Cíl: Zaměřili jsme se na stanovení prevalence infekce SARS-CoV-2 se symptomatickým nebo asymptomatickým průběhem a na identifikaci prediktorů symptomatické nebo asymptomatické infekce SARS-CoV-2 u pacientů během sedmi měsíců následujících po transplantaci alogenních hematopoetických kmenových buněk (alo-HSCT) v období cirkulace varianty omikron. Metody: Prevalence proběhlé infekce SARS-CoV-2 byla detekována u pacientů během sedmi měsíců po allo-HSCT v omikronovém období pomocí buněčné a humorální imunitní odpovědi proti nukleoproteinu SARS-CoV-2 (NCP). Výsledky: Pozitivní markery prodělané infekce byly identifikovány u 45,2 % pacientů (n = 42). Infekce byla asymptomatická u 68,4 % pacientů s anti-NCP pozitivitou. Hledání rizikových faktorů pro symptomatickou infekci SARS-CoV-2 u příjemců alo-HSCT odhalilo, že nízká úroveň rekonstituce B buněk byla jediným signifikantně souvisejícím rizikovým faktorem. Závěr: Vysoký podíl příjemců alo-HSCT, kteří byli asymptomaticky infikováni do sedmi měsíců po transplantaci v letech 2022–2023, přestože byli imunokompromitovaní a neočkovaní, ukazuje na oslabení cirkulujícího viru a může signalizovat pro pacienty po transplantaci menší riziko onemocnění SARS-CoV-2 v omikronovém období. Ukázalo se, že očkování těchto pacientů proti SARS- -CoV-2 je spojeno s nízkým, ale významným rizikem exacerbace vyléčené chronické reakce štěpu proti hostiteli (GVHD – Graft Versus Host Disease) a s rizikem de novo GVHD. Nízká úroveň rekonstituce B-buněk byla jediným významným rizikovým faktorem pro symptomatickou infekci SARS-CoV-2 u příjemců alo-HSCT.
Aim: We aimed to determine the prevalence of SARS-CoV-2 infection, including both symptomatic and asymptomatic courses, and to identify predictors of asymptomatic or symptomatic SARS-CoV-2 infection in patients within seven months after allo-HSCT (allogenic hematopoietic stem cell transplantation) in the Omicron period. Methods: Prevalence of the past SARS-CoV-2 infection was determined in patients within seven months after allo-HSCT in the Omicron period using the cellular and humoral immune response against the SARS-CoV-2 nucleoprotein (NCP). Results: Positive markers of past infection were identified in 45.2% of patients (n = 42). The infection was asymptomatic in 68.4% of anti-NCP positive patients. The search for risk factors for symptomatic SARS-CoV-2 infection in allo-HSCT recipients revealed that a low level of B cell reconstitution was the only significantly associated risk factor. Conclusion: A high proportion of allo-HSCT recipients who were asymptomatically infected within up to seven months after transplantation from 2022 to 2023 despite being immunosuppressed and unvaccinated indicates an attenuation of the circulating virus and may signal less risk for transplanted patients from SARS-CoV-2 infection in the Omicron period. Vaccination of these patients against SARS-CoV-2 was shown to be associated with a low but significant risk of exacerbation of cured chronic GVHD (graft versus host disease) and the risk of de novo GVHD. The low level of B-cell reconstitution was the only significant risk factor for symptomatic SARS-CoV-2 infection in HSCT recipients.
- Klíčová slova
- Omikron,
- MeSH
- asymptomatické infekce * epidemiologie MeSH
- B-lymfocyty imunologie mikrobiologie transplantace MeSH
- COVID-19 * komplikace mikrobiologie MeSH
- homologní transplantace MeSH
- kohortové studie MeSH
- lidé MeSH
- nemoc štěpu proti hostiteli etiologie imunologie MeSH
- rizikové faktory MeSH
- SARS-CoV-2 patogenita MeSH
- transplantace hematopoetických kmenových buněk * MeSH
- vakcíny proti COVID-19 škodlivé účinky MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
Secretory (S) IgA antibodies against severe acute respiratory syndrome (SARS)-CoV-2 are induced in saliva and upper respiratory tract (URT) secretions by natural infection and may be critical in determining the outcome of initial infection. Secretory IgA1 (SIgA1) is the predominant isotype of antibodies in these secretions. Neutralization of SARS-CoV-2 is most effectively accomplished by polymeric antibodies such as SIgA. We hypothesize that cleavage of SIgA1 antibodies against SARS-CoV-2 by unique bacterial IgA1 proteases to univalent Fabα antibody fragments with diminished virus neutralizing activity would facilitate the descent of the virus into the lungs to cause serious disease and also enhance its airborne transmission to others. Recent studies of the nasopharyngeal microbiota of patients with SARS-CoV-2 infection have revealed significant increases in the proportions of IgA1 protease-producing bacteria in comparison with healthy subjects. Similar considerations might apply also to other respiratory viral infections including influenza, possibly explaining the original attribution of influenza to Haemophilus influenzae, which produces IgA1 protease.
