- MeSH
- antibakteriální látky MeSH
- kolaterální senzitivita MeSH
- lidé MeSH
- mikrobiologické techniky * metody MeSH
- odběr biologického vzorku MeSH
- řízení kvality MeSH
- Salmonella enterica izolace a purifikace patogenita MeSH
- Salmonella izolace a purifikace klasifikace patogenita MeSH
- séroskupina MeSH
- Staphylococcus lugdunensis izolace a purifikace patogenita MeSH
- statistika jako téma MeSH
- testování odbornosti laboratoří * metody statistika a číselné údaje MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- zprávy MeSH
- Klíčová slova
- Salmonella kiambu,
- MeSH
- importované infekce * diagnóza terapie MeSH
- lidé MeSH
- předškolní dítě MeSH
- Salmonella klasifikace patogenita MeSH
- salmonelóza * diagnóza přenos terapie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- předškolní dítě MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
The application of rapid, specific, and sensitive methods for pathogen detection and quantification is very advantageous in diagnosis of human pathogens in several applications, including food analysis. The aim of this study was the evaluation of a method for the multiplexed detection and quantification of three significant foodborne pathogenic species (Escherichia coli O157, Salmonella spp., and Listeria monocytogenes). The assay combines specific DNA extraction by multiplex magnetic capture hybridization (mMCH) with multiplex real-time PCR. The amplification assay showed linearity in the range 106-10 genomic units (GU)/PCR for each co-amplified species. The sensitivity corresponded to 1 GU/PCR for E. coli O157 and L. monocytogenes, and 10 GU/PCR for Salmonella spp. The immobilization process and the hybrid capture of the MCH showed good efficiency and reproducibility for all targets, allowing the combination in equal amounts of the different nanoparticle types in mMCH. MCH and mMCH efficiencies were similar. The detection limit of the method was 10 CFU in samples with individual pathogens and 102 CFU in samples with combination of the three pathogens in unequal amounts (amount's differences of 2 or 3 log). In conclusion, this multiplex molecular platform can be applied to determine the presence of target species in food samples after culture enrichment. In this way, this method could be a time-saving and sensitive tool to be used in routine diagnosis.
- MeSH
- Escherichia coli O157 klasifikace genetika MeSH
- hybridizace nukleových kyselin MeSH
- kvantitativní polymerázová řetězová reakce MeSH
- lidé MeSH
- Listeria monocytogenes klasifikace genetika MeSH
- multiplexová polymerázová řetězová reakce MeSH
- Salmonella klasifikace genetika MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
BACKGROUND: Few studies have been conducted on the presence of Salmonella in the rodents that inhabit the wet markets that play an important role in daily life in Southeast Asia. The results of studies of rodents as carriers of Salmonella vary greatly, ranging from an absence of Salmonella to high prevalences. Previous studies investigated habitats such as farms and urban and wild areas where there is less rodent-human interaction than in wet markets. Consequently, the potential role of rodents as reservoirs and transmitters of Salmonella in wet markets is of great interest. METHODS: Rodents were trapped in eight traditional wet markets in Thailand and identified to species level. Subsequently, they were screened for Salmonella and isolates were serotyped. RESULTS: A total of 110 rats (Rattus norvegicus and Rattus exulans) were examined. Overall, the prevalence of Salmonella in rats was 49.10%, but varied between 0% and 73.3% among markets. Three serovars were identified: Salmonella Typhimurium (30%), S. Weltevreden (12.7%), and S. 4,[5],12:i:- (6.4%). CONCLUSIONS: Our results show that rodents in wet markets are a potential reservoir of Salmonella due to the close contact they have with humans and food. The three isolated serovars, of which serovar S. 4,[5],12:i:- is reported for the first time in rodents, are among the 10 commonest serovars isolated from humans in Thailand. Thus, more attention should be paid to rodents as potential reservoirs of Salmonella.
- MeSH
- krysa rodu rattus MeSH
- obchod * MeSH
- potravinářská mikrobiologie MeSH
- Salmonella klasifikace izolace a purifikace MeSH
- salmonelová infekce u zvířat epidemiologie mikrobiologie MeSH
- zdroje nemoci mikrobiologie veterinární MeSH
- zoonózy MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- krysa rodu rattus MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- Geografické názvy
- Thajsko MeSH
- MeSH
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- feces mikrobiologie MeSH
- hospitalizovaní pacienti statistika a číselné údaje MeSH
- kojenec MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- novorozenec MeSH
- předškolní dítě MeSH
- Salmonella * izolace a purifikace klasifikace MeSH
- salmonelóza * epidemiologie mikrobiologie přenos MeSH
- školky MeSH
- školy MeSH
- věkové rozložení MeSH
- zdroje nemoci * mikrobiologie MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- kojenec MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- novorozenec MeSH
- předškolní dítě MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- tabulky MeSH
An increased number of cases of salmonellosis caused by the rare serotype Mikawasima was noted in the years 2012 and 2013 in the Czech Republic. A potential on-going outbreak caused by this serotype in European countries has also been reported. Altogether 14 human and 1 environmental isolates from the year 2012 and 11 human isolates from the year 2013 from different locations of the Czech Republic were sent to our laboratory for typing. Macrorestriction analysis together with antimicrobial susceptibility testing and PCR for ESBL and plasmid-mediated quinolone resistance detection were performed to compare our isolates. Twenty-one isolates created two very similar clusters and 5 isolates had different profiles. Twenty-five isolates were fully susceptible to all agents used. One isolate showed resistance to 12 microbial agents and possessed blaTEM, blaSHV, blaOXA, blaCTX-M and qnrB genes.
