BACKGROUND: Congenital skeletal abnormalities are a heterogeneous group of diseases most commonly associated with small or disproportionate growth, cranial and facial dysmorphisms, delayed bone maturation, etc. Nonetheless, no detailed genotype-phenotype correlation in patients with specific genetic variants is readily available. Ergo, this study focuses on the analysis of patient phenotypes with candidate variants in genes involved in bone growth as detected by molecular genetic analysis. METHODS: In this study we used molecular genetic methods to analyse the ACAN, COL2A1, FGFR3, IGFALS, IGF1, IGF1R, GHR, NPR2, STAT5B and SHOX genes in 128 Czech children with suspected congenital skeletal abnormalities. Pathogenic variants and variants of unclear clinical significance were identified and we compared their frequency in this study cohort to the European non-Finnish population. Furthermore, a prediction tool was utilised to determine their possible impact on the final protein. All clinical patient data was obtained during pre-test genetic counselling. RESULTS: Pathogenic variants were identified in the FGFR3, GHR, COL2A1 and SHOX genes in a total of six patients. Furthermore, we identified 23 variants with unclear clinical significance and high allelic frequency in this cohort of patients with skeletal abnormalities. Five of them have not yet been reported in the scientific literature. CONCLUSION: Congenital skeletal abnormalities may lead to a number of musculoskeletal, neurological, cardiovascular problems. Knowledge of specific pathogenic variants may help us in therapeutic procedures.
- MeSH
- Child MeSH
- Gene Frequency genetics MeSH
- Genetic Association Studies MeSH
- Skeleton * metabolism MeSH
- Humans MeSH
- Growth Disorders * epidemiology genetics metabolism MeSH
- Short Stature Homeobox Protein genetics MeSH
- Check Tag
- Child MeSH
- Humans MeSH
- Publication type
- Journal Article MeSH
- Geographicals
- Czech Republic MeSH
Východisko. Tuberózní skleróza je autozomálně dominantní onemocnění charakterizované tvorbou novotvarů – hamartomů v různých orgánových systémech. Příčinou je mutace jednoho ze dvou tumor supresorových genů TSC1 nebo TSC2. Odhalování kauzálních mutací je vzhledem k jejich náhodné distribuci velmi náročné. Metody a výsledky. Práce referuje o provedení první prenatální diagnostiky tuberózní sklerózy v České republice založené na znalosti příčinné mutace. U těhotné ženy z rodiny s mutací Q435X byla provedena ve 13. týdnu gravidity denaturační gradientová gelová elektroforéza (DGGE) vzorku fetální DNA. Závěry. Vyšetření vyloučilo přítomnost sledované poruchy TSC1 genu u potomka.
Background. Tuberous sclerosis is an autosomal-dominant disease characterised by development of benign growth - hamartomas in different organs. Disorder is caused by mutations affecting either of the tumor-suppressor genes, TSC1 or TSC2. Quest for causing mutations is very difficult due to their random distribution over the genes. Methods and Results. Article refers on accomplishment of the first tuberous sclerosis prenatal diagnostics in Czech Republic based on knowledge of causing mutation. Foetal DNA sample, obtained in 13th week from Q435X family pregnant woman, was analyzed by DGGE method. Conclusions. Examination excluded presence of tested TSC1 gene defect in an offspring.
Cíl studie: Rychlá detekce nejčastějších aneuploidií pomocí metody multiplex QF PCR na nekultivovaných vzorcích choriové tkáně. Shrnutí výsledků aplikace multiplex QF PCR v managmentu péče o těhotné ženy v prvním trimestru gravidity. Typ studie: Původní práce. Název a sídlo pracoviště: Ústav lékařské genetiky a fetální medicíny FN a LF UP, Olomouc. Metodika: Vzorky choriové tkáně byly získány od 101 gravidních žen. Nekultivované vzorky byly zpracovány metodou multiplex QF PCR. Analyzovány byly STR lokusy chromozomů 13, 18, 21 a X, Y. Tyto markery byly amplifikovány ve 2 oddělených multiplex PCR reakcích za stejných podmínek a podrobeny fragmentační analýze v kapilární elektroforéze. Výsledky: Všech 101 analyzovaných vzorků choriové tkáně bylo úspěšně amplifikováno. V tomto souboru bylo metodou multiplex QF PCR celkem detekováno 16 patologií u plodů. Ve dvou případech se jednalo o triploidii, v sedmi případech byla zachycena trizomie chromozomu 21 – Downův syndrom, v šesti případech pak trizomie chromozomu 18 – Edwardsův syndrom a jednou byla odhalena monozomie gonozomu X – Turnerův syndrom. Závěr: Metoda multiplex QF PCR je nedílnou součástí screeningu prvního trimestru a poskytuje rychle dostupný a spolehlivý výsledek u vyšetřovaných pacientek.
Objective: Rapid detection of most frequent aneuploidies by the multiplex QF PCR method in non-cultured samples of chorial tissue. Summarized results of QF PCR method applied in the management of care of pregnant women in the first trimester of pregnancy. Type of study: An original contribution. Setting: Institute of Medical Genetics and Fetal Medicine, Faculty Hospital and Medical Faculty, Palacky University Olomouc. Methods: The samples of chorial tissue were obtained from 101 pregnant women. Non-cultured samples were processed by the multiplex QF PCR method. STR loci of chromosomes 13, 18, 21 and X and Y were analyzed. These markers were amplified in two separate multiplex PCR reactions under the same conditions and subjected to fragmentation analysis in capillary electrophoresis. Results: All 101 analyzed samples of chorial tissue were successfully amplified. In this group, 16 pathologies of the fetuses were detected by the multiplex QF PCR method. Triploidy was detected in two cases, trisomy of chromosome 21 – Down syndrome was found in seven cases, and trisomy of chromosome 18 – Edwards syndrome was found in six cases and monosomy of gonosome X – the Turner’ s syndrome was revealed once. Conclusions: The multiplex QF PCR method is an indispensable part of the screening of the first trimester and provides a rapidly available and reliable result in the examined patients.
- MeSH
- Aneuploidy MeSH
- Cytogenetic Analysis methods trends utilization MeSH
- Research Support as Topic MeSH
- Genetic Testing ethics methods MeSH
- Humans MeSH
- Polymerase Chain Reaction methods utilization MeSH
- Prenatal Diagnosis methods trends utilization MeSH
- Pregnancy Trimester, First genetics MeSH
- Check Tag
- Humans MeSH
- Publication type
- Comparative Study MeSH
- MeSH
- Antelopes parasitology MeSH
- Research Support as Topic MeSH
- Abortion, Veterinary parasitology MeSH
- Toxoplasmosis, Animal complications MeSH
- Animals MeSH
- Check Tag
- Animals MeSH
- Publication type
- Case Reports MeSH
- MeSH
- Anesthetics, Dissociative pharmacology MeSH
- Xenarthra physiology MeSH
- Hypnotics and Sedatives pharmacology MeSH
- Imidazoles pharmacology MeSH
- Immobilization veterinary MeSH
- Ketamine pharmacology MeSH
- Animals MeSH
- Check Tag
- Animals MeSH
- Publication type
- Case Reports MeSH
- MeSH
- Y Chromosome MeSH
- Chromosome Aberrations MeSH
- DNA chemistry MeSH
- Research Support as Topic MeSH
- Humans MeSH
- Linear Models MeSH
- Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction methods MeSH
- Polymerase Chain Reaction methods MeSH
- Turner Syndrome genetics MeSH
- Check Tag
- Humans MeSH
- Male MeSH
- Publication type
- Comparative Study MeSH
Tuberózní skleróza je autozomálně dominantní dědičné onemocnění charakterizované tvorbou hamartomů v mnoha orgánových systémech. Příčinou choroby jsou mutace jednoho ze dvou tumor supresorových genů, TSC1 a TSC2. Vznik tumoru je vyvolán zánikem nebo poškozením druhé funkční kopie genu, často je provázen ztrátou heterozygozity (loss of heterozygozity – LOH) přilehlých polymorfních markerů. Vyhledávání kauzálních mutací je velmi pracné, zdlouhavé a málo efektivní. Prenatální diagnostika je často znemožněna vzhledem k neznalosti příčinné mutace. Detekce LOH v hamartomatózní tkáni odhalí, který z genů je v daném případě zodpovědný za onemocnění, a umožní určit, který z homologního páru chromozómů nese germinální mutaci. Vyšetření LOH pro účely prenatální diagnostiky je obzvlášť vhodné v případě časové tísně (těhotenství), případně při neúspěchu mutačního skríninku.
Tuberous sclerosis (TSC) is a frequent hereditary autosomal-dominant disease characterised by hamartomas developing in many organs. The disorder is caused by mutations affecting either of the tumor-supressor genes, TSC1 and TSC2. Tumorogenesis is triggered by the loss of second functional gene copy, mostly accompanied by loss of heterozygosity (LOH) of flanking polymorphic markers. Search for causing mutations is very laborious, time consuming and loweffective. Prenatal diagnosis is often hampered by lack of detection of causing mutation.Detection of LOH in hamartomatous tissue suggests which gene is involved in particular case of disease and specifies which of homologous chromosomes carries germinal mutation. Examination of LOH is useful for prenatal diagnostics especially when time is lacking due to patient’s pregnancy or in case of mutation screening failure.
- MeSH
- Angiomyolipoma diagnosis pathology MeSH
- Cytogenetic Analysis methods MeSH
- Genetic Carrier Screening methods MeSH
- Research Support as Topic MeSH
- Hamartoma diagnosis genetics pathology MeSH
- Humans MeSH
- Prenatal Diagnosis methods MeSH
- Tuberous Sclerosis diagnosis genetics pathology MeSH
- Check Tag
- Humans MeSH
