Nowadays, biomedicine is characterised by a growing need for processing of large amounts of data in real time. This leads to new requirements for information and communication technologies (ICT). Cloud computing offers a solution to these requirements and provides many advantages, such as cost savings, elasticity and scalability of using ICT. The aim of this paper is to explore the concept of cloud computing and the related use of this concept in the area of biomedicine. Authors offer a comprehensive analysis of the implementation of the cloud computing approach in biomedical research, decomposed into infrastructure, platform and service layer, and a recommendation for processing large amounts of data in biomedicine. Firstly, the paper describes the appropriate forms and technological solutions of cloud computing. Secondly, the high-end computing paradigm of cloud computing aspects is analysed. Finally, the potential and current use of applications in scientific research of this technology in biomedicine is discussed.

• MeSH
• biomedicínský výzkum * ekonomika   přístrojové vybavení   metody   MeSH
• cloud computing * MeSH
• lékařská informatika * ekonomika   přístrojové vybavení   metody   MeSH
• lékařství * metody   MeSH
• objevování léků metody   MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• přehledy MeSH

• MeSH
• lékařská informatika MeSH
• Publikační typ
• kongresy MeSH
• sborníky MeSH

• Konspekt
• Lékařské vědy. Lékařství
• NLK Obory
• lékařská informatika

Infrastruktura jako služba, tedy infrastruktura poskytovaná zákazníkovi formou služby poskytovatele, je jedním z modelu nasazení tzv. cloud computingu, který umožňuje využít datovou a výpočetní kapacitu v cloudu jako množinu fyzických či virtuálních zařízení. Infrastruktura jako služba může být poskytována zvlášť každému výzkumnému projektu a přitom sdílet stejné fyzické kapacity zapojených počítačů a zařízení. V současné době je testováno poskytování infrastruktury jako služby několika projektům v rámci aktivit sdružení CESNET, 1. lékařské fakulty Univerzity Karlovy v Praze (1. LF UK) a Hudební a taneční fakulty Akademie múzických umění v Praze (HAMU). Současný výzkum v oblasti výpočetní fyziologie je náročný na výpočetní kapacitu. Výpočetní úlohy jsou distribuovány počítačům, které jsou poskytovány infrastrukturou. Projekt v oblasti analýzy lidského hlasu je náročný na propustnost počítačové sítě mezi akustickým a video zařízením na lokální straně a analytickou aplikací na straně výkonného serveru. Tento příspěvek popisuje hlavní vlastnosti a výzvy pro infrastruktury určené pro takovýto typ aplikací. Infrastruktura jako model nasazení v rámci cloud computingu může být vhodná pro mezioborové týmy a pro spolupráci a integraci vysoce specializovaných softwarových aplikací.

Infrastructure as a service (infrastructure which is offered to a customer in the form of service of the provider) is a deployment model which allows utilize data and computing capacity of a cloud as a set of virtual devices and virtualized machines. Infrastructure as a service can be offered separately to each project. The same capacity of connected physical machines and devices can be shared. Currently, the concept of an Infrastructure as a service is tested on several projects within activity of the CESNET association, First Faculty of Medicine, Charles University, Prague and Musical and Dance Faculty of Academy of Performing Arts in Prague. The current research in the field of computation physiology is demanding on a high computation capacity. The computation tasks are distributed to computers, which are provided by the infrastructure. The project in the field of the analysis of a human voice is demanding on high throughput of a computer network between an acoustic or video device on the local side and an analytic application on the remote high performance server side. This paper describes features and main challenges for infrastructure dedicated for such a type of an application. Infrastructure as a deployment model of cloud computing might be beneficial for a multi domain team and for collaboration and integration of a high specialized software application.

• Klíčová slova
• infrastruktura jako služba, virtualizace, virtualizace, výpočetní fyziologie, identifikace fyziologických systémů, validace fyziologických systémů, protokol vzdálené plochy, grid computing, hlasové pole,
• MeSH
• biomedicínské technologie MeSH
• cloud computing MeSH
• financování organizované MeSH
• počítačové komunikační sítě organizace a řízení   trendy   využití   MeSH
• počítačové systémy trendy   využití   MeSH
• využití lékařské informatiky MeSH

The purpose of this study is (1) to introduce a new approach for edge detection in orthopantograms (OPGs) and an improved automatic parameter selector for common edge detectors, (2) to present a comparison between our novel approach with common edge detectors and (3) to provide faster outputs without compromising quality. A new approach for edge detection based on statistical measures was introduced: (1) a set of N edge detection results is calculated from a given input image and a selected type of edge detector, (2) N correspondence maps are constructed from N edge detection results, (3) probabilities and average probabilities are computed, (4) an overall correspondence is evaluated for each correspondence map and (5) the correspondence map providing the best overall correspondence is taken as the result of edge detection procedure. A comparison with common edge detectors (the Roberts, Prewitt, Sobel, Laplacian of the Gaussian and Canny methods) with various parameter settings (304 combinations for each test image) was carried out. The methods were assessed objectively [edge mismatch error (EME), modified Hausdorff distance (MHD) and principal component analysis] and subjectively by experts in dentistry and based on time demands. The suitability of the new approach for edge detection in OPGs was confirmed by experts. The current conventional methods in edge detection in OPGs are inadequate (none of the tested methods reach an EME value or MHD value below 0.1). Our proposed approach for edge detection shows promising potential for its implementation in clinical dentistry. It enhances the accuracy of OPG interpretation and advances diagnosis and treatment planning.

