Confirmation of the newly described 1p36.13-1p36.12 microdeletion syndrome by finding of a 2,2 Mb deletion in the critical region in a Czech two generation family with a very similar phenotype, but in addition also polyneuropathy of lower limbs.

• MeSH
• Chromosome Deletion * MeSH
• Chromosome Disorders * genetics   MeSH
• Phenotype MeSH
• Humans MeSH
• Chromosomes, Human, Pair 1 genetics   MeSH
• Syndrome MeSH
• Check Tag
• Humans MeSH
• Publication type
• Letter MeSH
• Research Support, Non-U.S. Gov't MeSH
• Geographicals
• Czech Republic MeSH

Dědičné neuropatie (DěN) jsou heterogenní skupinou geneticky podmíněných onemocnění periferních nervů, projevující se u převážné většiny pacientů do 20. roku věku a typicky ve školním věku, mezi 6. a 15. rokem, pomalu progredující svalovou slabostí distálně a později i atrofiemi, dříve a více na dolních končetinách a většinou i různě závažnou poruchou čití s distálním maximem, někdy i trofickými změnami. Začátek obtíží s prvními příznaky onemocnění v předškolním věku nebo i po 20. roce života jsou vzácnější, ale také možné a souvisí to do velké míry s konkrétní genovou poruchou. DěN jsou nejčastějším geneticky podmíněným nervosvalovým onemocněním a v ČR je jimi postiženo asi 4 000 lidí. Dědičné neuropatie nezkracují normální délku života, ale mohou vést k tělesné invalidizaci se ztrátou nebo výrazným zhoršením samostatné chůze a výrazně ovlivňovat kvalitu života i samostatný pohyb i sebeobsluhu. Mentální úroveň je typicky normální. Závažnost postižení je do velké míry závislá na genetické příčině a také na délce trvání nemoci.

Hereditary neuropathies are a heterogeneous group of genetically determined peripheral nerve diseases. In the vast majority of patients, they occur by 20 years of age, most typically during school age between ages 6 and 15, and are manifested by slowly progressive muscle weakness distally and, later on, by atrophies, initially and more predominantly in the lower limbs, as well as by sensory disturbance of varying severity with a distal maximum, sometimes even by trophic changes. The onset of complaints with initial symptoms of the disease in preschool age or after 20 years of age is rarer, but also possible, and is, to a great degree, related to the particular gene disorder. Hereditary neuropathies are the most frequent genetically determined neuromuscular diseases, affecting approximately 4,000 people in the Czech Republic. Hereditary neuropathies do not reduce normal life expectancy, but may lead to physical disability with loss or substantial worsening of independent gait and significantly affect the quality of life as well as self-locomotion and self-care. The intellectual level is typically normal. The severity of disability largely depends on the genetic cause as well as on disease duration.

• MeSH
• Charcot-Marie-Tooth Disease diagnosis   genetics   therapy   MeSH
• Hereditary Sensory and Motor Neuropathy * diagnosis   genetics   therapy   MeSH
• Humans MeSH
• Check Tag
• Humans MeSH
• Publication type
• Review MeSH

• Publication type
• Newspaper Article MeSH
• Interview MeSH

Hluchota je nejčastější smyslovou vadou. Víc než 60 % případů má genetickou příčinu, monogenní a většina je autozomálně recesivních(AR), nesyndromových. AR dědičná hluchota je geneticky vysoce heterogenní. Zjistili jsme, že u 40 % pacientů s prelingvální ztrátou sluchu jsou příčinou mutace v GJB2 genu. U zbylých 60 % pacientů však po vyšetření GJB2 genu zůstává příčina neobjasněna, protože šance na objasnění vyšetřením jednotlivého dalšího genu je pod 1-2 %. Těmto pacientům je třeba nabídnout vyšetření pomocí nového masivně paralelního sekvenování panelu všech dosud známých (>60) genů spojovaných s AR hluchotou. Není známo, jaký podíl na příčině hluchoty mají mutace v jednotlivých dosud známých genech a ani jaké procento pacientů lze objasnit současným vyšetřením všech genů nyní spojených s hluchotou. Po 12 letech DNA diagnostiky máme k dispozici vzorky od více než 600 neslyšících pacientů s vyloučenými mutacemi v GJB2 z nichž 100 má i neslyšícího sourozence. Tyto vzorky budou vyšetřeny masivně paralelním sekvenováním (NGS) panelu genů s využitím systému HaloPlex (Agilent).; Early severe deafness has prevalence of 1:1000 and is the most frequent sensory deficit. More than 60% of the cases have genetic, monogenic origin, most frequently autosomal recessive and are non-syndromic. Hereditary deafness is genetically highly heterogeneous. Mutations in the major gene GJB2 gene are found in 40% of patients with pre-lingual hearing loss. But in more than 60% of patients already tested for GJB2 the cause of deafness remains unknown and the probability of finding the causal mutation in another single gene drops to 1-2%. Patients without GJB2 mutations should be tested by massive parallel sequencing of a gene panel containing about 60 actually known genes relevant for hearing impairment. During 12 years of DNA diagnostics GJB2 gene testing, we collected more than 600 deaf patients with unknown cause of prelingual deafness who should be tested by the AR hereditary hearing loss gene panel using massive parallel sequencing. We want to test how many patients can be clarified by the gene panel testing and what genes are more frequently mutated in Czech patients.

• MeSH
• Genetic Diseases, Inborn genetics   MeSH
• Humans MeSH
• Mutation genetics   MeSH
• Hearing Loss genetics   MeSH
• High-Throughput Nucleotide Sequencing methods   MeSH
• Check Tag
• Humans MeSH

• Conspectus
• Patologie. Klinická medicína
• NML Fields
• otorinolaryngologie
• neurologie
• genetika, lékařská genetika
• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

• MeSH
• Genetics, Medical * MeSH
• Publication type
• Biography MeSH
• Eulogy MeSH

• About
• Seemanová, Eva, 1939-2020 Authority

• MeSH
• Heredodegenerative Disorders, Nervous System MeSH
• Publication type
• Editorial MeSH

Epilepsie jsou heterogenní skupinou onemocnění. Příčinou jsou strukturální vývojové vady mozku, metabolická onemocnění a v poslední době výrazně přibylo objevů řady genů, jejichž mutace způsobují epilepsie. V projektu budou využity metody molekulární genetiky - masivní paralelní sekvenování včetně exomového sekvenování – pro objasnění příčin dětských epilepsií a epileptických encefalopatií. Takové možnosti dosud nejsou v ČR dostupné. V projektu bude pomocí metody HaloPlex připraven panel genů, jejichž poruchy jsou spojeny s epilepsiemi dětského věku (již více než 100 genů). Cílem je vyšetřit cca. 100-150 pacientů (převážně z našeho Centra pro epilepsie) s těžkou epilepsií, kteří nemají objasněnou etiologii a mají negativní MRI mozku. Výsledky genetického testování budou interpretovány se zkušeným epileptologem v kontextu klinických příznaků a rodinné anamnézy. V naší laboratoři již máme velmi dobré zkušenosti s využitím sekvenování nové generace u geneticky heterogenního onemocnění (dědičné neuropatie). Výsledky budou mít velký význam pro klinickou praxi a zlepší péči o pacienty.; We will use massive parallel sequencing (MPS – targeted as well as whole exome) for elucidation of causes of severe childhood epilepsies and epileptic encephalopathies. This approach is not yet available in the Czech Republic. A large cohort of patients with unknown cause of non-lesional epilepsy is available at our Centre for epilepsies. We will focus on epileptic encephalopathies, severe childhood epilepsies and familial epileptic syndromes and syndromes with epilepsy. We also have enough experience and equipment for data processing and filtering from MPS in other neurological disorders. In selected patients a panel of all (about 100) relevant known genes yet related to monogenic early childhood epilepsies and epileptic encephalopathies will be examined by the HaloPlex MPS method. About 50 patients per year will be tested. Results will be interpreted by experienced epileptologists according to clinical data and family history. The results will improve our understanding of the aethiology of epilepsies and improve Czech healthcare including personalized therapy.

• MeSH
• Child MeSH
• Epilepsy diagnosis   MeSH
• Mutation MeSH
• High-Throughput Nucleotide Sequencing MeSH
• Check Tag
• Child MeSH

• Conspectus
• Patologie. Klinická medicína
• NML Fields
• neurologie
• genetika, lékařská genetika
• pediatrie
• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Dědičná neuropatie Charcot-Marie-Tooth (CMT) je nejčastějším dědičným neurologickým onemocněním a patří s prevalencí až 1:2500 mezi nejčastější geneticky podmíněná onemocnění vůbec. V ČR je tedy chorobou CMT postiženo až 4000 osob. CMT je příkladem skupiny chorob s extrémní genetickou heterogenitou, kdy mutace v již více než 50 různých genech mohou být příčinou CMT. V posledních 2-3 letech došlo k rychlému rozvoji a dostupnosti nových sekvenčních a genotypizačních technologií s obrovskou kapacitou a možností vyšetření stovek a tisíců genových sekvencí současně během krátké doby a za zlomek ceny, která se stala dostupnou i pro např. sekvenování celého exomu (všech kódujících částí všech genů). To dává možnost pro zásadní zefektivnění molekulární diagnostiky u geneticky velmi heterogenních skupin neurologických chorob, zejména dědičné neuropatie CMT. Tyto nové možnosti vysokokapacitního vyšetření je nezbytné využít i pro klinickou diagnostiku neurologických chorob a tento cíl si klade i tento projekt.; Hereditary peripheral neuropathies known as Charcot-Marie-Tooth (CMT) with the incidence of 1:2500 are the most frequent genetically caused neuromuscular disorders. It is estimated that in the Czech Republic at least 4000 patients are affected with CMT. Hereditary peripheral neuropathies are a very heterogeneous group of disorders, especially genetically. Recently, mutations in more than 50 genes are associated with CMT. Major developments in the availability of new genotyping and sequencing techniques were made in last 2-3 years. This is most apparent with so-called next generation sequencing which has made possible to sequence the whole exome (all coding exons of all genes) in real-time. This is what has meant a great progress in the genetic diagnosis of a very heterogenous group of disorders, with CMT being a representative example. The aim of the project is to make advantage of these new techniques and to use them to improve genetic diagnostic of neurological disorders.

• MeSH
• Charcot-Marie-Tooth Disease MeSH
• Molecular Diagnostic Techniques MeSH
• Exome genetics   MeSH
• Genotyping Techniques MeSH
• Hereditary Sensory and Motor Neuropathy MeSH
• Sequence Analysis, DNA MeSH

• Conspectus
• Patologie. Klinická medicína
• NML Fields
• neurologie
• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Defekty v SH3TC2 genu byly nedávno objeveny jako zřejmě častá příčina autosomálně recesivně dědičného demyelinizačného typu Charcot-Marie-Tooth (CMT). Cílem projektu je vyšetření genu pro SH3TC2 u pacientů s demyelinizačním typem dědičné neuropatie Charcot-Marie-Tooth (CMT4C) a zjištění prevalentních mutací v tomto genu v české populaci. To vše pro zavedení efektivní DNA i klinické diagnostiky CMT 4C v ČR. Ze shromáždeného souboru pacientů s chorobou CMT budou vybráni pacienti s demyelinizačním typem neuropatie, u kterých lze předpokládat autosomálně recesivní typ přenosu - přibližně 120 pacientů. Jejich DNA bude vyšetřena pomocí sekvenování všech 17 kódujících exonů genu SH3TC2 . U pacientů s prokázanými mutacemi v SH3TC2 genu bude upřesněn fenotyp abude provedeno DNA vyšetření u dostupných příbuzných k potvrzení segregace mutace s fenotypem CMT4C. V případě nálezu dosud nepopsané mutace bude k upřesnění kausálního vlivu vyšetřen vzorek 100 kontrolních anonymizovaných DNA.; Defects in the SH3TC2 gene have been recently identified in patients with hereditary motor and sensory neuropathy (HMSN). Patients cohort of about 120 urelated individuals with the demyelinating hereditary neuropathy and pedigrees compatible with autosomal recessive mode of inheritance will be selected from a large cohort of CMT patients and will be tested by direct sequencing analysis of all 17 coding exons of the SH3TC2 gene including the flanking intronic regions. New mutations will be tested also in100 control DNA samples. Detailed analysis of clinical and electrophysiological phenotype will be performed in patients with detected SH3TC2 mutation and selection criteria for SH3TC2 mutation testing will be refined. Results of the study will specify phenotype and genotype variability of hereditary motor and sensory neuropathy.

• MeSH
• Early Diagnosis MeSH
• Charcot-Marie-Tooth Disease diagnosis   genetics   MeSH
• Hereditary Sensory and Autonomic Neuropathies diagnosis   genetics   MeSH
• Molecular Diagnostic Techniques utilization   MeSH
• Phenotype MeSH
• Genetic Predisposition to Disease MeSH
• Genetic Counseling MeSH
• Mutation MeSH
• Prenatal Diagnosis MeSH
• src Homology Domains MeSH

• Conspectus
• Patologie. Klinická medicína
• NML Fields
• neurologie
• genetika, lékařská genetika
• biologie
• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

• Publication type
• Meeting Abstract MeSH