Východiska: Ferroptóza je jedním z nově objevených typů buněčné smrti. Je geneticky, morfologicky i biochemicky odlišitelná od dalších typů programované buněčné smrti, jako je nekróza, apoptóza i autofagie. Pro indukci ferroptózy je důležitá hladina volného železa uvnitř buněk a tvorba reaktivních kyslíkových radikálů (reactive oxygen species - ROS), které aktivují mechanizmy vedoucí k buněčné smrti. K indukci ferroptózy může dojít prostřednictvím inhibice jednoho ze dvou klíčových procesů. Prvním je zablokování přenosu cystinu do buněk pomocí cystin/glutamátového transportního systému (Xc-), neboť cystin slouží jako prekurzor k syntéze glutathionu, hlavního buněčného antioxidantu. Druhým je inhibice glutathion peroxidázy 4, která chrání buňky před peroxidací lipidů. Ferroptóza bývá asociovaná s mnoha metabolickými poruchami, vč. neurologických chorob nebo rakoviny. Molekuly zapojené do drah aktivujících ferroptózu se podílejí na obraně buněk před stresovými podmínkami, napomáhají udržovat hladinu nikotinamidadenindinukleotidfosfátu, glutathionu a homeostázu železa. Důležitá je také spojitost s autofagií. Pomocí tzv. ferritinofagie dochází k uvolňování železa z lysozomů do cytosolu buněk. Následnou kaskádou reakcí uvolněných nestabilních atomů železa s jinými molekulami dochází k produkci ROS a iniciaci buněčného stresu, jež je spouštěčem ferroptózy. U onemocnění, jako je rakovina, při které jsou mechanizmy indukující buněčnou smrt, vč. apoptózy potlačeny obvykle z důvodu genetických změn, může indukce alternativního způsobu buněčné smrti představovat atraktivní léčebnou strategii. Závěr: V posledních letech je výzkum nových protinádorových léků směřován na aktivaci alternativních drah buněčné smrti, které mohou překonat narušené metabolické procesy uvnitř rakovinných buněk nebo rezistenci buněk k běžně podávané chemoterapii. Byla nalezena celá řada molekul, které mohou ferroptózu v nádorových buňkách indukovat, což dodává jejímu výzkumu na významu, neboť by mohl vést k objevu nových alternativ při léčbě nádorových onemocnění.

Background: Ferroptosis is a recently discovered type of cell death. It is genetically, morphologically, and biochemically distinct from other types of programmed cell death, such as necrosis, apoptosis, and autophagy. The level of intracellular free iron and reactive oxygen species formation are important for ferroptosis activation, which can occur through either of two key inhibitory processes. The first one involves inhibition of cystine transfer into cells by the cystine/glutamate antiporter system (Xc-). Cystine serves as a precursor for the synthesis of glutathione, a major cellular antioxidant. The second one involves the inhibition of glutathione peroxidase 4, which protects cells from lipid peroxidation. Ferroptosis is associated with many metabolic disorders, including neurological diseases and cancer. Molecules involved in the activation of ferroptotic pathways are involved in protecting cells against stress conditions, and in the maintenance of nicotinamide adenine dinucleotide phosphate and glutathione levels, as well as iron homeostasis. Also important is the connection with autophagy, so called ferritinophagy, in which iron is released from lysosomes into the cytosol. Cascade reactions of free unstable iron atoms with other molecules result in the production of reactive oxygen species that initiate the cellular stress that triggers ferroptosis. In diseases such as cancer where cell death inducing mechanisms, including apoptosis, are usually suppressed by genetic changes, the induction of alternative pathways leading to cell death could provide an attractive treatment strategy. Conclusion: In recent years, research into new antimetastatic drugs has focused on the activation of alternative cell death pathways that might overcome disturbed metabolic processes inside cancer cells or the chemotherapy resistance acquired in the course of routine treatment. A number of molecules have been found to induce ferroptosis in tumor cells, suggesting that they may offer new alternatives for anticancer treatment.