• MeSH
• algoritmy MeSH
• analýza hlavních komponent MeSH
• anatomická značka radiografie   MeSH
• artefakty MeSH
• časové faktory MeSH
• cysty čelistí radiografie   MeSH
• extrakce zubů MeSH
• lidé MeSH
• normální rozdělení MeSH
• počítačové zpracování obrazu statistika a číselné údaje   MeSH
• pravděpodobnost MeSH
• rentgendiagnostika panoramatická statistika a číselné údaje   MeSH
• rentgenový obraz - interpretace počítačová metody   MeSH
• zubní kaz radiografie   MeSH
• zuby přespočetné radiografie   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• srovnávací studie MeSH

• MeSH
• dospělí MeSH
• fibula chirurgie   patologie   MeSH
• fraktury kostí chirurgie   MeSH
• fraktury tibie chirurgie   patofyziologie   MeSH
• hlezenní kloub chirurgie   patologie   MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladý dospělý MeSH
• osteoartróza prevence a kontrola   MeSH
• počítačová rentgenová tomografie MeSH
• prospektivní studie MeSH
• radiografie MeSH
• senioři MeSH
• vnitřní fixace fraktury metody   využití   MeSH
• výsledek terapie MeSH
• výsledky a postupy - zhodnocení (zdravotní péče) MeSH
• zákroky plastické chirurgie metody   využití   MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladý dospělý MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• kazuistiky MeSH

• MeSH
• biomedicínské inženýrství MeSH
• biomedicínské technologie MeSH
• telemedicína MeSH
• výpočetní biologie MeSH
• Publikační typ
• kongresy MeSH
• sborníky MeSH
• zprávy MeSH

• Konspekt
• Biotechnologie. Genetické inženýrství
• NLK Obory
• biomedicínské inženýrství
• lékařská informatika

• MeSH
• bezpečnost MeSH
• cloud computing * MeSH
• lékařská počítačová informatika * MeSH
• software MeSH

BACKGROUND: Definite Alzheimer's disease (AD) requires neuropathological confirmation. Single-photon emission computed tomography (SPECT) may enhance diagnostic accuracy, but due to restricted sensitivity and specificity, the role of SPECT is largely limited with regard to this purpose. METHODS: We propose a new method of SPECT data analysis. The method is based on a combination of parietal lobe selection (as regions-of-interest (ROI)), 3D fuzzy edge detection, and 3D watershed transformation. We applied the algorithm to three-dimensional SPECT images of human brains and compared the number of watershed regions inside the ROI between AD patients and controls. The Student's two-sample t-test was used for testing domain number equity in both groups. RESULTS: AD patients had a significantly reduced number of watershed regions compared to controls (p < 0.01). A sensitivity of 94.1% and specificity of 80% was obtained with a threshold value of 57.11 for the watershed domain number. The narrowing of the SPECT analysis to parietal regions leads to a substantial increase in both sensitivity and specificity. CONCLUSIONS: Our non-invasive, relatively low-cost, and easy method can contribute to a more precise diagnosis of AD.

• MeSH
• algoritmy MeSH
• Alzheimerova nemoc MeSH
• fuzzy logika MeSH
• interpretace obrazu počítačem metody   MeSH
• jednofotonová emisní výpočetní tomografie metody   MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mozek MeSH
• reprodukovatelnost výsledků MeSH
• retrospektivní studie MeSH
• rozpoznávání automatizované metody   MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• senzitivita a specificita MeSH
• vylepšení obrazu metody   MeSH
• Check Tag
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

• MeSH
• diagnostické zobrazování metody   přístrojové vybavení   využití   MeSH
• fuzzy logika MeSH
• interpretace obrazu počítačem využití   MeSH
• lidé MeSH
• magnetická rezonanční tomografie metody   využití   MeSH
• neuronové sítě MeSH
• statistika jako téma metody   MeSH
• teoretické modely MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

Many hospitals and medical clinics have been using a wearable sensor in its health care system because the wearable sensor, which is able to measure the patients' biometric information, has been developed to analyze their patients remotely. The measured information is saved to a server in a medical center, and the server keeps the medical information, which also involves personal information, on a cloud system. The server and network devices are used by connecting each other, and sensitive medical records are dealt with remotely. However, these days, the attackers, who try to attack the server or the network systems, are increasing. In addition, the server and the network system have a weak protection and security policy against the attackers. In this paper, it is suggested that security compliance of medical contents should be followed to improve the level of security. As a result, the medical contents are kept safely.

• MeSH
• algoritmy MeSH
• ambulantní monitorování přístrojové vybavení   MeSH
• biometrie MeSH
• chorobopisy MeSH
• cloud computing * MeSH
• důvěrnost informací MeSH
• elektronické zdravotní záznamy MeSH
• internet MeSH
• lékařská informatika přístrojové vybavení   MeSH
• lidé MeSH
• poskytování zdravotní péče MeSH
• programovací jazyk MeSH
• sběr dat MeSH
• ukládání a vyhledávání informací metody   MeSH
• zabezpečení počítačových systémů * MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH