A fatal case of 67-year-old female with metastatic breast cancer on chemotherapy complicated with febrile neutropenia, colitis and sepsis due to Clostridium septicum is presented. Important clinical symptoms, laboratory and radiology findings together with therapy and outcome of neuropenic colitis are also discussed.
- MeSH
- bakteriemie * diagnóza MeSH
- Clostridium septicum * MeSH
- klostridiové infekce * komplikace diagnóza MeSH
- kolitida * diagnóza etiologie MeSH
- lidé MeSH
- nádory prsu * komplikace MeSH
- senioři MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- kazuistiky MeSH
In our study we present an overview of the use of Oxford Nanopore Technologies (ONT) sequencing technology on the background of Enteric fever. Unlike traditional methods (e.g., qPCR, serological tests), the nanopore sequencing technology enables virtually real-time data generation and highly accurate pathogen identification and characterization. Blood cultures were obtained from a 48-year-old female patient suffering from a high fever, headache and diarrhea. Nevertheless, both the initial serological tests and stool culture appeared to be negative. Therefore, the bacterial isolate from blood culture was used for nanopore sequencing (ONT). This technique in combination with subsequent bioinformatic analyses allowed for prompt identification of the disease-causative agent as Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A. The National Reference Laboratory for Salmonella (NIPH) independently reported this isolate also as serovar Paratyphi A on the basis of results of biochemical and agglutination tests. Therefore, our results are in concordance with certified standards. Furthermore, the data enabled us to assess some basic questions concerning the comparative genomics, i.e., to describe whether the isolated strain differs from the formerly published ones or not. Quite surprisingly, these results indicate that we have detected a novel and so far, unknown variety of this bacteria.
OBJECTIVES: To investigate the relationship between Clostridium (Clostridioides) difficile strain characteristics and C. difficile infection (CDI) outcome. METHODS: Between October and December 2017, 16 hospitals collected epidemiological data according to the European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC) surveillance protocol for CDI. C. difficile isolates were characterized by ribotyping, toxin genes detection and antibiotic susceptibility testing to metronidazole, vancomycin and moxifloxacin. RESULTS: The overall mean CDI incidence density was 4.5 [95% CI 3.6-5.3] cases per 10,000 patient-days. From the 433 CDI cases, 330 (76.2%) were healthcare-associated, 52 (12.0%) cases were community-associated or of unknown origin and 51 (11.8%) CDI cases recurrent; a complicated course of CDI was reported in 65 cases (15.0%). Eighty-eight (20.3%) of patients died and 59 of them within 30 days after the CDI diagnosis. From the 379 C. difficile isolates, the most prevalent PCR ribotypes were 001 (n = 127, 33.5%) and 176 (n = 44, 11.6%). A total of 186 (49.1%) isolates showed a reduced susceptibility to moxifloxacin (> 4 mg/L) and 96.4% of them had Thr82Ile in the GyrA. Nineteen isolates revealed reduced susceptibility to metronidazole and two isolates to vancomycin (> 2 mg/L). A fatal outcome was associated with a reduced susceptibility to moxifloxacin, the advanced age of the patients and a complicated course of CDI (p<0.05). No association between ribotype, binary toxin and a reduced susceptibility to moxifloxacin and complicated course or recurrent CDI was found. CONCLUSIONS: A reduced susceptibility to moxifloxacin, in causative C. difficile strains was associated with fatal outcome of the patients, therefore it is an important marker in surveillance of CDI.
- MeSH
- antibakteriální látky terapeutické užití MeSH
- Clostridioides difficile účinky léků MeSH
- feces mikrobiologie MeSH
- infekce spojené se zdravotní péčí MeSH
- klostridiové infekce farmakoterapie mikrobiologie mortalita MeSH
- lidé MeSH
- mikrobiální testy citlivosti MeSH
- moxifloxacin terapeutické užití MeSH
- ribotypizace MeSH
- senioři MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- multicentrická studie MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Bakteriémie vyvolaná Staphylococcus aureus (SAB) je nejčastější infekcí krevního řečiště s vysokou incidencí a letalitou. Při zjištění SAB je velmi důležité dodržet správný vyšetřovací a léčebný postup. Záměrem studie bylo posoudit klinické a epidemiologické charakteristiky případů SAB zachycených v ÚVN Praha a zhodnotit dodržení doporučených postupů v diagnostice a léčbě. Celkem bylo do retrospektivní studie zařazeno 65 pacientů, u nichž byl zachycen S. aureus v hemokultuře. V 60 případech (92 %) byla SAB vyvolána kmeny MSSA a u 5 pacientů (8 %) byly detekovány kmeny MRSA. Zdroj infekce se podařilo prokázat v 83 % případů. Průměrná smrtnost v analyzovaném souboru byla 28 %. Výsledky analýzy indikátorů kvality péče naznačily nedostatky v diagnostickém i léčebném postupu u 65 % pacientů. Studie podpořila nutnost konziliárních vyšetření odborníkem na infekční choroby u lůžka.
Staphylococcus aureus bacteremia (SAB) is the most common cause of severe bloodstream infections with high incidence and lethality. The diagnosis of SAB must be followed by an appropriate diagnostic and therapeutic management. The aim of the study was to identify clinical and epidemiological characteristics of SAB cases treated in the Central Military Hospital Prague and to assess compliance with the guidelines for diagnosis and therapy. A total of 65 patients with S. aureus blood culture positivity were enrolled in the retrospective study. Sixty SAB cases (92%) were caused by MSSA strains, and MRSA strains were detected in five patients (8%). The source of the infection was confirmed in 83% of patients. The average case fatality rate in the study cohort was 28%. The analysis of the quality of care suggested both diagnostic and therapeutic insufficiencies in 65% of SAB patients. Overall, the result of the study supports the importance of the role of infectious disease specialists played in the bedside management of patients with SAB.