• Klíčová slova
• ferritinofagie, buněčný stres,
• MeSH
• autofagie MeSH
• buněčná smrt * MeSH
• ferroptóza MeSH
• lidé MeSH
• nádory * terapie   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH

Východiska: Nesteroidní protizánětlivé léky (non-steroidal anti-inflammatory drugs - NSAID) představují skupinu léků inhibujících enzym cyklooxygenázu (COX) a vykazujících účinek analgetický, antipyretický a antiinflamatorní. Díky své efektivitě, dobré toleranci a snadné dostupnosti patří k celosvětově nejvíce užívaným lékům. Již několik desítek let přibývají důkazy o jejich protinádorovém účinku, přičemž největší množství publikovaných prací se týká kolorektálního karcinomu (colorectal cancer - CRC). Na základě výsledků pokusů in vitro a in vivo a dat získaných z epidemiologických a klinických studií se v současné době diskutuje o možnosti nasazení NSAID zejména v rámci tzv. chemoprevence CRC, jejímž cílem je zabránit vzniku nebo rekurenci prekanceróz a nádorů. Nadějným lékem v této indikaci je acetylsalicylová kyselina (acetylsalicylic acid - ASA), která je nejstarším, více než 100 let používaným členem rodiny NSAID. Předpokládá se, že neselektivní ireverzibilní inhibice COX je důležitým, nikoli však jediným mechanizmem jejího protinádorového účinku. Širšímu využití v chemoprevenci CRC brání nedostatečně definovaná cílová skupina pacientů a zejména pak obavy z gastrointestinální a renální toxicity vyvolané zvláště při jejím dlouhodobém užívání. Cíl: Předkládaná přehledová práce seznamuje s úlohou COX v nádorové biologii CRC a poukazuje na výsledky nejzajímavějších experimentů objasňujících protinádorový efekt ASA. V neposlední řadě rozebírá nejdůležitější publikované klinické analýzy chemopreventivního účinku ASA u CRC a hodnotí aktuální situaci.

Background: Non-steroidal anti-inflammatory drugs (NSAID) represent a group of medicaments inhibiting cyclooxygenase (COX) enzyme, and, in parallel, these drugs show also analgesic, antipyretic and anti-inflammatory effects. Due to their efficiency, good tolerance and easy availability, they belong to the world's most used drugs. For decades, evidence of their anti-tumor activity has been growing, with the largest amount of published work being related to colorectal cancer (CRC). Based on both in vitro and in vivo experiments and data obtained from epidemiological and clinical studies, potential application of NSAID as chemo-preventive treatment for CRC patients is recently discussed in order to prevent development or recurrence of precanceroses and tumors. Promising treatment for such indication would be acetylsalicylic acid (ASA), which is the oldest, more than 100 years used member of the NSAID family. Nonselective irreversible COX inhibition is an important but probably not solely mechanism of its anticancer activity. Notably, wider use of ASA in chemoprevention is also prevented due to particular concerns about gastrointestinal and renal toxicity caused especially by its long-term use. Aims: This review introduces the role of COX in tumor biology of CRC and highlights the results of the most interesting experiments illustrating the anti-tumor effect of ASA. Moreover, our work evaluates the most important published clinical analyzes of the ASA chemopreventive effect on CRC and discusses the current state.

• MeSH
• antiflogistika nesteroidní terapeutické užití   MeSH
• Aspirin * terapeutické užití   MeSH
• chemoprofylaxe * metody   MeSH
• cyklooxygenasy MeSH
• klinická studie jako téma MeSH
• kolorektální nádory * prevence a kontrola   MeSH
• lidé MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH

Východiska: Vzhledem k nezastupitelné úloze chemoterapie při léčbě nádorových onemocnění se onkologický výzkum zaměřil na zvýšení účinnosti jednotlivých léčiv a maximální zmírnění, ne-li kompletní potlačení nežádoucích účinků. Vhodná léčba je primárně volena podle základních klinicko-patologických diagnostických kritérií, jako je velikost nádoru, stupeň diferenciace a přítomnost či absence standardních markerů. Situaci však komplikuje variabilita mezi jednotlivými pacienty spolu se značnou heterogenitou vlastního nádoru. Detailní charakterizace intratumorální heterogenity a získání spolehlivějších ukazatelů účinnosti léčiv by tak mělo vést k posílení personalizované terapie. Vývoj a výběr spolehlivých modelů tudíž představuje důležitou otázku ve výzkumu zaměřeném na predikci citlivosti nádorových buněk k léčbě. Cíl: Práce shrnuje poznatky o testovacích systémech zaměřených na stanovení citlivosti či rezistence nádorových buněk k chemoterapii a jejich zavádění do onkologické praxe od prvních dnes již historických pokusů až po současnost se snahou posoudit jejich uplatnění ve stávající klinické praxi či blízké budoucnosti. Značný důraz je kladen na porovnání 2D a 3D in vitro buněčných modelů, neboť jejich význam a popularita konstantně narůstá. Pozornost je též věnovaná systémům in vivo, které v poslední době zaznamenaly nemalý progres a jsou v rámci klinických studií testovány k predikci odpovědi na podávanou terapii. Závěr: Práce uvádí stručný přehled testů chemosenzitivity a hodnotí význam jednotlivých testů vzhledem k jejich zapojení do rozhodovacího procesu a stratifikace pacientů s cílem predikovat klinickou odpověď konkrétních pacientů a přispět tak k rozvoji cílené personalizované terapie.

Background: Due to the irreplaceable role of chemotherapy in cancer treatment, research has focused on improving the efficacies of individual drugs and minimizing, or completely suppressing, their negative side effects. Based on long-term experience and the results of clinical trials, the selection of appropriate treatment is currently based on classical clinical diagnostic criteria, such as tumor size, grade, and the presence or absence of standard markers. However, complications arise due to variability between patients and tumor heterogeneity. Characterization of intratumoral heterogeneity and acquisition of more reliable drug performance indicators should improve personalized therapy. Development and selection of suitable models are therefore important issues in cancer research focused on predicting sensitivity to therapy. Aim: This work provides an overview of various chemosensitivity tests that have been previously employed and those that are currently used. Great emphasis is placed on comparing 2D and 3D cell culture models, since their importance and popularity are increasing. Particular attention is paid to in vivo systems, which have significantly improved recently and are tested in clinical trials to predict responses to therapy. Conclusion: This work provides a brief overview of chemosensitivity tests, focusing on the importance of individual tests and their application in decision-making and patient stratification to improve the clinical responses of patients and the development of targeted personalized therapy.

• MeSH
• biologické modely MeSH
• cytotoxické testy imunologické MeSH
• individualizovaná medicína MeSH
• lidé MeSH
• nádorové buněčné linie MeSH
• nádory * farmakoterapie   MeSH
• preklinické hodnocení léčiv * MeSH
• techniky tkáňových kultur * metody   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH

The tumor suppressor p53 plays a key role in malignant transformation and tumor development. However, the frequency of p53 mutations within individual types of cancer is different, suggesting the existence of other mechanisms attenuating p53 tumor suppressor activity. Changes in upstream regulators of p53 such as MDM2 amplification and overexpression, expression of viral oncoproteins, estrogen receptor signaling, or changes in p53 transcriptional target genes were previously described in wild-type p53 tumors. We identified a novel pathway responsible for attenuation of p53 activity in human cancers. We demonstrate that AGR2, which is overexpressed in a variety of human cancers and provides a poor prognosis, up-regulates DUSP10 which subsequently inhibits p38 MAPK and prevents p53 activation by phosphorylation. Analysis of human breast cancers reveals that AGR2 specifically provides a poor prognosis in ER+ breast cancers with wild-type p53 but not ER- or mutant p53 breast cancers, and analysis of independent data sets show that DUSP10 levels also have prognostic significance in this specific sub-group of patients. These data not only reveal a novel pro-oncogenic signaling pathway mediating resistance to DNA damaging agents in human tumors, but also has implications for designing alternative strategies for modulation of wild-type p53 activity in cancer therapy.

• MeSH
• aktivace enzymů účinky léků   MeSH
• chemorezistence MeSH
• dospělí MeSH
• fosfatasy MAP kinas metabolismus   MeSH
• fosfatasy s dvojí specifitou metabolismus   MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mitogenem aktivované proteinkinasy p38 metabolismus   MeSH
• nádorové buněčné linie MeSH
• nádorový supresorový protein p53 metabolismus   MeSH
• nádory prsu farmakoterapie   metabolismus   patologie   MeSH
• nádory farmakoterapie   metabolismus   patologie   MeSH
• proteiny metabolismus   MeSH
• protinádorové látky farmakologie   MeSH
• prsy účinky léků   metabolismus   patologie   MeSH
• senioři MeSH
• signální transdukce * účinky léků   MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

Východiska: K léčbě onkologických onemocnění se používají kombinace postupů založených nejčastěji na chirurgickém odstranění nádoru, radioterapii, chemoterapii či hormonální terapii, přičemž samotný chirurgický zákrok většinou představuje stěžejní krok pro odstranění nádorové masy. Je ovšem často provázen problémy s určením ohraničení nádoru. Chirurg má před operací k dispozici pouze informace z předoperačních vyšetření, která naznačují lokalizaci a rozsah nádoru, ale neurčí jasné hranice mezi nádorovou a zdravou tkání. Tuto oblast ve většině případů nelze rozeznat zrakem či hmatem, a pokud není nádor zcela odstraněn, musí pacient podstoupit reoperaci. Cíl: Nové technologie vyvíjené ve výzkumných centrech umožňují operatérovi získat informace o stavu nádorové tkáně v reálném čase přímo na operačním sále v průběhu chirurgického zákroku. Patří mezi ně přístroje MarginProbe, Spectropen a spektroskopický tkáňový skener. Další skupinu tvoří zobrazovací techniky využívající hmotnostní spektrometrii k určování tkáňové specifičnosti. V posledních letech prošla obrovským vývojem technika intraoperativní hmotnostní spektrometrie (REIMS). Využívá elektronický skalpel, kterým chirurg provádí řez tkáně, přičemž vznikající aerosol je odváděn do hmotnostního spektrometru, jenž během několika desetin sekund získá hmotnostní spektra fosfolipidů specifických pro operovanou tkáň (nádorovou či zdravou). V České republice se již tato technologie využívá ve výzkumu k detekci koncentrace léčiva deponovaného v nádorové a zdravé tkáni myší trpících melanomem. Získané výsledky ukazují, že pomocí tohoto přístroje by bylo možné zásadním způsobem ovlivnit léčbu i její účinnost u onkologických onemocnění. O těchto nových technologiích vás v článku budeme podrobněji informovat a seznamovat s jejich principy a využitím.

Background: The treatment of oncological diseases is based on the combination of surgery, representing the key step for the removal of the tumor tissue, radiotherapy, chemotherapy, and hormone therapy. However, the surgery is often accompanied by issue of determining the boundaries of the tumor. Prior the operation, the surgeon has information on preoperative ndings, which indicate the location a

• Klíčová slova
• MarginProbe, SpectroPen, Ramanův skener, REIMS,
• MeSH
• hmotnostní spektrometrie dějiny   využití   MeSH
• lidé MeSH
• mikroskopie metody   využití   MeSH
• molekulární patologie metody   MeSH
• nádory podle lokalizace MeSH
• nádory * chirurgie   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH

• MeSH
• banky biologického materiálu MeSH
• molekulární biologie MeSH
• nádory diagnóza   terapie   MeSH
• výzkum MeSH
• Publikační typ
• abstrakty MeSH
• kongresy MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• molekulární biologie, molekulární medicína

Hydrogen/deuterium exchange connected with mass spectrometry is increasingly applied for the interrogation of protein conformation, mapping protein dynamics, identification of protein-ligand interaction sites, and allosteric conformation changes. The dynamics of protein changes is determined with the m/z value of deuterated and non-deuterated protein or percentage of deuterium incorporation for the digested peptides. Hydrogen/deuterium exchange data are processed with selected software and finally quaternary structure of protein is visualized showing how different protein and ligand chains hook up with each other. Obtained results can help understand how protein interacts with its ligand and elucidate the role of this complex in a living organism. Utilization of this method is demonstrated by the amyloid-beta peptide aggregation associated with Alzheimer´s disease; determination of the structure toxin-co-regulated pili Vibrio cholerae in connection with its pathogenesis or revelation of binding sites on Mouse double minute 2 homolog complex with small molecule Nutlin-3 which is important for elucidation of drug effects in cancer research.

• MeSH
• alosterické místo účinky léků   MeSH
• Alzheimerova nemoc etiologie   MeSH
• hmotnostní spektrometrie * metody   využití   MeSH
• konformace proteinů MeSH
• lidé MeSH
• ligandy MeSH
• mapování interakce mezi proteiny * využití   MeSH
• nádory MeSH
• peptidové mapování metody   využití   MeSH
• simulace molekulární dynamiky využití   MeSH
• vazba proteinů * MeSH
• výzkum MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH
• přehledy MeSH