- MeSH
- antibakteriální látky farmakologie MeSH
- beta-laktamová rezistence MeSH
- epidemický výskyt choroby * MeSH
- lidé MeSH
- Salmonella klasifikace účinky léků genetika izolace a purifikace MeSH
- salmonelóza epidemiologie mikrobiologie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
- MeSH
- feces mikrobiologie MeSH
- hospitalizovaní pacienti statistika a číselné údaje MeSH
- lidé MeSH
- novorozenec MeSH
- Salmonella * izolace a purifikace klasifikace MeSH
- salmonelóza * epidemiologie mikrobiologie přenos MeSH
- stravovací služby nemocnice pracovní síly MeSH
- věkové rozložení MeSH
- zdroje nemoci * mikrobiologie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- novorozenec MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- tabulky MeSH
- MeSH
- kontaminace potravin prevence a kontrola MeSH
- lidé MeSH
- rostliny mikrobiologie škodlivé účinky MeSH
- Salmonella * klasifikace patogenita růst a vývoj MeSH
- salmonelóza epidemiologie patologie prevence a kontrola MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Evropa MeSH
- Spojené státy americké MeSH
The objective of this study was to assess the genotypic diversity associated with antimicrobial susceptibility of Salmonella serovars isolated from patients arriving with diarrhoea to six hospitals of Tehran, Iran. During 2007-2008, a cross-sectional convenience study was performed. Stool samples were screened for the presence of Salmonella, serotyped, tested for antimicrobial susceptibility using disk diffusion and examined for the presence of relevant resistance genes and integrons by PCR. A total of 1,120 patients were screened for the presence of Salmonella. Out of 71 Salmonella isolates recovered, the following serovars were identified: 17 Typhi, 14 Paratyphi C, 13 Enteritidis, 11 Paratyphi B, 10 Paratyphi A and six Infantis. Most resistance was observed towards sulfamethoxazole (30%), tetracyclines (25%), nalidixic acid (22%), spectinomycin (17%), trimethoprim (15%), ampicillin (14%) and kanamycin (14%). The tetracycline resistance genes tet(A), tet(B), and tet(G) were found in 28%, 14% and 6% of the tetracycline resistant isolates, respectively. The genes aadA, aadB, strA, strB and aphA1-Iab were present in 83%, 55%, 34%, 1% and 17% of the aminoglycoside resistant isolates, respectively. Additionally, bla (PSE) and bla (TEM) β-lactamase genes were detected in 63% and 18% of the ampicillin-resistant isolates. The 23 sulphonamide resistant isolates harboured sul1 and intI1 genes, typical to class 1 integrons. Nine of these isolates also yielded amplicons for intI2 (class 2 integrons). The presence of multi-drug resistant Salmonella may compromise the successful treatment of enteric infection diseases. The enforcement of strict prescription practices will help to minimise the emergence of resistance.
- MeSH
- antibakteriální látky farmakologie MeSH
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mikrobiální testy citlivosti MeSH
- mladiství MeSH
- mladý dospělý MeSH
- mnohočetná bakteriální léková rezistence MeSH
- nemocnice statistika a číselné údaje MeSH
- předškolní dítě MeSH
- průřezové studie MeSH
- Salmonella klasifikace účinky léků genetika izolace a purifikace MeSH
- salmonelóza mikrobiologie MeSH
- senioři MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mladý dospělý MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- předškolní dítě MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Írán MeSH
Salmonella Enteritidis je nejčastěji hlášeným původcem salmonelóz u lidí. Nejvýznamnějším rezervoárem salmonel je hrabavá drůbež (Gallus gallus), kam kromě slepic spadají i brojleři (kuřata chovaná na maso). Z výsledků studie MIKROMON vyplývá, že konzumace kuřecího masa se na humánních infekcích podílí jen okrajově a majoritním zdrojem salmonel jsou pro humánní populaci slepičí vejce a maso.
Salmonella Enteritidis is the most commonly reported cause of salmonellosis in humans. The most important reservoir of Salmonella is gallinaceous poultry (Gallus gallus) such as chickens and broilers. The MIKROMON study has shown that the consumption of young chicken meat plays a marginal role in human infections while hen eggs and meat are a major source of Salmonella for humans.
- MeSH
- drůbež * MeSH
- maso mikrobiologie škodlivé účinky statistika a číselné údaje MeSH
- Salmonella imunologie klasifikace patogenita MeSH
- salmonelóza * imunologie krev MeSH
- sérotypizace MeSH
- vejce mikrobiologie škodlivé účinky statistika a číselné údaje MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH