Vyšetření lymfoproliferací v lymfatických uzlinách průtokovou cytometrií poskytuje pouze minimální informace o morfologii (orientační stanovení velikosti a granularity buněk), a zcela postrádá informace topografické. Nicméně velkou výhodou této metody je především rychlost stanovení a hodnocení kombinace vyšetřovaných antigenů, kde neméně důležité jsou i intenzity exprese jednotlivých znaků. Toto je zcela zásadní pro hematologické malignity, kdy se různá onemocnění mohou na morfologické úrovni velmi podobat a odchylky vzhledu buněk mohou být minimální. Při diagnostice lymfomů korelace histologie a imunohistochemie s průtokovou cytometrií poskytuje komplexnější pohled pro interpretaci jednotlivých nálezů. Cílem tohoto článku je poskytnout základní informace o vyšetření lymfatických uzlin a biopsií extranodálních tkání průtokovou cytometrií se zaměřením na lymfoproliferativní onemocnění a vytvořit odrazový můstek pro spolupráci mezi patologem a cytometristou.
Although flow cytometry examination of lymphoproliferation in lymph nodes provides minimal morphological information, apart from indicative determination of cell size and granularity, and completely loses topographical information. However, the great advantage of this method is the speed of determining and combination of investigated antigens, where the expression intensities of individual markers are no less important. This is absolutely crucial for hematological malignancies, where different diseases can look very similar at the morphological level and variations in the appearance of tumour cells can be minimal. When diagnosing lymphomas, the combination of histology and immunohistochemistry with flow cytometry provides a more comprehensive view for the interpretation of individual findings. The aim of this article is to provide basic information about the examination of lymph nodes and extranodal tissue by flow cytometry as a starting point for the collaboration of the pathologist and the cytometrist.
- Klíčová slova
- lymfoproliferace,
- MeSH
- lidé MeSH
- lymfatické uzliny MeSH
- průtoková cytometrie * metody MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
Kazuistika popisuje vzácný případ kompozitního folikulárního lymfomu (FL) a in situ mantle cell neoplázie (ISMCN) v lymfatické uzlině. Obě nádorové populace byly primárně charakterizovány pomocí průtokové cytometrie. Nález kompozitního FL grade 3A (FL-G3A) a ISMCN byl potvrzen histopatologickým vyšetřením lymfatické uzliny, metodami imunohistochemickými a pomocí fluorescenční in situ hybridizace (FISH). Popsaný případ ukazuje na významnou roli průtokové cytometrie při záchytu tohoto vzácného nálezu.
The aim of the presented case report is to acquaint the wider professional public with a rare case of composite follicular lymphoma (FL) and in situ mantle cell neoplasia (ISMCN) in a lymph node. In both components, characteristics of tumor cells populations were investigated primarily using flow cytometry. The patient was diagnosed with a combination of composite FL grade 3A (FL-G3A) and ISMCN, this finding was also confirmed by histopathological and immunohistochemical examination of the lymph node and complemented by fluorescence in-situ hybridization (FISH). The described case shows the diagnostic difficulties in detecting this rare lesion and an important role of flow cytometry in diagnostics of lymphomas.
- MeSH
- folikulární lymfom * diagnóza MeSH
- kompozitní lymfom diagnóza MeSH
- lidé MeSH
- průtoková cytometrie * metody MeSH
- senioři MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
Krátce po prvním oficiálním oznámení Světové zdravotnické organizace byl v Liberci odhalen a potvrzen první český případ nákazy COVID-19 způsobené variantou SARS-CoV-2 omikron. Zároveň se jednalo o jeden z prvních zachycených evropských případů. Za méně než 24 hodin od ohlášení suspekce praktickým lékařem, bezodkladně reagujícího na první informaci o existenci nové varianty koronaviru ve sdělovacích prostředcích, byla tato varianta potvrzena sekvenací, kterou byla laboratoř schopna provést ihned po vyžádání. To umožnilo okamžité trasování kontaktů, při němž bylo vyšetřeno a izolováno jedenáct osob. Jedna z nich byla testována pozitivně, šíření viru bylo izolací zastaveno. Případ mimo jiné ukazuje na snadné šíření viru SARS-CoV-2 na dlouhé vzdálenosti.
Shortly after the WHO's first notice a suspected case of omicron SARS-CoV-2 was reported in Liberec, Czech Republic. The primary goal of the following actions was to test the presence of the variant and stop the spread of the virus variant. On November 25 a sixty-year-old lady, who had recently returned from Namibia, visited a GP with flu-like symptoms and a rash on her chest. The antigen test was positive for SARS-CoV-2, a PCR test was planned. At that time, it was not known that a new variant of concern was spreading from Africa. On November 26 in the morning the GP announced a suspected omicron case to the Regional public health authority, who organized the following steps. A mobile sampling team was sent to the patient's home immediately, sample transported into the regional hospital and analyzed with the help of the national reference laboratory. The captured virus SARS-CoV-2 fitted the description of the omicron variant, was shared in the GISAID database and named hCoV-19/Czech Republic/KNL_2021-110119140/2021. Contact tracing was started immediately, eleven persons were tested and quarantined. One of them positive with no further spread. It is the first documented omicron case in the Czech Republic and one of the first cases in Europe, with an excellent systemic response to the alert. The laboratory was able to detect the omicron variant instantly after the request. This case also demonstrates how easily the virus spreads on long distances and how important it might be to increase the uptake of the booster vaccine.
- Klíčová slova
- SARS-CoV-2 omikron,
- MeSH
- COVID-19 * diagnóza přenos MeSH
- hlášení nemocí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- testování na COVID-19 MeSH
- trasování kontaktů * MeSH
- Check Tag
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Extranodální lymfom z marginální zóny slizniční lymfoidní tkáně (MALT lymfom) se řadí mezi primární extranodální non-Hodgkinovy lymfomy s nízkým stupněm malignity, nicméně s rizikem generalizace. B lymfomy bývají někdy asociovány s dalšími chorobnými stavy (například infekce Helicobacter pylori, Campylobacter jejuni či idiopatické střevní záněty). Klinicky se mohou prezentovat různorodě od dyspeptických potíží s malabsorpcí a hubnutím až po ileózní stav či masivní krvácení do trávicího traktu. Diagnostika se opírá o klinický stav, laboratorní výsledky a výsledky zobrazovacích metod, endoskopie má zásadní význam při vizualizaci nádorové masy a odběru bioptovaného materiálu pro stanovení definitivní histopatologické diagnózy. Léčba MALT lymfomů spadá do rukou onkologa, zahrnuje chemoterapii a/nebo radioterapii, v ojedinělých případech je indikován též resekční výkon. V předložené kazuistice prezentujeme starší pacientku, která byla do našeho IBD centra odeslána pro nespecifické bolesti břicha a pozitivní test na okultní krvácení. Při CT vyšetření před endoskopií byla popsána infiltrace oblasti lienální flexury blíže nespecifikovanou masou, následně provedená koloskopie prokázala pouze intaktní sliznici tračníku, včetně terminálního ilea. Teprve při druhém čtení CT scanu byla zpřesněna lokalizace infiltrátu na oblast proximálního jejuna a jeho mezenteria, následující gastroskopické vyšetření odhalilo stenozující exulcerovaný tumor v proximálním jejunu, nepropustný ani pro pediatrický koloskop. Histologické vyšetření bioptované tkáně potvrdilo diagnózu MALT lymfomu. Při kontrolním gastroskopickém vyšetření po ukončené onkologické léčbě (chemoterapie v kombinaci s radioterapií) byla nadále přítomna endoskopicky neprůchozí stenóza proximálního jejuna. Klinicky u pacientky doházelo k hubnutí, které bylo do jisté míry způsobeno intermitentní poruchou pasáže při pozření tuhého sousta, proto byl perorální příjem obohacen o vysokokalorický sipping. Další kontrolní CT břicha vykazovalo regresi infiltrátu, ale přetrvávala stenóza proximálního jejuna v délce asi 7 cm. Dle přání pacientky nebyla provedena chirurgická resekce stenotického úseku střeva, ale přistoupili jsme k endoskopické dilataci stenotického úseku jejuna balonkem. Po prvních dvou dilatacích postižené oblasti došlo u pacientky k přechodnému zlepšení tolerance tuhé stravy. Pro restenózu byla provedena třetí endoskopická dilatace s rozvojem komplikací, které zahrnovaly krátkodobou oběhovou nestabilitu s bolestmi břicha a nakonec vyústily v neodkladné chirurgické řešení.
Extranodal lymphoma from the marginal zone mucosa-associated lymphoid tissue (MALT lymphoma) is one of the primary extranodal non-Hodgkin‘s lymphomas with low degrees of malignancy but with the risk of spreading to distant locations in the body. B-lymphomas are sometimes associated with other diseases (eg. Helicobacter pylori and Campylobacter jejuni infections or inflammatory bowel disease). B-lymphomas may manifest with a variety of clinical signs, from dyspeptic syndrome with malabsorption and weight loss to ileus or massive gastrointestinal bleeding. Diagnosis is based on the clinical condition and the results of laboratory tests and imaging techniques, while endoscopy is the essential procedure for visualizing the tumor mass and collecting a biopsy sample to determine the definitive histopathological diagnosis. MALT lymphoma treatment is managed by oncologists and includes chemotherapy and/or radiotherapy, with resection indicated in rare cases. In this case report we present an elderly female patient who was referred to our IBD centre for non-specific abdominal pain with a positive fecal occult blood test. Computed tomography (CT) examination was used before endoscopy and showed an infiltration of the splenic flexure by an unspecified mass, a subsequent colonoscopy showed intact mucosa of the colon, including the terminal ileum. In the second reading of the CT scan the location of the infiltrate was identified more specifically as the area of the proximal jejunum and jejunal mesentery. Subsequent upper endoscopy revealed a stenosing exulcerated tumor in the proximal jejunum, with the stenosis impassable even for a pediatric colonoscope. The diagnosis of MALT lymphoma was confirmed by a histological examination of the biopsied tissue. A follow-up upper endoscopy was performed after the patient had completed her oncological treatment (chemotherapy in combination with radiotherapy), showing the presence of stenosis at the proximal jejunum, still impassable for the endoscope. In clinical terms, the patient experienced weight loss, which was to some extent caused by intermittent pseudo-obstruction when on a solid diet, therefore we decided to enrich her oral intake with high-calorie sip feed. The next follow-up CT scan of the abdomen showed a regression of the infiltrate, but the stenosis of the proximal jejunum, about 7 centimeters long, persisted. To respect the patient‘s wishes, no surgical resection of the stenotic section of the intestine was performed, but we proceeded with endoscopic dilatation of the stenotic section of the jejunum with a balloon. After the first two endoscopic dilatations of the stenotic area the patient experienced a temporary improvement in solid food tolerance. Because of restenosis, a third endoscopic dilatation was performed, with the development of complications that included short-term circulatory instability with abdominal pain and eventually required an urgent surgical solution.
- MeSH
- dilatace metody MeSH
- jejunum chirurgie patologie MeSH
- lidé MeSH
- lymfom z B-buněk marginální zóny * chirurgie diagnóza MeSH
- perforace střeva chirurgie etiologie MeSH
- senioři MeSH
- stenóza chirurgie etiologie MeSH
- střevní nádory chirurgie diagnóza MeSH
- výsledek terapie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
Our previous study showed that a diet enriched with 400 g of carp per week improved plasma lipids in subjects after aortocoronary bypass (CABG). The aim of the present study is to determine whether the different carp farming systems have an impact on the effects of carp meat in secondary cardiovascular prevention. We examined 3 groups of patients after CABG over a 4-week period of spa treatment (108 persons, 73 males, 35 females, age over 60 years). We found no differences in baseline values of blood pressure or plasma lipids. The patients were given a standard spa diet (controls; N=36) or a diet enriched of 400 g of carp meat per week, enriched omega 3 (N=37) or cereal carp (N=35). Plasma lipid parameters were examined at start and after 4 weeks in a routine laboratory setting. Group consuming omega-3 carp showed the largest decline in total cholesterol, LDL cholesterol, triglycerides and an increase in HDL cholesterol (all p<0.01). We found that carp meat from the two production systems showed significantly different effects on plasma lipids. Further trials should be performed to clarify the exact causes of the differences.
- MeSH
- ischemická choroba srdeční krev dietoterapie epidemiologie MeSH
- kapři * MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- následné studie MeSH
- omega-3 mastné kyseliny aplikace a dávkování MeSH
- sekundární prevence metody MeSH
- senioři MeSH
- stravovací zvyklosti * MeSH
- vodní hospodářství metody MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
Cíl práce: Zavedení sekvenace enterovirů jako progresivní metody umožňující zařazení izolovaných virů podle nové nomenklatury a detailní posouzení charakteru izolátu. Materiál a metody: Bylo analyzováno 75 vzorků pocházejících od 64 pacientů ze 2 pracovišť – Krajské nemocnice v Liberci a Fakultní nemocnice Plzeň. Věk sledovaných pacientů se pohyboval v intervalu od 4 do 54 let, medián věku byl 15 let u mužů a 16 let u žen. Důvodem hospitalizace byly u převažujícího počtu pacientů intenzivní bolesti hlavy, horečky, zvracení, únava, meningeální příznaky, u dvou pacientů byly příznaky střevní a u jednoho kožní. Vyšetřované vzorky byly výtěry z rekta, krku, mozkomíšní moky a stolice. Molekulární detekce a typizace byla provedena s využitím metody RT-PCR. Pro typizaci byl vybrán úsek z nekódující oblasti 5´RNA. Vzorky byly amplifikovány jednokrokovou PCR s vnějšími primery a se stejnými primery prodlouženými o M13 sekvence (Generi-Biotech). Editace, sestava a kvalitativní analýza sekvencí byla provedena pomocí programu LASERGENE (DIASTAR). Získané sekvence byly vyhodnoceny centrální databází sekvencí GenBank pomocí algoritmu BLAST. Výsledky: V izolátech jsme identifikovali 61 ECHO virů 30, 3 coxsackieviry B1, 1 coxsackievirus B3, 1 coxsackievirus A9, 1 enterovirus 86, 1 enterovirus 71, 2 ECHO virus 13/ coxsackievirus B5, 1 ECHO virus 7/30/coxsackievirus B4, 1 coxsackievirus B4/enterovirus B, 1 enterovirus 87/ECHO virus 30/enterovirus B a 1 ECHO virus 3. Všechny izolované viry, mimo enteroviru 71 patřícího do skupiny A, spadají do skupiny B. Závěr: Enteroviry bylo možné jednoznačně identifikovat, ačkoliv byl sekvenován krátký konzervativní úsek se značnou variabilitou. Sekvenace v plné míře nahradila bližší určování enterovirů virusneutralizací a umožnila detailní posouzení izolátů. Převaha ECHO 30 jako kauzálního agens vyvolávajícího aseptické meningitidy je ve shodě s literárními údaji.
Objective: Introducing enterovirus sequencing as an advanced approach to classify the viruses isolated according to the novel nomenclature and to characterize isolates in detail. Material and methods: Seventy-five specimens collected from 64 patients in two hospitals, Liberec Regional Hospital, and Plzeň University Hospital, were analyzed. The study patients' age ranged from four to 54 years, with a median of 15 years in males and 16 years in females. In most patients, the reasons for admission were intense headache, fever, vomiting, tiredness, meningeal symptoms, intestinal symptoms (in two patients), and skin symptoms (in one patient). The speci-mens collected were rectal and throat swabs, cerebrospinal fluid (CSF) and stool specimens. Molecular detection and typing were performed using the RT-PCR method. A segment of the 5´non-coding RNA was selected for typing. Specimens were amplified using single-step PCR with external primers and with the same primers extended to include M13 sequen-ces (Generi-Biotech). The LASERGENE software (DIASTAR) was used in sequence editing, alignment, and quality check. The sequences obtained were checked against the central GenBank sequence database using the BLAST algorithm. Results: The identification of the study isolates resulted in 61 ECHO viruses 30, three coxsackie viruses B1, one coxsackie virus B3, one coxsackie virus A9, one enterovirus 86, one enterovirus 71, Two ECHO viruses 13/coxsackie virus B5, one ECHO virus 7/30/coxsackie virus B4, one coxsackie virus B4/enterovirus B, one enterovirus 87/ECHO virus 30/enterovirus B, and one ECHO virus 3. All viruses isolated, except enterovirus 71 classified into group A, were of group B. Conclusion: The enteroviruses were identified unambigously, although the sequencing only targeted a short, conserved segment that showed considerable variability. The sequencing was an effective alternative to enterovirus identification by the neutralisation test and allowed for detailed characterization of the isolates. The predominance of ECHO 30 as the cause of aseptic meningitis is in accordance with the literature data.
- MeSH
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- ECHO virové infekce virologie MeSH
- enterovirové infekce * virologie MeSH
- enterovirus B lidský genetika izolace a purifikace MeSH
- Enterovirus * genetika izolace a purifikace MeSH
- feces virologie MeSH
- genotyp MeSH
- kvantitativní polymerázová řetězová reakce MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- meningitida aseptická virologie MeSH
- mladiství MeSH
- mladý dospělý MeSH
- mozkomíšní mok virologie MeSH
- odběr biologického vzorku MeSH
- předškolní dítě MeSH
- RNA virová * genetika MeSH
- sekvenční analýza RNA * MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mladý dospělý MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- předškolní dítě MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
V České republice nepatří molekulárně biologický průkaz původců virových gastroenteritid ke standardním vyšetřením. V zahraničí je však tato metoda považována za zlatý standard. V naší studii jsme porovnávali běžně využívanou imunochromatografii (průkaz antigenu) s multiplexní PCR. Bylo vyšetřeno celkem 69 vzorků stolice, u kterých se podařilo zvýšit celkový záchyt původců o 35 % a v určitých skupinách pacientů až o 57 %. Výsledky studie by měly posloužit k zamyšlení o využití molekulárně biologických metod v průkazu původců virových gastroenteritid a také ke zvýšení povědomí o této skupině onemocnění, u které je celá řada otázek stále nezodpovězena.
In the Czech Republic, molecular biological detection of viruses causing gastroenteritis is not routinely used. Nevertheless, in other countries, this method is considered as a gold standard. In the present study, immunochromatography (antigen detection), a commonly used method, was compared with multiplex polymerase chain reaction (PCR). Sixty-nine stool samples were analyzed and a 35% to 57% higher overall detection rate of the causative agents was achieved. The study results should support the potential for use of molecular biological methods in the detection of viruses causing gastroenteritis and should enhance the awareness of these infections where a number of questions remain unanswered.
- MeSH
- chemické techniky analytické metody MeSH
- chromatografie afinitní * metody využití MeSH
- diagnostické techniky molekulární * metody využití MeSH
- ELISA metody využití MeSH
- gastroenteritida * diagnóza virologie MeSH
- lidé MeSH
- polymerázová řetězová reakce metody využití MeSH
- virové nemoci * diagnóza MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