Migrace a invazivita jsou fenotypovými vlastnostmi buněk, které významně přispívají k průběhu žádoucích fyziologických dějů, jako je hojení ran či embryogeneze, i k velmi závažným patologickým procesům, především pak k metastazování nádorů. Dostupnost vhodných metod studia migračních a invazivních vlastností buněk je tedy zásadní pro pochopení molekulární podstaty těchto dějů a v případě nádorových onemocnění je migrační, invazivní a metastatický potenciál nádorových buněk klíčovým faktorem určujícím klinickou prognózu pacienta. Tento článek podává přehled základních metod in vitro a in vivo, které se využívají při studiu buněčné migrace, invazivity a mechanizmů metastazování nádorů. In vitro metody studia buněčné migrace zahrnují jednoduché dvourozměrné testy (scratch‑wound assay a test založený na účinku hepatocytárního růstového faktoru) a dále metody využívající účinku chemotaxe (Dunnova komůrka, videomikroskopie buněk a použití nosičů s chemoatraktanty). Metody pro studium buněčné migrace a invazivity in vitro zahrnují složitější systémy založené na principu Boydenovy komůrky (Transwell migrační/invazivní test, analýza buněčné migrace a invazivity pomocí systému xCELLigence, a analýzy prováděné s využitím konfokální mikroskopie) a rovněž pak metodu studia buněčné migrace v mikrokanálcích. Přehled in vivo metod shrnuje základní organizmy a metody užívané ke studiu buněčné migrace a invazivity s hlavním důrazem na studium metastazování in vivo v myších modelech. Popsané metody se uplatňují především ve výzkumných projektech zaměřených na vývoj nových dia­gnostických a terapeutických přístupů v onkologii.

Migration and invasiveness are phenotypic characteristics of cells that contribute to physiological processes, such as wound healing or embryogenesis and they are involved in serious pathological processes, namely in tumor cell metastasis. Availability of methods for studying migration and invasiveness of the cells is important for understanding molecular basis of these processes. In the case of cancer, migration, invasiveness and metastatic potential of tumor cells are key factors that determine clinical prognosis of the patients. This communication provides an overview of in vitro and in vivo methods which are used to study cell migration, invasion and metastasis. In vitro meth­ods for studying cell migration include simple two‑dimensional assays (scratch – wound assay and the assay based on the effect of hepatocyte growth factor) and methods based on chemotaxis (Dunn‘s chamber, videomicroscopy of cells, the use of carriers with chemoattractants). Methods for studying both cell migration and invasiveness in vitro include more complex systems based on the principle of the Boyden chamber (transwell migration/invasive test, analysis of cell migration and invasion in xCELLigence system, confocal microscopy based approaches) as well as analysis of cell migration in micro‑channels. Our overview of in vivo methods provides an introduction into model organisms and methods used in this field, with an emphasis on the study of cancer metastasis in mouse models. The methods described in this review are mainly involved in larger research projects aiming at developing new dia­gnostic and therapeutic approaches in oncology. Key words: migration – invasiveness – in vitro assays – in vivo models – metastasis – tumor cells This work was supported by the project of Czech Science Foundation No. 14-19250S, by the European Regional Development Fund and the State Budget of the Czech Republic (RECAMO, CZ.1.05/2.1.00/03.0101) and by MH CZ – DRO (MMCI, 00209805). The authors declare they have no potential conflicts of interest concerning drugs, products, or services used in the study. The Editorial Board declares that the manuscript met the ICMJE “uniform requirements” for biomedical papers. Submitted: 27. 1. 2014 Accepted: 31. 3. 2014

• Klíčová slova
• in vitro assaye, in vivo modely, scratch-wound assay, scatter test, Boydenova komůrka, Dunnova komůrka,
• MeSH
• analýza buněčné migrace * metody   přístrojové vybavení   MeSH
• buněčné kultury * metody   MeSH
• chemotaxe MeSH
• invazivní růst nádoru * MeSH
• konfokální mikroskopie MeSH
• kultivační média MeSH
• metastázy nádorů MeSH
• mikrofluidika MeSH
• nádorové buněčné linie MeSH
• pohyb buněk MeSH
• videomikroskopie MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• zvířata MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH

PCR metoda se velmi krátce od svého objevení stala rutinní metodou molekulárně bio­logických výzkumných laboratoří a nepostradatelným nástrojem dia­gnostické medicíny. Za dobu svého využívání byla rozvinuta do řady variant, které specificky reagují na potřeby výzkumu a dia­gnostiky co do použitého vstupního materiálu a jeho množství, podmínek reakce a nově vyvinutých technologií. Předložená práce stručně shrnuje jednotlivé PCR přístupy s důrazem na jejich využití v onkologickém výzkumu a praxi.