- MeSH
- antibakteriální látky terapeutické užití MeSH
- bakteriemie * diagnóza etiologie farmakoterapie MeSH
- lidé MeSH
- retrospektivní studie MeSH
- stafylokokové infekce diagnóza farmakoterapie mortalita MeSH
- Staphylococcus aureus * patogenita MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
A case report of cutaneous mucormycosis and obstacles to early diagnosis is presented. A 38-year-old male was involved in a car accident that led to amputation of both lower limbs. Subsequently, he developed fungal wound infection of the left lower limb stump. The infection was detected very early, although the diagnosis was difficult because only a small area was affected and histopathological examination was initially negative. The infection was proven by microscopy, culture and histopathology. The isolate was identified by sequencing of the rDNA ITS region gene (internal transcribed spacer region of ribosomal DNA) as Lichtheimia corymbifera. Liposomal amphotericin B and surgery were successful in management of the disease.
- MeSH
- amfotericin B aplikace a dávkování MeSH
- antifungální látky aplikace a dávkování MeSH
- časná diagnóza MeSH
- debridement MeSH
- DNA fungální chemie genetika MeSH
- dopravní nehody MeSH
- dospělí MeSH
- histocytochemie MeSH
- infekce v ráně diagnóza mikrobiologie patologie MeSH
- lidé MeSH
- mezerníky ribozomální DNA chemie genetika MeSH
- mikroskopie MeSH
- Mucorales klasifikace genetika izolace a purifikace MeSH
- mukormykóza diagnóza mikrobiologie patologie MeSH
- rány a poranění komplikace MeSH
- sekvenční analýza DNA MeSH
- výsledek terapie MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- kazuistiky MeSH
- MeSH
- diagnostické techniky molekulární metody přístrojové vybavení MeSH
- klinické laboratorní techniky * metody přístrojové vybavení MeSH
- kultivační vyšetření krve metody přístrojové vybavení MeSH
- laboratoře nemocniční * MeSH
- laboratorní automatizace MeSH
- laboratorní informační systémy MeSH
- mikrobiologické techniky metody přístrojové vybavení MeSH
- polymerázová řetězová reakce metody přístrojové vybavení MeSH
- sérologické testy metody MeSH
- vojenské nemocnice * MeSH
Spread of carbapenemase-producing bacteria has been described all over the world. This phenomenon may be accelerated by many factors, including wars and natural disasters. In this report, we described an NDM-1-producing Klebsiella pneumonia ST11 recovered from a patient injured during the Maidan revolution in Ukraine. To our knowledge, this is the first report of a carbapenemase-producing Enterobacteriaceae in Ukraine and one of several reports describing wound colonization/infection of humans injured during war.
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
Autory je předložen přehled aktuálně dostupných informací o syndromu toxického šoku (TSS – toxic shock syndrome) – život ohrožujícím onemocnění, v jehož patogenezi sehrávají klíčovou úlohu toxiny grampozitivních bakterií Staphylococcus aureus a Streptococcus pyogenes. Autoři se věnují epidemiologii a patogenezi onemocnění, upozorňují na důležitá anamnestická data i klinické známky, které by mohly na rozvoj TSS poukazovat. V neposlední řadě zmiňují současný pohled na adekvátní diagnostiku a terapii v případě rozvíjejícího se či již rozvinutého syndromu. Pro názornost je referát doplněn popisem vlastních klinických případů, které demonstrují dvě etiologicky odlišné formy této poměrně vzácné nozologické jednotky.
The authors present an up-to-date review of toxic shock syndrome (TSS) – a life-threatening condition where toxins of the Gram-positive bacteria Staphyloccocus aureus and Streptococcus pyogenes play a key role in the pathogenesis. The authors provide insight into the epidemiology and pathogenesis of the disease and point out the relevant patient history data and clinical signs and symptoms that may indicate progression of TSS. Last but not least, the state of the art diagnostic and therapeutic approaches to early and full blown TSS are summarized. Case reports are presented to illustrate two different etiological forms of this relatively rare nosological entity.
- MeSH
- antibakteriální látky terapeutické užití MeSH
- bolest etiologie MeSH
- C-reaktivní protein MeSH
- cytotoxiny fyziologie imunologie metabolismus MeSH
- debridement MeSH
- dospělí MeSH
- edém etiologie MeSH
- erytém etiologie terapie MeSH
- exantém etiologie MeSH
- exotoxiny metabolismus MeSH
- hemodynamika účinky léků MeSH
- hospitalizace MeSH
- imunitní systém - jevy fyziologie imunologie účinky léků MeSH
- intravenózní imunoglobuliny MeSH
- kalcitonin MeSH
- klindamycin terapeutické užití MeSH
- lidé MeSH
- modely nemocí na zvířatech MeSH
- multiorgánové selhání etiologie mikrobiologie MeSH
- myši MeSH
- otorinolaryngologické chirurgické výkony využití MeSH
- peniciliny MeSH
- pleurální výpotek etiologie terapie MeSH
- pooperační komplikace diagnóza etiologie imunologie patofyziologie terapie MeSH
- respirační insuficience etiologie terapie MeSH
- rizikové faktory MeSH
- septický šok * diagnóza epidemiologie etiologie patofyziologie terapie MeSH
- směrnice pro lékařskou praxi jako téma MeSH
- stafylokokové infekce etiologie imunologie patologie MeSH
- Staphylococcus aureus izolace a purifikace patogenita MeSH
- Streptococcus pyogenes izolace a purifikace MeSH
- streptokokové infekce etiologie imunologie patologie MeSH
- T-lymfocyty fyziologie imunologie metabolismus MeSH
- výsledek terapie MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- myši MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