- MeSH
- Bacteria enzymologie MeSH
- COVID-19 * přenos imunologie virologie mikrobiologie MeSH
- Haemophilus influenzae enzymologie imunologie MeSH
- imunoglobulin A sekreční * metabolismus MeSH
- imunoglobulin A imunologie MeSH
- lidé MeSH
- nazofarynx mikrobiologie virologie MeSH
- neutralizující protilátky imunologie MeSH
- protilátky virové imunologie MeSH
- SARS-CoV-2 * imunologie MeSH
- serinové endopeptidasy metabolismus imunologie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
To reveal the variation of gut microbiota and its association with immune function in cured patients with coronavirus 2019 (COVID-19) disease, gut microbiota of patients discharged from hospital for 20 ~ 23 months and healthy volunteers was analyzed by high throughput 16S rRNA sequencing. The diversity and abundance were compared, and the correlation with immunity factors was investigated, and changes in the content of 6 genera microorganisms with proportion higher than 0.1% were revealed in patients with COVID-19 disease: reduced content of Subdoligranulum, Haemophilus, Coprococcus, Eubacterium vertriosum group, and Lachnospiraceae ND3007 group and increased content of Hungatella. NK cells were negatively correlated to Subdoligranulum, while CD8 cells were positively correlated to Subdoligranulum but negative to Hungatella. IL-8 concentration was negatively correlated to Subdoligranulum, Haemophilus, Coprococcus, Eubacterium vertriosum group, and Lachnospiraceae ND3007 group but positively to Hungatella, while IL-1β concentration was negatively correlated to Haemophilus and Eubacterium ventriosum group but positively to Hungatella. The variation of probiotics and potential pathogenic bacteria implies a higher risk in diseases and inflammation, and the modulation of the gut microbiota may help the healing of COVID-19 patients.
- MeSH
- Bacteria klasifikace genetika izolace a purifikace MeSH
- buňky NK imunologie MeSH
- COVID-19 * imunologie mikrobiologie MeSH
- dospělí MeSH
- feces mikrobiologie virologie MeSH
- interleukin-1beta MeSH
- interleukin-8 MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- RNA ribozomální 16S * genetika MeSH
- SARS-CoV-2 * imunologie MeSH
- senioři MeSH
- střevní mikroflóra * MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- MeSH
- COVID-19 mikrobiologie prevence a kontrola MeSH
- interpretace statistických dat MeSH
- lidé MeSH
- odběr biologického vzorku metody MeSH
- polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí MeSH
- reprodukovatelnost výsledků MeSH
- testování na COVID-19 průkazem nukleové kyseliny * metody MeSH
- testování na COVID-19 metody MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
Cíl práce: Pandemie covid-19 měla zásadní vliv na zdravotnictví, které bylo nuceno zvládnout velké množství pacientů, včetně osob s respirační insuficiencí a nutností oxygenoterapie. Z obavy před souběžnou bakteriální koinfekcí byla u mnoha pacientů aplikována antibiotická terapie. Cílem předložené práce bylo porovnání antimikrobiální rezistence (AMR) v předcovidové a covidové době u pacientů v intenzivní péči. Materiál a metody: Do studie byli zařazeni pacienti hospitalizovaní na Klinice anesteziologie, resuscitace a intenzivní medicíny Fakultní nemocnice Olomouc (KARIM) v předcovidovém období (2018–2019) a v období covidové pandemie (2020–2021). Klinické vzorky z dolních cest dýchacích byly odebírané standardně dvakrát týdně, přičemž od každého pacienta byl do studie zařazen vždy jeden kmen daného druhu, který byl izolován první. Výsledky: U několika bakteriálních species (Escherichia coli, Proteus mirabilis a Haemophilus influenzae) byl zaznamenán pokles frekvence výskytu, na druhé straně byl v případě Enterococcus faecium, Serratia marcescens a Klebsiella variicola dokumentován vzestup. Celkově však lze konstatovat, že v covidové době nedošlo k zásadní změně frekvence bakteriálních patogenů izolovaných z dolních cest dýchacích. Stejně tak se až na několik výjimek významně nezměnila AMR. Významnější zvýšení rezistence bylo prokázáno u Serratia marcescens, a to k piperacilin/tazobaktamu, cefotaximu, ciprofloxacinu a gentamicinu. Současně však byl prokázán pokles rezistence Pseudomonas aeruginosa a Burkholderia cepacia komplex k meropenemu. Závěr: V době pandemie covid-19 nedošlo k významné změně frekvence bakteriálních patogenů a jejich rezistence k antibiotikům. Nicméně u některých species došlo ke zvýšení nebo snížení jejich procentuálního zastoupení a rezistence.
x
Fakultní nemocnice v Praze – Motole provedla v průběhu pandemie COVID-19 v létě roku 2020 a následně 2021 séroprevalenční studie mezi svými zaměstnanci. Zatímco v roce 2020 byla nalezena pozitivita pouze u 2 % testovaných zaměstnanců, v roce 2021 se situace výrazně změnila jednak probíhajícími vlnami infekce a dále nástupem vakcinačních programů. Souhrn studie přináší přehled o současném stavu imunity proti SARS-CoV-2 mezi zaměstnanci nemocnice v září 2021. Data ukazují velmi významnou proočkovanost mezi zaměstnanci, která přináší výbornou a stabilní protilátkovou odpověď, zvláště robustní u těch, kteří kromě očkování onemocnění COVID-19 prodělali. Samotná infekce indukuje diverzifikovanou imunitní odpověď vůči širšímu spektru antigenů viru, ve srovnání s očkováním je ale u části kohorty provázena absencí protilátek v odstupu několika měsíců po infekci. Sledování reakcí po očkování či onemocnění po vakcinaci přineslo očekávatelné výsledky, potvrzující hlavně častý výskyt mírných, převážně lokálních reakcí a možnost prolomení vakcinační ochrany u malého počtu kolem 2 % vakcinovaných osob, s následným mírně symptomatickým onemocněním. Práce také diskutuje individuální přístup k několika zaměstnancům, kteří neodpověděli na základní očkování tvorbou protilátek a jejichž situace se řešila v některých případech indikací další vakcinace, po níž pak k tvorbě protilátek došlo. Celkově lze hodnotit stav imunity proti SARS-CoV-2 u zaměstnanců k září 2021 jako velmi příznivý.
The University Hospital in Prague – Motol conducted a seroprevalence study among its employees during the COVID-19 pandemic in the summer of 2020 and subsequently in 2021. While in 2020 positivity was found in only 2% of tested employees, in 2021 the situation changed significantly with the ongoing waves of infection and the initiation of vaccination programs. The presented study provides an overview of the current status of the immune response among hospital employees in September 2021. The data show a very significant vaccination rate among employees of the hospital that provides a very good and stable antibody response, especially robust in those who have had COVID-19 in addition to vaccination. The infection itself induces a diversified immune response against a wider range of viral antigens, but compared to vaccination, it is accompanied by a lack of detectable antibody levels several months after infection in a subset of vaccinees. Monitoring of adverse reactions after vaccination or acquired disease after vaccination yielded the expected results, confirming mainly the frequent occurrence of mild, mainly local reactions and the possibility of breaking vaccination protection in a small number of about 2% of vaccinated persons, presenting mostly as an asymptomatic or mild disease. The work also discusses the individual approach to a few individual employees who did not respond to basal vaccinations and whose situation was addressed, in some cases, by indications of further vaccination dose, with afavorable outcome. Overall, the situation among employees in terms of their immune response can be assessed as very favorable, reflecting the stage of the pandemic in autumn 2021.
- MeSH
- COVID-19 mikrobiologie MeSH
- klinické laboratorní techniky * metody MeSH
- RNA izolace a purifikace MeSH
- Publikační typ
- rozhovory MeSH