Since its discovery, PCR has become a conventional method of molecular bio­logy research laboratories and an indispensable tool in dia­gnostic medicine. Multiple variants of the PCR technique were developed, which enable the analysis of different bio­logical materials at different amounts and reaction conditions. This article briefly summarizes the PCR approaches and points out their applications in oncological research and practice. Key words: polymerase chain reaction (PCR) – real‑time PCR – digital PCR – clinical oncology This work was supported by the European Regional Development Fund and the State Budget of the Czech Republic (RECAMO, CZ.1.05/2.1.00/03.0101), BBMRI_CZ (LM2010004), GACR 13-00956S and by MH CZ – DRO (MMCI, 00209805). The authors declare they have no potential conflicts of interest concerning drugs, products, or services used in the study. The Editorial Board declares that the manuscript met the ICMJE “uniform requirements” for biomedical papers. Submitted: 10. 2. 2014 Accepted: 1. 4. 2014

• Klíčová slova
• digitální PCR,
• MeSH
• kvantitativní polymerázová řetězová reakce * metody   MeSH
• lékařská onkologie MeSH
• lidé MeSH
• mutace genetika   MeSH
• nádory * diagnóza   genetika   MeSH
• polymerázová řetězová reakce * dějiny   metody   trendy   MeSH
• polymorfismus genetický genetika   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH

Nádory jsou geneticky a klinicky velmi různorodá onemocnění, a proto se v poslední době řada proteomických studií zabývá hledáním bio­markerů, které by usnadnily prognostiku, dia­gnostiku či léčbu onkologických onemocnění. Účinným nástrojem je hmotnostní spektrometrie umožňující identifikaci, kvantifikaci a charakterizaci bio­molekul v komplexních bio­logických vzorcích. Prvním krokem vedoucím k selekci bio­markerů je tzv. discovery proteomika, jejímž cílem je detailní analýza vzorků směřující ke zmapování a porovnání přítomných proteinů a výběru vhodných kandidátů na potenciální bio­markery. V dalším kroku proteomické analýzy probíhá verifikace vybraných bio­markerů tzv. cílenou (targeted) proteomikou, jejímž úkolem je ověření přítomnosti a kvantity daného proteinu v analyzovaných, přesně klinicky definovaných vzorcích. Předložený článek je zaměřen na popis různých typů metod vhodných pro kvantitativní analýzu proteinů využívající hmotnostní spektrometrií.

Cancers are genetically and clinically very heterogeneous diseases; therefore, various proteomic studies have been trying to find bio­markers which can facilitate prognosis, dia­gnosis or treatment of these oncological diseases. The mass spectrometry is an effective tool for identification, quantitation, and characterization of bio­molecules in the complex bio­logical samples. The first step suitable for selection of bio­markers called discovery proteomics provides a detailed analysis of the samples contributing to the identification of proteins, comparison of their presence in the samples, and selection of the convenient candidates for the prospective bio­markers. The next step of proteomics analysis is directed towards verification of chosen bio­markers with the approach called targeted proteomics. This technique evaluates presence and quantity of the proteins (bio­markers) in clinically precisely defined samples. This article focuses on the description of various approaches suitable for the quantitative analysis of the proteins connected with mass spectrometry. Key words: quantitative proteomics – mass spectrometry – protein – bio­marker – oncology – cancer This work was supported by the European Regional Development Fund and the State Budget of the Czech Republic (RECAMO, CZ.1.05/2.1.00/03.0101) and by MH CZ – DRO (MMCI, 00209805). The authors declare they have no potential conflicts of interest concerning drugs, products, or services used in the study. The Editorial Board declares that the manuscript met the ICMJE “uniform requirements” for biomedical papers. Submitted: 20. 1. 2014 Accepted: 7. 4. 2014

• Klíčová slova
• kvantitativní proteomika, SILAC,
• MeSH
• hmotnostní spektrometrie * metody   MeSH
• izotopové značení MeSH
• lidé MeSH
• nádorové biomarkery * analýza   metabolismus   MeSH
• nádorové buněčné linie MeSH
• nádorové buňky kultivované * MeSH
• nádorové proteiny * analýza   metabolismus   MeSH
• nádory diagnóza   MeSH
• proteomika MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH