sRNA
Dotaz
Zobrazit nápovědu
Small RNAs (sRNAs) are molecules essential for a number of regulatory processes in the bacterial cell. Here we characterize Ms1, a sRNA that is highly expressed in Mycobacterium smegmatis during stationary phase of growth. By glycerol gradient ultracentrifugation, RNA binding assay, and RNA co-immunoprecipitation, we show that Ms1 interacts with the RNA polymerase (RNAP) core that is free of the primary sigma factor (σA) or any other σ factor. This contrasts with the situation in most other species where it is 6S RNA that interacts with RNAP and this interaction requires the presence of σA. The difference in the interaction of the two types of sRNAs (Ms1 or 6S RNA) with RNAP possibly reflects the difference in the composition of the transcriptional machinery between mycobacteria and other species. Unlike Escherichia coli, stationary phase M. smegmatis cells contain relatively few RNAP molecules in complex with σA. Thus, Ms1 represents a novel type of small RNAs interacting with RNAP.
- MeSH
- bakteriální chromozomy MeSH
- DNA řízené RNA-polymerasy metabolismus MeSH
- konformace nukleové kyseliny MeSH
- malá nekódující RNA chemie genetika metabolismus MeSH
- Mycobacterium smegmatis enzymologie genetika růst a vývoj MeSH
- Mycobacterium genetika MeSH
- sigma faktor metabolismus MeSH
- syntenie MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
At low temperatures the Escherichia coli rpoS mRNA, encoding the stationary phase sigma factor RpoS, forms an intramolecular secondary structure (iss) that impedes translation initiation. Under these conditions the small RNA DsrA, which is stabilzed by Hfq, forms a duplex with rpoS mRNA sequences opposite of the ribosome-binding site (rbs). Both the DEAD box helicase CsdA and Hfq have been implicated in DsrA·rpoS duplex formation. Hfq binding to A-rich sequences in the rpoS leader has been suggested to restructure the mRNA, and thereby to accelerate DsrA·rpoS duplex formation, which, in turn, was deemed to free the rpoS rbs and to permit ribosome loading on the mRNA. Several experiments designed to elucidate the role of Hfq in DsrA-mediated translational activation of rpoS mRNA have been conducted in vitro. Here, we assessed RpoS synthesis in vivo to further study the role of Hfq in rpoS regulation. We show that RpoS synthesis was reduced when DsrA was ectopically overexpressed at 24 °C in the absence of Hfq despite of DsrA·rpoS duplex formation. This observation indicated that DsrA·rpoS annealing may not be sufficient for efficient ribosome loading on rpoS mRNA. In addition, a HfqG29A mutant protein was employed, which is deficient in binding to A-rich sequences present in the rpoS leader but proficient in DsrA binding. We show that DsrA·rpoS duplex formation occurs in the presence of the HfqG29A mutant protein at low temperature, whereas synthesis of RpoS was greatly diminished. RNase T1 footprinting studies of DsrA·rpoS duplexes in the absence and presence of Hfq or HfqG29A indicated that Hfq is required to resolve a stem-loop structure in the immediate coding region of rpoS mRNA. These in vivo studies corroborate the importance of the A-rich sequences in the rpoS leader and strongly suggest that Hfq, besides stabilizing DsrA and accelerating DsrA·rpoS duplex formation, is also required to convert the rpoS mRNA into a translationally competent form.
- MeSH
- 5' nepřekládaná oblast MeSH
- bakteriální proteiny genetika metabolismus MeSH
- bakteriální RNA genetika MeSH
- Escherichia coli genetika MeSH
- malá nekódující RNA genetika metabolismus MeSH
- messenger RNA metabolismus MeSH
- mutace MeSH
- protein hostitelského faktoru 1 metabolismus MeSH
- proteiny z Escherichia coli metabolismus MeSH
- proteosyntéza MeSH
- regulace genové exprese u bakterií MeSH
- ribozomy metabolismus MeSH
- sigma faktor genetika metabolismus MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
Autoři shrnují základní poznatky a zmiňují své zkušenosti se vzácnou nosologickou jednotkou - syndromem solitárního rektálního vředu (SRUS). V první části je zmíněna patofyziologie a diagnostika SRUS. Obecně uznávaná teorie vzniku SRUS je doložena citacemi relevantních studií. Diagnóza SRUS je stanovena z klinického a endoskopického obrazu a v případě nejasností i z biopsie. V diagnostice je nezastupitelná defekografie, především s ohledem na volbu terapie SRUS. Ve druhé části jsou popsány možnosti léčby SRUS. Vždy začínáme terapií konzervativní. V případě jejího selhání je možná endoskopická terapie, nicméně její efektivita je rovněž omezená. Nejkauzálnější je chirurgická léčba, která také nabízí i nejvíce možností. V závěru jsou zmíněny vlastní zkušenosti autorů se SRUS.
The authors summarise the basic facts about and personal experience with a rare nosological disorder-solitary rectal ulcer syndrome (SRUS). In the first part, the pathophysiology and the diagnostics of SRUS are mentioned. The generally accepted theory of the development of SRUS is supported by the relevant citations. The symptoms and the endoscopic picture and in uncertain cases also the biopsy are the basis for the diagnosis of SRUS. In diagnostics, evacuation proctography is crucial especially with regard to SRUS therapy planning. In the second part, all the possible SRUS therapies are described. First in the line is conservative therapy. If conservative therapy fails, endoscopic therapy can be indicated but with limited options. The most causal is surgical therapy, which also offers the most options. Finally, the authors share their clinical experience with patients suffering from solitary rectal ulcer syndrome.
- Klíčová slova
- rektální prolaps,
- MeSH
- biofeedback (psychologie) MeSH
- defekografie MeSH
- diferenciální diagnóza MeSH
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mladý dospělý MeSH
- nemoci rekta diagnóza patofyziologie terapie MeSH
- příznaky a symptomy MeSH
- senioři MeSH
- syndrom MeSH
- vřed diagnóza patofyziologie terapie MeSH
- výsledek terapie MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mladý dospělý MeSH
- senioři MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
Cílem přehledového článku je představení rukou asistované laparoskopické adrenalektomie (RALA), jako jedné z možných operačních technik odstranění větších tumorů nadledvin, která kombinuje výhody totální laparoskopie a otevřeného chirurgického přístupu. Jedná se o bezpečný, efektivní, minimálně invazivní výkon snižující počet konverzí v otevřenou operaci. Mimo zásad předcházejících operační výkon je zmíněn především vlastní operační postup.
The aim of this article is to introduce hand‑assisted laparoscopic adrenalectomy as one of the surgical techniques for removing large adrenal tumors which basically combines the advantages of total laparoscopy and open surgery. It is a effective and minimally invasive procedure reducing the number of open conversions. Besides the principles before any surgery, we would like to mention especially the method of operation.
- Klíčová slova
- rozměrné nádory,
- MeSH
- adrenalektomie * metody MeSH
- lidé MeSH
- nádory nadledvin chirurgie MeSH
- rukou asistovaná laparoskopie metody MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH