The increasingly more prevalent bacterial resistance to antibiotics presents an important worldwide problem. Compounds of natural origin with a proven anti-bacterial effect may represent new resources in this area or serve as complimentary therapies utilized together with antibiotics. Certain compounds from hops, especially beta-bitter acids and xanthohumol possess strong inhibitory effects on Gram-positive (Staphylococcus aureus, including resistant variants such as MRSA) and anaerobic bacteria, namely Clostridium perfringens and C. difficile. Some of the other characteristics of these compounds, including their low solubility in water, low toxicity and low level of adsorption in the gastrointestinal tract (GIT), predispose them as useful tools for local infections of skin and GIT. Formulations containing these compounds, which will be developed and evaluated in this project, can thus represent much needed tools for a local therapy of infections caused by antibiotic-resistant strains of bacteria.

Vzrůstající rezistence bakterií na antibiotika představuje závažný problém. Látky rostlinného původu s prokázanými antimikrobními účinky mohou být novou cestou nebo doplňkem stávající antibiotické terapie. Látky obsažené v chmelu, zejména beta hořké kyseliny a xanthohumol mají výrazné inhibiční účinky na Gram pozitivní bakterie (Staphylococcus aureus včetně rezistentních forem MRSA) a anaerobní bakterie, zejména Clostridium perfringens a Clostridium difficile. Jejich další vlastnosti jako je nízká rozpustnost ve vodě, malá toxicita a nízký stupeň vstřebávání v gastrointestinálním traktu předpokládají využití při terapii lokálních infekcí zejména kožních a infekcí zažívacího traktu. Preparáty na bázi těchto látek, které budou vyvinuty a otestovány během projektu, mohou být využitelné pro lokální terapii infekcí měkkých tkání a pro prevenci, popřípadě terapii klostridiových infekcí, zejména enteroroxikózy způsobené toxigenními kmeny Clostridium difficile.

• MeSH
• anaerobní bakterie účinky léků   MeSH
• antibiotická rezistence MeSH
• antiinfekční látky terapeutické užití   MeSH
• Clostridioides difficile patogenita   účinky léků   MeSH
• grampozitivní bakterie účinky léků   MeSH
• Humulus MeSH
• infekce spojené se zdravotní péčí farmakoterapie   MeSH
• kyseliny terapeutické užití   MeSH
• lidé MeSH
• mikrobiální testy citlivosti MeSH
• rostlinné extrakty terapeutické užití   MeSH
• vyvíjení léků MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• hodnotící studie MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• farmacie a farmakologie
• infekční lékařství
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

• MeSH
• antibiotická rezistence MeSH
• antigeny analýza   MeSH
• diagnostické techniky dýchacího ústrojí klasifikace   MeSH
• diagnostické techniky molekulární MeSH
• infekce dýchací soustavy * diagnóza   etiologie   mikrobiologie   MeSH
• kultivační techniky metody   MeSH
• lidé MeSH
• mikrobiologické techniky * klasifikace   metody   MeSH
• mikroskopie metody   MeSH
• odběr biologického vzorku metody   MeSH
• odběr vzorku krve MeSH
• protilátky analýza   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH

Identifikace etiologického agens v krvi je jedno z nejdůležitějších, ale zároveň nejdelších vyšetření v diagnostice bakteriálních infekcí. Klasický postup hemokultivace za použití automatizovaných přístrojů, identifikace z 24hodinové bakteriální kultury a stanovení kvantitativní citlivosti k antibiotikům trvá zhruba 3–5 dní. V posledních letech byly implementovány do praxe nové metody umožňující identifikaci bakteriálního původce a stanovení citlivosti/rezistence k antibiotikům, včetně detekce genů rezistence pomocí amplifikačních technik, přímo z pozitivních hemokultivačních lahviček. Tyto metody umožňují výrazně zkrátit čas od odběru krve do hlášení výsledku a současně aplikaci cílené antibiotické terapie. Předložený přehledový článek má za cíl seznámit klinické lékaře s novinkami v oblasti bakteriologického vyšetření krve používanými v rutinní mikrobiologické praxi.

Identifying the etiological agent in blood is one of the most crucial yet time-consuming investigations in diagnosing bacterial infections. The conventional approach of blood culture utilizing automated systems, followed by identification from a 24-hour bacterial culture and determination of quantitative antibiotic susceptibility, typically takes about 3-5 days. However, in recent years, new methods have been implemented in practice, enabling the identification of bacterial pathogens and the determination of sensitivity/resistance to antibiotics, including the detection of resistance genes through amplification techniques directly from positive blood culture bottles. These methods significantly reduce the turnaround time from blood collection to result reporting, while also facilitating the application of targeted antibiotic therapy. The presented review article aims to acquaint clinical physicians with the latest advancements in the field of blood bacteriological testing.

• MeSH
• antibiotická rezistence MeSH
• kultivační vyšetření krve * metody   MeSH
• lidé MeSH
• mikrobiální testy citlivosti metody   MeSH
• odběr vzorku krve MeSH
• spektrometrie hmotnostní - ionizace laserem za účasti matrice metody   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

x

x

• Publikační typ
• abstrakt z konference MeSH

• Publikační typ
• abstrakt z konference MeSH

• Publikační typ
• abstrakt z konference MeSH

• MeSH
• antibiotická rezistence MeSH
• bakteriální infekce etiologie   farmakoterapie   klasifikace   MeSH
• digitální technologie * metody   zákonodárství a právo   MeSH
• diskové difúzní antimikrobiální testy metody   MeSH
• infekce etiologie   klasifikace   MeSH
• lidé MeSH
• mikrobiální testy citlivosti klasifikace   metody   přístrojové vybavení   MeSH
• mikrobiologie * MeSH
• mikrobiota MeSH
• umělá inteligence MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH
• přehledy MeSH

Úvod: Včasná a kauzální aplikace antibiotik u pacientů s pozitivní hemokulturou patří mezi základní předpoklady úspěšné léčby infekce. Izolace a následná identifikace bakterií z hemokultury klasickými (kultivačními) metodami však může trvat až několik dní. MALDI-TOF MS patří mezi metody, které umožňují rychlou identifikaci bakterií, a to nejen kultur z kultivačních médií, ale i přímo v klinickém materiálu. Metodika: Do studie byly zařazeny vzorky pozitivních hemokultur, které byly v letech 2016 až 2018 odebrány od pacientů Fakultní nemocnice Olomouc a následně byly vyšetřeny na Ústavu mikrobiologie Lékařské fakulty Univerzity Palackého v Olomouci. Vzorky pozitivních hemokultur byly zpracovány pomocí vlastního modifikovaného postupu, zahrnujícího odstranění krevních buněk pomocí centrifugace za nižších otáček. Následně byla pomocí centrifugace za vyšších otáček a promývání vzorku získána peleta, která byla testována pomocí MALDI-TOF MS. Výsledky: Ve studii bylo metodou přímé identifikace vyšetřeno celkem 110 pozitivních hemokultur. Správná identifikace na úrovni druhu byla vyšší u gramnegativních bakterií (88 %) v porovnání s grampozitivními bakteriemi (79 %) a také u nich bylo dosaženo vyšších hodnot identifikačního skóre. Hodnota identifikačního skóre vyšší nebo rovna než 2,0 byla u 62 % hemokultur obsahujících gramnegativní bakterie a 17 % hemokultur obsahujících bakterie grampozitivní. Hodnota identifikačního skóre v rozmezí 1,7–2,0 byla zjištěna u 21 % hemokultur gramnegativních a 33 % hemokultur s grampozitivními bakteriemi. Závěr: Přímá identifikace mikroorganismů z pozitivních hemokultur metodou MALDI-TOF MS umožňuje rychlejší diagnostiku a v důsledku zkrácení doby potřebné k dosažení výsledku identifikace patogenu může pozitivním způsobem významně ovlivnit antibiotickou léčbu pacientů.

Background: Early and causal administration of antibiotics in patients with a positive blood culture is an essential prerequisite for successful treatment of infection. However, isolation and subsequent identification of bacteria in a blood culture by classical (culture) methods may last several days. MALDI-TOF MS is a method allowing rapid identification of bacteria, not only cultures from culture media, but also directly in clinical specimens. Methods: The study included samples of positive blood cultures taken from patients in the University Hospital Olomouc between 2016 and 2018 and examined at the Department of Microbiology of the Faculty of Medicine, Palacký University Olomouc. Positive blood culture samples were processed using an in-house method involving the removal of blood cells by low-speed centrifugation. Subsequently, a pellet obtained by high-speed centrifugation and sample washing was tested by MALDI-TOF MS. Results: A total of 110 positive blood cultures were examined using the method of direct identification. At a species level, more Gramnegative bacteria (88 %) than Gram-positive bacteria (79 %) were correctly identified, with higher identification score values being obtained for the former. Identification score values of 2.0 or higher were found in 62 % of blood cultures containing Gram-negative bacteria and 17 % of blood cultures containing Gram-positive bacteria. Identification score values ranging from 1.7 to 2.0 were found in 21 % of Gram-negative blood cultures and 33 % of blood cultures containing Gram-positive bacteria. Conclusion: Direct identification of microorganisms from positive blood cultures using MALDI-TOF MS enables more rapid diagnosis. By reducing the time required to obtain the result of pathogen identification, it may positively affect the antibiotic treatment of patients.

• MeSH
• bakteriemie * diagnostické zobrazování   mikrobiologie   MeSH
• gramnegativní bakterie izolace a purifikace   patogenita   MeSH
• grampozitivní bakterie izolace a purifikace   patogenita   MeSH
• lidé MeSH
• senzitivita a specificita MeSH
• spektrometrie hmotnostní - ionizace laserem za účasti matrice metody   přístrojové vybavení   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH

Successful surgeries involving orthopedic implants depend on the avoidance of biofilm development on the implant surface during the early postoperative period. Here, we investigate the potential of novel antibacterial compounds-second-generation lipophosphonoxins (LPPOs II)-as additives to surgical bone cements. We demonstrate (i) excellent thermostability of LPPOs II, which is essential to withstand elevated temperatures during exothermic cement polymerization; (ii) unchanged tensile strength and elongation at the break properties of the composite cements containing LPPOs II compared to cements without additives; (iii) convenient elution kinetics on the order of days; and (iv) the strong antibiofilm activity of the LPPO II-loaded cements even against bacteria resistant to the medicinally utilized antibiotic, gentamicin. Thus, LPPOs II display promising potential as antimicrobial additives to surgical bone cements.

• Klíčová slova
• lipofosfonoxiny,
• MeSH
• antiinfekční látky * analýza   terapeutické užití   MeSH
• biofilmy MeSH
• grampozitivní bakterie MeSH
• hydrofobní a hydrofilní interakce MeSH
• iminosacharidy analýza   terapeutické užití   MeSH
• infekce spojené s protézou prevence a kontrola   MeSH
• kostní cementy * analýza   terapeutické užití   MeSH
• lidé MeSH
• mikrobiální testy citlivosti metody   MeSH
• nukleosidy analýza   terapeutické užití   MeSH
• organofosfonáty analýza   terapeutické užití   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• hodnotící studie MeSH
• práce podpořená grantem MeSH