Cíl studie: Clostridium difficile je v současnosti významným původcem nozokomiálních průjmů, v posledních letech narůstá i počet případů infekcí vzniklých v komunitě. Od začátku roku 2010 jsme v Pardubické krajské nemocnici, a. s. (PKN) zaznamenali výrazný nárůst počtu případů infekcí Clostridium diffícile. Cílem práce bylo popsat a vyhodnotit metody používané v laboratorní diagnostice infekcí Clostridium diffícile v PKN a popsat používaný laboratorní diagnostický algoritmus. Materiál a metody: Vzorky stolic byly odebrány od symptomatických pacientů hospitahzovaných nebo vyšetřených na ambulancích PKN v období od 1. 7. 2010 do 31. 12. 2012. K detekci glutamát dehydrogenázy (GDH) a toxinu A/B byl použit duální test na principu enzymoimunoeseje C. Diff Quik Chek Complete, Techlab® (D-ELA). Ke konfirmaci byl použit systém GeneXpert PCR Cepheid® (PCR). Od začátku roku 2011 byla prováděna kultivace u všech GDH pozitivních vzorků. Výsledky: Celkem bylo vyšetřeno 2 040 vzorků. D-EIA test byl použit k vyšetření 2 014 vzorků. I 373 (68,2 %) vzorků bylo GDH a toxin A/B negativní. Ve 359 (17,8 %) vzorcích byla prokázána GDH i toxin A/B. Zjištěná senzitivita a specificita D-ElA testu pro průkaz toxigenního kmene ve vzorku stolice byla 21,8 a 97,2 %. PPV a NPV kalkulovaná pro populaci s prevalencí onemocnění 5,10,20,50 % byla 0,29, 0,46, 0,66, 0,88 a 0,96, 0,92, 0,83, 0,55. Senzitivita a specificita GDH pro detekci Clostridium diffícile ve stolici byla 100,0 a96,2%. PCR vyšetření bylo celkem provedeno u 140 vzorků. 82 vzorků bylo PCR pozitivních. Gen pro produkci toxinu B byl prokázán ve 47 %, nález suspektní pro ribotyp 027 (gen pro toxin B, binární toxin a delece tcdC) ve 48 %, u 5 % vzorků byl detekován současně gen pro toxin B a gen pro binární toxin. Závěr: Vzhledem k nízké senzitivitě EIA testu pro průkaz toxigenního kmene Clostridium diffícile, pokud je užit jako jediný, byl pro rutinní laboratorní vyšetřování infekcí Clostridium difficile na Oddělení klinické mikrobiologie PKN zaveden dvoustupňový testovaci algoritmus. Použití D-EIA testu v prvním kroku umožnilo diagnostikovat 86 % vyšetřovaných vzorků během 30 minut jako pozitivní (GDH +; toxin A/B +) nebo negativní (GDH -; toxin A/B -). Vyšetření pomocí PCR ve druhém kroku zvyšuje počet diagnostikovaných případů CDI. Výsledek testu je k dispozici do dvou hodin, což umožňuje rychlé zavedení izolačních opatření na odděleních PKN a adekvátní antibiotickou léčbu pacientů.
Background: Clostridium difficile is currently a significant cause of nosocomial diarrhea. For several years, the number of infectious cases in the community has also been increasing. Since the beginning of 2010, quite a large increase in the number of Clostridium difficile infections (GDIs) has been noted in Pardubice Regional Hospital (PRH). The objectives of this study were to describe and evaluate the methods used in the laboratory diagnosis of GDIs in PRH, and to describe the laboratory diagnostic algorithm used here. Material and methods: Samples of stools were taken from symptomatic patients hospitalized or examined in the outpatient departments of PRH from 1 July 2010 to 31 December 2012. For the detection of glutamate dehydrogenase (GDH) and toxin A/B, the dual test based upon the principle enzyme immunoassays C. Diff Quik Chek Complete, Techlab® (D-EIA) was used. The system GeneXpert PCR Cepheid® (PCR) was used for confirmation of laboratory findings. Since the beginning of 2011, all the GDH-positive samples were cultured. Results: A total of 2,040 samples were examined. The D-EIA test was used for examination of 2,014 samples. Of those, 1,373 (68.2 %) samples were GDH- and toxin A/B-negative. In 359 (17.8 %) samples, both GDH and toxin A/B were detected. The D-EIA sensitivity and specificity for detecting toxigenic strains in stool samples were 21.8 % and 97.2 %, respectively. The PPV and NPV rates calculated for the populations with prevalence rates of disorders of 5 %, 10 %, 20 % and 50 % were 0.29, 0.46, 0.66, 0.88 and 0.96, 0.92, 0.83,0.55, respectively. The sensitivity and specificity of GDH for the detection of Clostridium difficile in stools were 100.0 % and 96.2 %, respectively. PCR examination was carried out in 140 samples. Of those, 82 samples were PCR- positive. The gene for the production of toxin B was detected in 47 %, the finding suspected for ribotype 027 (gene for toxin B, binary toxin and deletion of tcdC) in 48 %. In 5 % of the samples, the gene for toxin B and the gene for the binary toxin were detected. Conclusion: Considering the low sensitivity of the D-EIA test for detecting the toxigenic strain of Clostridium difricile, if used as the only one, a two-step algorithm was introduced for routine laboratory examination of infections with Clostridium difRcile in the Clinical Microbiology Department of PRH. In the first step, the D-EIA test diagnosed 86 % of examined samples in 30 minutes as positive (GDH +; toxin A/B -i-) or negative (GDH -; toxin A/B -). The examination with PCR in the second step increased the number of patients diagnosed with GDI. The test results are available within two hours. This enables quick introduction of isolation measures in the departments of PRH and appropriate antibiotic treatment of the patients.
