V roce 2013 bylo do surveillance databáze spojující data NRL a data EPIDATu zařazeno celkem 424 případů invazivních pneumokokových onemocnění (IPO). Celková nemocnost IPO v roce 2013 stoupla na 4,0 /100 000 oproti roku 2012 (3,2/100 000) v důsledku vysokého nárůstu nemocnosti ve věkové skupině 0-11m (z 1,8/100 000 na 9,2/100 000) a 1–4 roky (z 2,7/100 000 na 3,8/100 000). U pacientů nejvyšší věkové skupiny 65 let a starších došlo též k vzestupu (z 8,1/100 000 na 10,2/100 000). Nárůst nemocnosti u dětí pod 5 let věku lze vysvětlit minimální proočkovaností v roce 2013 konjugovanými vakcínami (PCV). Z 424 případů IPO bylo posláno do NRL k typizaci 362 (85,4 %) izolátů S. pneumoniae. V nejmladší věkové skupině 0-11 měsíců, která je cílovou vakcinační skupinou pro PCV, bylo zjištěno z deseti IPO šest způsobených sérotypy zahrnutými do PCV. Z celkového počtu 10 IPO u dětí 0-11měsíců byl jen jeden případ očkován.V roce 2013 dosáhla celková smrtnost IPO nižší hodnoty (16,3 %) než v předchozím roce (18,2 %), zůstává však na vysokých hodnotách po celou dobu provádění surveillance. Bylo zjištěno 69 úmrtí IPO, žádné v nejmladší věkové skupině dětí pod 5 let věku (4 věková skupina 20-39 let, 25 věková skupina 40-64 let a 40 věková skupina 65+).
In 2013, 424 cases of invasive pneumococcal disease (IPD) were reported by the surveillance database bringing together the data from the National Reference Laboratory (NRL) for Streptococcal Infections and EPIDAT data. The overall incidence of IPD increased from 3.2/100 000 population in 2012 to 4.0 /100 000 in 2013 due to the sharp rise in the age groups 0-11 month (from 1.8/100 000 to 9.2/100 000, respectively) and 1 - 4 years (from 2.7/100 000 to 3.8/100 000, respectively). An upward trend was also observed in the age group 65 years and over (from 8.1/100 000 to 10.2/100 000, respectively). Higher morbidity in children under five years of age can be explained by the low rate of pneumococcal conjugate vaccine (PCV) coverage achieved in 2013. Three hundred and sixty-two isolates of S. pneumoniae from IPD cases (85.4% of the total of 424 cases) were referred for typing to the NRL for Streptococcal Infections. In the youngest age group, 0-11 months, which is the target group for the PCV, six of ten IPD cases were caused by serotypes included in the PCV. Only one of the ten 0-11-month-olds with IPD was vaccinated with PCV. In 2013, the overall case fatality rate declined from18.2% in 2012 to 16.3%, remaining high over the whole period of surveillance. Sixty-nine deaths from IPD were reported, but none of them in the youngest age group under five years (4 deaths in the age group 20-39 years, 25 deaths in the age group 40-64 years, and 40 deaths in the age group 65+).
- Klíčová slova
- surveillance, invazivní pneumokokové onemocnění, nemocnost, smrtnost, sérotypy,
- MeSH
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- hlášení nemocí statistika a číselné údaje MeSH
- kojenec MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- morbidita trendy MeSH
- mortalita MeSH
- novorozenec MeSH
- pneumokokové infekce * epidemiologie mikrobiologie přenos MeSH
- pneumokokové vakcíny imunologie MeSH
- předškolní dítě MeSH
- senioři MeSH
- sérotypizace klasifikace metody statistika a číselné údaje využití MeSH
- věkové rozložení MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- kojenec MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- novorozenec MeSH
- předškolní dítě MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- grafy a diagramy MeSH
- tabulky MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
- MeSH
- dítě MeSH
- kojenec MeSH
- kongresy jako téma MeSH
- lidé MeSH
- pneumokokové infekce * terapie MeSH
- pneumokokové vakcíny * imunologie terapeutické užití MeSH
- sérotypizace využití MeSH
- Streptococcus pneumoniae * imunologie patogenita účinky léků MeSH
- vakcinace metody MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- kojenec MeSH
- lidé MeSH
- Publikační typ
- novinové články MeSH
- MeSH
- lidé MeSH
- pneumokokové infekce epidemiologie klasifikace MeSH
- sérotypizace využití MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
V článku jsou prezentovány první výsledky charakterizace 77 českých novorozeneckých kmenů Streptococcus agalactiae metodou multilokusové sekvenační typizace. Cílem této studie bylo ověřit, zda české izoláty patří k potenciálně invazivnímu klonálnímu komplexu CC17, a dále analyzovat vztahy mezi sérotypy a sekvenčními typy (ST). Dvanáct zjištených ST bylo přiřazeno k 5 klonálním komplexům. U většiny sérotypů našeho souboru byla zjištěna variabilita sekvenčních typů. Potenciálně invazivní ST17 byl jediným sekvenčním typem striktně vázaným na sérotyp III. ST17, ST23 a ST19 dohromady tvořily 83 % invazivních kmenů. „Hyperinvazivní“ ST17 byl zachycen u 85 % (6 ze 7) izolátů z mozkomíšního moku, ale pouze u 32 % (7 z 22) kmenů S. agalactiae izolovaných z hemokultur.
The first multilocus sequence typing results of Czech neonatal Streptococcus agalactiae isolates are presented in this paper. The aims of the study were to prove if the Czech isolates belong to potential invasive clonal complex CC17 and to further analyse serotype – sequence type relationships. Twelve sequence types detected among 77 isolates were assigned to 5 clonal complexes. Sequence type variability was found for most of our collection serotypes. As many as 83 % of the invasive isolates were covered by as few as 3 sequence types: S17, ST23 and ST19. ST17 was the only sequence type strictly tied to serotype III. “Hyperinvasive” ST17 was identified in 85 % of the cerebrospinal fluid isolates (6 out of 7), but in 32 % of the blood isolates only.
Celorepublikový program surveillance invazivních pneumokokových onemocnění (IPO) byl zahájen v lednu 2008, v roce 2007 probíhala pilotní studie surveillance, v letech 2000-2006 studie NRL (laboratory based data). Nemocnost v roce 2008 byla u IPO 3,3/100 000, u pneumokokové meningitidy (PM) 0,9/100 000. Nejvyšší specifická věková nemocnost byla zaznamenána u dětí 0-11misícu (IPO 15,7/100 000, PM 7,9/100 000) a u osob 65 let a starších (IPO 6,6/100 000, PM 1,5/100 000). Celková smrtnost dosahovala v tomto roce 15,9 % u IPO a 14,3 % u PM. Specifická věková smrtnost IPO byla nejvyšší u pacientů 65 a více roků (26,3 %), ve věkové kategorii 40-64 let (17,2 %) a u dětí o-11 měsíců (11,1 %). U PM byla nejvyšší smrtnost zaznamenána u osob 65 a více roků 31,8 %. Dětí 0-11 měsíců se smrtností 11,1 % byly na druhém místě. Data zjištěná pro nemocdiagnosnost a smrtnost v období surveillance (2008) byla porovnatelná s údaji zaznamenanými v období 2000-2007 i s předvakcinačními hodnotami uváděnými v Evropě. Pokrytí sérotypů pneumokokovými vakcínami bylo hodnoceno za celé sledované období (2000-2008). Ve dvou nejmladších věkových skupinách (0-11m a 1-4r) bylo pokrytí sérotypů konjugovanými vakcínami podstatně vyšší než u dospělé populace (40-64r a nad 65 let). U dětí 0-11 měsíců dosahovalo pokrytí 7-valentní konjugovanou vakcínou (PCV-7) 61,6%, 10-valentní konjugovanou vakcínou (PCV-10) 70,7 % a 13-valentní konjugovanou vakcínou (PCV-13) 78,7%. Sérotypy zjištěné u dětí 1-4 roky byly zastoupeny v PCV-7 v 63,4 %, PCV-10 v 71,9 % a PCV-13 v 85,6 %. U pacientů nejvyšších věkových skupin pokrytí sérotypů osahovalo hodnoty nad 60 % až u PCV-13. Distribuce sérotypů působících IPO je odlišná v dětské a dospělé populaci. V celém období 2000-2008 prevalovaly typy 14, 19F, 23F a 1 u dětí pod 5 let věku, typy 3, 4, 9N a 14 u pacientů 65 let a starších a sérotypy 3,4 a 14 u osob všech věkových skupin.
A nationwide surveillance program of invasive pneumococcal disease (IPD) started in January 2008. It was preceded by a pilot IPD surveillance study in 2007 and a NRL study (laboratory based data) in 2000-2006. In 2008, the incidence rates of IPD and pneumococcal meningitis (PM) were 3.3/100,000 and 0.9/100,000, respectively. The highest age-specific rates were reported in children 0 to11 months of age (IPD 15.7/100,000 and PM 7.9/100,000, respectively) and in the age group of 65 years and older (IPD 6.6/100,000 and PM 1.5/ 100,000, respectively). The overall death rates were 15.9% and 14.3%, respectively. The highest age-specific IPD death rates were recorded in patients aged 65 years and older (26.3%), those aged 40-64 years (17.2%) and children 0-11 months of age (11.1%). The highest age-specific PM death rate of 31.8% was observed in patients aged 65 years and older, followed by 11.1% in children 0-11 months of age. The morbidity and mortality data from 2008 were comparable with those obtained in 2000-2007 as well as with the pre-vaccination data reported by other European countries. Vaccine serotype coverage was analyzed for the entire period 2000-2008. The two youngest age groups (0-11months and 1-4 years) showed considerably higher conjugate vaccine serotype coverage than adults (40-64 years and 65 years and older). In children 0-11 months of age, the coverage rates were 61.6% for 7-valent conjugate vaccine (PCV-7), 70.7% for 10-valent conjugate vaccine (PCV-10) and 78.7% for 13-valent conjugate vaccine (PCV-13). The serotypes found in children aged 1-4 years were covered by PCV-7 at a rate of 63.4%, by PCV-10 at a rate of 71.9% and by PCV-13 at a rate of 85.6%. In the oldest age groups, a coverage higher than 60% was only observed for PCV-13. IPD serotype distribution differed between children and adults. In the period 2000-2008, serotypes 14, 19F, 23F and 1 prevailed in children under 5 years of age, serotypes 3,4, 9N and 14 were typically found in patients aged 65 years and older and serotypes 3,4 and 14 were common in the population of all age groups.
- MeSH
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- incidence MeSH
- lidé MeSH
- pneumokoková meningitida epidemiologie mortalita MeSH
- pneumokokové infekce epidemiologie mortalita MeSH
- pneumokokové vakcíny aplikace a dávkování MeSH
- pneumonie pneumokoková epidemiologie mortalita MeSH
- sepse epidemiologie mikrobiologie mortalita MeSH
- sérotypizace využití MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- lidé MeSH
Je prezentována stručná zpráva o výsledcích řešení projektu IGA MZ ČR, kterému byla udělena Cena ministra zdravotnictví České republiky za lékařský výzkum za rok 2008 (http://www.mzcr.cz/Odbornik/Pages/816-udeleni-ceny-ministra-zdravotnictvi-pro-rok-2008 html). Oborovými komisemi Interní grantové agentury Ministerstva zdravotnictví České republiky bylo doporučeno 16 kandidátů k udělení této ceny, vědecká rada IGA MZ ČR vybrala k jejímu udělení 5 projektů. Na prvním místě se umístil projekt řešený ve Státním zdravotním ústavu: Studium hypervirulentních komplexů Neisseria meningitidis metodami molekulární biologie a možnosti prevence jejich výskytu v České republice vakcinací. Řešitel projektu: MUDr. Pavla Křížová, CSc., odborní spolupracovníci: MUDr. Jitka Kalmusová, RNDr. Martin Musílek, Ph.D. Registrační číslo: 1A/8688-3, doba řešení: 2005 – 2007. Ceny udělil ministr zdravotnictví MUDr. Tomáš Julínek, MBA dne 15.12.2008 u příležitosti výročí narození J.E.Purkyně.
A brief report is presented of the results of the Project of the Internal Grant Agency of the Ministry of Health of the Czech Republic that received the Medical Research Award 2008 from the Minister of Health of the Czech Republic (http://www.mzcr.cz/Odbornik/Pages/816-udeleniceny- ministra-zdravotnictvi-pro-rok-2008.html). The Science Council of the Internal Grant Agency of the Ministry of Health of the Czech Republic selected 5 award winners of 16 candidate projects recommended by the Specialty Commissions of the Internal Grant Agency. The winning project: Study of hypervirulent complexes of Neisseria meningitidis by molecular biological methods and preventive potential of vaccination against these complexes in the Czech Republic. Principal investigator: Pavla Křížová, MD, PhD, co-investigators: Jitka Kalmusová, MD, Martin Musílek, MSc, PhD, registration No: 1A/8688-3 and completion period: 2005 – 2007. The award was received from Tomáš Julínek, MD, MBA, Minister of Health, on December 15, 2008 on the occasion of the anniversary of J.E.Purkyně’s birth.
- MeSH
- diagnostické techniky molekulární metody využití MeSH
- faktory virulence genetika MeSH
- financování organizované MeSH
- lidé MeSH
- meningokoková meningitida prevence a kontrola MeSH
- meningokokové vakcíny terapeutické užití MeSH
- Neisseria meningitidis genetika klasifikace patogenita MeSH
- sérotypizace metody využití MeSH
- vakcíny konjugované terapeutické užití MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- MeSH
- antigeny virové izolace a purifikace MeSH
- automatizované zpracování dat metody přístrojové vybavení využití MeSH
- dítě MeSH
- feces enzymologie virologie MeSH
- finanční podpora výzkumu jako téma MeSH
- lidé MeSH
- rotavirové infekce diagnóza epidemiologie etiologie MeSH
- sérotypizace klasifikace metody využití MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- Publikační typ
- srovnávací studie MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Genotypizace viru hepatitidy C /HCV)má význam zejména pro stanovení schématu léčby pacientů s chronickou VHC a pro prognózu úspěšnosti léčby. U souboru 62 sér pozitivních na HCV RNA v testu Cobas Amplicor HCV 2.0 (CA) byl zjišťován genotyp HCV metodou reverzní hybridizace (Versant HCV Genotype Assay (LiPA) Bayer), modifikovanou tím způsobem, že jako výchozí amplifikovaný materiál pro reakci byl použit přímo produkt CA. Z 57 vzorků (92 %) reaktivních v reverzní hybridizaci byl u 56 určen genotyp. U jednoho vzorku neodpovídal profil žádnému určitému genotypu, pět vzorků bylo nereaktivních a jeden nebyl v tomto uspořádání testován. U dvou z těchto 5 nereaktivních a u jednoho netestovaného séra byl určen genotyp reverzní hybridizací vycházející z nested PCR. Lze shrnout, že produkt získaný po jednostupňové amplifikaci HCV RNA v testu CA je pro většinu vzorků vhodným výchozím materiálem pro genotypizaci reverzní hybridizací. Pro laboratoře používající k detekci HCV RNA v séru Cobas Amplicor HCV 2.0 by tento postup vedl ke zjednodušení genotypizace a k časové a materiálové úspoře. U sér s nižší koncentrací viru, která nejsou typizovatelná touto kombinací metod, lze vycházet z nested PCR. Čtyřicet osm vybraných vzorků bylo typizováno vedle reverzní hybridizace také sérologicky soupravou Murex HCV Serotyping 1–6 Assay (Abbot Murex). Typ byl určen u 37 ze 48 testovaných sér (77 %) včetně všech tří sér negativních v reverzní hybridizaci. Přestože je sérologická typizace méně citlivá, může být významná při typizaci některých sér s nízkou hladinou HCV RNA a sér neobsahujících již detekovatelnou virovou NK, která nejsou typizovatelná reverzní hybridizací. U 33 sér, jež byla genotypovatelná oběma metodami, byly tyto metody ve vzájemné shodě. Pouze ve dvou případech zjistila sérologická metoda přítomnost jednoho typu viru navíc (smíšený genotyp) oproti reverzní hybridizaci.
Genotyping of hepatitis C virus (HCV) is of relevance to scheduling the treatment of patients with chronic hepatitis C (VHC), making their prognosis and monitoring the treatment efficacy. A set of 62 sera testing HCV RNA positive in Cobas Amplicor HCV 2.0 test (CA) were genotyped using Versant HCV Genotype Assay (LiPA) Bayer, i.e. the reverse hybridization method, with the CA amplified product being directly used in the assay. Fifty-six out of 57 samples reactive in reverse hybridization (92 %) were genotyped. One sample showed a profile differing from any genotype, five samples were not reactive and one sample was not tested within this study design. Two out of five non-reactive sera and one non-tested serum could be genotyped by nested PCR based reverse hybridization. It can be concluded that the CA product resulting from one-step HCV RNA amplification is suitable for use in genotyping by reverse hybridization. The CA product based genotyping procedure is easier to perform, less time-consuming and less costly. The nested PCR based procedure could be used for typing of sera with lower HCV concentrations nontypeable with the combination of CA and Versant HCV Genotype Assay. Forty-eight selected samples were typed not only by reverse hybridization but also by a serological kit Murex HCV Serotyping 1–6 Assay (Abbot Murex). Thirty-seven (77 %) of these sera, including all of three sera negative in reverse hybridization, appeared typeable by this kit. Although less sensitive, serotyping may be of relevance to typing of sera with low HCV levels or not containing detectable viral NA which are nontypeable by reverse hybridization. Thirty-three sera appeared genotypeable by both of the methods tested with the results being in good agreement. In two cases only the serotyping method revealed one more type of virus (mixed genotype) compared to the reverse hybridization.
Pozornosť sa venovala sérotypizácii a biologickým vlastnostiam kmeňov Plesiomonas shigelloides, ktoré môžu byť potenciálne spojené s ich virulenciou. Trinásť kmeňov bolo izolovaných od ľudí (H) a 14 bolo veterinárneho pôvodu (V) (zvieratá). Sérologickou typizáciou sme u H kmeňov najčastejšie identifikovali sérotyp 040: H6, v skupine V prevládal sérotyp 066: H3. Všetky H kmene a 92,8 % V kmeňov bolo hydrofóbnych. Pohyblivosť H izolátov bola nižšia (30,1 mm) v porovnaní s motilitou druhej skupiny (46,8 mm). Beta hemolýzu vyvolalo 76,9 % H kmeňov a 71,4 % V kmeňov. Testované kmene obidvoch skupín sa vyznačovali slabou produkciou biofilmu na sklenenom povrchu. V produkcii lipázy ako aj histidín dekarboxylázy sme nenašli významnejšie rozdiely medzi H a V kmeňmi. Inhibícia zóny bakteriálneho rastu ako odpoveď na oxidačný stres bola v priemere 26,6 mm u H kmeňov a u V kmeňov 28,1 mm. Ani jeden testovaný kmeň neprodukoval krátko reťazcové nesubstituované acylované homoserínové laktóny. Naše výsledky ukázali, že testované kmene P. shigelloides produkovali viaceré potenciálne faktory virulencie, ktoré môžu byť spojené s patogenézou infekcií nimi vyvolaných.
We focused on serotyping and biological characteristics of Plesiomonas shigelloides strains potentially associated with virulence. Thirteen strains isolated from humans (H) and 14 strains of animal origin (A) were tested. The most frequent serotype among H strains was 040:H6 while 066:H3 predominated among A strains. All of the H strains and 92.8 % of A strains were hydrophobic. H isolates showed lower motility (30.1 mm) compared to A isolates (46.8 mm). As many as 76.9 % and 71.4 % of H and A strains, respectively, produced beta-hemolysis. Both H and A strains exhibited low biofilm production on a glass surface. No significant differences were found between H and A strains in lipase production and histidine decarboxylase production. The zones of bacterial growth inhibition in response to oxidative stress were on average 26.6 mm and 28.1 mm for H and A strains, respectively. None of the strains tested produced unsubstituted shortchain acyl homoserine lactones. Our results showed that tested Plesiomonas shigelloides strains produced multiple potential virulence factors that may play a role in the pathogenesis of infections caused by this agent.
