clinical care, not even one improves prognosis of patients with heart failure.
- MeSH
- antagonisté adenosinového receptoru A1 aplikace a dávkování škodlivé účinky terapeutické užití MeSH
- kardiotonika MeSH
- klinické hodnocení nového léčiva * MeSH
- lidé MeSH
- metaanalýza jako téma MeSH
- močovina analogy a deriváty MeSH
- natriuretické peptidy terapeutické užití MeSH
- natriuretický peptid typu B aplikace a dávkování škodlivé účinky terapeutické užití MeSH
- randomizované kontrolované studie jako téma * MeSH
- rekombinantní proteiny terapeutické užití MeSH
- relaxin terapeutické užití MeSH
- srdeční selhání * diagnóza farmakoterapie prevence a kontrola MeSH
- statistika jako téma MeSH
- vasopresiny terapeutické užití MeSH
- vazodilatancia terapeutické užití MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
Kofeín je xantínový alkaloid so psychostimulačným účinkom, ktorý je sprostredkovaný jeho antagonistickým pôsobením na adenozínové A2A receptory. Jeho farmakologickým cieľom sú predovšetkým striatálne A2A-D2 receptorové heteroméry. Ako neselektívny antagonista adenozínových receptorov však blokuje aj presynaptické A1 receptory, čo vedie k jeho monoamínergickému pôsobeniu. V závislosti od koncentrácie môže interagovať s GABAergickou neurotransmisiou a agonisticky pôsobiť na ryanodínové receptory. Neuropsychofarmakologickým profilom kofeínu je daný i jeho neuroprotektívny účinok, synergický účinok s antidepresívami, ale aj jeho nežiaduce a potenciálne nebezpečné účinky v kombinácii s inými psychostimulanciami.
Caffeine is a xanthine alkaloid with a psychostimulant effect mediated by its antagonistic action at adenosine A2A receptors. Its pharmacological targets are primarily striatal A2A-D2 receptor heteromers. However, as a non-selective adenosine receptor antagonist, it also blocks presynaptic A1 receptors, leading to its monoaminergic action. Depending on the concentration it may interact with GABA-ergic neurotransmission and act at ryanodine receptors as an agonist. Neuropsychopharmacological profile of caffeine also determines its neuroprotective effect, synergistic effect with antidepressants, but also its undesirable and potentially dangerous effects in combination with other psychostimulants.
- Klíčová slova
- heteromerní komplex A2A-D2,
- MeSH
- abstinenční syndrom MeSH
- agonisté dopaminu MeSH
- antagonisté purinergního receptoru P1 farmakologie klasifikace MeSH
- antidepresiva MeSH
- corpus striatum účinky léků MeSH
- GABAergní neurony účinky léků MeSH
- káva MeSH
- kofein * farmakologie škodlivé účinky toxicita MeSH
- lékové interakce MeSH
- lidé MeSH
- neuroprotektivní látky MeSH
- Parkinsonova nemoc farmakoterapie patologie MeSH
- poruchy spojené s užíváním psychoaktivních látek MeSH
- psychotropní léky MeSH
- purinergní receptory P1 klasifikace účinky léků MeSH
- receptory dopaminové MeSH
- ryanodinový receptor vápníkového kanálu účinky léků MeSH
- synergismus léků MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
- MeSH
- agonisté beta-2-adrenergních receptorů aplikace a dávkování farmakokinetika škodlivé účinky terapeutické užití MeSH
- antagonisté leukotrienů aplikace a dávkování farmakokinetika škodlivé účinky terapeutické užití MeSH
- antagonisté purinergního receptoru P1 aplikace a dávkování farmakokinetika škodlivé účinky terapeutické užití MeSH
- aplikace inhalační * MeSH
- bronchiální astma * farmakoterapie MeSH
- dospělí MeSH
- dvojitá slepá metoda MeSH
- hodnocení léčiv MeSH
- hormony kůry nadledvin aplikace a dávkování farmakokinetika škodlivé účinky terapeutické užití MeSH
- klinické zkoušky, fáze II jako téma MeSH
- klinické zkoušky, fáze III jako téma MeSH
- lidé MeSH
- randomizované kontrolované studie jako téma MeSH
- tiotropium bromid * aplikace a dávkování farmakokinetika škodlivé účinky terapeutické užití MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Klíčová slova
- Coffea laurifolia Salisb., Arabian coffee (angl.), Kaffeebaum (něm.), Caféier (franc.), kahwe (arab.), fructus, semen, Coffeae carbo, Coffeae semen,
- MeSH
- antagonisté purinergního receptoru P1 * MeSH
- antimutagenní látky * MeSH
- antivirové látky * MeSH
- cholesterol * MeSH
- dítě MeSH
- homocystein * účinky léků MeSH
- inhibitory agregace trombocytů * MeSH
- inhibitory fosfodiesteras * MeSH
- káva * MeSH
- kofein * aplikace a dávkování farmakologie kontraindikace metabolismus škodlivé účinky terapeutické užití MeSH
- kojenec MeSH
- kojení MeSH
- kyselina chlorogenová * aplikace a dávkování farmakologie imunologie terapeutické užití MeSH
- léčivé rostliny * fyziologie chemie škodlivé účinky účinky léků MeSH
- lékové interakce * MeSH
- lidé MeSH
- předškolní dítě MeSH
- stimulanty centrálního nervového systému * MeSH
- těhotenství MeSH
- warfarin * MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- kojenec MeSH
- lidé MeSH
- předškolní dítě MeSH
- těhotenství MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- MeSH
- acetylcholinesterasa účinky léků MeSH
- alkaloidy farmakologie MeSH
- antagonisté purinergního receptoru P1 terapeutické užití MeSH
- inhibitory fosfodiesteras farmakologie MeSH
- kofein * farmakologie terapeutické užití MeSH
- lidé MeSH
- monoaminoxidasa účinky léků MeSH
- mozek účinky léků MeSH
- neurodegenerativní nemoci * farmakoterapie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- přehledy MeSH
The influence of pre- and postnatal caffeine treatment on brain excitability during development and adulthood is reviewed. Pre- and postnatal exposure to caffeine induces sex- and age-specific long-term neurochemical alterations in the brain and the behavior of rodents. Because adenosine neuromodulation is closely related to the regulation of brain excitability the increased expression in adenosine receptor system due to neonatal caffeine treatment should cause transient and permanent changes in seizure susceptibility. So far, findings have been focused on primarily developmental changes of the brain adenosine modulatory system and have demonstrated that the alterations are not restricted to a single brain region. Neurobehavioral changes and the anticonvulsant effect of early caffeine exposure are dependent on the caffeine dose, developmental stage of exposure and age of testing. Although outcomes of caffeine treatment are still a matter of debate, our review raise questions concerning the impact of early caffeine treatment on regulation of seizure susceptibility during development and adulthood.
- MeSH
- antagonisté purinergního receptoru P1 aplikace a dávkování farmakologie MeSH
- antikonvulziva aplikace a dávkování farmakologie MeSH
- kofein aplikace a dávkování farmakologie MeSH
- krysa rodu rattus MeSH
- lidé MeSH
- mozek účinky léků růst a vývoj metabolismus MeSH
- myši MeSH
- novorozená zvířata MeSH
- záchvaty metabolismus MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- krysa rodu rattus MeSH
- lidé MeSH
- myši MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- přehledy MeSH
Adenosine plays an important role during inflammation, particularly through modulation of monocyte function. The objective of the present study was to evaluate the effect of synthetic adenosine analogs on cytokine production by porcine monocytes. The LPS-stimulated cytokine production was measured by flow cytometry and quantitative real-time PCR. Adenosine receptor expression was measured by quantitative real-time PCR. The present study demonstrates that adenosine analog N-ethylcarboxyamidoadenosine (NECA) down-regulates TNF-α production and up-regulates IL-8 production by LPS-stimulated porcine monocytes. The effect was more pronounced in CD163(-) subset of monocytes compared to the CD163(+) subset. Although both monocyte subsets express mRNA for A1, A2A, A2B and A3 adenosine receptors, the treatment of monocytes with various adenosine receptor agonists and antagonists proved that the effect of adenosine is mediated preferentially via A2A adenosine receptor. Moreover, the study suggests that the effect of NECA on porcine monocytes alters the levels of the cytokines which could play a role in the differentiation of naive T cells into Th17 cells. The results suggest that adenosine plays an important role in modulation of cytokine production by porcine monocytes.
- MeSH
- adenosin-5'-(N-ethylkarboxamid) farmakologie MeSH
- adenosin farmakologie MeSH
- agonisté purinergního receptoru P1 farmakologie MeSH
- antagonisté purinergního receptoru P1 farmakologie MeSH
- antigeny diferenciační myelomonocytární metabolismus MeSH
- CD antigeny metabolismus MeSH
- cytokiny biosyntéza genetika MeSH
- lipopolysacharidy farmakologie MeSH
- messenger RNA genetika metabolismus MeSH
- monocyty účinky léků metabolismus MeSH
- purinergní receptory P1 genetika metabolismus MeSH
- receptory buněčného povrchu metabolismus MeSH
- regulace genové exprese účinky léků MeSH
- Sus scrofa metabolismus MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
Bradykinin can enhance skeletal muscle glucose uptake (GU), and exercise increases both bradykinin production and muscle insulin sensitivity, but bradykinin's relationship with post-exercise insulin action is uncertain. Our primary aim was to determine if the B2 receptor of bradykinin (B2R) is essential for the post-exercise increase in GU by insulin-stimulated mouse soleus muscles. Wildtype (WT) and B2R knockout (B2RKO) mice were sedentary or performed 60 minutes of treadmill exercise. Isolated soleus muscles were incubated with [(3)H]-2-deoxyglucose +/-insulin (60 or 100 microU/ml). GU tended to be greater for WT vs. B2RKO soleus with 60 microU/ml insulin (P=0.166) and was significantly greater for muscles with 100 microU/ml insulin (P<0.05). Both genotypes had significant exercise-induced reductions (P<0.05) in glycemia and insulinemia, and the decrements for glucose (~14 %) and insulin (~55 %) were similar between genotypes. GU tended to be greater for exercised vs. sedentary soleus with 60 microU/ml insulin (P=0.063) and was significantly greater for muscles with 100 microU/ml insulin (P<0.05). There were no significant interactions between genotype and exercise for blood glucose, plasma insulin or GU. These results indicate that the B2R is not essential for the exercise-induced decrements in blood glucose or plasma insulin or for the post-exercise increase in GU by insulin-stimulated mouse soleus muscle.
- MeSH
- adiponektin sekrece MeSH
- adrenalin farmakologie metabolismus MeSH
- antagonisté adenosinového receptoru A1 farmakologie MeSH
- dibutyryl cyklický AMP farmakologie metabolismus MeSH
- inzulin metabolismus MeSH
- krysa rodu rattus MeSH
- palmitany farmakologie metabolismus MeSH
- potkani Wistar MeSH
- techniky in vitro MeSH
- tukové buňky sekrece účinky léků MeSH
- xanthiny farmakologie MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- krysa rodu rattus MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- zvířata MeSH