Zažívací trakt je nejčastější (až 40%) lokalizací primárních mimouzlinových forem non-hodgkinských lymfomů. Téměř polovinu tvoří indolentní formy, především MALT lymfomy. Vývoj MALT lymfomu je dočasně závislý na antigenní stimulaci Helicobacter pylori. Více než 90 % nemocných s MALT lymfomem žaludku je sérologicky pozitivních na přítomnost protilátek proti H. pylori, ale histologicky či kultivačně se v bioptátu prokáže pouze u necelých 60 %. Antibiotická léčba infekce H. pylori může u lokalizovaného stadia MALT lymfomu vést k úplné regresi onemocnění bez jakékoliv protinádorové terapie. Naším příspěvkem formou kazuistiky chceme upozornit na toto onemocnění v souvislosti s možností antibiotické terapie tohoto nádoru.
Gastrointestinal tract is the most commonly (40 %) affected site of the extranodal forms of primary non-Hodgkin's lymphomas. Almost half of them are indolent lymphomas, mainly MALT lymphomas. The development of MALT lymphoma temporarily depends on antigen stimulation of Helicobacter pylori. More than 90 % of MALT lymphoma patients are positive for Helicobacter pylori antibodies, but the positivity of biopsy is present in only 60 % of them. Antibiotic therapy in Helicobacter pylori infection may lead to complete regression of the locahzed primary gastric lymphoma of the MALT type without any anti-tumour therapy. The aim of the case report is to present the disease in the context of possible antibiotic therapy of the tumour.
- Klíčová slova
- mouzlinové formy, non-hodgkinský lymfom,
- MeSH
- dospělí MeSH
- Helicobacter pylori MeSH
- infekce vyvolané Helicobacter pylori farmakoterapie komplikace MeSH
- lidé MeSH
- lymfom z B-buněk marginální zóny diagnóza mikrobiologie patologie MeSH
- nádory žaludku diagnóza mikrobiologie patologie MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
Tato kazuistika popisuje účinek léčby přípravkem Ecosin (registrovaná forma Pythium oligandrum pro zvířata) u kotěte britské kočky, u kterého byla klinicky a laboratorně diagnostikována dermatofytóza. Jako původce onemocnění bylo diagnostikováno Microsporum canis. Kotěti byla opakovaně aplikována koupel v přípravku Ecosin, který obsahuje živé kultury mykoparazitické houby Pythium oligandrum. Byly aplikovány tři celotělové koupele s týdenním odstupem a lokální aplikací přípravku, pokaždé druhý den po koupeli. Klinické vyšetření kotěte týden od ukončení aplikací již neprokázalo žádné příznaky dermatomykózy, negativní byly také kontrolní kultivace a trichoskopické vyšetření. Léčba přípravkem obsahujícím P. oligandrum byla bez jakýchkoli komplikací, bez nežádoucích i vedlejších účinků.
Presented case report describes therapeutical effect of biologic preparation Ecosin (registered form of mycoparasitic fungus Pythium oligandrum for animals) in a kitten of British shorthair cat, in which dermatophythosis has been diagnosed by means of clinical and laboratory examinations. Microsporum canis was identified as causal organism. The kitten was repeatedly treated by Ecosin in form of bath. Overall three baths were applied in a week interval and local administration of Ecosin was performed next day after each bath. No clinical symptoms were presented and both mycologic cultivation and trichoscopic examinations were negative after this medication. No adverse effect was recorded during and after treatment of the kitten by Ecosin.
