The MBT Pathfinder is an automated colony-picking robot designed for efficient sample preparation in matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight (MALDI-TOF) mass spectrometry. This article presents results from three key experiments evaluating the instrument's performance in conjunction with MALDI Biotyper instrument. The method comparison experiment assessed its clinical performance, demonstrating comparable results with gram-positive, gram-negative, and anaerobic bacteria (scores larger than 2.00) and superior performance over simple direct yeast transfer (score: 1.80) when compared to samples prepared manually. The repeatability experiment confirmed consistent performance over multiple days and labs (average log score: 2.12, std. deviation: 0.59). The challenge panel experiment showcased its consistent and accurate performance across various samples and settings, yielding average scores between 1.76 and 2.19. These findings underline the MBT Pathfinder as a reliable and efficient tool for MALDI-TOF mass spectrometry sample preparation in clinical and research applications.
- MeSH
- Bacteria * klasifikace izolace a purifikace MeSH
- laboratorní automatizace * metody MeSH
- lidé MeSH
- odběr biologického vzorku metody MeSH
- reprodukovatelnost výsledků MeSH
- robotika * MeSH
- spektrometrie hmotnostní - ionizace laserem za účasti matrice * metody MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- hodnotící studie MeSH
- MeSH
- interpretace obrazu počítačem metody přístrojové vybavení MeSH
- laboratorní automatizace metody přístrojové vybavení MeSH
- mikroskopie klasifikace metody MeSH
- objevování léků * metody MeSH
- rychlé screeningové testy metody MeSH
- techniky kombinatorické chemie metody MeSH
- vyvíjení léků metody přístrojové vybavení MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
- MeSH
- biochemie přístrojové vybavení trendy MeSH
- hmotnostní spektrometrie trendy MeSH
- klinická chemie * přístrojové vybavení trendy MeSH
- kongresy jako téma MeSH
- laboratorní automatizace metody MeSH
- laboratorní medicína přístrojové vybavení trendy MeSH
- lidé MeSH
- molekulární biologie trendy MeSH
- umělá inteligence trendy MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- MeSH
- klinická chemie MeSH
- klinické laboratorní techniky metody přístrojové vybavení MeSH
- laboratorní automatizace * metody přístrojové vybavení MeSH
- lidé MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Je předloženo zamyšlení nad digitalizací v klinické mikrobiologii. Jsou zvažovány výhody a limitace digitálního zpracování mikrobiologických dat pro jednotlivce i celou lidskou populaci.
x
- MeSH
- bezpečnost krve * dějiny metody přístrojové vybavení trendy MeSH
- diagnostické techniky molekulární metody přístrojové vybavení MeSH
- fotometrie metody přístrojové vybavení MeSH
- imunochemie metody přístrojové vybavení MeSH
- imunologické techniky klasifikace metody přístrojové vybavení MeSH
- klinické laboratorní techniky klasifikace metody přístrojové vybavení MeSH
- laboratorní automatizace MeSH
- lidé MeSH
- sérologické testy metody přístrojové vybavení MeSH
- transfuzní lékařství * dějiny metody přístrojové vybavení trendy MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
Microsatellite instability (MSI) is present in 15-20% of primary colorectal cancers. MSI status is assessed to detect Lynch syndrome, guide adjuvant chemotherapy, determine prognosis, and use as a companion test for checkpoint blockade inhibitors. Traditionally, MSI status is determined by immunohistochemistry or molecular methods. The Idylla™ MSI Assay is a fully automated molecular method (including automated result interpretation), using seven novel MSI biomarkers (ACVR2A, BTBD7, DIDO1, MRE11, RYR3, SEC31A, SULF2) and not requiring matched normal tissue. In this real-world global study, 44 clinical centers performed Idylla™ testing on a total of 1301 archived colorectal cancer formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tissue sections and compared Idylla™ results against available results from routine diagnostic testing in those sites. MSI mutations detected with the Idylla™ MSI Assay were equally distributed over the seven biomarkers, and 84.48% of the MSI-high samples had ≥ 5 mutated biomarkers, while 98.25% of the microsatellite-stable samples had zero mutated biomarkers. The concordance level between the Idylla™ MSI Assay and immunohistochemistry was 96.39% (988/1025); 17/37 discordant samples were found to be concordant when a third method was used. Compared with routine molecular methods, the concordance level was 98.01% (789/805); third-method analysis found concordance for 8/16 discordant samples. The failure rate of the Idylla™ MSI Assay (0.23%; 3/1301) was lower than that of referenced immunohistochemistry (4.37%; 47/1075) or molecular assays (0.86%; 7/812). In conclusion, lower failure rates and high concordance levels were found between the Idylla™ MSI Assay and routine tests.
- MeSH
- fixace tkání * MeSH
- fixativa MeSH
- formaldehyd MeSH
- imunohistochemie * MeSH
- kolorektální nádory chemie genetika patologie MeSH
- laboratorní automatizace MeSH
- lidé MeSH
- mikrosatelitní nestabilita * MeSH
- mutace * MeSH
- mutační analýza DNA * MeSH
- nádorové biomarkery * analýza genetika MeSH
- prediktivní hodnota testů MeSH
- reprodukovatelnost výsledků MeSH
- zalévání tkání do parafínu * MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- multicentrická studie MeSH
- srovnávací studie MeSH
