OBJECTIVES: To gain data on the current molecular epidemiology and resistance of MRSA in the Czech Republic. METHODS: Between September 2017 and January 2018, a total of 441 single-patient MRSA isolates were collected from 11 Czech hospitals and analysed by spa typing, SCCmec typing, antibiotic susceptibility testing, detection of the PVL toxin and the arcA gene. RESULTS: Of all MRSA isolates, 81.41% (n = 359) belonged to the CC5-MRSA clone represented by the spa types t003 (n = 136), t586 (n = 92), t014 (n = 81), t002 (n = 20) and other spa types (n = 30); a majority of the CC5 isolates (n = 348, 96.94%) carried SCCmec type II. The occurrence of CC5-MRSA was more likely in older inpatients and associated with a healthcare origin (P < 0.001). The CC5-MRSA isolates were resistant to more antimicrobial drugs compared with the other MRSAs (P < 0.001). Interestingly, t586 was detected in blood samples more often than the other spa types and, contrary to other spa types belonging to CC5-MRSA, t586 was not associated with patients of advanced age. Other frequently found lineages were CC8 (n = 17), CC398 (n = 11) and CC59 (n = 10). The presence of the PVL was detected in 8.62% (n = 38) of the MRSA isolates. CONCLUSIONS: The healthcare-associated CC5-MRSA-II lineage (t003, t586, t014) was found to be predominant in the Czech Republic. t586 is a newly emerging spa type in the Czech Republic, yet reported rarely in other countries. Our observations stress the need for MRSA surveillance in the Czech Republic in order to monitor changes in MRSA epidemiology.

• MeSH
• antibakteriální látky farmakologie   MeSH
• genotyp MeSH
• lidé MeSH
• methicilin rezistentní Staphylococcus aureus * genetika   MeSH
• mikrobiální testy citlivosti MeSH
• molekulární epidemiologie MeSH
• senioři MeSH
• stafylokokové infekce * epidemiologie   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• senioři MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

Mikrobiální perzistence patří jako jeden ze způsobů odolávání antibiotické léčbě mezi nejaktuálnější témata lékařské mikrobiologie. A to především proto, že ji pozorujeme v jakékoliv mikrobiální populaci, včetně těch, které nebyly žádné antimikrobiální látce vystaveny. Její podstatou je přirozená schopnost bakteriální subpopulace utlumit metabolismus, a tím se vyhnout účinkům léčiv. Ani antibiotická politika v pojetí, které si klade za cíl prevenci rezistence, tedy nemůže jejímu vzniku zabránit. V této práci citujeme účinné metody překonávání perzistence, jejich výběr ale záleží na individuálním zvážení s ohledem na pacienta.

Persistence, as one of the mechanisms of antimicrobial treatment survival, ranks among the hot topics of medical microbiology. We observe it in every microbial population: exposed to antimicrobials or native. It is based on a natural ability to down-regulate metabolic processes and thus avoid the effect of the medications. This is why antibiotic stewardship, in terms of resistance-lowering guidelines, cannot fight persistence. In this paper, we cite other methods of persistence overcoming, but the choice is individual, with regards to the needs of the patient.

• MeSH
• antibakteriální látky farmakologie   MeSH
• antibiotická rezistence * genetika   MeSH
• mikrobiální viabilita genetika   MeSH

Besides natural and acquired mechanisms of resistance, bacteria can cope with presence of antibiotics by using complex mechanisms such as persistence or tolerance. The main purpose of this study was to evaluate the suitability of newly developed Tolerance Disk Test (TDtest) (Gefen et al., 2017) to detect persistent or tolerant bacterial cells in clinical isolates of Staphylococcus aureus. The principle of the test is to resuscitate the subpopulation of persistent or tolerant bacterial cells following a disk diffusion test by glucose. Results of the TDtest were evaluated using time killing experiments for three pairs of consecutive S. aureus isolates from lower respiratory airway samples of three cystic fibrosis patients with chronic staphylococcal infections. TDtest enabled semi-quantitative detection of persistent or tolerant bacterial populations in all analyzed isolates for oxacillin, vancomycin, and ciprofloxacin to which isolates studied were susceptible. Therefore, TDtest is a promising method for rapidly determining persistence/tolerance in clinical isolates of S. aureus.

• MeSH
• antibakteriální látky farmakologie   MeSH
• cystická fibróza mikrobiologie   MeSH
• diskové difúzní antimikrobiální testy metody   MeSH
• glukosa metabolismus   MeSH
• infekce dýchací soustavy mikrobiologie   MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• mladý dospělý MeSH
• stafylokokové infekce mikrobiologie   MeSH
• Staphylococcus aureus účinky léků   izolace a purifikace   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• mladý dospělý MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• hodnotící studie MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

The ability to form persisters has been observed in many microorganisms, including Staphylococcus aureus, mainly in the context of chronic infections and the pathogenicity of these microbes. In our research, we have demonstrated that salt or oxidative stress could play a role in the formation of S. aureus persisters outside the host's intracellular interface. We pre-exposed planktonic growing bacterial culture to an oxidative or salt stress and monitored the dynamics of persister formation after ciprofloxacin and gentamicin treatment. In parallel, using the quantitative PCR (qPCR) approach, we determined the expression level of the stress sigma factor SigB. The pre-exposure of bacteria to salt stress caused a 1-2.5 order of magnitude increase in persister formation in the bacterial population after antibiotic exposure, depending on the type and concentration of the antibiotic used. In contrast, oxidative stress only minimally influenced the formation of persisters, without correlation to the antibiotic type and concentration. We have demonstrated that both stress and antibiotic exposure increase the expression of sigB in bacterial populations from very early on. And that the expression level of sigB differs with the type of antibiotic and stress, but no correlation was observed between persister formation and sigB expression. The method used could be helpful in testing the ability that strains can have, to form persisters.

• MeSH
• antibakteriální látky farmakologie   MeSH
• bakteriální geny genetika   MeSH
• fyziologický stres genetika   MeSH
• stafylokokové infekce farmakoterapie   mikrobiologie   MeSH
• Staphylococcus aureus účinky léků   genetika   MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

• MeSH
• antibakteriální látky škodlivé účinky   MeSH
• Bacteria růst a vývoj   účinky léků   MeSH
• bakteriální léková rezistence * účinky léků   MeSH
• biofilmy účinky léků   MeSH
• guanosinpentafosfát MeSH
• lidé MeSH
• quorum sensing účinky léků   MeSH
• SOS odpověď (genetika) účinky léků   MeSH
• systémy toxin-antitoxin účinky léků   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH
• přehledy MeSH

Komplexní patologické změny při chronické bakteriální infekci spolu s antibiotickou terapií představují stres, který selektuje adaptovanou bakteriální populaci na účinek antibiotik. Staphylococcus aureus je modelovým příkladem mimořádně úspěšného patogena, jehož neobvyklými strategiemi tolerance a alternativní rezistence k antibiotikům (perzistence, mutace cílového místa pro antibiotika a hypermutabilita) při chronické infekci se bude navrhovaný projekt prioritně zabývat. V rámci projektu bude pomocí fenotypových, genotypových a transkriptomických metod analyzován soubor vybraných časných a pozdních izolátů S. aureus od kohorty pacientů s cystickou fibrózou a porovnán s kontrolními kmeny z akutní infekce novorozenců a referenčními stafylokokových kmenů (n=100). Průkaz molekulárních mechanismů adaptací povede k lepšímu pochopení tohoto fenoménu a může vést k optimalizaci léčby konkrétních pacientů Pražského centra pro cystickou fibrózu.; Complex structural changes in the affected tissues develop during the course of chronic bacterial infection and along with antibiotic therapy act as strong stressors exerting a severe selective pressure and resulting in adapted bacterial population tolerant to antibiotics. Staphylococcus aureus is an extraordinarily successful opportunistic pathogen whose survival adaptation strategies like tolerance and alternative resistance to antibiotics (persistence, target site mutation, hypermutability) will be the main object of the Project. Therefore, a collection of early and subsequent late S. aureus isolates cultured from respiratory samples of chronically infected cystic fibrosis patients cohort will be analyzed using phenotypic, genotypic and transcriptomic methods and compared with the controls - S. aureus strains from newborn acute infections, and control reference strains (n=100). Determination of these molecular adaptation mechanisms may lead to improve understanding of the phenomena and optimization of antibiotic therapy for individual patients of Prague Cystic Fibrosis Centre.

• MeSH
• bakteriální léková rezistence MeSH
• bakteriologické techniky metody   MeSH
• diagnostické techniky molekulární metody   MeSH
• fenotyp MeSH
• genotyp MeSH
• lidé MeSH
• mutace MeSH
• perzistentní infekce mikrobiologie   MeSH
• stafylokokové infekce mikrobiologie   MeSH
• Staphylococcus aureus izolace a purifikace   MeSH
• tolerance léku MeSH
• transkriptom MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• infekční lékařství
• molekulární biologie, molekulární medicína
• farmacie a farmakologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Publikace přináší přehled základních informací o bakteriální perzistenci vůči antibiotikům. Určeno odborné veřejnosti.; Monografije posskytuje základní informace o bakteriální perzistenci vůči antibiotikům zejména mikrobiologům, infekcionistům, ale i jiným odborníkům, kteří používají antimikrobiální látky.

• MeSH
• antibakteriální látky MeSH
• bakteriální infekce farmakoterapie   MeSH
• bakteriální léková rezistence MeSH
• Publikační typ
• monografie MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• přehledy MeSH

• Konspekt
• Mikrobiologie
• NLK Obory
• farmacie a farmakologie
• bakteriologie