- MeSH
- dermatitida * diagnóza terapie veterinární MeSH
- klinické laboratorní techniky MeSH
- kočky MeSH
- Microsporum * MeSH
- mykózy * terapie MeSH
- nemoci koček MeSH
- Pythium * MeSH
- zoonózy MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- kočky MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
Obecně lze k diagnostice infekce Helicobacter pylori (H. pylori) užít metod invazivních a neinvazivních. Jednou z neinvazivních metod, kdy není potřeba endoskopického vyšetření pacienta, je kromě dechového testu a detekce antigenu ve stolici i sérologické vyšetření protilátek. Stanovují se protilátky ve všech třídách IgM, IgG, IgA. Hodnocení se provádí metodou ELISA se senzitivitou 82–96 % a specificitou 67–92 %. Konfirmace pomocí Westernblot testu pak umožňuje přesnější stanovení infekce a současně lze identifikovat jednotlivé specifické protilátky proti antigenní strukturám H. pylori. Umožňuje stanovení proti CagA antigenu, který je považován za důležitý marker virulence. V práci je zpracován soubor 447 sér od pacientů metodou ELISA na stanovení protilátek proti H. pylori ve třídách IgG a IgA v letech 2009–2010 (od roku 2010 i ve třídě IgM). Současně jsou předloženy i dvě zajímavé kazuistiky.
Generally, it is possible to use both invasive and non-invasive methods for the diagnosis of Helicobacter pylori infection. One of the non-invasive methods not requiring endoscopic examination of the patient is, besides the breath test and stool antigen test, serological detection of the antibodies. Antibodies are determined in the IgM, IgG and IgA classes using the ELISA method with a sensitivity of 82–96 % and specificity of 67–92 %. Confirmation with the Western blot allows more precise specification of the infection. At the same time, it is possible to identify individual specific antibodies against Helicobacter pylori antigens. It allows determination of antibodies against CagA which is considered an important virulence marker. The study comprised 447 sera from patients tested by ELISA to determine antibodies against Helicobacter pylori in the IgG and IgA classes in 2009–2010 (since 2010 also in the IgM class). Additionally, two interesting case reports are presented.
- Klíčová slova
- IgM, IgA, IgG,
- MeSH
- dospělí MeSH
- ELISA MeSH
- Helicobacter pylori imunologie MeSH
- infekce vyvolané Helicobacter pylori diagnóza MeSH
- lidé MeSH
- protilátky bakteriální krev MeSH
- senzitivita a specificita MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
Cíl práce: Cílem práce bylo zjistit incidenci iníekcí krevního řečiště spojených se zdravotní péčí (NIKR) v Pardubické krajské nemocnici, a. s. (PKN) a zavést systém pravidelného sledování těchto infekcí. Materiál a metody: V letech 2008-2009 byly u pacientů hospitalizovaných v Pardubické krajské nemocnici, a. s. sledovány mikrobiologicky potvrzené případy infekce krevního řečiště. V případě pozitivní hemokultury byl založen na oddělení klinické mikrobiologie protokol, který byl doplněn z nemocničního informačního systému a posléze po zhodnocení ošetřujícím lékařem a lékařem Týmu pro kontrolu infekcí uzavřen. Výsledky: Během prospektivního celonemocničního sledování NIKR v PKN bylo zaznamenáno celkem 207 případů NIKR u 185 pacientů (incidence 0,5 případů NIKR na 1 000 ošetřovacích dnů). 59,4 % bylo v souvislosti s intenzivní péčí (oddělení ARO a JIP), 38 % byly katétrové infekce krevního řečiště. Nejčastějším zdrojem u sekundárních NIKR bylo močové ústrojí (26 %). Celkem bylo izolováno 230 mikrobiálních kmenů, 9,1 % případů bylo polymikrobiální etiologie. Nejčastějším původcem byl Stsiphylococcus aureus (17 %), na druhém a třetím místě Klebsiella pneumonie (14,3 %) a Serratia marcescens (13 %). 25,6 % kmenů Staphylococcus aureus bylo rezistentních k methicilinu. Celkem bylo odebráno 13 hemokultur/1 000 ošetřovacích dnů. Závěr: Zjištěná incidence NIKR je srovnatelná s výsledky zahraničních studií. Rozdílné zastoupení nejčastěji izolovaných mikrobiálnich původců je pravděpodobně odrazem konkrétní epidemiologické situace a koreluje s výsledky plošného monitorování nemocničních mikrobiálních kmenů.
Objective: The aim of the study were to find out the incidence of health care-associated bloodstream infections in the Pardubice Regional Hospital (PRH) and to introduce a system of the regular monitoring of these infections. Material and methods: In 2008-2009, the incidence of the laboratory-confirmed bloodstream infections (BSIs) was monitored in patients hospitalized in tje PRH. In the case of positive blood culture, a protocol was set up in the department of clinical microbiology. The protocol was filled in with the data from the hospital information system and then closed after the evaluation of a physician and a member of the Infection Control Team. Results: During prospective BSI monitoring in the entire PRH, 207 cases BSIs in 185 patients (incidence 0.5 cases per 1 000 patientdays) were monitored. Of these, 59.4 % were related to intensive care in the ICUs. Thirty-eight percent were catheter-associated infections. The most frequent source of secondary BSIs was the urinary system (26 %). A total of 230 pathogenic microorganisms were isolated, with 9.1 % of cases being polymicrobial. The most frequent pathogen was Staphylococcus aureus (17 %), followed by Klebsiella pneumoniae (14.3%) and Serratia marcescens (13 %). The proportion of methicilin-resistant Staphylococcus aureus was 25,6 %. A total of 13 cultures per 1 000 patient-days were collected. Conclusion: The detected incidence BSIs is comparable to thet in foreign studies. The different representation of the most frequently isolated causative agents reflects the actual epidemiological situation and correlates with the outcomes of global monitoring of hospital microbial species.
- MeSH
- bakteriemie diagnóza epidemiologie etiologie mikrobiologie MeSH
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- incidence MeSH
- infekce spojené se zdravotní péčí diagnóza epidemiologie etiologie mikrobiologie MeSH
- kojenec MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mladý dospělý MeSH
- předškolní dítě MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- kojenec MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mladý dospělý MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- předškolní dítě MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Chaetomium species have been rarely described as aetiological agents of invasive and dermatomycotic infections in humans. The majority of cases have been reported within the last two decades. Treatment failed in most of these cases. In this paper we present two cases in which Chaetomium spp. can be clearly identified as an aetiological agent in pathological conditions. In the first report, we describe a new aetiological agent, Chaetomium brasiliense, which was implicated in a case of otitis externa in a patient with spinocellular carcinoma basis cranii. The patient had been repeatedly treated for relapsing otitis externa and had previously undergone surgery several times for otitis media. The fungal aetiology was confirmed by repeated positive culture and histologic studies. The second case involved onychomycosis with strikingly brown nail discoloration due to Chaetomium globosum in an otherwise healthy patient. The nail lesion was successfully cured by oral terbinafine. The determination of both species was supported by sequencing of rDNA regions. The morphological aspect of Chaetomium spp. identification is also discussed. In vitro antifungal susceptibility tests demonstrated that both isolates were susceptible to terbinafine and azole derivates except fluconazole. Amphotericin B was effective only against the C. brasiliense strain. We review the literature to summarize clinical presentations, histologic findings, and treatment strategies.
- MeSH
- antifungální látky farmakologie MeSH
- Chaetomium klasifikace genetika izolace a purifikace MeSH
- DNA fungální chemie genetika MeSH
- fylogeneze MeSH
- histocytochemie MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mezerníky ribozomální DNA chemie genetika MeSH
- mikrobiální testy citlivosti MeSH
- mikroskopie MeSH
- molekulární sekvence - údaje MeSH
- onychomykóza diagnóza mikrobiologie MeSH
- otitis externa diagnóza mikrobiologie patologie MeSH
- phaeohyphomykóza diagnóza mikrobiologie patologie MeSH
- ribozomální DNA chemie genetika MeSH
- sekvenční analýza DNA MeSH
- Check Tag
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- kazuistiky MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
V diagnostice infekce Helicobacter pylori lze využít metody invazivní, kdy je nutné k průkazu odebrat vzorky získané biopsií při endoskopickém vyšetření, a neinvazivní, kdy endoskopie není nutná. K invazivním testům patří histologické vyšetření, kultivace, rychlý ureázový test (RUT) a molekulární metody. Mezi neinvazivní řadíme sérologické vyšetřeni protilátek, detekci antigenu ve stolici (HpsAg) a dechový test. V práci je porovnán kultivační průkaz z bioptátu a průkaz Ag ve stolici na souboru 300 pacientů, kterým byla současně s endoskopickým vyšetřením odebrána stolice.
In the diagnosis of Helicobacter pylori infection, it is possible to use either invasive methods when it is essential to take biopsy samples from endoscopic examination or non-invasive methods which do not require endoscopy. The invasive tests include histological examination, culture, rapid urease test and molecular methods. The non-invasive methods are serological tests, stool antigen detection (HpsAg) and respiratory tests. The article compares biopsy culture with stool antigen detection in a group of 300 patients in whom stool samples were collected simultaneously with endoscopic examination.
- Klíčová slova
- antigen Helicobacter pylori ve stolici (HpsAg), eradikace,
- MeSH
- antigeny bakteriální analýza MeSH
- feces mikrobiologie MeSH
- Helicobacter pylori imunologie izolace a purifikace MeSH
- infekce vyvolané Helicobacter pylori diagnóza MeSH
- jehlová biopsie MeSH
- lidé MeSH
- muži MeSH
- senzitivita a specificita MeSH
- žaludek mikrobiologie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- ženské pohlaví MeSH
