- Publikační typ
- abstrakt z konference MeSH
- Publikační typ
- abstrakt z konference MeSH
- Publikační typ
- abstrakt z konference MeSH
Problematika léčby infekcí vyvolaných bakteriálními kmeny rezistentními na antibiotika může být řešena zavedením racionální fágové terapie. Bakteriofágy (fágy) byly již v minulosti hojně užívány k léčbě a prevenci bakteriálních infekcí a ve srovnání s antibiotikovou terapií nevedla jejich aplikace ve většině případů k závažným vedlejším účinkům. Zatímco dříve byly pro fágovou terapii využívány preparáty obsahující celé fágové částice, v současnosti otevírá nové možnosti v boji proti obtížně léčitelným infekcím izolace dobře charakterizovaných purifikovaných fágových komponent s antimikrobiálními vlastnostmi. Dnes je fágová terapie rozvíjena zejména u infekcí vyvolaných bakteriálními rody Eníerococcus, Escherichia, Klehsiella, Listeria, Proteus, Pseudomonas, Salmonella, Shigella, Staphylococcus a Streptococcus. Vedle humánní a veterinární medicíny nacházejí principy fágové terapie uplatnění také v zemědělství a potravinářství. Dosud prováděné klinické studie a četné experimenty na zvířecích modelech dokládají, že fágová terapie je účinnou a bezpečnou alternativou antibiotikové léčby bakteriálních infekcí.
A solution to the problem of the increasing number of antibiotic-resistant bacterial strains can be the use of rational phage therapy. In the past, bacteriophages (phages) were often used for the treatment and prevention of infections and unlike antibiotic therapy, phage therapy caused almost no serious side effects. While previously several preparations containing whole phage particles were available for phage therapy, currently, the isolation of well characterised and purified phage components with antibacterial properties opens up new options for the management of intractable infections caused primarily by the bacterial genera Enterococcus, Escherichia, Klebsielia, Listeria, Proteus, Pseudomonas, Salmonella, Shigella, Staphylococcus and Streptococcus. In addition to human and veterinary medicine, the phage therapy principles also find use in the agriculture and food industry. Recent and former clinical studies as well as numerous animal model experiments have supported that phage therapy is an effective and safe alternative of antibiotic treatment of bacterial infections.
Cíl: Cílem předložené práce bylo stanovení prevalence vankomycin-rezistentních enterokoků (VRE) ve výtěrech z rekta pacientů Fakultní nemocnice Olomouc (FNO) a osob v komunitním prostředí spádového regionu FNO. Materiál a metody. Z rektálních výtěrů pacientů hospitalizovaných ve FNO a osob z komunitního spádového prostředí byly v období 1. 7. 2002-1. 7. 2003 izolovány a identifikovány enterokoky, včetně stanovení citlivosti k antibiotikům. Fenotypové určení rezistence k vankomycinu bylo ověřeno PCR detekcí genů vanA, vanB, vanCI a vanC2. U kmenů Enterococcus faecium VanA byla provedena molekulárně biologická analýza. Ke stanovení příbuznosti kmenů byla použita makrorestrikční analýza genomové DNA naštěpené restrikční endonukleázou Smal. Výsledky. Ve sledovaném období bylo vyšetřeno 2 157 výtěrů z rekta hospitalizovaných pacientů a 4 874 od osob v komunitním prostředí. Celkem bylo izolováno 27 VRE nemocniční provenience a 13 kmenů z komunitní populace. Prevalence VRE v gastrointestinálním traktu hospitahzovaných pacientů byla 2,3 %, u osob z komunitního prostředí pak 0,6 %. V případě VRE nemocničního původu dominovaly kmeny Enterococcus faecium VanA (70,4 %), u komunitních VRE se nejčastěji jednalo o kmeny Enterococcus gaiJinarum VanC (46,2 %). Vzájemné genetické porovnání nemocničních a komunitních VRE neprokázalo žádnou podobnost. Závěr. VRE byly v CR prokázány v komunitním i nemocničním prostředí. Jejich prevalence v rektálních výtěrech je nízká a nepřesahuje hodnoty uváděné pro jiné evropské země.
Aim of the study. The presented study aimed at determining the prevalence of vancomycin-resistant enterococci (VRE) in rectal swabs taken from both patients in the Teaching Hospital in Olomouc (THO), Czech Republic, and subjects from the community setting of the hospital's catchment area. Materials and methods: Between July 1,2002 and July 1,2003, rectal swabs were taken from the THO patients as well as individuals from the community catchment area to be utilized for isolating and identifying enterococci and their suscetibihty to antibiotics. Vancomycin resistance phenotypes were verified by PCR detection of vanA, vanB, vanCl and vanC2 genes. A molecular biology analysis was performed in VanA Enterococcus faecium strains. To determine the relationship of strains, macrorestriction analysis of the total chromosomal DNA digested with Smal restriction endonuclease was used. Results: During the observed period, 2,157 rectal swabs from the hospitalized patients and 4,874 rectal swabs from the subjects in community setting were examined. In total, 27 VRE of hospital origin and 13 community-population strains were isolated. The prevalence of VRE in the gastrointestinal tract was 2.3 % in the hospitalized patients and 0.6 % in the community subjects. The prevailing strains were Enterococcus faecium VanA (70.4 %) in the VRE of hospital origin and Enterococcus gaUinarum VanC (46.2 %) in the community VRE. Mutual comparison between the hospital and community VRE showed no similarity. Conclusion: In the Czech Republic, VRE were proved both in community and hospital settings. Their prevalence in rectal swabs is low and does not exceed the values reported in other European countries.
- MeSH
- bakteriální léková rezistence MeSH
- Enterococcus faecalis izolace a purifikace patogenita účinky léků MeSH
- fenotyp MeSH
- finanční podpora výzkumu jako téma MeSH
- komunitní lékařství MeSH
- lidé MeSH
- nemocnice MeSH
- polymerázová řetězová reakce MeSH
- přenašečství MeSH
- prevalence MeSH
- vankomycin terapeutické užití MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- MeSH
- bakteriální toxiny izolace a purifikace MeSH
- dítě MeSH
- epidermis mikrobiologie patologie MeSH
- exfoliativní dermatitida mikrobiologie MeSH
- finanční podpora výzkumu jako téma MeSH
- lidé MeSH
- nemoci novorozenců mikrobiologie MeSH
- polymerázová řetězová reakce metody využití MeSH
- Staphylococcus aureus enzymologie izolace a purifikace patogenita MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- MeSH
- DNA primery MeSH
- DNA virů analýza chemie izolace a purifikace MeSH
- genom virový MeSH
- molekulární sekvence - údaje MeSH
- profágy genetika izolace a purifikace klasifikace MeSH
- stafylokokové bakteriofágy genetika izolace a purifikace MeSH
- Staphylococcus aureus klasifikace virologie MeSH
- Publikační typ
- techniky in vitro MeSH
Cíl: Cílem předložené práce byla molekulárně-biologická analýza kmenů Enterococcus faecium VanA, izolovaných z klinického materiálu pacientů Hemato-onkologické kliniky Fakultní nemocnice Olomouc v období 1997-2002, z prostředí uvedené kliniky a formulace hypotézy o zdroji a šíření VRE. Materiál a metody: Z klinického materiálu pacientů byly standardními kultivačními metodami izolovány a identifikovány enterokoky, včetně stanovení citlivosti k antibiotikům. Molekulárně-biologická analýza byla provedena u vankomycin-rezistentních kmenů E. faecium s fenotypem VanA. Ke stanovení příbuznosti kmenů byla použita makrorestrikční analýza celkové chromozomální DNA naštěpěné restrikční endonukleázou Smal. Výsledky: Celkem bylo ve sledovaném období izolováno 2 647 kmenů Enterococcus sp., přičemž 121 kmenů (4,6 %) bylo identifikováno jako VRE. Nejčastěji se jednalo o kmeny E. faecium VanA (78 %) a E. faecalis VanB (10 %). Z prostředí uvedené kliniky, včetně biologického materiálu ošetřujícího personálu, bylo izolováno 5 vankomycin-rezistentních kmenů E. faecium VanA. 5mal makrorestrikční spektrum genomové DNA analyzovaných kmenů E. faecium VanA tvořilo více než 25 fragmentů o velikosti od 18 do 470 kb. U 60 kmenů bylo identifikováno 28 jedinečných restrikčních profilů, jejichž podobnost se pohybovala od 62 do 97 %. Mezi těmito profily byly dále identifikovány 4 často zastoupené klonální typy, obsahující 5 a více kmenů, s podobností DNA-profilu 90 % a vyšší. Diskuze a závěr. Na základě získaných výsledků lze předpokládat endogenní i exogenní původ izolovaných kmenů E. faecium VanA. Lze potvrdit možnost přežívání těchto kmenů v prostředí nemocničního oddělení a následný přenos na hospitalizované pacienty. Současně je však nutné připustit i endogenní původ těchto kmenů a následnou selekci vlivem širokospektré antibiotické léčby.
Aim of the stady. The aim of this work was the molecular-biology analysis of Enterococcus faecium VanA strains that were isolated from clinical material of the patients hospitalized at the Department of Hemato-Oncology (DHO) of the Teaching Hospital in Olomouc (Czech Republic) from 1997 to 2002, from the environment of this deoartment and formulation of the hypothesis on the source and spread of the VRE. Material and methods: Enterococci were isolated and identified using conventional methods of cultivation including determination of antibiotic susceptibility. Molecular-biology analysis was performed in vancomycin-resistant E. faecium VanA strains isolated in various patients and from the environment of the DHO. A macrorestriction analysis of the total chromosomal DNA that was cleaved by the restriction endonucleasis Smal was used for the determination of the relationship of strains. This analysis was performed by pulsed - field gel electrophoresis (CHEF, Mapper, Bio-Rad) that was followed by statistical processing of the restriction profiles by cluster analysis (Gel Compar, Applied Maths). Results: 2 647 strains of Enterococcus sp. were isolated during the follow-up period totally and 121 of them (4.6 %) were identified as VRE. Most common strains were £. faecium phenotype VanA (78 %) and E. faecalis phenotype VanB (10 %). Five strains of E. faecium VanA were isolated from the environment of the DHO including nasal swabs, hair and uniforms of health care providers. Twenty five to thirty three fragments sized 18 to 470 kb originate in Smal macrorestrictional spectrum of genomic DNA of 60 E. faecium VanA strains and 28 unique restriction profiles were identified, whose similarity varied from 62 to 97 %. Four frequently presented clonal types with 5 and more strains, whose similarity of DNA-profile was > 90 %, were identified among these profiles. Three from five E. faecium VanA strains isolated from the environment had a unique profile that did not correspond with to any of clinical isolates and two strains were identical with the strains isolated from the patients. Conclusion: Based on the results, both endogenous and exogenous origins of isolated E. faecium VanA could be supposed. Possibility of survival of these strains in the hospital department environment and subsequent transmission to hospitalized patients could be confirmed. Simultaneously, endogenous origin of these strains and subsequent selection caused by broad spectrum antibiotic treatment should be admitted.
- MeSH
- Enterococcus faecium genetika patogenita MeSH
- finanční podpora výzkumu jako téma MeSH
- hematologické nádory MeSH
- infekce diagnóza mikrobiologie přenos MeSH
- lidé MeSH
- molekulární biologie MeSH
- pacienti hospitalizovaní MeSH
- restrikční enzymy diagnostické užití MeSH
- rezistence na vankomycin MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
- srovnávací studie MeSH
