Kondenzát vydechovaného vzduchu (EBC) představuje bohatý zdroj biomarkerů, které mohou poskytnout cenné informace o respiračních stejně jako o systémových onemocněních. Nalezení neinvazivních metod pro včasnou detekci poškození plic, zánětu a infekčních komplikací u chronických onemocnění, jako je cystická fibróza (CF) nebo astma bronchiale (AB) by bylo velmi přínosné. Navrhujeme proměřit proteinové "dechové otisky" z EBC, tvořící molekulární podpisy plicního zánětu a specifických respiračních bakteriálních infekcí u pacientů s CF a AB. Předpokládáme, že analýza EBC může odhalit biomarkery specifické pro tíži zánětu a identifikovat infekce způsobené oportunními patogeny, jako je např. P. aeruginosa (PA). Tyto dechové profily plánujeme korelovat s nálezy plicní mikroflóry pomocí tradičních metod a s tíží onemocnění cystickou fibrózou. Předpokládáme, že naše studie urychlí využití analýzy EBC jako nového nástroje pro stanovení správné diagnózy AB a umožní neinvazivní sledování aktivity onemocnění CF, účinnosti léčby a zpřesní diagnostiku oportunních infekcí.; Exhaled breath condensate (EBC) represents a rich source for countless biomarkers that can provide valuable information about respiratory as well as systemic diseases. Finding non-invasive methods for early detection of lung injury, inflamation and infectious complications in chronic diseases like Cystic fibrosis (CF) or bronchial asthma (AB) would be highly beneficial. We propose to establish EBC “breath-prints” revealing molecular signatures of pulmonary inflammation and specific respiratory bacterial infections of CF patients and AB. We hypothesize that the analysis of EBC can reveal biomarkers specific for severity of the inflammation and infection caused by opportunistic pathogens such as P. aeruginosa. With these breath-prints, we also propose to establish correlations between respiratory microbiota using traditional methods and CF lung disease severity. Together, our studies will advance the development and validation of EBC as a novel tool for the proper diagnosis of AB and monitoring of CF disease activity, treatment efficacy and diagnosis of opportunistic infections.

• MeSH
• biologické markery MeSH
• bronchiální astma diagnóza   genetika   MeSH
• cystická fibróza diagnóza   genetika   MeSH
• dechové testy metody   MeSH
• lidé MeSH
• proteomika metody   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• pneumologie a ftizeologie
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

A series of 19 synthetic alkyl and thioalkyl glycosides derived from d-mannose, d-glucose and d-galactose and having C10-C16 aglycone were investigated for cytotoxic activity against 7 human cancer and 2 non-tumor cell lines as well as for antimicrobial potential on 12 bacterial and yeast strains. The most potent compounds were found to be tetradecyl and hexadecyl β-d-galactopyranosides (18, 19), which showed the best cytotoxicity and therapeutic index against CCRF-CEM cancer cell line. Similar cytotoxic activity showed hexadecyl α-d-mannopyranoside (5) but it also inhibited non-tumor cell lines. Because these two galactosides (18, 19) were inactive against all tested bacteria and yeast strains, they could be a target-specific for eukaryotic cells. On the other hand, β-D-glucopyranosides with tetradecyl (11) and hexadecyl (12) aglycone inhibited only Gram-positive bacterial strain Enterococcus faecalis. The studied glycosides induce changes in the lipid bilayer thickness and lateral phase separation at high concentration, as derived from SAXS experiments on POPC model membranes. In general, glucosides and galactosides exhibit more specific properties. Those with longer aglycone show high cytotoxicity and therefore, they are more promising candidates for cancer cell line targeted inhibition.

• MeSH
• antibakteriální látky chemická syntéza   chemie   farmakologie   MeSH
• buněčné linie MeSH
• buňky A549 MeSH
• buňky K562 MeSH
• difrakce rentgenového záření MeSH
• Enterococcus faecalis účinky léků   MeSH
• galaktosa chemická syntéza   chemie   farmakologie   MeSH
• glykosidy chemická syntéza   chemie   farmakologie   MeSH
• HCT116 buňky MeSH
• lidé MeSH
• lipidové dvojvrstvy chemie   MeSH
• maloúhlový rozptyl MeSH
• mikrobiální testy citlivosti MeSH
• molekulární struktura MeSH
• proliferace buněk MeSH
• protinádorové látky chemická syntéza   chemie   farmakologie   MeSH
• sacharidové sekvence MeSH
• viabilita buněk účinky léků   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

Exhaled breath condensate is considered a rich source of biomarkers that can provide valuable information for early diagnosis of respiratory and systemic diseases. However, exhaled breath condensate (EBC) consists mainly of water vapor and the concentration of analytes in the exhaled breath condensate sample is very low, close to the detection limit of sensitive methods such as mass spectrometry. Here, we have developed a mass spectrometry-based approach to characterize the EBC proteome. We compared biological and technical replicates of the measured samples, compared the protein profile between individual samples of healthy individuals and described the reproducibility between the three technical replicates of the sample taken. We have found that repeated measurements of samples are reproducible and can increase the number of proteins identified. Analysis led to the detection of 2797 unique proteins in all samples. Based on statistical analysis, it was shown that the 10% difference from the mean is due more to the deviation of the mass spectrometry measurements than to the biological variability of the samples. And second, the change in protein amount below 20% of the average in the case of EBC is due to method variability and should not be considered a significant change in protein expression using label-free mass spectrometry techniques.

• MeSH
• dýchání ústy MeSH
• proteomika metody   MeSH
• vydechnutí MeSH
• vzduch * MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH

Cystic fibrosis (CF) is the most common genetic disease in Caucasians. CF is manifested by abnormal accumulation of mucus in the lungs, which serves as fertile ground for the growth of microorganisms leading to recurrent infections and ultimately, lung failure. Mucus in CF patients consists of DNA from dead neutrophils as well as mucins produced by goblet cells. MUC5AC mucin leads to pathological plugging of the airways whereas MUC5B has a protective role against bacterial infection. Therefore, decreasing the level of MUC5AC while maintaining MUC5B intact would in principle be a desirable mucoregulatory treatment outcome. Fenretinide prevented the lipopolysaccharide-induced increase of MUC5AC gene expression, without affecting the level of MUC5B, in a lung goblet cell line. Additionally, fenretinide treatment reversed the pro-inflammatory imbalance of fatty acids by increasing docosahexaenoic acid and decreasing the levels of arachidonic acid in a lung epithelial cell line and primary leukocytes derived from CF patients. Furthermore, for the first time we also demonstrate the effect of fenretinide on multiple unsaturated fatty acids, as well as differential effects on the levels of long- compared to very-long-chain saturated fatty acids which are important substrates of complex phospholipids. Finally, we demonstrate that pre-treating mice with fenretinide in a chronic model of P. aeruginosa lung infection efficiently decreases the accumulation of mucus. These findings suggest that fenretinide may offer a new approach to therapeutic modulation of pathological mucus production in CF.

• MeSH
• aplikace orální MeSH
• buněčné linie MeSH
• cystická fibróza komplikace   genetika   patologie   MeSH
• fenretinid aplikace a dávkování   MeSH
• fosfolipidy metabolismus   MeSH
• hlen metabolismus   MeSH
• krysa rodu rattus MeSH
• kyselina arachidonová metabolismus   MeSH
• kyseliny dokosahexaenové metabolismus   MeSH
• lidé MeSH
• modely nemocí na zvířatech MeSH
• mucin 5AC metabolismus   MeSH
• mucin 5B metabolismus   MeSH
• myši inbrední CFTR MeSH
• myši MeSH
• plíce účinky léků   metabolismus   patologie   MeSH
• pneumonie mikrobiologie   patologie   prevence a kontrola   MeSH
• pseudomonádové infekce mikrobiologie   patologie   prevence a kontrola   MeSH
• Pseudomonas aeruginosa patogenita   MeSH
• respirační sliznice cytologie   metabolismus   MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• krysa rodu rattus MeSH
• lidé MeSH
• myši MeSH
• zvířata MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

Proteomics is one of the crucial methods used in biomarker discovery in various human diseases. The advantage of proteomics relies in its ability to identify disease-specific proteins. One very promising strategy is to analyze body fluids that are proximal to the organ of interest and are usually less complex than tissues or blood. Such an approach increases the chance for marker definition. This article reviews current knowledge on body fluid proteomics and proteomic biomarkers of human diseases and highlights mass spectrometry as one of the crucial methods in biomarker discovery.

• MeSH
• biologické markery * MeSH
• lidé MeSH
• nádorové biomarkery * MeSH
• tělesné tekutiny chemie   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH

Pneumonie je u dětí častým infekčním onemocněním, které se v rozvinutých zemích většinou daří vyléčit a riziko úmrtí u nekomplikovaných onemocnění je menší než 0,5 %. V rozvojových zemích je však jedním z nejčastějších smrtelných infekčních onemocnění. Pneumonie je vyvolána viry a bakteriemi nebo jejich kombinací a i přes pokrok v diagnostice – sérologie, imunofluorescence, PCR – nemáme stále k dispozici rychlou a jednoznačnou metodu k průkazu vyvolávajících patogenů. Uvádí se, že v některých věkových skupinách je až 60 % pneumonií vyvoláno viry a velké množství pacientů je tedy léčeno antibiotiky zbytečně.

Pneumonia is a common infectious disease in children that is largely managed to be cured in developed countries, with the risk of death in uncomplicated cases being lower than 0,5%. In developing countries, however, it is one of the most frequent fatal infectious diseases. Pneumonia is caused by viruses and bacteria or by their combination and, despite the progress in diagnosing – serology, immunofluorescence, PCR – still no rapid and unequivocal method of identifying the causative pathogens is available. It has been reported that in some age groups up to 60% of pneumonia cases are caused by viruses and a large number of patients thus receive unnecessary treatment with antibiotics.

• MeSH
• antibakteriální látky aplikace a dávkování   škodlivé účinky   terapeutické užití   MeSH
• antivirové látky aplikace a dávkování   škodlivé účinky   terapeutické užití   MeSH
• bakteriální pneumonie diagnóza   klasifikace   terapie   MeSH
• diagnostické techniky dýchacího ústrojí * MeSH
• dítě MeSH
• farmakoterapie * metody   trendy   MeSH
• fluorescenční protilátková technika metody   trendy   MeSH
• lidé MeSH
• pneumonie * diagnóza   etiologie   klasifikace   MeSH
• polymerázová řetězová reakce metody   trendy   MeSH
• statistika jako téma MeSH
• věkové faktory MeSH
• virová pneumonie diagnóza   klasifikace   terapie   MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH
• přehledy MeSH

Tkáňová biopsie zůstane i do budoucna zlatým standardem diagnostiky karcinomu plic, významnou úlohu má i pro stanovení iniciálních prediktivních a prognostických ukazatelů onemocnění. Čím dál více se také uplatňuje V případě potřeby provést opakovaná histologická vyšetření v průběhu nemoci. V určitých situacích je ale její provedení obtížné a je spojeno s vyšším rizikem komplikací. Proto jsou vyvíjeny neinvazivní techniky, které umožňují překonat tyto problémy a mohou být vhodné i pro základní screening onemocnění. Článek přináší přehled neinvazivních diagnostických metod využívaných u plicního karcinomu.

Tissue biopsy will remain the gold standard for diagnosing lung cancer in the future; it also has an important role in determining the initial predictive and prognostic markers of the disease. Moreover, it is increasingly used when repeated histological examinations need to be performed in the course of the disease. In certain situations, however, the technique is difficult to perform and associated with higher complication rates. Therefore, non-invasive techniques are being developed that may overcome the problems and be suitable for basic screening for the disease as well. The paper provides an overview of non-invasive methods used for diagnosing lung cancer.

• MeSH
• časná detekce nádoru * metody   MeSH
• cirkulující nádorová DNA analýza   MeSH
• lidé MeSH
• nádorové biomarkery MeSH
• nádory plic * diagnóza   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH
• přehledy MeSH