Text classification Dotaz Zobrazit nápovědu
Background: Classifying diseases into ICD codes has mainly relied on human reading a large amount of written materials, such as discharge diagnoses, chief complaints, medical history, and operation records as the basis for classification. Coding is both laborious and time consuming because a disease coder with professional abilities takes about 20 minutes per case in average. Therefore, an automatic code classification system can significantly reduce the human effort. Objectives: This paper aims at constructing a machine learning model for ICD-10 coding, where the model is to automatically determine the corresponding diagnosis codes solely based on free-text medical notes. Methods: In this paper, we apply Natural Language Processing (NLP) and Recurrent Neural Network (RNN) architecture to classify ICD-10 codes from natural language texts with supervised learning. Results: In the experiments on large hospital data, our predicting result can reach F1-score of 0.62 on ICD-10-CM code. Conclusion: The developed model can significantly reduce manpower in coding time compared with a professional coder.
- MeSH
- automatizované zpracování dat metody MeSH
- deep learning * MeSH
- elektronické zdravotní záznamy MeSH
- mezinárodní klasifikace nemocí * MeSH
- neuronové sítě MeSH
- strojové učení MeSH
- ukládání a vyhledávání informací metody statistika a číselné údaje MeSH
- vizualizace dat MeSH
- zpracování přirozeného jazyka MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
BACKGROUND: Protected health information burned in pixel data is not indicated for various reasons in DICOM. It complicates the secondary use of such data. In recent years, there have been several attempts to anonymize or de-identify DICOM files. Existing approaches have different constraints. No completely reliable solution exists. Especially for large datasets, it is necessary to quickly analyse and identify files potentially violating privacy. METHODS: Classification is based on adaptive-iterative algorithm designed to identify one of three classes. There are several image transformations, optical character recognition, and filters; then a local decision is made. A confirmed local decision is the final one. The classifier was trained on a dataset composed of 15,334 images of various modalities. RESULTS: The false positive rates are in all cases below 4.00%, and 1.81% in the mission-critical problem of detecting protected health information. The classifier's weighted average recall was 94.85%, the weighted average inverse recall was 97.42% and Cohen's Kappa coefficient was 0.920. CONCLUSION: The proposed novel approach for classification of burned-in text is highly configurable and able to analyse images from different modalities with a noisy background. The solution was validated and is intended to identify DICOM files that need to have restricted access or be thoroughly de-identified due to privacy issues. Unlike with existing tools, the recognised text, including its coordinates, can be further used for de-identification.
- MeSH
- algoritmy MeSH
- datové soubory jako téma MeSH
- důvěrnost informací MeSH
- elektronické zdravotní záznamy MeSH
- lidé MeSH
- soukromí * MeSH
- zabezpečení počítačových systémů * MeSH
- zákon o převoditelnosti a povinném vyúčtování zdravotního pojištění (USA) MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Spojené státy americké MeSH
WHO klasifikácia tumorov centrálneho nervového systému z roku 2007 prináša radu konceptuálnych modifikácii, zmien v terminológii a sedem novo kodifikovaných samostatných jednotiek. Novú klasifikáciu porovnávame s predchádzajúcou z roku 2000 najmä z hľadiska chirurgickej neuropatológie. Novo kodifikované jednotky sú: angiocentrický glióm, pilomyxoidný astrocytóm, papilárny glioneuronálny tumor, rozety tvoriaci glioneuronálny tumor štvrtej komory, papilárny tumor pineálnej oblasti, vretenobunkový onkocytóm a pituicytóm. Prevažne sa jedná o raritné jednotky už známe z literatúry. Na základe nových poznatkov z molekulárnej patológie boli výrazne prepracované odseky o genetike príslušných nádorov. Komplexnosť a diverzita tumorov centrálneho nervového systému je enormná, a preto nie neočakávane, viacero problémových otázok klasifikácie a stupňovania ostáva v súčasnosti nezodpovedaných.
WHO Classification of Tumours of the Central Nervous System from the 2007 is distinguished from the previous 2000 classification by a few conceptual modifications, changes in the terminology and seven newly codified tumour entities. The text shows a short comparison of both classifications emphasising the most important changes from the surgical neuropathology point of view. The newly codified entities are: angiocentric glioma, pilomyxoid astrocytoma, papillary glioneuronal tumor, rosette-forming glioneuronal tumor of the 4th ventricle, papillary tumour of the pineal region, spindle cell oncocytoma and pituicytoma. Mostly, they are rare tumours already known from the literature. Based on new knowledge from the molecular pathology the paragraphs about tumour genetics were markedly changed. The complexity and diversity of tumours of the nervous system is enormous, and, not surprisingly, some problematic questions of classification and grading remain unresolved.
Cílem příspěvku je porovnat české lékařské zprávy psané volným textem a pomocí softwarové aplikace; analyzovat využitelnost mezinárodních klasifikačních systému v českém zdravotnickém prostředí. Analýza lékařských zpráv byla založena na atributech Minimálního datového modelu pro kardiologii (MDMK). Použili jsme lékařské zprávy psané volným textem a lékařské zprávy ze softwarové aplikace ADAMEK, kde jsou data ukládána strukturovaně. Pro naši práci jsme využili SNOMED CT a MKN-10. Zaměřili jsme se na jazyk česky psaných lékařských zpráv a na aplikaci výše zmíněných mezinárodních klasifikačních systémů v MDMK. Porovnali jsme, jak dobře jsou atributy MDMK zaznamenány v textových lékařských zprávách a v lékařských zprávách zaznamenávaných strukturovaně pomocí softwarové aplikace ADAMEK. Provedli jsme jazykovou analýzu českých textových lékařských zpráv. Dospěli jsme tedy k závěru, že zapisování lékařských zpráv formou volného textu je velice nehomogenní a není standardizováno. Standardizovaná terminologie by přinesla výhody lékařům, pacientům, administrátorům, softwarovým vývojářů a plátcům. Pomohla by poskytovatelům zdravotnické péče tím, že by poskytovala kompletní a snadno dostupné informace, které náleží k procesu zdravotnictví a to by vyústilo v lepší péči a pacienty. Použití mezinárodních klasifikačních systémů je nezbytným prvním krokem, který umožní interoperabilitu heterogenních elektronických zdravotních záznamů.
The objective of the paper is to compare Czech medical reports written in a free text and by means of a software application; to analyze the usability of international classification systems in the Czech healthcare environment. The analysis of medical reports was based on the attributes of the Minimal Data Model for Cardiology (MDMC). We have used medical reports written in a free text and medical reports from the ADAMEK software application where data are stored in a structured way. For our work SNOMED CT and ICD-10 have been used. We have focused on the language of Czech medical reports and the application of aforementioned international classification systems in MDMC. We have compared how well attributes of MDMC are recorded in textual medical reports and in medical reports recorded structurally by means of the ADAMEK software application. We have made the language analysis of the Czech textual medical reports. We compared how MDMC attributes are recorded in the ADAMEK application and in medical reports written in a free text. To conclude, using a free text in medical reports is very inhomogeneous and not standardized. The standardized terminology would bring benefits to physicians, patients, administrators, software developers and payers. It would help healthcare providers that it could provide complete and easily accessible information that belongs to the process of healthcare and it would result in better care of patients. The use of international classification systems is a necessary first step to enable interoperability of heterogeneous electronic health records.
- Klíčová slova
- terminologie, synonyma, klasifikační systémy, tezaurus, nomenklatura, nomenklatura, elektronický zdravotní záznam, interoperabilita, sémantická interoperabilita,
- MeSH
- ateroskleróza MeSH
- chorobopisy - počítačové systémy využití MeSH
- financování organizované MeSH
- kardiologie MeSH
- lidé MeSH
- mezinárodní klasifikace nemocí využití MeSH
- sémantika MeSH
- terminologie jako téma MeSH
- ukládání a vyhledávání informací metody využití MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Úvod: Textová zdravotní varování na obalech tabákových výrobků představují jednu z nejefektivnějších metod, jak informovat populaci o zdravotních důsledcích kouření. Cílem studie bylo hodnotit emoční dopad textových varování na cigaretových krabičkách používaných v ČR u vybraného vzorku dětí 6.–9. tříd. Metodika: Emoční dopad textových varování byl hodnocen pomocí metody Self-Assessment Manikin (SAM). Výběrový soubor sestával z 328 dětí (182 chlapců, průměrný věk 13,02 ? 1,46 roků a 146 dívek; průměrný věk 12,95 ? 1,48 roků); bylo identifikováno 58 současných kuřáků. Každé dítě vyplnilo dotazník, který obsahoval 24 textových varování a 24 neutrálních vět, které s tematikou kouření nesouvisejí. Výsledky: U většiny dětí vyvolala textová varování na cigaretách negativní valenci (2,58 ? 1,53) a zvýšenou úroveň arousalu (5,52 ? 1,87). Ukázalo se dále, že tato varování hodnotí kuřáci jako méně negativní ve srovnání s nekuřáky (kuřáci 3,40 ? 1,84; nekuřáci 2,88 ? 1,44; p <0,02), neliší se však mezi sebou v míře arousalu. Korelační analýza doložila existenci nenáhodného vztahu mezi arousalem a valencí (kuřáci: r = -0,50; nekuřáci r = -0,34; p <0,01). U kuřáků byl nenáhodný vztah také objeven mezi mírou závislosti na nikotinu a mírou arousalu, vyvolaného textovými varováními (r = 0,31; p <0,02). Statistická analýza dále doložila, že dívky hodnotí varovné nápisy jako více negativní (nižší valence) než chlapci (p <0,01). Míra arousalu se však mezi pohlavími nelišila. Závěr: Výsledky naší práce dokládají, že stávající textová varování na cigaretových krabičkách jsou dětmi a adolescenty hodnocena jako zneklidňující a velmi negativní, tudíž by se mohla významně podílet jak na primární, tak i na sekundární prevenci kouření. Přesto je však nutné, aby budoucí textová varování vyvolávala maximální negativní valenci a arousal a byla lépe cílená na specifické motivy a potřeby dětí.
Background: The cigarette text warnings are considered as one of the most effective ways to convey information on the health consequences of smoking. The aim of our study was to assess the emotional impact of cigarette text warnings used in the Czech Republic on a sample of basic schoolchildren. Method: The children's emotional response to the warnings was assessed by means of the Self-Assessment Manikin Method (SAM). The nine-point pen and paper version of SAM was used. The research sample consisted of 328 basic schoolchildren (182 boys, mean age 13.02?1.46 and 146 girls; mean age 12.95?1.48; 58 current smokers were identified). Each child completed a questionnaire where all the sentences with the SAM were presented (24 text warnings and 24 neutral sentences). Results: The majority of children assessed the warning texts as very unpleasant (valence for all warning texts 2.58?1.53) and above-average exciting (arousal 5.52?1.87). Smokers in comparison with non-smokers assessed the warning texts as less unpleasant (smokers 3.40?1.84; non-smokers 2.88?1.44; p<0.02) but equally arousing. A significant association was found between arousal and valence (smokers r=-0.50; non-smokers r=-0.34; p<0.01) and in smokers between arousal and level of nicotine dependence (r=0.31; p<0.02). Girls in comparison with boys assessed the warning texts as significantly more unpleasant (p<0.01). No gender differences were found in arousal levels. Summary: Our results showed that the existing text warnings are assessed by children and adolescents as arousing and very unpleasant; thus they could greatly support both the primary and secondary preventions of smoking. However, to intensify avoidance of smoking, the future text warnings should generate a more negative valence and arousal.
- MeSH
- dítě MeSH
- emoce MeSH
- inzerce jako téma * MeSH
- kouření * MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- odvykání kouření * metody MeSH
- primární prevence * MeSH
- průzkumy a dotazníky MeSH
- statistika jako téma MeSH
- zákonodárství jako téma MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
Komise pro klasifikaci a terminologii Mezinárodní ligy proti epilepsii (ILAE) publikovala po předchozí rozsáhlé diskuzi v r. 2017 dva klíčové dokumenty – novou klasifikaci epileptických záchvatů a novou klasifikaci epilepsií. V textu předkládáme část zdůvodnění a komentářů vycházející z originální anglické verze obou dokumentů a zejména českou verzi terminologie doporučenou výborem České ligy proti epilepsii.
Following the discussion at all levels, ILAE Commission for Classification and Terminology has published in 2017 two position papers onclassification of the epileptic seizures and on classification of the epilepsies. In the text we present translation of some parts of the originalposition papers and the Czech version of the terminology and classification that is recommended by the Czech League against Epilepsy.
- MeSH
- epilepsie * etiologie klasifikace MeSH
- lidé MeSH
- terminologie jako téma MeSH
- záchvaty * etiologie klasifikace MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
Funkční hodnocení, nikoli pouze etiologické, je zásadní pro hodnocení kvality života osob s jakýmkoli typem postižení, disabilitou. Disabilita je definována jako snížení funkčních schopností na úrovni těla, jedince nebo společnosti, která vzniká, když se zdravotní stav konfrontuje s bariérami prostředí. V souladu s doporučeními Světové zdravotnické organizace (WHO) se pro hodnocení disability používá jako objektivní nástroj Mezinárodní klasifikace funkčních schopností, disability a zdraví (MKF). V roce 2020 byla v českém jazyce vydána druhá aktualizovaná verze této klasifikace, která je v elektronické verzi volně přístupná na webových stránkách Ústavu zdravotnických informací a statistiky ČR. Níže v textu je popsaná nejen struktura MKF klasifikace, ale i metodika posuzování podle této klasifikace. V závěru článku je uvedeno několik jednoduchých vzorových příkladů, jak správně postupovat při vlastním hodnocení. Předkládaný článek má pomoci k základní orientaci v problematice funkčního hodnocení podle MKF.
A functional evaluation, not just an etiological one, is essential for the evaluation of the quality of life of persons with any type of disability. Disability is defined as a condition of the body or mind (impairment) that makes it more difficult for the person with the condition to do certain activities (activity limitation) and interact with the world around them (participation restrictions). In accordance with the recommendations of the World Health Organization (WHO), the International Classification of Functioning, Disability and Health (ICF) is used to assess disability. In 2020, a second updated version of this classification was published in the Czech language, which is freely accessible in an electronic version on the website of the Institute of Health Information and Statistics of the Czech Republic. Below in the text, not only the structure of ICF classification, but also the assessment methodology according to this classification is described. At the end of the article, there are several simple sample examples of how to proceed correctly in self-assessment. The presented article is intended to help with basic orientation in the issue of functional assessment according to ICF.
V textu je názorně předvedeno současné rozdělení nesteroidních antirevmatik podle různé blokády dvou izoenzymů cyklooxygenázy. Dále jsou probrány účinky všech uvedených skupin, a to výhody lepší snášenlivosti novějších skupin i jejich vedlejší klinické účinky. Přehled je uzavřen doporučením specialisty praktickému lékaři, jak správně indikovat jednotlivé skupiny léků. Současně jsou uvedeny i předpisy VZP k předpisu a cenám těchto léků.
The author describes the contemporary classification of antirheumatic drugs according to the different bloc of two cyclooxygenase isoenzymes. She discusses the effects of all mentioned groups, advantages of better tolerance of more recent groups and their clinical side-effects. The overview is completed by the recommendation of the consultant addressed to the GP how to indicate correctly different groups of drugs. Regulations of the General Insurance Company regarding prescription and prices of these drugs are also given.
- T Heather Herdman, RN, PhD, FNI -- What\'s New in the 2015-2017 Edition of -- Diagnoses and Classification Classified Groceries, Inc. 54 -- Figure 3.2 Classes and Concepts of Classified Groceries, Inc. 55 -- Classification about diagnosis development and review 127 -- Questions about the NANDA-I Definitions and -- Classification text 127 -- References 129 -- PART 3 THE NANDA INTERNATIONAL -- NURSING DIAGNOSES 131 -- International diagnosis 464 -- Diagnostic axes 465 -- Components of a nursing diagnosis 467 -- Definitions for classification
10th ed. 483 s.
- Klíčová slova
- příručka, NANDA International,
- MeSH
- klasifikace MeSH
- ošetřovatelská diagnóza MeSH
V textu jsou probrána hesla klasifikace funkčních poruch trávicí trubice podle klasifikace ROMA II pro dospělou populaci. Je podán stručný přehled subjektivních obtíží, definice jednotlivých stavů, diagnostický postup a ve většině případů je i navržena léčba.
This article deals with headlines of ROME II classification of functional disorders of gastrointestinal tract for adults. A brief review is given on subjective complaints, definitions of particular states, as well as on diagnostic approach. Treatment strategy is mostly proposed.