• MeSH
• biologické modely MeSH
• teoretické modely MeSH

• Konspekt
• Biologické vědy
• NLK Obory
• lékařství
• NLK Publikační typ
• elektronické časopisy

• Konspekt
• Fyziologie člověka a srovnávací fyziologie
• NLK Obory
• fyziologie

Virtual screening makes it possible to design and then test up to millions of structures. On the other hand, not every virtual structure can readily be prepared and tested in reality. Therefore, it is necessary to exclude unsuitable candidates, ideally at the beginning of virtual screening campaign. Three main approaches are used to filter out synthetically unfeasible structures: similarity to starting material, retrosynthetic route and complexity of the structure. These techniques vary in computational demands; they can therefore be used in various stages of screening, and/or combined to improve estimation of synthetic feasibility.

• Klíčová slova
• virtuální screening, syntetická dostupnost, komplexita, retrosyntetická analýza, syntetizovatelnost, chemický prostor,
• MeSH
• chemické databáze MeSH
• farmaceutická chemie MeSH
• objevování léků MeSH
• počítačová simulace * MeSH
• příprava léků MeSH
• racionální návrh léčiv MeSH
• techniky syntetické chemie MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH

Hledání optimálního nastavení podmínek chemické analýzy je zpravidla zdlouhavý proces. Tento článek k tomuto účelu navrhuje využití neuronových sítí, zejména ve vztahu k určení optimální podmínek pro analýzu zkoumaných látek s využitím technologie LC/MS/MS a ESI ionizací, a to na základě znalosti jejich základních vlastností, označených jako univerzální deskriptory. Práce se soustředí na nalezení takových podmínek analýzy, kdy dochází k maximalizaci signálu iontu prekurzoru. Práce se zabývá zejména otázkou, zda lze výsledky zjištěné na jednom typu analytu použít k neurální interpolační predikci optimálních podmínek analytů podobných.

The search for the optimal instrumental settings of conditions in chemical analysis is typically a lengthy process. This article proposes the use of neural networks for this purpose, particularly in relation to determining the optimal conditions for the analysis of substances under study using LC/MS/MS and ESI technologies, based on the knowledge of their fundamental properties, referred to as universal descriptors. The work focuses on finding such analysis conditions that maximize the precursor ion signal. The paper specifically addresses the question of whether the results obtained from one type of analyte can be used for neural-interpolated prediction of optimal conditions for similar analytes.

• MeSH
• chemické bojové látky chemie   MeSH
• chemické techniky analytické metody   MeSH
• chromatografie kapalinová metody   MeSH
• hmotnostní spektrometrie s elektrosprejovou ionizací metody   MeSH
• hmotnostní spektrometrie metody   MeSH
• lidé MeSH
• neuronové sítě MeSH
• organofosfáty * chemie   analýza   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• MeSH
• biomechanika MeSH
• biomedicínské inženýrství metody   MeSH
• počítačové metodologie MeSH

• Konspekt
• Biotechnologie. Genetické inženýrství
• NLK Obory
• biomedicínské inženýrství
• NLK Publikační typ
• elektronické časopisy

• MeSH
• hmotnostní spektrometrie metody   MeSH
• proteomika metody   MeSH
• výpočetní biologie MeSH
• Publikační typ
• monografie MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• biochemie

The search for the optimal instrumental settings of conditions in chemical analysis is typically a lengthy process. This article proposes the use of neural networks for this purpose, particularly in relation to determining the optimal conditions for the analysis of substances under study using LC/MS/MS and ESI technologies, based on the knowledge of their fundamental properties, referred to as universal descriptors. The work focuses on finding such analysis conditions that maximize the precursor ion signal. The paper specifically addresses the question of whether the results obtained from one type of analyte can be used for neural-interpolated prediction of optimal conditions for similar analytes.

• MeSH
• chemické bojové látky analýza   chemie   MeSH
• chemické techniky analytické metody   MeSH
• chromatografie kapalinová metody   MeSH
• hmotnostní spektrometrie s elektrosprejovou ionizací metody   MeSH
• hmotnostní spektrometrie metody   MeSH
• lidé MeSH
• neuronové sítě MeSH
• organofosfáty * analýza   chemie   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• MeSH
• chování MeSH
• experimentální psychologie přístrojové vybavení   MeSH
• počítače MeSH

• Konspekt
• Psychologie
• NLK Obory
• psychologie, klinická psychologie
• NLK Publikační typ
• elektronické časopisy

• MeSH
• DNA MeSH
• RNA MeSH
• Publikační typ
• monografie MeSH

• Konspekt
• Obecná genetika. Obecná cytogenetika. Evoluce
• NLK Obory
• genetika, lékařská genetika

Enzymes are in high demand for very diverse biotechnological applications. However, natural biocatalysts often need to be engineered for fine-tuning their properties towards the end applications, such as the activity, selectivity, stability to temperature or co-solvents, and solubility. Computational methods are increasingly used in this task, providing predictions that narrow down the space of possible mutations significantly and can enormously reduce the experimental burden. Many computational tools are available as web-based platforms, making them accessible to non-expert users. These platforms are typically user-friendly, contain walk-throughs, and do not require deep expertise and installations. Here we describe some of the most recent outstanding web-tools for enzyme engineering and formulate future perspectives in this field.

• MeSH
• biotechnologie * MeSH
• internet * MeSH
• rozpustnost MeSH
• výpočetní biologie MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• přehledy MeSH