Výukové texty pro studenty lékařství obsahují tradiční témata hygieny a epidemiologie jako biomedicínského základu primární prevence nemocí v novém pojetí. Moderně je zpracována epidemiologická metodologie a epidemiologie nejvýznamnějších skupin nemocí (kardiovaskulárních, nádorových, infekčních) a závislostí (návykové látky), problematika epidemiologických studií a očkování.Učebnice slouží k uvědomění a k pochopení komplexních souvislostí mezi působením životního i pracovního prostředí a možným vznikem nemocí u jedince i v populaci.Druhé, doplněné vydání

• Klíčová slova
• Lékařské obory,
• MeSH
• environmentální zdraví MeSH
• epidemiologické metody MeSH
• epidemiologie MeSH
• fyziologie výživy MeSH
• hygiena práce MeSH
• zdraví MeSH

• NLK Obory
• hygiena
• epidemiologie

Vysokoškolská učebnice, která se zaměřuje na lékařskou biologii a genetiku.

• MeSH
• biologie MeSH
• genetika MeSH
• lékařská genetika MeSH

• Konspekt
• Obecná genetika. Obecná cytogenetika. Evoluce
• Učební osnovy. Vyučovací předměty. Učebnice
• NLK Obory
• biologie
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• učebnice vysokých škol

This project is aimed at examining clinical, neuroradiological and biochemical biomarkers of Parkinson’s disease (PD), other parkinsonian syndromes and Wilson’s disease (WD). All patients will be examined using clinical scales, cognitive battery, brain magnetic resonance imaging (MRI), transcranial sonography (TCS) and blood/cerebrospinal fluid (CSF) analysis before treatment initiation. Predicitive values of these biomarkers will be assesed with regards to clinical outcome at 9 months, 3 years and 5 years after treatment initiation. We will also examine the sensitivity/specificity of MRI, TCS and blood/CSF biomarkers in the differential diagnosis of PD. In chronically treated WD patients we will examine whether the type of ATP7B mutation, ceruloplasmin activity, hepatic dysfunction or mode of treatment will predict clinical outcome and neuroradiological parameters. Post-mortem MRI-histopathology correlation study will be performed to validate MRI data in measuring metal concentration in basal ganglia as well as in quantification of neuronal loss in substantia nigra pars compacta.

Tento projekt je zaměřen na zkoumání klinických, neuroradiologických a biochemických biomarkerů Parkinsonovy nemoci (PN), parkinsonských syndromů a Wilsonovy nemoci (WN). Všechni pacienti budou vyšetřeni před nasazením terapie pomocí klinických škál, neuropsychologické baterie, zobrazení mozku magnetickou rezonancí (MRI mozku), transkraniální sonografie (TCS) a analýzy krve/mozkomíšního moku. Prediktivní hodnota těchto biomarkerů bude zhodnocena vzhledem ke klinickému stavu pacientů 9 měsíců, 3 roky a 5 let po zahájení léčby. Dále bude stanovena senzitivita a specificita MRI, TCS a biochemických biomarkerů v diferenciální diagnostice PN. U dlouhodobě léčených pacientů s WN budeme zkoumat vztah mezi typem ATP7B mutace, enzymatickou aktivitou ceruloplasminu, stupněm jaterní léze a způsobem léčby a tíží reziduálních neurologických příznaků a neuroradiologickými nálezy. Pomocí MRI-histopatologické korelační studie plánujeme potvrdit validitu MRI ve stanovení koncentrace kovů v bazálních gangliích a kvantifikaci stupně neurodegenerace v substantia nigra pars compacta.

• MeSH
• biologické markery MeSH
• hepatolentikulární degenerace diagnostické zobrazování   MeSH
• lidé MeSH
• magnetická rezonanční tomografie MeSH
• neurodegenerativní nemoci diagnostické zobrazování   MeSH
• parkinsonské poruchy diagnostické zobrazování   MeSH
• progrese nemoci MeSH
• stupeň závažnosti nemoci MeSH
• výsledek terapie MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• neurologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

HNF1B is a transcription factor which plays a key role in ontogenesis and regulates the expression of numerous genes involved in cell cycle modulation. Epigenetic changes and mutations of HNF1B (TCF2) are involved in the tumorigenesis of certain tumors. Immuno-histochemically, these changes can be associated with the loss or overexpression of the HNF1B protein. The protein exists in several isoforms, whose number and precise characterization are presently not exactly known. Genome-wide association studies have found an association of certain single nucleotide polymorphisms with an increased or conversely decreased incidence of certain solid tumors, such as carcinomas of the prostate and endometrium. However, overall knowledge of the epigenetic and genetic changes of HNF1B and their relation to neoplasms is very limited. In our work we want to build on our previous project focused on the problematics of HNF-1B in female genital tract tumors, and extend the analysis to other types of solid tumors of this and other areas, in which HNF1B involvement in carcinogenesis can be expected.

HNF-1B je transkripční faktor, který hraje klíčovou roli při ontogenezi a reguluje expresi četných genů podílejících se na modulaci buněčného cyklu. Epigenetické změny a mutace HNF-1B (TCF2) se podílí na vzniku některých nádorů a na imunohistochemické úrovni se tyto změny mohou projevit ztrátou nebo zvýšenou expresí proteinu HNF-1ß. Protein se vyskytuje ve více izoformách, jejichž počet a přesná charakterizace však v současné době nejsou přesně známé. Celogenomové asociační studie prokázaly souvislost některých jednonukleotidových polymorfismů se zvýšenou či naopak sníženou incidencí některých solidních nádorů, jako jsou například karcinomy prostaty a endometria. Celkové znalosti týkající se epigenetických a zejména genetických změn HNF1B a jejich vztahu k nádorovým onemocněním jsou však velmi limitované. V naší práci chceme navázat na náš předchozí projekt zabývající se problematikou HNF1B u nádorů ženského genitálu a rozšířit analýzu na další typy solidních epitelových nádorů této a jiných oblastí, u kterých lze účast HNF1B v procesu karcinogeneze očekávat.

• MeSH
• epigeneze genetická MeSH
• exprese genu MeSH
• hepatocytární jaderný faktor 1-beta genetika   MeSH
• imunohistochemie metody   MeSH
• lidé MeSH
• nádory genetika   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• genetika, lékařská genetika
• onkologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

The most common cause of preterm birth is chorioamnionitis which often leads to the development of fetal inflammatory response syndrome (FIRS). FIRS is a major risk factor for perinatal mortality, but also for early ad long-term neonatal morditidy, such as impaired cardiac function, bronchopulmonary dysplasia and brain injury. FIRS is defined by increased systemic inflammatory cytokine concentrations. Recently it became clear that blood platelets and platelet microparticles play an important role in many inflammatory conditions. Our project is aimed on a study of platelet status and presence of platelet microparticles in cord blood of preterm infants with and without chorioamnionitis. We plan to utilize quantitative flow cytometry for gathering representative data and correlate the results with the clinical outcome of the enrolled preterm birth infants. The goal of our project is to develop new diagnostic method of FIRS which would allow better prediction of clinical complications and individualization of the clinical care for preterm born infants.

Chorioamnionitida je jednou z nejčastějších příčin předčasného porodu, která velmi často vede k rozvoji syndromu systémové zánětlivé odpovědi plodu (fetal inflammatory response syndrome - FIRS). FIRS je vysoce rizikovým faktorem perinatální mortality a dlouhodobé neonatální morbidity (myokardiální dysfunkce, bronchopulmonální dysplázie a poškození mozku). FIRS je definován zvýšenou systémovou koncentrací cytokinů plodu. Nedávno publikované práce prokazují, že krevní destičky a destičkové mikropartikule mají důležitou úlohu při zánětové odpovědi organismu. Náš projekt je zaměřen na zjištění stavu destiček a přítomnosti destičkových mikropartikulí v pupečníkové krvi u nedonošených dětí ve vztahu k chorioamnionitidě pomocí kvantitativní průtokové cytometrie. Výsledky dostatečně reprezentativního vzorku u nezralých novorozenců budou analyzovány ve vztahu k závažným klinickým komplikacím. Cílem našeho projektu je vývoj nové diagnostické metody FIRS, která by umožňovala lepší predikci závažných klinických komplikací a vedla k individualizaci péče u předčasně narozených dětí.

• MeSH
• chorioamnionitida diagnóza   etiologie   MeSH
• fetální krev MeSH
• infekční komplikace v těhotenství MeSH
• lidé MeSH
• mikropartikule patologie   MeSH
• morbidita MeSH
• novorozenec nedonošený MeSH
• plod cytologie   patologie   MeSH
• předčasný porod MeSH
• průtoková cytometrie MeSH
• syndrom systémové zánětlivé reakce diagnóza   etiologie   MeSH
• vyšetření funkce trombocytů MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Pediatrie
• NLK Obory
• perinatologie a neonatologie
• infekční lékařství
• cytologie, klinická cytologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Autosomal dominant tubuloinsterstitial kidney diseases (ADTKD) are characterized by autosomal dominant inheritance, pathologic tubular changes and interstitial fibrosis resulting in slowly progressive chronic kidney disease. There are four major conditions as cause of ADTKD: mutation in UMOD, REN, MUC1 or SEC61A1 gene. There are still 35% of ADTKD cases with unknown ethiology. The rate of progression is very variable in individual patients between as well as within families – something that is not yet understood – with individuals requiring renal replacement therapy between the 3rd and 5th decades of life. The aim of the project is to screen families for established genetic causes, to identify genetic and molecular origin of the disease in ADTKD families, to identify genetic factors affecting progression of the disease in individual patients and to develop methods for noninvasive diagnosis and treatment follow up of these conditions. The project should enhance knowledge on ADTKD, determine the pathophysiology, and most importantly, find cures for these conditions.

Autosomálně dominantní tubulointersticiální onemocnění ledvin (ADTKD) zahrnují vzácná pomalu progredující onemocnění ledvin, jež vedou ve 3.–5. dekádě života k renální insuficienci vyžadující transplantaci ledvin. Dosud známé kauzální geny UMOD, MUC1, REN a SEC61A1 objasňují genetickou příčinu u 65% případů s ADTKD. Projekt je založen na systematickém vyhledávání vzácných genetických variant v rodinách a sporadických případech s evidentně geneticky podmíněnou ADTKD, následné molekulárně biologické charakterizaci nalezených genetických variant a definici základních biologicko-patologických procesů spojených se studovanými fenotypy. Dosažených výsledků bude využito k charakterizaci genetických faktorů ovlivňujících věk nástupu a progresi postižení ledvin v jednotlivých rodinách a u jednotlivých pacientů. Zároveň budou výsledky sloužit ke správné a včasné diagnose, prevenci, cílené terapii a snížení morbidity a mortality spojené s tímto typem onemocnění.

• MeSH
• chronická renální insuficience genetika   MeSH
• fenotyp MeSH
• genetická variace MeSH
• intersticiální nefritida genetika   komplikace   MeSH
• lidé MeSH
• sekvenční analýza DNA metody   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• genetika, lékařská genetika
• nefrologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Effective search for producers of novel, pharmaceutically attractive natural compounds requires application of new screening techniques using genomic data. Growing information on the genetics of biosynthesis of natural compounds and their structural components, brings the possibility to use newly characterized enzymatic systems as markers in genetic screening of potential producers of structuraly and functionaly unique active metabolites, which may find it application as novel antibiotics, immunomodulators and cancerostatics. Two model enzymes of actinomycetes, the cyclizing aminolevulinate synthase and a novel type of type II polyketides synthase specific for short linear polyketide chains, will be employed in the project.

Efektivní vyhledávání producentů nových, farmaceuticky atraktivních, přírodních látek vyžaduje uplatnění nových skríningových technik s využitím genomových informací. Rostoucí informace o genetice biosyntézy přírodních látek a jejich strukturních komponent umožňuje využít nově charakterizované enzymové systémy jako markery při genetickém skríningu potenciálních producentů strukturně a funkčně unikátních aktivních látek, které se mohou uplatnit jako nová antibiotika, imunomodulátory a kancerostatika. V projektu budou takto využity dva modelové enzymy aktinomycet, cyklizující aminolevulinátsyntáza a nový typ polyketidsyntázy specifický pro krátké lineární polyketidy.

• MeSH
• Actinomycetaceae izolace a purifikace   MeSH
• antibakteriální látky MeSH
• biologické markery analýza   MeSH
• biosyntetické dráhy MeSH
• enzymy MeSH
• genetické testování metody   MeSH
• imunologické faktory MeSH
• lidé MeSH
• objevování léků metody   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• biochemie
• farmacie a farmakologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

The incidence of congenital cataract is estimated 1-6 in 10 000 newborns. In 15% of cases congenital cataract is a part of a syndromic disease, the manifestation at an early age is however often nonspecific and the diagnostic process is long and complicated placing a considerable burden on both patients and the healthcare resources. The aim of the project is to propose a novel diagnostic algorithm for children with congenital cataracts utilizing modern techniques of whole-exome and whole-genome sequencing. We expect increased rate of correct diagnosis and shortening time of making the final diagnosis in syndromes. The project will unravel mechanisms involved in hereditary cataract formation and address whether specific genotypes may influence the success of revolutionary surgical method preserving endogenous lens epithelial stem/progenitor cells. The knowledge gained can be also applied for preimplantation or prenatal diagnosis. The project will enable, in the context of personalized medicine, multidisciplinary team care approach to congenital cataract patients.

Kongenitální katarakta se vyskytuje u 1-6 dětí z 10 000, přičemž v 15% případech je součástí multisystémového onemocnění. Projevy syndromů asociovaných s kataraktou jsou v raném věku často nespecifické, což vede ke zdlouhavému diagnostickému procesu značně zatěžujícího pacienta i veřejné zdravotnictví. Cílem projektu je pomocí metod celoexomového a celogenomového sekvenování navrhnout u dětí s kongenitálními kataraktami nový diagnostický algoritmus, který povede ke zvýšení procenta stanovení diagnózy multisystémových onemocnění a zároveň zkrátí čas k jejímu určení. Projekt dále přinese odhalení molekulárních mechanismů podílejících se na vzniku kongenitálních katarakt a zjistí, zda existují i pacienti s konkrétními genotypy, kteří nejsou vhodní pro revoluční techniku chirurgie dětské katarakty využívající endogenní kmenové buňky. Získané poznatky budou využity i v rámci prenatální či preimplantační diagnostiky. Projekt umožní v kotextu personalizované medicíny zavedení multidisciplinárního přístupu k pacientům s kongenitálními kataraktami jak na úrovni klinické, tak i výzkumné.

• MeSH
• dítě MeSH
• genetické asociační studie metody   MeSH
• genetické nemoci vrozené diagnóza   genetika   terapie   MeSH
• individualizovaná medicína MeSH
• katarakta diagnóza   genetika   terapie   MeSH
• lidé MeSH
• preimplantační diagnóza MeSH
• prenatální diagnóza MeSH
• týmová péče o pacienty MeSH
• vysoce účinné nukleotidové sekvenování metody   MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• genetika, lékařská genetika
• oftalmologie
• pediatrie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Metabolic syndrome-a risk factor for arteriosclerosis and diabetes type 2- is one of the major population health burdens while homocystinurias are rare genetic disorders complicated also by vascular disease. These seemingly unrelated conditions, however, have been both linked to disturbed metabolism of sulfur compounds including cysteine and hydrogen sulfide. We will use targeted metabolomics approach for determination of compounds related to cysteine metabolism (including markers of hydrogen sulfide synthesis and catabolism) in plasma samples obtained from patients with homocystinurias, obese patients and controls, and in cultured human cells; to get further insight into organ-specific changes we will complement research in humans by studying tissues from animal models. This project will elucidate the role of cysteine and hydrogen sulfide in selected diseases and will facilitate development of novel personalized approaches to treat metabolic syndrome or its components, and to ameliorate complications in homocystinurias by targeting specific parts of relevant metabolic pathways.

Metabolický syndrom je rizikový faktor pro atherosklerózu a diabetes 2.typu a patří mezi populačně významné stavy, naproti tomu homocystinurie s postižením cévního systému patří mezi vzácné genetické nemoci. U obou těchto zdánlivě nesouvisejících chorob však byly nalezeny změny v metabolismu cysteinu i sirovodíku. Ve studii použijeme metody cílené metabolomiky pro stanovení látek souvisejících s metabolismem cysteinu (včetně látek odrážejících syntézu a katabolismus sirovodíku) ve vzorcích plasmy získaných od pacientů s homocystinuriemi, obézních pacientů a kontrol, a dále v kultivovaných lidských buňkách. Pro porozumění orgánově specifickým změnám doplníme výzkum na humánních vzorcích studiem tkání u zvířecích modelů. Řešení tohoto projektu objasní detailně úlohu cysteinu a sirovodíku u dvou skupin nemocí a umožní tak vývoj nových postupů personalizované medicíny zacílených na určitá místa metabolických drah; tyto postupy budou využitelné při léčbě metabolického syndromu či jeho komponent a pro zmírnění komplikací u pacientů s homocystinuriemi.

• MeSH
• cystein metabolismus   MeSH
• homocystinurie etiologie   metabolismus   MeSH
• kultivované buňky MeSH
• lidé MeSH
• metabolický syndrom etiologie   metabolismus   MeSH
• metabolomika MeSH
• modely nemocí na zvířatech MeSH
• sulfan metabolismus   MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• zvířata MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• vnitřní lékařství
• neurologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Congenital Disorders of Glycosylation (CDG) represents a large group of severe inherited metabolic diseases that are caused by impaired biosynthesis of glycoproteins and glycolipids.The complexity of glycosylation pathways determines the occurrence of a large number of CDG types - currently more than 100 were described. Glycoproteins constitutes more than 50% of total protein. Their impaired biosynthesis has critical impact on the functioning of the whole organism and manifests with severe clinical symptoms with high child mortality (about 25%). The project aims are i) to elucidate the etiology of the disease in patients with suspected CDG to provide early genetic counseling in affected families; ii) to analyse profile of dolichol metabolites in the urine in order to extend the selective CDG screening in CR; iii) to study the impact of CDG on the energetic metabolism with effort to understand the pathophysiology of disease; iii) to study impaired glycosylation in the background of various pathologies in order to find a specific biomarker reflecting the current state of nutrition.

Dědičné poruchy glykosylace (CDG) představují rozsáhlou skupinu závažných dědičných metabolických onemocnění, které jsou způsobeny poruchou biosyntézy glykoproteinů a glykolipidů Složitost glykosylačních drah předurčuje výskyt velkého množství typů CDG – v současnosti jich bylo popsáno >100 a jsou objevovány stále nové. Glykoproteiny tvoří >50 % všech proteinů s obrovskou funkční rozmanitostí, jejich porušená biosyntéza má kritický dopad na fungování celého organismu. Projevuje se vážnými klinickými příznaky s vysokou mírou dětské úmrtnosti (cca 25%). Cílem projektu je: a) objasnit etiologii nemoci u pacientů s podezřením na CDG s cílem umožnit včasné genetické poradenství v postižených rodinách; b) zavedením analýzy profilu isoforem dolicholů v moči rozšířit spektrum selektivního skríningu CDG chorob v ČR; c) studovat dopad poruch glykosylace na energetický metabolismus se snahou přesněji pochopit rozvoj nemoci;.d) studovat biochemické souvislosti dysregulace glykosylace na pozadí různých patologických stavů s cílem najít specifický biomarker odrážející aktuální stav výživy

• MeSH
• biologické markery MeSH
• časná diagnóza MeSH
• diagnostické techniky molekulární MeSH
• dolichol moč   MeSH
• energetický metabolismus MeSH
• lidé MeSH
• mitochondrie MeSH
• nutriční stav MeSH
• vrozené poruchy glykosylace diagnóza   etiologie   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• genetika, lékařská genetika
• vnitřní lékařství
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR