• MeSH
• dějiny lékařství MeSH
• významné osobnosti MeSH
• Publikační typ
• biografie MeSH

• O autorovi
• Held, Jan Theobald, 1770-1851 Autorita

• MeSH
• lékařství MeSH
• významné osobnosti MeSH
• Publikační typ
• biografie MeSH

• Konspekt
• Lékařské vědy. Lékařství
• NLK Obory
• dějiny lékařství

• O autorovi
• Held, Jan Theobald, 1770-1851 Autorita

RNA synthesis is central to life, and RNA polymerase (RNAP) depends on accessory factors for recovery from stalled states and adaptation to environmental changes. Here, we investigated the mechanism by which a helicase-like factor HelD recycles RNAP. We report a cryo-EM structure of a complex between the Mycobacterium smegmatis RNAP and HelD. The crescent-shaped HelD simultaneously penetrates deep into two RNAP channels that are responsible for nucleic acids binding and substrate delivery to the active site, thereby locking RNAP in an inactive state. We show that HelD prevents non-specific interactions between RNAP and DNA and dissociates stalled transcription elongation complexes. The liberated RNAP can either stay dormant, sequestered by HelD, or upon HelD release, restart transcription. Our results provide insights into the architecture and regulation of the highly medically-relevant mycobacterial transcription machinery and define HelD as a clearing factor that releases RNAP from nonfunctional complexes with nucleic acids.

• MeSH
• bakteriální proteiny chemie   metabolismus   ultrastruktura   MeSH
• DNA bakterií chemie   metabolismus   MeSH
• DNA řízené RNA-polymerasy chemie   metabolismus   ultrastruktura   MeSH
• elektronová kryomikroskopie MeSH
• katalytická doména MeSH
• molekulární modely MeSH
• Mycobacterium smegmatis enzymologie   MeSH
• nukleové kyseliny metabolismus   MeSH
• proteinové domény MeSH
• vazba proteinů MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Research Support, N.I.H., Extramural MeSH

• MeSH
• významné osobnosti MeSH
• Publikační typ
• biografie MeSH

• O autorovi
• Held, Jan Theobald, 1770-1851 Autorita

• MeSH
• dějiny lékařství MeSH
• lékaři MeSH
• významné osobnosti MeSH
• Publikační typ
• biografie MeSH

• Konspekt
• Lékařské vědy. Lékařství
• NLK Obory
• dějiny lékařství

• O autorovi
• Held, Jan Theobald, 1770-1851 Autorita

The HelD is a helicase-like protein binding to Bacillus subtilis RNA polymerase (RNAP), stimulating transcription in an ATP-dependent manner. Here, our small angle X-ray scattering data bring the first insights into the HelD structure: HelD is compact in shape and undergoes a conformational change upon substrate analog binding. Furthermore, the HelD domain structure is delineated, and a partial model of HelD is presented. In addition, the unique N-terminal domain of HelD is characterized as essential for its transcription-related function but not for ATPase activity, DNA binding, or binding to RNAP. The study provides a topological basis for further studies of the role of HelD in transcription.

• MeSH
• Bacillus subtilis enzymologie   MeSH
• bakteriální proteiny chemie   metabolismus   MeSH
• difrakce rentgenového záření MeSH
• DNA řízené RNA-polymerasy metabolismus   MeSH
• maloúhlový rozptyl MeSH
• molekulární modely MeSH
• proteinové domény MeSH
• vazba proteinů MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

Bacterial RNA polymerase (RNAP) is an essential multisubunit protein complex required for gene expression. Here, we characterize YvgS (HelD) from Bacillus subtilis, a novel binding partner of RNAP. We show that HelD interacts with RNAP-core between the secondary channel of RNAP and the alpha subunits. Importantly, we demonstrate that HelD stimulates transcription in an ATP-dependent manner by enhancing transcriptional cycling and elongation. We demonstrate that the stimulatory effect of HelD can be amplified by a small subunit of RNAP, delta. In vivo, HelD is not essential but it is required for timely adaptations of the cell to changing environment. In summary, this study establishes HelD as a valid component of the bacterial transcription machinery.

• MeSH
• adenosintrifosfát metabolismus   MeSH
• Bacillus subtilis enzymologie   genetika   MeSH
• bakteriální proteiny izolace a purifikace   metabolismus   MeSH
• DNA řízené RNA-polymerasy chemie   izolace a purifikace   metabolismus   MeSH
• DNA metabolismus   MeSH
• elongace genetické transkripce MeSH
• fenotyp MeSH
• genetická transkripce * MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

• Publikační typ
• biografie MeSH

• O autorovi
• Held, Jan Theobald, 1770-1851 Autorita
• Palacký, František