Počet diagnostikovaných onemocnění vyvolaných netuberkulózními mykobakteriemi u predisponovaných jedinců zůstává v České republice každoročně konstantní. Jejich klinické uplatnění je variabilní a závisí na vlastnostech konkrétního druhu, jeho přítomnosti a kvantity v bezprostředním okolí člověka. Mezi nejčastější klinicky zaznamenávané druhy patří Mycobacterium avium, M. kansasii a M. xenopi. Nejvýznamnějším zdrojem M. avium je rašelina a z ní odvozené produkty. Sekundárně osídluje teplovodní systémy, které jsou velice rizikové z hlediska expozice (především vířivky). M. kansasii je stále přítomno ve vodách v oblastech ovlivněných průmyslovou a důlní činností. Jeho recentně vyčleněné genetické varianty jsou obvykle zcela bez klinického významu, nicméně mohou být přítomny jako kontaminace ve zdravotnických přípravcích. M. xenopi trvale osídluje většinu teplovodních systémů a jeho praktická všudypřítomnost ovlivňuje správné diagnostické závěry u nejasného nálezu při zobrazovacích metodách. Iniciace antibiotické léčby, která nemusí být vždy úspěšná, by měla probíhat na základě komplexního posouzení stavu pacienta, nálezu a jeho progrese. Ani výsledky laboratorních vyšetření nemusí být při rozhodování vždy směrodatné.
The annual number of diagnosed diseases caused by non-tuberculous mycobacteria in predisposed individuals remains constant in the Czech Republic. Their clinical characteristics vary depending on the properties of the causative species and its presence and quantity in the immediate environment of the patient. The most common clinically relevant species are Mycobacterium avium, M. kansasii, and M. xenopi. The most important source of M. avium is peat and products derived from it. M. avium may colonise warm water systems, posing a high risk of exposure to users (jacuzzi users in particular). M. kansasii is still present in waters of areas affected by industrial and mining activities. Its recently isolated genetic variants are mostly of no clinical significance but may be present as contaminants in medical preparations. M. xenopi permanently colonises most warm water systems, and its practical ubiquity makes difficult the interpretation of ambiguous findings on imaging. The antibiotic treatment, which may not always be successful, should be initiated after a comprehensive assessment of the patient’s condition, imaging data, and disease progression. Similarly, the results of laboratory tests may not always be authoritative in decision making.
- MeSH
- lidé MeSH
- morbidita MeSH
- Mycobacterium avium komplex izolace a purifikace klasifikace patogenita MeSH
- Mycobacterium kansasii izolace a purifikace patogenita MeSH
- Mycobacterium xenopi izolace a purifikace patogenita MeSH
- Mycobacterium klasifikace patogenita MeSH
- mykobakteriózy * diagnóza etiologie farmakoterapie klasifikace mikrobiologie přenos MeSH
- netuberkulózní mykobakterie izolace a purifikace klasifikace patogenita MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- přehledy MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
- Publikační typ
- abstrakt z konference MeSH
The multiple forms of pulmonary aspergillosis caused by Aspergillus species are the most common respiratory mycoses. Although invasive, the analysis of diagnostic biomarkers in bronchoalveolar lavage fluid (BALF) is a clinical standard for diagnosing these conditions. The BALF samples from 22 patients with proven or probable aspergillosis were assayed for human pentraxin 3 (Ptx3), fungal ferricrocin (Fc), and triacetylfusarinine C (TafC) in a retrospective study. The infected group included patients with invasive pulmonary aspergillosis (IPA) and chronic aspergillosis (CPA). The BALF data were compared to a control cohort of 67 patients with invasive pulmonary mucormycosis (IPM), non-Aspergillus colonization, or bacterial infections. The median Ptx3 concentrations in patients with and without aspergillosis were 4545.5 and 242.0 pg/mL, respectively (95% CI, p < 0.05). The optimum Ptx3 cutoff for IPA was 2545 pg/mL, giving a sensitivity, specificity, positive predictive value (PPV), and negative predictive value (NPV) of 100, 98, 95, and 100%, respectively. The median Ptx3 concentration for IPM was high at 4326 pg/mL. Pentraxin 3 assay alone can distinguish IPA from CPA and invasive fungal disease from colonization. Combining Ptx3 and TafC assays enabled the diagnostic discrimination of IPM and IPA, giving a specificity and PPV of 100%.
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- O autorovi
- Kaustová, Jarmila, 1945-2020 Autorita
- MeSH
- Mycobacterium kansasii izolace a purifikace klasifikace MeSH
- mykobakteriózy diagnóza MeSH
- Publikační typ
- nekrology MeSH
- O autorovi
- Kaustová, Jarmila 1945-2020 Autorita
Mycobacterium marinum patří mezi pomalu rostoucí, netuberkulózní (environmentální, atypická) mykobakterie se zoonotickým potenciálem. Vyskytuje se ve vodním prostředí a vyvolává onemocnění u ryb a jiných vodních živočichů označované jako mykobakteriózy. U lidí vyvolává primárně kožní onemocnění, které bývá nejčastěji lokalizováno na horních končetinách. Onemocnění se objevuje nejčastěji v souvislosti s akvarijním prostředím, a proto také bývá označováno jako „fish tank granuloma“. Léčba je, jako v případě všech mykobakteriálních onemocnění, komplikovaná a zdlouhavá. Pro definitivní určení patogenního agens by vždy mělo být provedeno vyšetření biologického materiálu laboratoří specializujících se na diagnostiku mykobakteriálních onemocnění. Zásadním bodem pro diagnostiku je správné odebrání vzorku a také posouzení anamnézy pacienta. Základními laboratorními metodami jsou kultivace a mikroskopie. Pro zařazení do druhu jsou nejčastěji využívány moderní biologické metody, jako hmotnostní spektrofotometrie (MALDI), polymerázová řetězová reakce (PCR), hybridizační sondy nebo sekvenování.
Mycobacterium marinum is a slowly growing non-tuberculous (environmental, atypical) mycobacterium with zoonotic potential. It occurs in the aquatic environment and causes diseases in fish and other aquatic animals known as mycobacterioses. In humans, it primarily causes skin infections, which are most commonly located in the upper limbs. The disease commonly appears in connection with the aquarium environment and is thus referred to as fish tank granuloma. As with all mycobacterial diseases, treatment is complicated and lengthy. For a definitive determination of the pathogen, biological materials should always be examined in a laboratory specializing in diagnosing mycobacteria. Critical for the right diagnosis is proper sample collection and assessment of the patient’s history. To detect mycobacteria, culture and microscopy are generally used. Species are identified using modern biological methods such as mass spectrometry (MALDI), polymerase chain reaction, hybridization probes or sequencing.
- MeSH
- diagnostické techniky a postupy MeSH
- klinické laboratorní techniky metody MeSH
- lidé MeSH
- Mycobacterium marinum izolace a purifikace patogenita růst a vývoj MeSH
- mykobakteriózy * diagnóza etiologie mikrobiologie MeSH
- nemoci zvířat diagnóza etiologie mikrobiologie MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- přehledy MeSH
- Publikační typ
- abstrakt z konference MeSH
Článek se zabývá epidemiologií zástupců komplexu Mycobacterium tuberculosis (MTBC) v České republice v letech 2000 - 2016 s výjimkou původce M. tuberculosis. M. bovis bylo prokázáno u 18 pacientů. M. caprae bylo diagnostikováno u 2 pacientů v letech 2001 a 2016 a M. microti u 1 pacienta v roce 2007. M. africanum bylo prokázáno v roce 2011 u HIV pozitivní ženy z Nigérie. U zvířat bylo izolováno M. pinnipedii v roce 2009 u lachtana hřivnatého (Otaria flavescens) importovaného z Německa. M. caprae bylo izolováno v roce 2002 od 2 velbloudů dvouhrbých (Camelus ferus) chovaných v zoologické zahradě. M. tuberculosis bylo izolováno v roce 2004 od psa a v roce 2007 od 2 prasat domácích. V obou případech byl zdrojem M. tuberculosis infikovaný pacient. Při vyšetření 3 727 vzorků vod a sedimentů z prostředí nebyl ve sledovaném období prokázán žádný ze zástupců MTBC. Za současné rizikové faktory šíření původců MTBC je možné považovat infikované osoby pocházející z oblasti výskytu M. africanum (zejména západní Afriky) a infikovaná zvířata. Při zachování stávající epidemiologické situace nehrozí riziko přenosu MTBC syrovým mlékem ani tepelně neopracovanými mléčnými výrobky.
The paper concerns the epidemiology of Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC) members except for M. tuberculosis in the Czech Republic in 2000 to 2016. M. bovis was confirmed in 18 patients. M. caprae was diagnosed in two patients in 2001 and 2016 and M. microti in one patient in 2007. M. africanum was detected in one HIV infected woman from Nigeria in 2011. As regards animals, M. pinnipedii was isolated in 2009 from one Southern sea lion (Otaria flavescens) imported from Germany. In 2002, M. caprae was isolated from two Bactrian camels (Camelus ferus) kept in a zoological garden. M. tuberculosis was isolated from one dog in 2004 and from two domestic pigs in 2007. In both cases, the source of M. tuberculosis was an infected patient. Upon examination of 3 727 environmental samples of water and sediments, none of the MTBC members was detected in the stu-died period. Infected persons coming from M. africanum endemic countries (especially West African countries) and infected animals can be considered as the current risk factors for transmission of MTBC species. If the epidemiological situation remains as it is now, there is no risk of transmission of MTBC species via milk or unpasteurised dairy products.
- MeSH
- divoká zvířata MeSH
- domácí zvířata MeSH
- ekologie MeSH
- kontaminace potravin MeSH
- lidé MeSH
- mikrobiologie vody MeSH
- Mycobacterium * izolace a purifikace patogenita MeSH
- mykobakteriózy epidemiologie MeSH
- tuberkulóza epidemiologie patologie MeSH
- zdroje nemoci MeSH
- znečištění vody MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
- Klíčová slova
- naplaveniny - mikrobiologie,
- MeSH
- Chiroptera MeSH
- ekosystém MeSH
- feces mikrobiologie MeSH
- geologické sedimenty mikrobiologie MeSH
- jeskyně * chemie mikrobiologie MeSH
- mikrobiologické techniky MeSH
- mikrobiologie vody MeSH
- mikrobiologie životního prostředí * MeSH
- Mycobacterium * genetika izolace a purifikace klasifikace MeSH
- Oligochaeta mikrobiologie MeSH
- polymerázová řetězová reakce metody MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
- Publikační typ
- abstrakt z konference MeSH
